Ll_transcript_409843

• Id Trinity: TRINITY_DN51671_c4_g3_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_409843
• Sequence: TCATTGGTGTGGGATTTCACTTATACACATTGCACATTCACCACCTTGATGATTATTTCGTGTTTATGTATCATAATTTTGTATTTTCTGCAGAAGGGCC AAAAACCAACTCAAGGTCTCCTTTCTTATTTTCCCCCACTTTTGTTTTTAATGTGTCAGTTGGGCACTTTTCTCCTTTTGTATTGTTTTTCTGGGTTGCT TTTGTTTTCGCATTTTTCTGGTTAAACATAAGAATAACCACATTTGCTTGAATTCACTTACTTTCTGTCATGATTAGTTCTCCTTAAGCACAGGTTCTAT TCTTCCTTCTCCTCTCTTTTCCCTGTGTATTTGTTCATATTTATAGGTGTGATTGTTTTGCTAACTTCGATATGAAATTCTCCATGTTTAGGTAAGGGCG ATGCTATGGGATGATCATGAAGAATTGATAGCAACTCAGCAGCAAAATAAAGTGACATAGCAATTACCTTGGATGTGTTTATAGCAATGGCCCTTGATGT AGCAACCTTTGAAAGCATATGCCCTTCTCGCTTTATCTCCTTCACTATACCCAACCCAACTTGTTCAGATTCACTGCTCCGAGTTGCTGTCCTTGACTCT CCAGTCCAACCCACTGACTCACCACAAGTTGGTGCTATGTTAGTTCCAGAAGGTCGTGAAACTGATTGGATCTTCTCTACTGAATTGGGTCAACTCCAGC TTCTCTTCAGTTCTCCAGGAATCTCCCGCTTGATTTTGATAGGAAACCAATTCAAGGAGGATGATTTTTCACGAAATATTTATCATCGCCCATTGGATTG TTCCTTGCAACAGCAGGGATTTGAGGTGTGGTCAAAACCTCTTCTCCTTGCTTTATCTCCCAGATCTTTGTTCAGAAATGGCATCCCCGAGATACCCATT TTGAGTTATGAAGATAGTTTGGTTTCTAGCGTAGTAATACATTCTTGTGTTGGTTACCATGTTGGTGAAATATTGGTTGAAGATGTTGAAATTGAAAGCG AGGGTGAGGTGCATCATGGTTGTCATAAGAGGGAATTTCGTAGGCGGATGAGGTTCAAGAAGATGCCTAATTTGATTCAAACAGAGATTCGCATTGTTCC AGAGACAGATCCTTGTTTGAATAGTGTAAGGATCGGGGATATGGGGTTTATACCTGATCTTCAGGTTTTGGTACACCCTTACCTGGCTCCTATGGTGGCT AGCCTTTCATTGATTAGCGAATATTTAGAGGGTCAAATACAGAATGGATTTAAACCAAAAGCTCTATGCTTGGGTGTTGGAGGTGGGGCTTTGCTTACTT TCTTGACTACTCAATTGGGTTTTGAGGTCATGGGAGTGGATAATGAAACAGAGGTTTTGAGGGTTGCAAAAGACTACTTTGGACTGGAAGATGGTGAATG TATGCATGTTGTTGTTGGAGATGCCATTAAATATATAAAGAAACTCGCATACCATGAAAATCTGCAAACTCAAAGTTCCTTTGCTGATTGTGGTGATAAT GGTTTGAGTCACCTGGTAGATGGTAAGGTTAACCATAAATTTGATGTTGTTATGGTTGATTTGGATTCAAGTGATATAAGGCGTGGTGTAAGTTCTCCAC CTTTGGAATTTGTTAGAAAGAATGTTCTTCTTGCTGTTAAATTAGCTCTTTCTGAATCTGGAATTCTTGCTATTAATGTCATTCCTTCAACTAACTCTTT CTATGAAAACCTGGTAAACCATTTTCTCGAAGCTTTCGAAGACCTGTACAAGATAGATGTCGGGAATGGTGAAAATTTTGTTCTCATTGCCACCGTATCA CCTCAGGTGTTTCCAGTTGGGGATCACAGTAATGCTTTTCTTATGCGACTAAAAGCAGTTATTCCAGAAGTATACATAAATTCCATCGTAAAGATATAAT ACTTGATGAGGCAAGTTCTCTTTAAAGATCAATCACCTCCGGTTTCTGCAGTGCAGGGGTAATTGAAGATGTGTCAATAATTTGGATAATTGTACAGAAA ACAAAGAATGTTTTTGTGAAGCTTCTTTACTTTCTACGTGGATCAGCTTTAAGACATTTAAACAGTAGCTTTGCATCTTGTTCGAGATCCAATATACCGA AGATGAAAATAAGCATTATGATAATCAAGATGATCACCATTCGTGAGAATGGTTCTAATTAAACTTAAGATGCTGAAGAAATACCACTTACTACTACAAC CCTATGCCTTCTGAACGAGGTGCTTAAAGATTTTTCAGCTCATAGCAACTTCGACTAAATCCTCTGGCTCAACTATACTGCTCGGTTAGTTGTCTTAGCA ACTATACTGCTTGGTTAGTTGTTTTAGCAACTACAGCTGCTGGGGTAACCGTCTTAGCTCAAAAGTGTACAACTCGTTATGGTTTAGCTGATCTTGGTTC AGCCGATTGGTGAACTTTTGTATATTGGTTGATCGACCTGGTACTTCATTCATCCAAGTAGCAGCTTTAGCAGAGCCCAGTCCTCAGGAATACTCGATTT CGCAAGCTCTTATTGACTATGTACCCAGTTGTTAGCCTACCAGCTTGATAACCTACAACTTTGTCCAAATTAGCTATTTTGGTGCTTGTTAATGGAATCT TTAAAATTCTTATTAAGAAACTTTCGTATTAGGTCAATTCTATTTGTGCTCATAGAAGTATTATTACTAACACCCTTCCCTTTCTAAAAGGGATGAGTGA TTATGATAGAAGTTAAAGATGAATAGTAACATAAACTTGAAAGTTTATTACAAAATTTGTATAAAAATGGTGAGAGTAATGTTTGCATGTGTGAAAATAG AGTTGGCCTGTGATTATTGCTAGTGCCAATTCGTGAATGAAGTTGCCAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_186757;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_409843

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.1
• PS1: 0
• PS2: 0.2
• PS3: 0
• PW1: 0
• PW2: 0
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_409843

• Blastp: Methyltransferase-like protein 13 from Xenopus with 26.06% of identity
• Blastx: Methyltransferase-like protein 13 from Xenopus with 24.41% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (414682)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019464942.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;