Ll_transcript_298683

• Id Trinity: TRINITY_DN51570_c0_g1_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_298683
• Sequence: CAAAAAATTACTCTTTTTTTAATTTCTAATATGGGTTTTTATTCTTTTCAAGTTTTGATTATTGGGTATAGTTGAATTTACTATATATCTATGTAAAGTT CAAAATACTAGTATTTTTGTGTTAAAAGCTCTTTATAATACTTAATGGAGTAATTTTGTAGATCTAGCATTCATGAAATGCATCAGCTCCTTTATTCAGG GCCCATTTACATGATTAAGAAAGTGATTAGTAGATATTCTAAAAAAGTGATTTTGGAAAAGCTAAAAATATAGCTTCTCATAAATCCTGAGTTTCTGCCT TTTGTGCTTCTGGTTTTTAGTAAAAGCCCTACCAAATAAGCATTTCAGAAGATGATTTTTGTACCAAAAAGGAATTTTTTGTAGTTGTGAAAATCCTAAA CAAATGGGGCCTATATAATATATATTGAAAGTTGAGATTTTTGTATCAATTTTATATTGGTGTGAAGCTGAGATCTACTGATGAAGCGCAGTAATAGTGT GGAAAATAAAATTGTAAACAAAGCAAGCCGGGGGTTCATGAACCATGATGATTTTGTAAAGCTAGTGGCAGTTTGTGTGATTGATATGAAGGCCATTTTG CTTGGTGGTTATATTGGTTTTGAGTTGGCCGGAACTGACTATGACCTTTGTGATTTGCCTCAGATTTGACAAGTGAATAATTCACGAAACCAAAGTGGTT TTCGAGTGTTACATCATTTAGAAAGTAATAGAGAAGGGAGGCTGTGAAGAGATAGACAAGTGTTATTGTGGTCCAAATAAACTGAATGTTTCTTACTTCA TGCCTAGAAGCGGAGCTGAATTAAAGCTTATAACATATTTATGATAGCTAATTAATACGTGTAAAAAAATAATTTCTGTCAATCAATTATTGTAAATTTT GCAGCACAAAAATGGGAATCTCTATCTTCATTTAAGGGCAGTTTCGTTTTGTTACAGCTGAGATTGTAGCAGGATCTACAGCATGGCTCGGTAAAGGTCT TTCTTGTGTCTGTGCTCAGAGAAGAGAGAGTGAATCACGTCCTTCTTTTGATTTAACTCCAGTACAAGTAAGATTTTATTGATTTAATTGCTGGAGCAGC AATTTATAGCTAATTTAGTGATTCTGTTAATTTTCTCTTGAATCTTCCTGCCATACATAAAAGAAATGTTGTTCTAGGGTATGTGACATGTGTATAAAGG ATGTGCCATGTTTTTATTTTTTGGTTACTATTGTGAATATTGTGATGATAAGCATCTTCCGAACATAATCGACAGACAAGATTGCACTTTACCCTTTTAT TGAATGATCAATCTTCTTTTCAAATAATAAAAGTGTTCAAGTGGGTTCCTTGCTATATGCTCTTTTCTTGTGTATCCAACATACTTTCTACCTGGTTTGA GCTAGCTAAAAATCTGATCGCTGGAGAAAATTATTGAATAGAAAAAGCTGATAGACTATTGTGTTTAGTGGTGCCAAGATGCTGGTGTTCCTACTTATTA TTTGAAATTCTTGATACTTTTTATTCCCCTTTGGTTTTTAGTGATCAAATTATGAGGCTGACATACTCTTGTCTTTGCTTAATCTTTGTGTGTTCAAAAG CTTTCTTAACTAGAATTAACTATTCACATATTTTTGGAATTTATGCAGTTATGTTATGCTCAATTTTTCTCTTGCTCTGAATTTGTAGTAGCTTCCAATC ACACCCATCTTTCACATGGCTGGGTTTTTTGTATGAATTTTTTTATATTCAGTACTTTGATCATGTTGTATACCTCTTTGGATCAAAATATTGCACTCTA ATTATCTTTTCTATTAAATATTGTTTACAATTATGGCAAAATTCTCGATGCTGAACTTTTTATTCTCAGGAAGAATGCTTGCAGAGGATACAGAGCCGTA TAGATGTTCCCTATGATAGTTCTATCCCTGAGCACCAGGATGCCCTAAAGGCTTTATGGGATACTGCATTTCCTGAAGAAAAACTCCATGGCTTGATTTC TGAACAGTGGAAGGAAATGGGCTGGCAAGGGAAGGATCCATCAACCGATTTTAGGGGTGGTGGTTTCATATCATTGGAGAATTTGCTGTTTTTTGCTAGA AATTTCCCAAAATCCTTTCAGGATCTTTTACGGAAGCAGGAAGGAGATCGATCAGTTTGGGAATATCCATTTGCTGTTGCTGGTGTTAATATCACATTCA TGCTTATTCAGATGCTGGATCTTGAAGCAGGTTTGTCAGTTTTATTGTTATTAATATAATATTTTAGTCCAAACATATATCATGTCTAAAAGAATGGCTG AACAAATCCTAGATGTATAGTCATTTTCTCTTCTGGATTGTGCTGTCAATTTCATAGATCCCTAGCAACTTAACAAGTTGAGATTACTTTGAATTTATTC GGTTCTTCGAATGTAACGTGTTGGCATAAATATGCTTATGTTATTTTACCATTTACTTTTGTATACTTCAGCTGTGTCTATCAGTCTTGGCCTTGGGCGG GCATCTATGCTACTACGGAAAGATGATTTCATTTCTTGTTATAGTATTTTCGTCTTCGTTAATTGGTTATTCTAAACAAATTATAAAGGCTGATCTCTAA TATCTACTTCCTACTTTTAAGCATTTTTGCTAATTTTTGCATAGTATGAAATTGTTTTTTTAATTAAACATATTACAAAATTGTTATTAGAACTTCAAAA AATAGATAAATTTGCCAGGACCTTGCTTTGAATAGATTTTGTTATCCCAAATCATTGTGATGCTATCTGTTAATGATCTTTGCCTTTACAGTCAAGCCAC GGACACTGGTTGGAGCAACTTTTCTAAAATTTCTTGCAGGTAGCCCGAATTATTCCCTGTT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_185980;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_298683

FPKM

• PAB: 0.7
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.1
• PS2: 0.2
• PS3: 0.2
• PW1: 0.3
• PW2: 0.5
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_298683

• Blastp: -
• Blastx: ELMO domain-containing protein A from Dictyostelium with 42.48% of identity
• Eggnog: ELMO CED-12 domain containing(ENOG410XRXC)
• Kegg: Link to kegg annotations (DDB_G0278051)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019459125.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;