Ll_transcript_410709

• Id Trinity: TRINITY_DN51609_c2_g1_i13
• Name Transcript: Ll_transcript_410709
• Sequence: GCCACCTATGACTCTACACGAAGACTACTACTCTGTCCACACGGTTCATACGCTCATTCTCCCACTCCCATCCCTCTTCAATTTTCAATATCCATTCACT CCTTTCTTATGACCCCACATTCATAACTGTCACTCAAATCCTTTATTTCCCATTCTCCATTTATACTCAACCAACACTTTCCCCTCACCAATTCCCCAAA CCATGTCTTCTCCTTCTCATTACACTCTCTTCCTCTCTTTCACCCTCTTAATCCTCTGCGCTCACCTCCACGCTCAGGATCTACTCTCAGATGGGGTCCA CAACGCTTCTAACCACACGCTTCTCAGACTCCCTTCAAATGACGTGGAACCTTCTTCCACGTGTGAGCAGACGTATGGATTCTTACCGTGCACCACCACC GTATTGGGAAACACGTTCTTGATAATTGTGTATGGGTTTCTCATGTACACTGCTGCTACGTATTTGTCCGCTGGTAGCGAGCTTTTGCTTGAGATCTTGG GACCTGGCATCGTTGGAGGATTGTTTCTTCCTATTCTCGGTGCTCTTCCAGATGCCATGCTTATTCTCGTATCTGGACTTTCCGGTACTGCTGAGACTGC TCAAAGTCAGGTCTCTGTTGGAATGGGTCTGCTAGCTGGGTCAACAGTTATGCTTCTGACTGTAATATGGGGGACCTGTGTAATTGTTGGCAAGTGTGAC CTTGAAGGTTCAATTGCAATAGATTCGCGTGATACCAGGGGATTTCATTTAACCAGTTCTGGTGTTAGTACTGATATTTGGACAAGTTATGCTGCTAGGA TTATGGTTTTATCTGTCATTCCATTTTTGATCGTTCAGTTACCGCAATTGCTCAGCTCAACTTCAGGAAGGCACTTCGCTATTTTGATTGCTCTTGTTGT CTCCATCTGTTTATTGATTGTGTATTGCCTTTACCAGGTAAATTTCTTTTTATGGTGCAATTGTTTTTCCTTCTGCATTCTGATCTCTTTCTATATCCAA ACACTTCTAGTTTTGTTGATAGTATTTTGTATATATATATGTACATATACATTTCACCAATGAAGAAATGGGTAGTGTAGGACTTCAGTCTTTTGTTATA GTTAGGTTTCTTTTATTTTTTATCATGATTTAATGAAATTAGTTTTAATTGATATCGACCTGCACTGTTGTGCTTAACTCTGATGACACATTCCATGGAT GTTATGGTTAGAACTTTCAGTAGCTGTATTTGGACGAATGTTTATTCTCTATTATTTGGACACCTCGTCAGTCTTTTTATTATTTTAAAAATTGATAAAA ATTTAATAAAAAAATGGTACAGGTTTTCCAGCCCTGGATACAGAGGAGAAAACTTTCATATGTTAAACACAAACATGTAATCTTAGGACTTTTGAAACAT TTGAAGCAACGTGCATTGGGAAGGCTGCTAACAGAGAATGGTGAACCTAACATAAAAATTATAGAAAAGTTGTTTGATACAATTGATGAGAATAAGGATG GTGAACTTTCTCACGGTGAATTGAAAGCGCTGGTTGTTGGAATTCAATTTGAGGAGGTTGACCTGGATCATGAAGATGCTGTGACAAAAATAATACAGGA CTTTGATGTTTCGGGTAATAATCGTGTTGATAAAAAGGAATTTATTAGTGGCACTTGTAGATGGCTTCAAAAGGCTAAGGGTTCTCGAGTTGCATCTGGT GATGCTGGTGCACACACAATGAAGTTTTTAAGTGATTTTCACGATGAAACAAAGAGGGAGCACGATCTTCTTGATGTTGGGGGTGAGAGTGATGAAGTCA TTGAAGGCGTTGGAAATGCTGGGTGGACTACCGTCAAAGCTGTGCTGCTGCTGGTGCTGGGATCTCTTATTGCTGCTGCATTTGCTGATCCTTTGGTTGA TGTAGTTCATAACTTTTCTAATGCTACAAGTATTCCTGCTTTTTTCATTTCCTTCATTGCTCTGCCTTTAGCCACCAATTCAAGTGAAGCAGTGTCGGCA ATAATTTTTGCTAGTCGTGATAAGAGGCAGACTGCCTCACTAACATTTTCCGAGATATATGGGGCAGTGACAATGAACAATGTGCTTTGCCTATCAGTCT TCTTGGCCCTGGTTTACGCGAGGGGTTTGACATGGGACTTCTCTTCGGAAGTGTTAGTTATTCTCGTCGTCTGCGTCGTCATGGGCGCCTTTGCCAGTTT CAGAACCACCTTCCCTCTATGGACATCCATAGTAGCCATCCTCCTTTATCCTTTCTCCTTGGCATTAGTCTATGTTCTTGATTATGTATTTGGTTGGTCA TAGACCATATAACAATGTTTTCTATGTGTTAGTGCCCTGTATGGCTATTACTCTTGGAGTGTGTGTTTATTATAAGTTGTGTTCTAGAGATTGTGTGGTG TTATTGATTCCAAGTTGGGATTGACATGAAATCGAGAATTTGGGATTTTAATTATGCCCTTTTCATGCATTCTTTATTAGTATAGTTTTTTTTGGTATTA TAAATGTATCCCTTCGTCTTTTTAGGTAAGGAACTAATCATTTTGGGGTGTAGTTATTTCTCTAAACAAGTGCCACTTTCAAGAATCGAATATTTGACCT TTTGGTCAATATGGAGATTTCGGAGCCTTACATCACTAGACCAATACTTTACTGGTGAGAATAGGTATTGTTTTGACACAATTTGCT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_186301;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_410709

FPKM

• PAB: 27.8
• PNAB: 20.8
• PS1: 23.4
• PS2: 17.5
• PS3: 38.6
• PW1: 22.6
• PW2: 29.3
• PW3: 19.4

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_410709

• Blastp: Sodium/calcium exchanger NCL1 from Oryza sativa with 65.96% of identity
• Blastx: Sodium/calcium exchanger NCL1 from Oryza sativa with 65.96% of identity
• Eggnog: Calcium-binding EF hand family protein(ENOG410ZVKW)
• Kegg: Link to kegg annotations (4325568)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019443893.1)
• Pfam: EF-hand domain pair (PF13499.5)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;