Ll_transcript_409848

• Id Trinity: TRINITY_DN51671_c4_g3_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_409848
• Sequence: TTAAAATCAAGATTGCATCTTACATGACAAATTCTAAAACCCATTATAATCTGTTTGGCGTGACCAGTTCTTCATTCTCTTCTCATCTCTTTGTAAAACT GCACTCTCCCTTATTTCTTAGTGGTTATCATCACCGGTAAGGGCGATGCTATGGGATGATCATGAAGAATTGATAGCAACTCAGCAGCAAAATAAAGTGA CATAGCAATTACCTTGGATGTGTTTATAGCAATGGCCCTTGATGTAGCAACCTTTGAAAGCATATGCCCTTCTCGCTTTATCTCCTTCACTATACCCAAC CCAACTTGTTCAGATTCACTGCTCCGAGTTGCTGTCCTTGACTCTCCAGTCCAACCCACTGACTCACCACAAGTTGGTGCTATGTTAGTTCCAGAAGGTC GTGAAACTGATTGGATCTTCTCTACTGAATTGGGTCAACTCCAGCTTCTCTTCAGTTCTCCAGGAATCTCCCGCTTGATTTTGATAGGAAACCAATTCAA GGAGGATGATTTTTCACGAAATATTTATCATCGCCCATTGGATTGTTCCTTGCAACAGCAGGGATTTGAGGTGTGGTCAAAACCTCTTCTCCTTGCTTTA TCTCCCAGATCTTTGTTCAGAAATGGCATCCCCGAGATACCCATTTTGAGTTATGAAGATAGTTTGGTTTCTAGCGTAGTAATACATTCTTGTGTTGGTT ACCATGTTGGTGAAATATTGGTTGAAGATGTTGAAATTGAAAGCGAGGGTGAGGTGCATCATGGTTGTCATAAGAGGGAATTTCGTAGGCGGATGAGGTT CAAGAAGATGCCTAATTTGATTCAAACAGAGATTCGCATTGTTCCAGAGACAGATCCTTGTTTGAATAGTGTAAGGATCGGGGATATGGGGTTTATACCT GATCTTCAGGTTTTGGTACACCCTTACCTGGCTCCTATGGTGGCTAGCCTTTCATTGATTAGCGAATATTTAGAGGGTCAAATACAGAATGGATTTAAAC CAAAAGCTCTATGCTTGGGTGTTGGAGGTGGGGCTTTGCTTACTTTCTTGACTACTCAATTGGGTTTTGAGGTCATGGGAGTGGATAATGAAACAGAGGT TTTGAGGGTTGCAAAAGACTACTTTGGACTGGAAGATGGTGAATGTATGCATGTTGTTGTTGGAGATGCCATTAAATATATAAAGAAACTCGCATACCAT GAAAATCTGCAAACTCAAAGTTCCTTTGCTGATTGTGGTGATAATGGTTTGAGTCACCTGGTAGATGGTAAGGTTAACCATAAATTTGATGTTGTTATGG TTGATTTGGATTCAAGTGATATAAGGCGTGGTGTAAGTTCTCCACCTTTGGAATTTGTTAGAAAGAATGTTCTTCTTGCTGTTAAATTAGCTCTTTCTGA ATCTGGAATTCTTGCTATTAATGTCATTCCTTCAACTAACTCTTTCTATGAAAACCTGGTAAACCATTTTCTCGAAGCTTTCGAAGACCTGTACAAGATA GATGTCGGGAATGGTGAAAATTTTGTTCTCATTGCCACCGTATCACCTCAGGTGTTTCCAGTTGGGGATCACAGTAATGCTTTTCTTATGCGACTAAAAG CAGTTATTCCAGAAGTATACATAAATTCCATCGTAAAGATATAATACTTGATGAGGCAAGTTCTCTTTAAAGATCAATCACCTCCGGTTTCTGCAGTGCA GGGGTAATTGAAGATGTGTCAATAATTTGGATAATTGTACAGAAAACAAAGAATGTTTTTGTGAAGCTTCTTTACTTTCTACGTGGATCAGCTTTAAGAC ATTTAAACAGTAGCTTTGCATCTTGTTCGAGATCCAATATACCGAAGATGAAAATAAGCATTATGATAATCAAGATGATCACCATTCGTGAGAATGGTTC TAATTAAACTTAAGATGCTGAAGAAATACCACTTACTACTACAACCCTATGCCTTCTGAACGAGGTGCTTAAAGATTTTTCAGCTCATAGCAACTTCGAC TAAATCCTCTGGCTCAACTATACTGCTCGGTTAGTTGTCTTAGCAACTATACTGCTTGGTTAGTTGTTTTAGCAACTACAGCTGCTGGGGTAACCGTCTT AGCTCAAAAGTGTACAACTCGTTATGGTTTAGCTGATCTTGGTTCAGCCGATTGGTGAACTTTTGTATATTGGTTGATCGACCTGGTACTTCATTCATCC AAGTAGCAGCTTTAGCAGAGCCCAGTCCTCAGGAATACTCGATTTCGCAAGCTCTTATTGACTATGTACCCAGTTGTTAGCCTACCAGCTTGATAACCTA CAACTTTGTCCAAATTAGCTATTTTGGTGCTTGTTAATGGAATCTTTAAAATTCTTATTAAGAAACTTTCGTATTAGGTCAATTCTATTTGTGCTCATAG AAGTATTATTACTAACACCCTTCCCTTTCTAAAAGGGATGAGTGATTATGATAGAAGTTAAAGATGAATAGTAACATAAACTTGAAAGTTTATTACAAAA TTTGTATAAAAATGGTGAGAGTAATGTTTGCATGTGTGAAAATAGAGTTGGCCTGTGATTATTGCTAGTGCCAATTCGTGAATGAAGTTGCCAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_186757;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_409848

FPKM

• PAB: 2.4
• PNAB: 3.1
• PS1: 4
• PS2: 3.4
• PS3: 5.4
• PW1: 3
• PW2: 3.2
• PW3: 3.8

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_409848

• Blastp: Methyltransferase-like protein 13 from Xenopus with 26.06% of identity
• Blastx: Methyltransferase-like protein 13 from Xenopus with 24.41% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (414682)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019464942.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;