Ll_transcript_410635

• Id Trinity: TRINITY_DN51617_c0_g1_i12
• Name Transcript: Ll_transcript_410635
• Sequence: CTCAATTCGACAAGTTACAAGCTAACAACCGTAAAACTACAAGCTCATAGCTACACACTACAAGCTCATAGTTACAACCTCGTAGCTATAAGCTATTTTC AAAACAATGTGATAGAATATATCAGAAAAATAATTTTAAAAAATACTAAAAATAACTAACGTAACTTTTATTTAATATATTTTAGTCTCATTTTGAATAA ATGAATTTGATGCAAATATTTTGAGTGGCACAAAATGAATTTTGACTCAAAATGAATATGTAATATTGTAATTTTCTCTTTTGTAGAATTAGGGTTTGTC ACTCTTTACCCTTGCCTTAGCCTCACGCAGTCTACGGCTCTCACACTCACACTTCCCTCTCACACACTTCATCTGCACCGTCCCTCTTCCTCCCCGCCGT TGATTCTCGCTCCGGCCACCTTAATCCGCCGTAGCTGCCACCCCTCCACCTTCTTTCAGATAGTTTAGCATCAAATATTTGTAAAGTCATAAAACACTTG CAAAATGGCACGGAAGGGTTTGATGGAACAAGACCTGAAAAAATTGGATGTCACAAAATTGCATCCACTTTCTCCTGAAGTCATATCTCGGCAAGCTACC ATTAATATTGGCACCATAGGTCATGTGGCACATGGTAAGTCAACAGTTGTGAAAGCAATATCAGGCGTTCAGACTGTACGTTTTAAAAATGAGTTGGAGA GGAATATTACAATCAAGCTTGGCTATGCAAATGCAAAGATATATAAGTGTGAAGATGAACGGTGTCCAAGGCCTCTGTCCTATAAGGCTTATGGGAGTGG AAAGGAAGATGCTCCTATGTGTGATGCACCGGGGTTTGAGAACTGCAAAATGAAATTGCTAAGACATGTTTCTTTTGTAGATTGCCCGGTAATGTCCTAA ACTGTCATTTGGTAGTTAGTGTTTCTTTTCTATACCATAATTTCATCAAATTTTGTATATTGTTTAGGATTTACTTTAATATACCTGCCATTGGCTTTAC ATTGTTTTTGTCCCTTTAAAGTTCAACCCCTCTCCTTAGCATATTCTCTCCCAGTTCTTTTAGCATCATGTACCCAAATGTTTGGATCAAAAACCCATAT TTTATTATGCTCACACAACTTCATTTCCAGGGTATTTCAGACAATTTATATTATTTTGTTTTAAAACATTTATTGTATTTTGCTATACGAGGAAGAAATT GAATAATATTTGAAGAAGAAAAGTTAAATAATTAATGAGTGGGACAAGATGTTAAAAGAGATTTTATTGACATACCAATCAATCATGTGAAGTATATCTG AGTTCTAACATCTAACATTTCATATAATTATTTCAGTACTAAACATTGCACATGATTACAGCTGTGATATATATTTTAAGTTTTTGCATGATTAAATGTT ATCCAGATTATACTCATAGCATGTGTTGCATTTTATTTATGATAAGCAGCAAGCATTGCGTTAACTGAAAAATTGCACTCAGTATATTTAATTTCTAAGA ACATCCAACTATTTTCAGAAAGAAGAAAATATATAACTATAATCAAGGGGCTTTGGTTGTATGAACCGTTCCTTTTGCATTTTAGTAGGAACTAGTTAAA CAACTGTTACCAAGAATTGATTTGTGTTTTAGAATGCCATTTTTAAAACCAGTTTAAAAGATTCTTGTTTGGTTTGTGAAGCAACTAGTATAATCACTGT TAGAATATAAAATCATGATTCATGGATATGTTTTTCAAATATTCTACATGATGCATTTGCTATATGAGGAAGAAGATGAATAGTATTTGAAGAAGAAAAG TTAAGTAATTAATGATGAGACCAGATGCGAAGAGAGAGAAAATACAATAAATGTTTTAAAAATAAAATAATATAATTGTCTGAAATACCCTTGAAATGAA CTTGTGTGAGCATAGTAAAATCTGGGTTTTGGTCCAAATATTTGGGTACACAATGCTAACATGATCCTTCATGAAAACAACTTGACTCATGTTAGTGAAC CTCTATATATGTATAGATATACATATTGTTGGGTGTATACCATTTGACATTTTTTGTTGTCATATGTTGCAAGATTTTCATGTTTCAATGTGTATCTTTA TACTGTTCAGTTAGTTACTGGCCACCAATCCATGTTATATCATTCAATATTTCGATATATATTTAGTATGATTACTTTTACAACTATATGATATCTATTT TTGCTTGTACGATTTCCTTAGGGACATGATATTCTCATGGCTACAATGCTTAATGGAGCAGCAATCATGGACGGAGCTTTGCTACTCATAGCTGCTAATG AGAGTTGCCCACAACCACAAACCTCTGAGCATTTAGCTGCTGTGGAAATTATGCGGCTGCAGCATATAATAATCCTTCAGAACAAGGTAGACCTGATTCA AGAAAATGTGGCAATCAATCAGCATGAAGCAATTCAGAAGTTCATCCAAGGAACTGTTGCTGATGGTGCACCAGTAGTACCTATTTCAGCACAACTGAAG TATAATATTGATGTCGTATGTGAGTATATCGTGAAAAAGATCCCAATTCCTGAAAGGAACTTCATCTCTCCCCCTAATATGATTGTTATTCGGTCATTTG ATGTCAATAAACCTGGGTTTGAGGTTGATGACATAAAAGGAGGTGTAGCTGGTGGAAGCATTCTAAGGGGTGTTTTGAAGGTCAATCAATTCATTGAAGT TCGACCTGGTATAGTTGTTAAAGACGAGAATGGAAATATCAAATGCACGCCCATATACTCTAGAATAGTTTCGCTGTTTGCTGAACAAAATGAGCTTCAG TATGCTGTGCCTGGAGGCCTAATTGGTGTTGGGACAACTATGGATCCCACTTTGACACGTGCTGATAGGTTAGTTGGGCAAGTTCTCGGAGCAGTTGAAT CACTGCCAGAGGTTTTTGTTGAACTTGAGGTAAACTTTTTCTTGCTTAGGCGACTTCTAGGTGTCCGGACAAAAGGCACCGAGAGACAAGGAAAGGTATC GAAACTGGCTAAAGGAGAAATGCTAATGTTGAACATAGGATCAATGTCAACCGGTGCCAGAGTTGTTGCTGTGAAGAATGACCTGGCCAAGTTGCAGCTC ACTTCCCCTGTATGCACCAGCAAGGGTGAAAAGATAGCCCTTAGTCGACGTGTCGAGAAGCACTGGCGTCTTATTGGGTGGGGTCAAATCCAAGCAGGAA TCACTCTTGATGTTCCTAGTGCCCCCTTTTCAGCTGAAGACATAAAAGAATAGACAAACAAGAAACAAGTGCTACAAAATCCTGAGAGGAATTTAGAATG TGGGAAGGGACACATTTGTTGGGAACCATTTTTTTGAGGTGGAGAAGAAAATGTTTGGATTGTCCAATTTTTTGTTTTACATTGTTATTTGGTTTTTGTC TCTGTCTACTATATAAGTTGTATCTTATGTCGATTGAGTTTAGGTTGGAGTAAGAATATGAATGAGTATTTATTACTTTCCATGATCACATTACTCACCA ATAAACTTTACTGGTCCTGCATATTTTATGGTATTCTTTATTTTAAACATTATATCCCCAAACAGTTGTGAAGCTTTTCATGTCTCCCTATTGTTCTACA GATAGAAATTGGATGTCTGAGATTGATGTACGTGAATAGCTTGGGGCTGGTTTACTACGAAGTTTTATTTGGAACTTCACTCTTTTAGGGTAGTGTTTAT GGTTGGCAAATGGATTATTT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_186360;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_410635

FPKM

• PAB: 0.2
• PNAB: 0.4
• PS1: 0.1
• PS2: 0.3
• PS3: 0.3
• PW1: 0
• PW2: 0
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_410635

• Blastp: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3 from Bos with 74.38% of identity
• Blastx: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3 from Bos with 74.77% of identity
• Eggnog: translation initiation factor(COG5257)
• Kegg: Link to kegg annotations (512350)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019433374.1)
• Pfam: Elongation factor Tu GTP binding domain (PF00009.26)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;