Ll_transcript_410696

• Id Trinity: TRINITY_DN51609_c2_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_410696
• Sequence: TAAATATAAAGGGTGAAGATGCAATGACAGTGCATAAAACTCATACACTGTCAGTGCATACATTTTAACTCTTATTAAAATGAGTTGTTCTATTTTGACT TTACCTTTGTATTTGCTCCGACATAGAAGAATCAGAACTTTGTTGTCATTTTCCCTTTCCTATGATTCTTTAGACTTTGCACTGGGATATTTTCATATTA AATTTTTGTTTTTTTATTGAATTTTATCTCCCCCCTTTTGCTTTTATTCTCTATTGCTTTTGGTGCTTTACTTTCATGTAGTGGACACTGTGAACCCCAC CAATGGAATAAATTGATTACACAGCTTCTGTCTTTGTTGCAACTTTCTTTTTTCCACCCCTAACATGATTTAGTATTTTTTGTAATAGGTTATTCTGGAA ATTCTTGATTTACTGTGTAATTATTCTTTAGATTGCAAATAGGCAAAATATGATGATTTTGTTTGTTTAACAAAAATGACATCAAATTCATGCTACAAAA TATAATGATTTTGTTTCTTTAACAAAATGGCATCAAATTCATTTTTTACAGTTGAAGTCTTAAAATATGTCATAGTCATGGTTGAGGATTAGAATATAGG GAATATAATCAGGGTGGTGATTTACAAGACATGTAAATTTACTCCCTTGATGTGTTCCTTGAAGTCCAAATTCTAAGGAGCTTTATTTACTTGTTTGCCA TTGTAATTGTGCTTAAATGCTAAAGTTTTCTAATTTTCTTTTTCTTTTACATTGGGTTCCTTCTTTGTGTTGAACACACCATGAGTAAGTGATATTTCAA ACTTCAAAGCTGCCCCTGATGCATTTGTTGAAGAGAATGTCAAGTTGTTTCTGGATCATGCCATTAAGAAAGTTTGAATAGCTAAACACAATTTGGACTT TGAATGATGCTTTGGGTTGTTATGATCTTATGTCGGTTAAATTGTTAGAACTTAGAAGTTAGTAGTAGTGGAACTTCTGAGTTCCTAAAATCAACTGTAG TTAAATTCTTAACTGTCTAATAGTGGCAATATAATTCCTAAAATCAAGTGCATTTCTCATATATTAGGATTTATGCACTTGTAGTACTTTTATTTACTTT GTTTTTAGGTTTCTAATCTTTCTTTTTATGTTTTTCTAGTATCTGGACTTTCCGGTACTGCTGAGACTGCTCAAAGTCAGGTCTCTGTTGGAATGGGTCT GCTAGCTGGGTCAACAGTTATGCTTCTGACTGTAATATGGGGGACCTGTGTAATTGTTGGCAAGTGTGACCTTGAAGGTTCAATTGCAATAGATTCGCGT GATACCAGGGGATTTCATTTAACCAGTTCTGGTGTTAGTACTGATATTTGGACAAGTTATGCTGCTAGGATTATGGTTTTATCTGTCATTCCATTTTTGA TCGTTCAGTTACCGCAATTGCTCAGCTCAACTTCAGGAAGGCACTTCGCTATTTTGATTGCTCTTGTTGTCTCCATCTGTTTATTGATTGTGTATTGCCT TTACCAGGTAAATTTCTTTTTATGGTGCAATTGTTTTTCCTTCTGCATTCTGATCTCTTTCTATATCCAAACACTTCTAGTTTTGTTGATAGTATTTTGT ATATATATATGTACATATACATTTCACCAATGAAGAAATGGGTAGTGTAGGACTTCAGTCTTTTGTTATAGTTAGGTTTCTTTTATTTTTTATCATGATT TAATGAAATTAGTTTTAATTGATATCGACCTGCACTGTTGTGCTTAACTCTGATGACACATTCCATGGATGTTATGGTTAGAACTTTCAGTAGCTGTATT TGGACGAATGTTTATTCTCTATTATTTGGACACCTCGTCAGTCTTTTTATTATTTTAAAAATTGATAAAAATTTAATAAAAAAATGGTACAGGTTTTCCA GCCCTGGATACAGAGGAGAAAACTTTCATATGTTAAACACAAACATGTAATCTTAGGACTTTTGAAACATTTGAAGCAACGTGCATTGGGAAGGCTGCTA ACAGAGAATGGTGAACCTAACATAAAAATTATAGAAAAGTTGTTTGATACAATTGATGAGAATAAGGATGGTGAACTTTCTCACGGTGAATTGAAAGCGC TGGTTGTTGGAATTCAATTTGAGGAGGTTGACCTGGATCATGAAGATGCTGTGACAAAAATAATACAGGACTTTGATGTTTCGGGTAATAATCGTGTTGA TAAAAAGGAATTTATTAGTGGCACTTGTAGATGGCTTCAAAAGGCTAAGGGTTCTCGAGTTGCATCTGGTGATGCTGGTGCACACACAATGAAGTTTTTA AGTGACTTTCACGATGAAACAAGAAGGGAGCATGATCTTCTGGATGTGGGGGGTCACGATGATGAAGTTGATGAGGGTGTTGGAAATGCTGGATGGACTT CCATCAAAGCAGTGCTTCTGCTTGTGCTGGGTTCTCTTATTGCTGCTGCATTTGCTGATCCTCTGGTTGACGCAGTTAATAACTTTTCTAATGCTACAAG TATTCCTGCTTTTTTCATTTCCTTCATTGCTCTGCCTTTGGCAACCAATTCAAGTGAAGCAGTATCAGCAATAATTTTTGCTAGTCGTGATAAAAGGCAA ACTGCCTCACTAACATTTTCGGAGCTATATGGGGCAGTGACAATGAATAATGTGCTTTGCCTATCAGTATTCTTGGCTCTGGTTTATGCAAGGGGGTTAA CATGGGACTTCTCTTCAGAAGTGTTGGTTATTCTGGTTGTCTGCATTGTAATGGGTGGCATTGGCAGTTTCAGGACAACATTCCCTCTATGGACATCTAT AGTGGCTATCCTTCTTTATCCCTTTTCCTTGGCATTGGTCTATGTTCTTGATTATGTATTTGGTTGGTCATAGACCATAGTTTAATGATGCTTTCTATGT TAGTTTGGACTTGTATGGCTCTTGAACTTCTTGGGGTGTATGCTTAGTGTAGTTTCTTTCTGAGATATTGTATGGTGTTGTTGATTCCTAGTTGGGAATG ACATCCATTTGAGACTTTAGATTTTAACTGTGCCATTTTCATGCATTTCATTATTGATTTAATAATGGTTGATCAGGTACAGTTTTGACTCAATTTACCC ACAATTAGAGCTATTTAAATAAATAAATTACAATAAAAAAATAAAAAAATGTGTTGCAATGTTATTTATTGATTTTTATCGTTTAGAACAGAAATTTTGA TAGGATGAGTTTAGCTTGTTTCCAATTGGTCATGGTTTAAATGCATTTTTATGGCACAGTTTGCACATAAAGAGAGTATAACTAATCTATTAAGTGTGAG AGTCTCATGACTTAAGTATTACATTAAGTTTGTTATGTTATCGAATGCAAAATTCCTAATATTACTGTCCTTTTAAGTGTCAGAGTTCATTACGATTTTC ACTTTATCGA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_186301;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_410696

FPKM

• PAB: 13.8
• PNAB: 8
• PS1: 13.7
• PS2: 3.2
• PS3: 9.3
• PW1: 91.7
• PW2: 69.4
• PW3: 20.4

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_410696

• Blastp: Sodium/calcium exchanger NCL1 from Oryza sativa with 65.35% of identity
• Blastx: Sodium/calcium exchanger NCL1 from Oryza sativa with 64.13% of identity
• Eggnog: Calcium-binding EF hand family protein(ENOG410ZVKW)
• Kegg: Link to kegg annotations (4325568)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019443893.1)
• Pfam: EF-hand domain pair (PF13499.5)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;