Id Trinity | TRINITY_DN51670_c0_g1_i12 |
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Name Transcript | Ll_transcript_408111 |
Sequence | CGATACTCTACGCCTTTGACCAACCAATGAATTCTACTCTAATCGTCACCACGACGGTGCAAATGCCGTTTCTCAAATCGCTCAACCGCCACATCACCGC ACCTCCTCACAACCTCCTCCTCCTCCGCCGCAACAACCTCAAATACGTTGTTGCTTCTTATAACAACAGCTCTCACTGCATTTCCACCTCCTTCGCTTCT GCTCCATCGTCACGCTCGCTCTGTGCTTTCAGTTCACTTCTCCGACGAACGCCGTTCCTTCTGCGGTGTGTTTCAAGCTCCGACGCTTCCTTTGCTTCTT CAGCCGGCGGAGGAAATTCTGGCGGTGGAGTTTCCGGCGGAAGTGGTGGAGGTGGTGGTGGTTCTGGCGGGGATTATGGAGATGGTAGTGGTAAATTGGT TGTAGACGCGGCGGTTCAGGATCTTTCAGAAGTTTCAGCGGACGTTATTATTTTAGATGTTTCGGTGTGTGAAACTCTTCTTTCTCTGCGAAGTTTCATT GTGTTATTCTTTTTCTTCTTCGTTAATACAGTATAGTTTTTTGTTTCTGTGCGTGTGTATGATAGGGAATGGTGTGTGGTGGATGTGCAGCGAATGTGAA AAGGATCCTGGAAAGTCAAGTAAGTTGTTCAAATTTTGTATTTGATTTGATTTGATTTAGATGCTTCAATTACTAAGATGATAGGGGTTCTTATAGGTTC AATTTAATGTTGATGATGTTCTGCTAACTTGCTAAGTTTATATTGTTAGTTATTGAAACTGGATAATTATGAGCTCACCATATTTTTATAATTTCCTTAA GCCTGTGGATGTTCTTGGAGAAAATTAGCAACCGAGGTGAAAAAGTTATGCTGAGAGATTTAAAGGGAATGTGGTAGTTTACTGTCTGGGAAGTGGGAAT TCTTAATTTGAATTTGCTCTTTTATACATATGGATTCCAGAAAATGAAAAACAGTCGAACAAAGAAATTATTTGCGGGGAAGGGTAAAATTGGCATTCTA GTTTGGTTCCATGCCATCTTTTCTGATAAAAATAAGATGTAATAAAGGAAAAAAATCAATGAAAGAAATATGAGGTAAACAAAGTTTATATCTTCTTTAG ATGTGTGAGCATATATAGTTTTATTTTTAACTTTTCAGTAATATAAATCATGGTTCTTTAATTTTATGTCGATGGACAGCCACAAGTATCATCGGCTAGT GTAAATCTAACAACAGAGACAGCAATAGTTTGGCCTGTATCTGAAGCAAAGACTGCACCAAATTGGAAAAAGCAATTAGGAGAGGAACTTGCACAGCATT TAACTGGCTGTGGTTTTAATTCTAGCCTTCGAGGTATATTTTCAAGTTCATCAACAAACCACTTTTTTTGTTAAAAGAAGTTCAGGGGGTGTAAGGTAGG TTAGGTCAAGCATGCAACAGATGAGGACATATCATGACCCTTGCTGGTGACCTTCCAATGAAGGATAGGCATGAGGGCTTAGGAGTTGAACCATATAAAT ACCTTTGATTGAGTCAACACGGTGTACTCATTCCAGTTGAGCCAACCACCATTGGCTCAACACAGTGGCTTTTACCTTTAATATGCTACCTGCATAATTT TTATAACAAATGTCTGTTTTGGTTGATTATTCTTCTTTTCCATCCTTTTTATTATGTTATCTGTTTGCACTAATGCCCATCCGATCTTAGCAATTGCACT TCTTTTACTGTTTGAGTTGTTAAAGTAAATTGGTTGTTTAATGGTTATAGTGCAAGCGTATTATGTAGAAAACTTCAATTGGGAACAACAAAAACAACTC CCTTTCTGAAGTAGGATTCTTAAGCATGGAGATACCTTTGAATTGTCAGATGGATGTAACTTATGAGCTTAGATGTTATCTATGTTTTGGAGTTCATTGA TTTACATGAAGCTGGGTGGGTTAAGTGGCAGGTGATGAAGATAGCAACTGAAGCAGTTATTTCATTCACCATATAAATGCACTAGAGTGGTTGTTTGGAG TTGATGGAGGTGAGTATCTGTGATCTGTGGCTTCTTGTGGTGGGTAGGAGAGACATCTGTGTTCAGGCGACCTTGCATGTTGAAGAGTTTGCTGATGTTG AATCTGAAAGTAGCAATCCTTTAGTTTTGAAGATTTTTGAGGACTCTTATGAATTGAAATTCAGTAAGAGACAATTTCTTCCAAATTTTTCAAAGGAAGA TGGAGGAAAAGCGTAAACAATTAAGAGAAAGTGGTCGCGAGCTAGCTGTTTCTTGGGCCCTATGCACTGTCTGTCTTGTTGGCCATCTCTCTCATTTCTT TGCAGCAAAGGCACCATGGATCCATGCATTTCATTCCACTGGATTTCATATGTCATTGTCATTGTTTACATTGCTTGGTCCTGGCCGTCAACTTATCCTT GATGGTTTGAAAAGTCTTCTTAAAAGGGCTCCAAACATGAACACCTTAGTTGCTCTTGGGGCTTTATCATCATTTACAGTCAGTTCATTTGCTGCATTTC TGCCAAAATTGGGTTGGAAGGCTTTCTTCGAGGAACCAATTATGTTAATTGCATTTGTCTTGTTAGGAAGGAATCTTGAACAGAGAGCTAAAATTAAAGC AACCAGTGATATGACAGGACTTCTTAGTATGCTTCCATCAAAAGCTCGCCTTCTAGTTAACAATGGGGAATCAGAAGTTGGCACAATTGTTGAAGTTCCA TCGGACAGTCTTTCTGTTGGAGATCAGATTATTGTGTTACCTGGAGACCGTATTCCAGCAGATGGAGTTGTCCGAGCTGGTAGAAGCACTGTAGATGAAT CAAGTTTCACTGGGGAGCCACTTCCTGTAACAAAACTACCCGGGAGTGAGGTTGCAGCTGGAAGTATAAATCTGAATGGAACTCTTACAATGGAAGTGCG GAGACCAGGTGGTGAAACTGCCATGGGGGACATTGTCCGTCTAGTTGAGGAAGCACAGAGTAGGGAAACTCCAGTACAACGGTTGGCTGACAAGGTAGCT GGACACTTCACTTATGGAGTGATGGCAGTCTCTTTTACCACATTTACATTCTGGAGTCTGTTTGGCACACACATTTTACCCGCTTCTCTGTACCAAGGAA GTGCTGTTTCACTGGCTTTGCAGCTTGCTTGCAGTGTTCTGGTTATTGCTTGTCCATGTGCACTTGGGTTAGCCACACCTACTGCCGTGCTGGTTGGAAC TTCTTTGGGAGCTACAAAAGGATTACTTTTGCGTGGTGGAAACATTTTAGAGAAGTTTGCCATGGTAAAAACTGTTGTGTTTGATAAAACAGGGACCCTG ACGGTTGGTAGACCTGTTGTAACAAAGATTCTCTCTCCTACATGCAGACAAAATGCAAATTCAAGTCAAACTGAAGAAACTACTTGGTCTGATGTTGAAA TCCTGAGGTTAGCAGCTGCAGTAGAATCAAGTTCAGTACATCCAGTTGGAAAAGCGATTGTTGATGCTGCTCAGGAACTTAATTGTCATAATGCCAAGGT AGCAGATGGTTCATTCCTGGAAGAACCTGGATCTGGTGCAGTTGCAACCATTGATAACAAAAAGGTTTCTGTTGGGACATGGGAATGGATCACCAGGCAT GGAATTAAAGGCAGTATCCAGCAAGAAGTGGAGGAGTGTAAAAACCAATCTGTTGTCTATGTTGGAGTTAATGATACTCTAGCTGGCCTAATTTATACTG AAGATGAGATAAGGGAAGATGCAAGACATGTTGTTGACACATTGTCTAAGCAAAATATTGATGTATACATGCTGTCTGGAGACAAAAGGAATGCAGCTGA ATATGTTGCATCTCGTGTTGGAATTCCAAAAGAGAAGGTGCTATCTGGAGTGAAACCAGATGAGAAAAAGAAGTTCATAAATGAGCTACAGAAGGATCAG AACATTGTAGCCATGGTTGGTGATGGAATTAATGATGCAGCTGCTCTGGCTTCTTCACATATTGGCATTGCATTAGGTGGAGGTGTTGGGGCTGCTAGTG AGGTGTCTTCAATTGTATTGATGCGCAACCAGCTCTCACAGCTACTTGATGCTTTGGAGCTTAGCAGGCTAACCATGAATACTGTAAAACAAAATCTTTG GTGGGCTTTCATTTACAACATCGTAGGGATTCCAATTGCAGCTGGAGTTTTATTTCCTGTAAATGGGACCATGCTGACTCCATCAATTGCAGGTGCTCTA ATGGGGTTGAGTTCCATTGGTGTAATGTCTAACTCATTGCTTTTAAGATTCAAATTTTCCTCAAAGCAGAAACAAATGCATGCCACATTCCCAAATATCA AAATCAAGGTGGATTCTGATTTGCCACGCCGAAACCAGAAAATAAAATATTCAAGTTAGATGTTAGATGGAGGCACATAATAACACAACATAAGTCAAGT ACACCTTGGCAGGAGTATGAACTTCAAAGAGAAATTTAATGTATAGAAATCAAAGAATCACACTATATGTGATGGGGAACTTCAAAGAGGAATTGTATGA ACTTTATTTTTTCCGAGAACTCCATATTTCCACTATTAATTTGTGTCTAGTTCTTTCAACTTCACTGCATTGTGTATTGAAAATTTTATGTGGGTTTTAC TCGCTTGAAAAATATGTATCCAGACTGTAGCTTTTTATATTTACAAACAAGGTTATTTATAAATCATTTGTCAGCAAATTCTGGTTTAATCAATCCTCAT AAGTAAACATGAAC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_186739; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_408111
Blastp | Copper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic from Arabidopsis with 70.54% of identity |
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Blastx | Copper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic from Arabidopsis with 70.11% of identity |
Eggnog | p-type ATPase(COG2217) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT4G33520) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019461308.1) |
Pfam | E1-E2 ATPase (PF00122.19) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |