Id Trinity | TRINITY_DN51670_c0_g1_i13 |
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Name Transcript | Ll_transcript_408112 |
Sequence | CGATACTCTACGCCTTTGACCAACCAATGAATTCTACTCTAATCGTCACCACGACGGTGCAAATGCCGTTTCTCAAATCGCTCAACCGCCACATCACCGC ACCTCCTCACAACCTCCTCCTCCTCCGCCGCAACAACCTCAAATACGTTGTTGCTTCTTATAACAACAGCTCTCACTGCATTTCCACCTCCTTCGCTTCT GCTCCATCGTCACGCTCGCTCTGTGCTTTCAGTTCACTTCTCCGACGAACGCCGTTCCTTCTGCGGTGTGTTTCAAGCTCCGACGCTTCCTTTGCTTCTT CAGCCGGCGGAGGAAATTCTGGCGGTGGAGTTTCCGGCGGAAGTGGTGGAGGTGGTGGTGGTTCTGGCGGGGATTATGGAGATGGTAGTGGTAAATTGGT TGTAGACGCGGCGGTTCAGGATCTTTCAGAAGTTTCAGCGGACGTTATTATTTTAGATGTTTCGGGAATGGTGTGTGGTGGATGTGCAGCGAATGTGAAA AGGATCCTGGAAAGTCAAGTAAGTTGTTCAAATTTTGTATTTGATTTGATTTGATTTAGATGCTTCAATTACTAAGATGATAGGGGTTCTTATAGGTTCA ATTTAATGTTGATGATGTTCTGCTAACTTGCTAAGTTTATATTGTTAGTTATTGAAACTGGATAATTATGAGCTCACCATATTTTTATAATTTCCTTAAG CCTGTGGATGTTCTTGGAGAAAATTAGCAACCGAGGTGAAAAAGTTATGCTGAGAGATTTAAAGGGAATGTGGTAGTTTACTGTCTGGGAAGTGGGAATT CTTAATTTGAATTTGCTCTTTTATACATATGGATTCCAGAAAATGAAAAACAGTCGAACAAAGAAATTATTTGCGGGGAAGGGTAAAATTGGCATTCTAG TTTGGTTCCATGCCATCTTTTCTGATAAAAATAAGATGTAATAAAGGAAAAAAATCAATGAAAGAAATATGAGGTAAACAAAGTTTATATCTTCTTTAGA TGTGTGAGCATATATAGTTTTATTTTTAACTTTTCAGTAATATAAATCATGGTTCTTTAATTTTATGTCGATGGACAGCCACAAGTATCATCGGCTAGTG TAAATCTAACAACAGAGACAGCAATAGTTTGGCCTGTATCTGAAGCAAAGACTGCACCAAATTGGAAAAAGCAATTAGGAGAGGAACTTGCACAGCATTT AACTGGCTGTGGTTTTAATTCTAGCCTTCGAGGTATATTTTCAAGTTCATCAACAAACCACTTTTTTTGTTAAAAGAAGTTCAGGGGGTGTAAGGTAGGT TAGGTCAAGCATGCAACAGATGAGGACATATCATGACCCTTGCTGGTGACCTTCCAATGAAGGATAGGCATGAGGGCTTAGGAGTTGAACCATATAAATA CCTTTGATTGAGTCAACACGGTGTACTCATTCCAGTTGAGCCAACCACCATTGGCTCAACACAGTGGCTTTTACCTTTAATATGCTACCTGCATAATTTT TATAACAAATGTCTGTTTTGGTTGATTATTCTTCTTTTCCATCCTTTTTATTATGTTATCTGTTTGCACTAATGCCCATCCGATCTTAGCAATTGCACTT CTTTTACTGTTTGAGTTGTTAAAGTAAATTGGTTGTTTAATGGTTATAGTGCAAGCGTATTATGTAGAAAACTTCAATTGGGAACAACAAAAACAACTCC CTTTCTGAAGTAGGATTCTTAAGCATGGAGATACCTTTGAATTGTCAGATGGATGTAACTTATGAGCTTAGATGTTATCTATGTTTTGGAGTTCATTGAT TTACATGAAGCTGGGTGGGTTAAGTGGCAGGTGATGAAGATAGCAACTGAAGCAGTTATTTCATTCACCATATAAATGCACTAGAGTGGTTGTTTGGAGT TGATGGAGGTGAGTATCTGTGATCTGTGGCTTCTTGTGGTGGGTAGGAGAGACATCTGTGTTCAGGCGACCTTGCATGTTGAAGAGTTTGCTGATGTTGA ATCTGAAAGTAGCAATCCTTTAGTTTTGAAGATTTTTGAGGACTCTTATGAATTGAAATTCAGTAAGAGACAATTTCTTCCAAATTTTTCAAAGGAAGAT GGAGGAAAAGCGTAAACAATTAAGAGAAAGTGGTCGCGAGCTAGCTGTTTCTTGGGCCCTATGCACTGTCTGTCTTGTTGGCCATCTCTCTCATTTCTTT GCAGCAAAGGCACCATGGATCCATGCATTTCATTCCACTGGATTTCATATGTCATTGTCATTGTTTACATTGCTTGGTCCTGGCCGTCAACTTATCCTTG ATGGTTTGAAAAGTCTTCTTAAAAGGGCTCCAAACATGAACACCTTAGTTGCTCTTGGGGCTTTATCATCATTTACAGTCAGTTCATTTGCTGCATTTCT GCCAAAATTGGGTTGGAAGGCTTTCTTCGAGGAACCAATTATGTTAATTGCATTTGTCTTGTTAGGAAGGAATCTTGAACAGAGAGCTAAAATTAAAGCA ACCAGTGATATGACAGGACTTCTTAGTATGCTTCCATCAAAAGCTCGCCTTCTAGTTAACAATGGGGAATCAGAAGTTGGCACAATTGTTGAAGTTCCAT CGGACAGTCTTTCTGTTGGAGATCAGATTATTGTGTTACCTGGAGTGAGTAATATCAGAATCTGCATTTATCAGATACAACTGTTAGCTCCTTCACCCTA TTATTGGACCGTATTCCAGCAGATGGAGTTGTCCGAGCTGGTAGAAGCACTGTAGATGAATCAAGTTTCACTGGGGAGCCACTTCCTGTAACAAAACTAC CCGGGAGTGAGGTTGCAGCTGGAAGTATAAATCTGAATGGAACTCTTACAATGGAAGTGCGGAGACCAGGTGGTGAAACTGCCATGGGGGACATTGTCCG TCTAGTTGAGGAAGCACAGAGTAGGGAAACTCCAGTACAACGGTTGGCTGACAAGGTAGCTGGACACTTCACTTATGGAGTGATGGCAGTCTCTTTTACC ACATTTACATTCTGGAGTCTGTTTGGCACACACATTTTACCCGCTTCTCTGTACCAAGGAAGTGCTGTTTCACTGGCTTTGCAGCTTGCTTGCAGTGTTC TGGTTATTGCTTGTCCATGTGCACTTGGGTTAGCCACACCTACTGCCGTGCTGGTTGGAACTTCTTTGGGAGCTACAAAAGGATTACTTTTGCGTGGTGG AAACATTTTAGAGAAGTTTGCCATGGTAAAAACTGTTGTGTTTGATAAAACAGGGACCCTGACGGTTGGTAGACCTGTTGTAACAAAGATTCTCTCTCCT ACATGCAGACAAAATGCAAATTCAAGTCAAACTGAAGAAACTACTTGGTCTGATGTTGAAATCCTGAGGTTAGCAGCTGCAGTAGAATCAAGTTCAGTAC ATCCAGTTGGAAAAGCGATTGTTGATGCTGCTCAGGAACTTAATTGTCATAATGCCAAGGTAGCAGATGGTTCATTCCTGGAAGAACCTGGATCTGGTGC AGTTGCAACCATTGATAACAAAAAGGTTTCTGTTGGGACATGGGAATGGATCACCAGGCATGGAATTAAAGGCAGTATCCAGCAAGAAGTGGAGGAGTGT AAAAACCAATCTGTTGTCTATGTTGGAGTTAATGATACTCTAGCTGGCCTAATTTATACTGAAGATGAGATAAGGGAAGATGCAAGACATGTTGTTGACA CATTGTCTAAGCAAAATATTGATGTATACATGCTGTCTGGAGACAAAAGGAATGCAGCTGAATATGTTGCATCTCGTGTTGGAATTCCAAAAGAGAAGGT GCTATCTGGAGTGAAACCAGATGAGAAAAAGAAGTTCATAAATGAGCTACAGAAGGATCAGAACATTGTAGCCATGGTTGGTGATGGAATTAATGATGCA GCTGCTCTGGCTTCTTCACATATTGGCATTGCATTAGGTGGAGGTGTTGGGGCTGCTAGTGAGGTGTCTTCAATTGTATTGATGCGCAACCAGCTCTCAC AGCTACTTGATGCTTTGGAGCTTAGCAGGCTAACCATGAATACTGTAAAACAAAATCTTTGGTGGGCTTTCATTTACAACATCGTAGGGATTCCAATTGC AGCTGGAGTTTTATTTCCTGTAAATGGGACCATGCTGACTCCATCAATTGCAGGTGCTCTAATGGGGTTGAGTTCCATTGGTGTAATGTCTAACTCATTG CTTTTAAGATTCAAATTTTCCTCAAAGCAGAAACAAATGCATGCCACATTCCCAAATATCAAAATCAAGGTGGATTCTGATTTGCCACGCCGAAACCAGA AAATAAAATATTCAAGTTAGATGTTAGATGGAGGCACATAATAACACAACATAAGTCAAGTACACCTTGGCAGGAGTATGAACTTCAAAGAGAAATTTAA TGTATAGAAATCAAAGAATCACACTATATGTGATGGGGAACTTCAAAGAGGAATTGTATGAACTTTATTTTTTCCGAGAACTCCATATTTCCACTATTAA TTTGTGTCTAGTTCTTTCAACTTCACTGCATTGTGTATTGAAAATTTTATGTGGGTTTTACTCGCTTGAAAAATATGTATCCAGACTGTAGCTTTTTATA TTTACAAACAAGGTTATTTATAAATCATTTGTCAGCAAATTCTGGTTTAATCAATCCTCATAAGTAAACATGAAC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_186739; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_408112
Blastp | Copper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic from Arabidopsis with 67.21% of identity |
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Blastx | Copper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic from Arabidopsis with 68.82% of identity |
Eggnog | p-type ATPase(COG2217) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT4G33520) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019461306.1) |
Pfam | E1-E2 ATPase (PF00122.19) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |