Id Trinity | TRINITY_DN51668_c7_g1_i12 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_410794 |
Sequence | ATTGATTTGTGATACCTTTTAAGATACCATTTGGACATGTGATCCCAATCTATCATTTCCCTCTTATAAATACGGCTTCAAAAACCTTTGCTAACAATCA TAATATCACACACATCTTTTTCTTGTCACCATAGCTTAAATTAATAATGTCCAACCAAAACTCTCTACCCCTCTATGAAAAACATTGGTACAAACATAAT TTCAAACGGGTAATGGATGTGCTGATTTTGTTCCTCCTCTTATTGCTTCTTTGTTACCGCGTTACCTCTGTTAATAACTACTCTATCCCTTGGTTTGTTG CATTGGTATGTGAATCATGGTTCACCTTTTCTTGGATTTTCATTTTCACAACTCAATGGACTCCTGCAATAGTTAAAACCTACCCAGATCGTCTCTTACA TAGTGTGCAAGAGCTTCCACGTGTGGATTTATTTGTGACAACAGCAGATGATGTGCTAGAACCACCAATAATCACAGTGAACACTGTTCTGTCTCTGTTA GCACTTGACTACCCAGCTGAGAAGCTAGCTTGTTATGTTTCTGATGATGGCTTTTCCCCTCTCACCTTCCACGCTCTTCAACAAGCCTCACATTTTGCAA AGCTTTGGATCCCCTTTTGTAAGAAGTACCATGTGCAAATTAGAGCTCCATTCAGGTTCTTCTGTGACCAGAATGGGGCCTCCTCGTACCAAAACACAAC ACCAAAATTTAGAGAGGAATGGTTATGGATGAAAGTAAGTGTTTGACATATATATAAAGTTGAAATAAAAAAACCCTCATATCAAATTAGCTAACTGAAA TTTGTCAGAGCTAGATGATATTAGTAATCGGTTCTGAAGTCATAAATGGCATTTTCATTTTGGAAATGAGTCATAAGCTAATTTGTTAAGATGGTATGTC ATTTACAACTATATAAATTTTTATAGTGATTTATATTCTATCAATTAATTGAAACTAATGATTTATTATCCTATAAAATCATCATAGATTCCATCTTAAA GACAAGAAAGAGACATGTGAGGAATTAATTATTATAAACACTAACAAGAAAATACTAACAAGACATTGATATGTAAAGCTCAACTAGATCCTAAAAGTCA AGTGTTTTATGTGAATAATATTTGTTAAGAGGGTTAACCACAAACCTAAAAAAAGATTAGTTCCCTACCGTACCAAAAAACTAACCATTTATGGGGAGGA TCAATTTGTTATAAGAGTAGGTTTAAAATATTTACTTCTCATCTTAGGCATCAATTCTAGAAAAGTTTGAATTAGTGATAGATTCAAACAATTCAATTTT TAATGAATTGATGACTAAAATAAGAAGTAAGTCTAAAAAGACTTACTCTTGGAATAAATTGATCACTACCCATTATTTATAGAATTTATAAACTAATGTA ATGTTTTAAGAGAATATGTTATTTTTCTTTAAAAGTAAGAGTAACAAAATTAGGCATAAGTGACATGTGATTTGAGTTGGCAGGAGAAGTATGATAATCT TTGCCACAAAATAGAAGAGGCGTCCCATAAATCAATTCCTTGGCAACTTGATGGAGAATTTGCTGTATTTTCAAACAGTGACCGCAAAAATCATCCAACC ATTATACGGGTAACTACTGAATTCACAATTTCTTTGCATTTTGTGTTCAACCAGAGACTCTTTTATATCTTTGTTAAATCCATCCTTAGGTAGTTTTACA AATATATATTTTTGACAGTTCTAATAATATCCAGCCTTATGCCAATTTTAGCATTTTTTAATTTTTGAAATTTTTTAATAATAGAAGAGCCTTATGGGAT TGTTAATAACTGAACTAAGGATCGTTTAAGGTAGAGAAAAGAGGGGTTATCTTAAAAATAATAATTGCAGTCCTATAAAAACTAGTGAATGATTATCTTA ATATTCAATTACATTCCACCTTATTCCTCAATATGTATATCTATTACAAATCTATATCTATACTTTTATACTATTAATAAAGAGAAAACATAAAATAACA ACTTCACTGTCATTGTGTAGTTTGTGTTTTCCTATTTTGTCATTAATATTTTCTTATTTGTACCAAAAAACCATATAACATTATATTTTTATTTTATTCT TATTTGTACCAAAAAACCATATAACATTATATTTTTATTTTATTCTCATTATCTTCTTATTTTTAAAGTATATTTAAAAAATTGAATATTACATCAACCG AATAAATTCAACTGCAAATTACATGTTATACACATGAGAAAGCGGGTTGATAGACACGTTACAAGCAATAGGAAAATGAATTGACAGATACAACGATGCA TGTCAATACGATAGTCTATTATAAACCTAAAACATGGTGTAACTACCTATTATGGAGTAATTTGTAGTTTCCATTTTTGTCCTTGCATTTTTCATTTTCT ACAATATATATAATCCAATACTCATATTCCCACTACAAATTCTATGTTATTTTCTTAATTTTACGGTATTCTTATTTTTAATACTTAATATCATAAAATA ATAAAGCGACTGAGTTATTTCCCTAGAAGAGGACCAAAACTCTACGAAAGTTAAATATTAAGTTGATGAATCCTAAATCCCCACTCTTCCTACATGAGCA TTTCATAATAGGTATAGAATACTATAATGAATGCATTTTTTTATATTATATTCTCGTTTAAGGAGAGTTTAGATTTATCCATTTACAAAGTATCATAACT AATCATTCATGAAGTATCCACAAACTAGTAATAATAATGGGAAAAAAATCATATTTGACATTGCTCACATTGTGAATTTGGAAGGTTATATGGGACAAGA ATGAAGGGCTTTTTGATGGGTTGCCACATTTGATCTACATATCTAGAGAGAAGAGATCAAACCACCCACATCATTTCAAAGCTGGTGCCATGAATGTGTT GACAAGAGTCTCTGGATTGATAACCAATGCTCCATTCATGCTGAACGTGGATTGTGACATGTATGTAAATAACCCAAACATTATTCAGCATGCAATGTGC ATTTTGCTTGATTCCATTGGAGACAAAGAAGTTGCATTTGTTCAATGCCCCCAACAATTTTATGGTGGACTTAAGGACGACCCTTTTGATAATCAAATGG TGGTTATGTTTAAGTACATTGGGGCTGGACTAGCAGGACTCCAAGGACCTTTCTATGGGGGAACAAATTGCTTCCATAGAAGAAAAGTTATCTATGGACT TTCTCCATATAACATAGAAAAGGGAAATATTATATCAGAGAAGGAGTTAAAACAAAAATTTGGAGGTTCAGAGGAGCTTGTGAAATCAGTTGCTGATGCT TTGGAAGGAAGAAGTTATTCACCTCATGATGATATCAATGTTTCCAACACTCTTGAGGCAGCAAGTGAAGTTGCTAGTTGTGGTTATGAATATGCAAATG GCTGGGGCCAACAGGTCTGCAAGAGAAACATAACATATGTTAGGTTACCTAAAGCAATATTATTCTATATTTATAGTTTTGGAATAACATGCATCAAAAC TCATTTACTAACTAATATGTATAAAATAACATAAATTCCTAGCTTATAAACTATAGGCCCCTCAAGTAATTTATTACATACAATTTAATAAAATAACATC AAAACTCATTTAAGTGATTTTATTTTCAATGTAATAAAATTGAAAATGAAAGTTGGCTTGGTTGTTTGTGAAATGAAGGTAGGTTGGATATATGGATCAA TAACAGAGGATGTCCAAACAGGGCTTACAATACATAGAAAGGGTTGGAGATCAGAAATGTGTACACCAAACCCAATTGGATTCACAGGATGTGCTCCAAT