| Id Trinity | TRINITY_DN51570_c0_g2_i12 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_298701 |
| Sequence | ATAGTTTGGGACATATTTTAGGACAAATGATCTATAGGAAGAAAATGGTAAAGGAGAAGATTAAGGCTTTGTGAGAGTCATAGATTCTCACACATATTTC CCTTTTCCCTATCTCTAACCGTTTCCCATAATACACTTATTTCTCTCTTTCACTCCATTCTTCATAAATATGGAAGATAGAACTGTTGGTATTGGTGGTG CCTCTTTTGTCGCTGTTCGGAAGATTCCACACGGAGAACCTTGCCATTCTAATTCTGGTATTTTCTTTCATTCCGATAATTGTATTAAATTACGGTTATG GTTGCGGTTACTGTAATTATTTACTGTTGTGGTCCTCCTGATGTATTGCAGACTGCAATTTAAAACACTGTCGAGTATCTCGGGATCTCGACTTACTATA TATGATATGACTAGTGTTTTATTTTTTTGCATATTTAATGATCATTTGCTTGTGTTACATTTTGGTGACTCACATTAGTGGTGTAGTGTTCGATTTTTTC GTACTACGTCACTTTTTCTCGTAAGGAACTAATCCCTTTCAGGTTTCGTGCTGCGCCTCCCAATAAGTACAGCTCCCAGGAATCGAACTCTCAACCTTAG GAATCTAGTGAGACCTTATACCAACGCCTTGTTGGTGTTGTAGTGTTCGATTGAGCAGTATTAAAGCTGTTTCGGATGCTTAATTTACGATGAGGTTGTT GTTATGCTCATGAATCAACTCATATGTTGTCAAATGTTGCTGTTCTTATAATATTCCGATTCCGATTAAGGTGAATGTTAAAGCTGTCTGTTGCTTGATT AAGCTGAATGATTCAGATTCTATGGTAGACGCTGGCCGAACTGAACAGAAATAATAGTAATTGAAAGATTTGGGTGAAACTTGTGGATTAAAAGTGGAAG GATCTTTGTTGATGGGGAATTTTTCTATATGATTACAGCTGAGGTTGTGGCAGGATCAGCAGCGTGGCTCGGTAAAGGTCTTTCTTGTGTCTGTGTACAG AAAAGAGATAGTGATGCTTCTACTTTTTTCGATTTAACTTTAGCCCAGGTAATATTTTTGTAATTACTCAAGCAACACTGAATGTTTATGTAGTTCTGTT AACTATGCTCTTGGAATCTTTCTTCATGAAGAAAAAGGAAATCAAGTTTTATTCTTCACCATGTAGTATGCACATTTTGCAATTTATATTCATGTTGAAA GGTATATTTTCTTATCAAATATCAAAAGTACTGTTTAATTGCATTTCCGGCTATTTGTTTTTTCTTGTTTATCCTCGATGTCTTCTGGGTTTGTGTAACA CAGAAAACCTAGTGTTGTTAGAGGGAATCTTCACTAGCAAAGGCTAATCAGTTGTGTTTAGTGGTTCCGAGATACTTGATCTCCTATATCACATGAAATT CTGGAGCACTTTGTACTTAAATGTTTCTGTTCAATCTTCAATATTGTGTTTATAATAATATCATGTAAAACTCACATGTTATTGAATTTCATTTTTCGCA GGAGGAATGCTTGGAGAGGTTACAGAGACGTATAGATGTTCCATATGATAGTTCTATAACTGAGCACCAGGATGCCCTTAGGGCTTTATGGAATGCTGCA TTTCCTGGAGAAGAACTCCGTGGCTTGATATCTGAGCAGTGGAAGGAAATGGGTTGGCAAGGGAAGGATCCATCAACGGATTTTAGGGGTGGTGGTTTTA TATCATTGGAGAATTTTCTGTACTTCTCTAGGAATTTCCCGGTATGATTTGTTTATTTGTTTGCTTACTCTTATCTGATATTGTAATAAATATCTTACTT AGGTAGGACCAATATCGAAATTTAGAATGGATATTGCAACCTAGAGTTGTTGGTTGCAAACATTCATGGTAGTTATGGTGTGAACACTGTCATGCTCTGC CCAAAGCTCGCAGTTGCCAACTTCTTTTGCAACTCCAGCCGGTTGTGAAGGGGTGTACACCATTGCTTAGTTTTTCATGTGCATCAAGGTTATCGTTGAC TCTCTTATTTCCATTGGTTCTCTGATTACACATGCTGATTTCATTTTGGATGGCCTCTTTGAAGACTTTCAGCCAGTTATCACTATTAGGGAAAATCAAG ATGATATTCCTTCTGTTAATGCGCTTCAATCTTATATTTTTACCTTTGAATCTCAACTAGGGTGCAATCGGAACAAATCGGTTTCAGATGCACTATCTGT GAATCTGGCAGCAAAGTTGCCATTGAATTCTCCGGTGTCTGTTACATCGACGATGAAATTCATCGTATTCACATACATGTGCTGAAGGCTCGTCTTCTCT CTTTCATGGCTGCACAGGTTATCATGGTGATGTTTGTGGCGGTTATCTTGGTGGTCGTGGTTGCTTGGCGCCAAGGAGGGTGGTTGTTACTGTGGACATA GCAACTGTTATGGTCATGATTTGTCCTTTTGCTACTATGTTCCCCTGATTTCGGTGCAAATTACACCAATTCCTATGGATCATAGGGTGCACCTCCTGGT TTCGGTGTACCTAATGGTCATTATGCACCCACTGCTTATCCTCATGCGCCACGACATTTCACTCAGTTTTCTTGTCCACATTCTTAATTTTGAAGATATT CAGCACCATCTCACTTGGCTGGACAAGATACTCACATTGAAGCCCACTTTTCTAGACATGCTCGCAGTGCTAGGCCTTCTTCATGACTCACGAGCTCCAC CCAATACCCCTATGCCATGATAGCTAGTTCTGGTGATGCAGAAACTAAGTCTCGCATGCTAGTGTTGTGTCCAGCTTCAGGAGCCACTAACATCTCACTT CATACCCTGCTCTTGTGCACGGATGTACTGAAAAATCCACTTCTGAGTATATATACATGAGTAATGGCTCTGAAAAATTCACTTTTGATTTATAAACTAA GTCTCACACATCAGTTGGTATCCTGATTCAGGAGTGCCACTAATCATATCACCTTAGACTCTACTCTTGTGCACAAACCTACTGAAAAATTCACTTTTGA GTAGAGATATACATGGGTAATGGCTCTGGGATTTCTGTTACAGCTTCTGGCAATTCTGAAGGGTCTTTGTTTGTTTGTGTTTTCCTATTTGAGTAGAGAA TTGGATTGTTAAAGGGTCTAATTATGAGGAAAACAGAAACAAACAAATACCTCTCTCATTCTAGTTCCATTCCCCTCTCATCCTAGTTCTATGACACCCG CCTCCACTTTTGTCTTCAACTTTGTTTCCTTGAGCAAACCACCTTACGATTCGTGTGGGAATATTAGAGAAGTCTCTGGCTTAAGTAATAATAGTTATTT TTCTGTAAACAGAGTTTCCCTTCCTATTGTAAATCAAGTAATCATAATAAGAAAGTTCTAACAGATTCGGTTACACTTCTCTCTCTATTACAGTTTCCGT TTCTTACAGATTTGGTCCCCAAGAACTAAAATTTCCATACAACCTTCAACTAATCAGTTCTCTTTGATGTCAATGTCTCTTAATCTTAAAACTCAACTTT TCATCTTGTAGAAATCCTTCCAGGATCTTTTATGGAAGCGGGAAGGAGATCGATCGGTGTGGGAATACCCATTTGCTGTTGCTGGTGTTAATATCACATT CATGCTAATTCAGATGCTTGATCTTGAAGCAGATTATGGGTGGTGCCATATTGTGGATTTTATCTGCTAACAACATGCTTTATCTTTACAGTCAAGCCAC GCACACTGGTAGCAGCAGCGTTCCTGAAATTTCTTGAAGAAAATGAATCAGCTTTTGATCTTCTATATTGCATAACTTTCATGCTGATGGATCATCAATG GCTTTCTATGCATGCTTCATACATGGACTTTAATGTATGTATTCTTTAACCTCAGAGCTCTATGGCACAAGAAAATTTAATTCAAGTCTATAATTTGTTA AGAAGGGAGGGTAAAAGGAGAATGCATGCAAGAATAGGCAATTATAAAAACCTATGCCACTCTTGATATGGAGGAAAAGATATCTTTCAATTAATAAAAC CAATCAGTTACACCCATAAATGGTTATCTAGGAGTGTAAGGCCTACTAGATTCCCAAGTATCGAACTAGGCCAAAGGTTAGAGGTTCGATTCCTGGGAGC GATACTTGTTGGGAGAAGCAGTCATGCAATCCGAAATGGATTAGTTTCTTATCCATAGGGTGCAGGGATACTTTTGGTTTTACCGAAAAAATAAAAGATC GTCTTGGAGATGATTGTGATCTCTTTTCTTAGTAATTGAGCTTTACTTCTTAGCTTCATATTGGTATTGGCAACCTTTGCTTTTATATCTTTTACTTCAT AATCCAACAGACAGTGATGAAATCTACACGAAGTCATCTGGAGAAAGAGCTTCTTGTTGAAGACATAACACGCCTTGAAGATTTACCCTCATACAAACTA CTTTCATGATAGATTTCAAGAACTCTAGCTACAAATGTTTTTTTGTACATGATACAATGCTCCTCATTATAATCTTCACTCTCTCAACCCAGCATTCAAT CTTCCAACATTTTTGGCAATTTCAGCTAAGAACATGTAAAACTGATGCGAGCTTAACGGTGACGAGCTTAACGGTGACGCCGATAAGGTTCGAAATGCAA CAGCTAAGCTTTTAGTGCAGTTGGATGATAAATTTTGTTGGCAGTGGCAAGAGTCTGAAATGTAAGTGTGTTTGGTATTAGATTTTAATGAATTGTTGAT TGCCACTTTGCCTATACATGAAACTTTCAGGTAGATTTTGAAAGTGTTAATAGAGTCAATGTTTGTTTTGAGTAATAGTGTTAGTACTGTAACAACTTAT TCCTGTTGTCAAATAAAATAAGAACACCACCGGGCGTTGGTTCAAG BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_185981; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_298701
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | ELMO domain-containing protein 2 from Homo with 41.49% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019464704.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |