Id Trinity | TRINITY_DN51670_c0_g1_i16 |
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Name Transcript | Ll_transcript_408117 |
Sequence | CGATACTCTACGCCTTTGACCAACCAATGAATTCTACTCTAATCGTCACCACGACGGTGCAAATGCCGTTTCTCAAATCGCTCAACCGCCACATCACCGC ACCTCCTCACAACCTCCTCCTCCTCCGCCGCAACAACCTCAAATACGTTGTTGCTTCTTATAACAACAGCTCTCACTGCATTTCCACCTCCTTCGCTTCT GCTCCATCGTCACGCTCGCTCTGTGCTTTCAGTTCACTTCTCCGACGAACGCCGTTCCTTCTGCGGTGTGTTTCAAGCTCCGACGCTTCCTTTGCTTCTT CAGCCGGCGGAGGAAATTCTGGCGGTGGAGTTTCCGGCGGAAGTGGTGGAGGTGGTGGTGGTTCTGGCGGGGATTATGGAGATGGTAGTGGTAAATTGGT TGTAGACGCGGCGGTTCAGGATCTTTCAGAAGTTTCAGCGGACGTTATTATTTTAGATGTTTCGGGAATGGTGTGTGGTGGATGTGCAGCGAATGTGAAA AGGATCCTGGAAAGTCAAGTAAGTTGTTCAAATTTTGTATTTGATTTGATTTGATTTAGATGCTTCAATTACTAAGATGATAGGGGTTCTTATAGGTTCA ATTTAATGTTGATGATGTTCTGCTAACTTGCTAAGTTTATATTGTTAGTTATTGAAACTGGATAATTATGAGCTCACCATATTTTTATAATTTCCTTAAG CCTGTGGATGTTCTTGGAGAAAATTAGCAACCGAGGTGAAAAAGTTATGCTGAGAGATTTAAAGGGAATGTGGTAGTTTACTGTCTGGGAAGTGGGAATT CTTAATTTGAATTTGCTCTTTTATACATATGGATTCCAGAAAATGAAAAACAGTCGAACAAAGAAATTATTTGCGGGGAAGGGTAAAATTGGCATTCTAG 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GTGGCTTAAACTATACCTCAGGACGAATCTATGACGCCAAATTCCATGCAAGTTCCACTTGAAATCAGGTTCAATCCATTAGTTTCTGCCCAACTATTCT CAAGATCCAATATGCATTATCAGCAGCCACAACCTACAGTTCATGTGGCTCATACGCTAATAGTCATGAAGGCAGAACAACATATGGTTTATGTGGTTCC TAATGAGCAGGGATAAGAAAACCCTTATTTAACTGTAGTCTTGAGCTATTAAAATAGTGTTTAATATCTCCAGGAGACATCAAACGTGGACTTGAAGTAG TTAATTCACAATATATATATATATGTGAAAGAAGTCTTTGCTTTATGTTTTCTTTCTGGTCCTAAATACTGGGCTTTACCTTTGTTAAGAAATTATATCA TGTGTGCTGTGAACTAATTTTGAATGCTTGGGTAACTAATCTGTATATGTTTATACAGCTACTTGATGCTTTGGAGCTTAGCAGGCTAACCATGAATACT GTAAAACAAAATCTTTGGTGGGCTTT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_186739; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_408117
Blastp | Copper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic from Arabidopsis with 67.87% of identity |
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Blastx | Copper-transporting ATPase PAA1, chloroplastic from Arabidopsis with 69.79% of identity |
Eggnog | p-type ATPase(COG2217) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT4G33520) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019461306.1) |
Pfam | E1-E2 ATPase (PF00122.19) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |