Ll_transcript_410628

Id TrinityTRINITY_DN51617_c0_g1_i5
Name TranscriptLl_transcript_410628
SequenceCTCAATTCGACAAGTTACAAGCTAACAACCGTAAAACTACAAGCTCATAGCTACACACTACAAGCTCATAGTTACAACCTCGTAGCTATAAGCTATTTTC AAAACAATGTGATAGAATATATCAGAAAAATAATTTTAAAAAATACTAAAAATAACTAACGTAACTTTTATTTAATATATTTTAGTCTCATTTTGAATAA ATGAATTTGATGCAAATATTTTGAGTGGCACAAAATGAATTTTGACTCAAAATGAATATGTAATATTGTAATTTTCTCTTTTGTAGAATTAGGGTTTGTC ACTCTTTACCCTTGCCTTAGCCTCACGCAGTCTACGGCTCTCACACTCACACTTCCCTCTCACACACTTCATCTGCACCGTCCCTCTTCCTCCCCGCCGT TGATTCTCGCTCCGGCCACCTTAATCCGCCGTAGCTGCCACCCCTCCACCTTCTTTCAGATAGTTTAGCATCAAATATTTGTAAAGTCATAAAACACTTG CAAAATGGCACGGAAGGGTTTGATGGAACAAGACCTGAAAAAATTGGATGTCACAAAATTGCATCCACTTTCTCCTGAAGTCATATCTCGGCAAGCTACC ATTAATATTGGCACCATAGGTCATGTGGCACATGGTAAGTCAACAGTTGTGAAAGCAATATCAGGCGTTCAGACTGTACGTTTTAAAAATGAGTTGGAGA GGAATATTACAATCAAGCTTGGCTATGCAAATGCAAAGATATATAAGTGTGAAGATGAACGGTGTCCAAGGCCTCTGTCCTATAAGGCTTATGGGAGTGG AAAGGAAGATGCTCCTATGTGTGATGCACCGGGGTTTGAGAACTGCAAAATGAAATTGCTAAGACATGTTTCTTTTGTAGATTGCCCGGTAATGTCCTAA ACTGTCATTTGGTAGTTAGTGTTTCTTTTCTATACCATAATTTCATCAAATTTTGTATATTGTTTAGGATTTACTTTAATATACCTGCCATTGGCTTTAC ATTGTTTTTGTCCCTTTAAAGTTCAACCCCTCTCCTTAGCATATTCTCTCCCAGTTCTTTTAGCATCATGTACCCAAATGTTTGGATCAAAAACCCATAT TTTATTATGCTCACACAACTTCATTTCCAGGGTATTTCAGACAATTTATATTATTTTGTTTTAAAACATTTATTGTATTTTGCTATACGAGGAAGAAATT GAATAATATTTGAAGAAGAAAAGTTAAATAATTAATGAGTGGGACAAGATGTTAAAAGAGATTTTATTGACATACCAATCAATCATGTGAAGTATATCTG AGTTCTAACATCTAACATTTCATATAATTATTTCAGTACTAAACATTGCACATGATTACAGCTGTGATATATATTTTAAGTTTTTGCATGATTAAATGTT ATCCAGATTATACTCATAGCATGTGTTGCATTTTATTTATGATAAGCAGCAAGCATTGCGTTAACTGAAAAATTGCACTCAGTATATTTAATTTCTAAGA ACATCCAACTATTTTCAGAAAGAAGAAAATATATAACTATAATCAAGGGGCTTTGGTTGTATGAACCGTTCCTTTTGCATTTTAGTAGGAACTAGTTAAA CAACTGTTACCAAGAATTGATTTGTGTTTTAGAATGCCATTTTTAAAACCAGTTTAAAAGATTCTTGTTTGGTTTGTGAAGCAACTAGTATAATCACTGT TAGAATATAAAATCATGATTCATGGATATGTTTTTCAAATATTCTACATGATGCATTTGCTATATGAGGAAGAAGATGAATAGTATTTGAAGAAGAAAAG TTAAGTAATTAATGATGAGACCAGATGCGAAGAGAGAGAAAATACAATAAATGTTTTAAAAATAAAATAATATAATTGTCTGAAATACCCTTGAAATGAA CTTGTGTGAGCATAGTAAAATCTGGGTTTTGGTCCAAATATTTGGGTACACAATGCTAACATGATCCTTCATGAAAACAACTTGACTCATGTTAGTGAAC CTCTATATATGTATAGATATACATATTGTTGGGTGTATACCATTTGACATTTTTTGTTGTCATATGTTGCAAGATTTTCATGTTTCAATGTGTATCTTTA TACTGTTCAGTTAGTTACTGGCCACCAATCCATGTTATATCATTCAATATTTCGATATATATTTAGTATGATTACTTTTACAACTATATGATATCTATTT TTGCTTGTACGATTTCCTTAGGGACATGATATTCTCATGGCTACAATGCTTAATGGAGCAGCAATCATGGACGGAGCTTTGCTACTCATAGCTGCTAATG AGAGTTGCCCACAACCACAAACCTCTGAGCATTTAGCTGCTGTGGAAATTATGCGGCTGCAGCATATAATAATCCTTCAGAACAAGGTAGACCTGATTCA AGAAAATGTGGCAATCAATCAGCATGAAGCAATTCAGAAGTTCATCCAAGGAACTGTTGCTGATGGTGCACCAGTAGTACCTATTTCAGCACAACTGAAG TATAATATTGATGTCGTATGTGAGTATATCGTGAAAAAGATCCCAATTCCTGAAAGGAACTTCATCTCTCCCCCTAATATGATTGTTATTCGGTCATTTG ATGTCAATAAACCTGGGTTTGAGGTTGATGATATTAAAGGAGGTGTAGCTGGTGGAAGCATTCTAAGGGGTGTTTTGAAGGTCAATCAATTCATTGAAGT TCGACCTGGTATAGTTGTTAAAGACGAGGTTGGAAATATCAAATGCACACCCATATACTCTAGAATAGTTTCACTGTTTGCTGAACAAAATGAGCTTCAG TTTGCTGTGCCTGGAGGGTTAATTGGTGTTGGGACAACGATGGATCCCACTTTGACACGGGCTGATAGGTTAGTTGGGCAAGTTCTTGGAGCGGTTGGAT CATTGCCTGAGGTTTTTGTTGAGCTTGAGGTAGGTGGCCATGTCTAACTGTTTATTAATTTATGTGCATCTACCATAAAATTTGGGTTGTCAATCACCTT GCTATGTTTTGGAGTTCATAAGTGTGGATAAAGAGCTTACTTTTCATGATATCTATATCCACCACTTTTCACAATATGGTCTTGCAGGTAAACTTTTTCT TGCTTCGGCGGCTTCTAGGTGTCCGGACAAAAGGCACCGAGAGACAGGGAAAGGTATCTAAACTGGCTAAAGGAGAGATGCTAATGTTGAACATTGGATC AATGTCAACTGGGGCCAGAGTTGTTGCTGTGAAGAATGATTTGGCCAAGTTGCAACTTACTTCCCCTGTATGCACTAGCAAGGGCGAGAAGATCGCGCTT AGTCGACGTGTTGAGAAGCACTGGCGTCTTATTGGGTGGGGTCAAATCCAAGCAGGAATCACTCTAGATGTTCCTAGTGCCCCCTTTTCAGTTGCAGACA TAGTAGAATAGACAAAGAAGAAACCCTTGTTACAAAATTGAGAGAGGAATTTAGAGATGTGGGAAGGGAGACAATTGTTGGGAACCATTTTTTTGAGGTG GAGAAGAAAACGTTTGGTTTGTCCAATTTTTGTTCTACATTATTTGGTTTTTATCCCTGTCTACTTACTATATAAGTTTTATCTTAATGTCGATTGAGTT TAGGTTGGGGTGAGCATATCAACGAGTACGTGTTGATTTCAATGGTTACACAGTAAGCGTTACTGTTCAGGCATATATGATGCATTCCTTACTCCTTTTT GAACAGTGCTTGAAGCTCTTCTTGTGATGAATGTGTTGTGACTGTTCTAGTATAGGTAAAGATGAGATTACAGAAAGGTTTATGCAATGTTAAGTAATGG GATGCAGACATTAAATTGAAAGAGTATGATTGCATATAATATATGAAAATAAAGAATCTCAGATAAAA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_186360; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_410628

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_410628

BlastpEukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3 from Sophophora with 75.85% of identity
BlastxEukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3 from Sophophora with 76.35% of identity
Eggnogtranslation initiation factor(COG5257)
KeggLink to kegg annotations (Dmel_CG43665)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019461644.1)
PfamElongation factor Tu GTP binding domain (PF00009.26)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;