AGGATTACCAACTGCAATGACCCAACAAAAGAGATGGGTCACAGGAATGGTTGAGATTTTCTTTAGCAGACATTGTCCTATTCTTGCAACCCTTTTTGGT AATCTTCCATTTAGGATGTTCTTGGCGTATATGTGGATCATTGATTGGGGCTTGCGCTCTCTCCCTCAAACTTGCTATGTCTCTCTCCTTACATATTGCA TCATTACTAACTCCAATTTCTTGCCTAAGGTATGCATTATATAATACAGCAAATATTATTTACTCCATGTTATATATACTATCCAATACTTAATTCTCAA TCAAACCTTTAAACCCAACAAGATATTGATTCAATGATGTAAGGTCTTACTAGATTCTCAGAAGTCTTATTGTAAGGGACAATCAGACAATCCAAAAGAA ATTATTCCTTATCCATAAGGTGATCAAATATAATTGGTTATCTAATAACAAATTTCAAAAGTCTAAAAGGGTAAGAAATATATGTTGAGATCAACTTGTA TGATTAAACTCTAAGATATATTGTGGAAAAACTACAATATCTCACACTCTCACTTAATGTCAAAGTTTTGTTTTTAGTCTAAAAATCTAAGCCTCAAGTT TTCTCTATATAACCCATAGGTGAACTTTATATTAGTATTTCTTATTTCCTATATCTAAGAAATAACATATATCAATATAGATAAGTATAGATATAGAGGT TGACCTTGTATTTTTTCTTTTTAATCCAGGGATGGGGTCTATGGATTCATGTAACTATTTTCACAATTCACACGGTTTGTACTTTATCAGAGTACTTGGC AACAGGTCTATCAATCAGAGCATGGTGGAACAATCAAAGGATGTCAAGAATAAGAACAACAAGTGCTGGGTTTTTAGGATTTTTGAGTGCTTTATTTAAG CTGCTTAGGATATCAGACACTGTTTTTGATATAACAAGGAAAGATGAAAACCCTTTTGGGAATGGTATACATGACTCAGATGCTGGAAGATTTACATTCA ATGAGTCACCAGTGTTTGTACCTGCTACTACCATTTTGCTATCGCAGTTGATAGCACTGTCTATGAAGTTGTTGGGGTTGCAACCAATTAAGAGTGGGAA TAATGAGTGTGGGATAGGTGAGTTGTTGTGTAGTGCATATTTGGTAATATGTTATTGGCCTTTTTTGAGAGGGTTATTTCAAAGGGGTAAATATGGGATT CCATTATCTACAATATGCAAGTCAGCATCTCTGGCTTTTCTATTTGTGCACTTATGTAAAAGGACCATTGAGAGTTGATGTACTCTTTGAAACCAGAAAC AAGACAAGTCTTGATTATACCAAGTGAAAATATATAGTTTCTTGAAATTCAATATTACAATATATTAGGTTGTTAAGTTTCTTGAAATTCAATTTTGTTT TGTCACCACATTCACTCATTAATACAATATATGAAGTTTCTTGAAAAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_186727; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_410794
Blastp | Cellulose synthase-like protein H1 from Oryza sativa with 52.84% of identity |
---|---|
Blastx | Cellulose synthase-like protein H1 from Oryza sativa with 53.95% of identity |
Eggnog | Glycosyl transferase, family 2(COG1215) |
Kegg | Link to kegg annotations (4348359) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019453798.1) |
Pfam | Cellulose synthase (PF03552.13) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |