Ll_transcript_410390

• Id Trinity: TRINITY_DN51694_c2_g2_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_410390
• Sequence: CTTTACCCGTATTTTTTCATTCATTATACTTCTTTGTATGCTTTTAAAATAATTCTCATCATAAAAAGGTGAAAATTATGAAGCACAGTATGTGTCTCGT ATATATTTAAGTTTTTGGTTAATGACATCAACCATGCCCAACATTTTACATGGTTAGGTGGCTTGTCATTGCCAAGTATAGATACTAGAGGACTAATAGT CAAAGAATCTTATATTGAACCCTTTCAGGTGTAGTTATGTGTAGCATGCTAACATAGGACATGGTTTGAAATGTTTATCAAAACTCAAAAGCATTAACGA TGTATAGTTTGGATGCTTTTAATTTTTTTTCTTTTTAAATACTACATATAGGTATATGAGATATGCACATTAAGGGCAAGTTGATGAACAAAAGTAGCAA CTGTTTGTGAGCCAAACTTGTTCAGTTATGCTATTGTACTGAACATTTTTCTTGGTGCTGTGCTGTATGGTAAACAATTAAATGTAAATGAGAAGTAAGT TATGAAATAAAATATAATATAAGATAGAGTAGTAGACTACTCCTGCCTATGTGGTGTGTGGTCTGATACCTTATTCAAGCAAACCTGTAGACTATGACAG TTTCTCCCCTTTTTGTACATGTTAATTAAACCCAAGTCCTATATCATAGGCCTACCCAGCTTAATCGTTACCAGCTGAATCCCAAATCATCCATTTTTTT ATATAAATTGTTGAAAGTTTTGGGAAGAGCATGTTGCCCTGTTCAAGTTGTTTCTGTTCAGATTGACTCCAACTTGTTATAATTTCATTCATTGAGGGAG AATTACAATAAGGGAAACCTTGCAGAAAAATATTTCCAGTTAGGAATAATTAAGGATAACCACTCAAATTGTCAATGATATCAAAAGCATGAGTAAATTG TACCACACGCGCACATATGACATAACTGCTTTTTTGATAGATATTATTGGCTTTATTAGCCACTTGATCTGTCAACTGTTCCCAAAACTGGGACAAAATC AAATGTCCCATTACATGTACCACAAATTTATGATTGATCAAATGTTATTTTCTTCTAAGTTATCAATTTAAGTTTTTTATGTTTTGACCAATCACAAAGT TATCTACCCTCCCCAACCCCAAAGTTATCAAAAAGTTGTGGCACATGAAGTGGGACAAAACCCAAAAGATTTAATCTCCTAAAATTAGGAAGGTTTGTAC GAACCCCTGGGAAAATAACGCACAACATATAAAGAACCAGATTACATATGACCAGATTTTTTAATTATATATGTTTTGCCATATTTTGTGCTTCATTGGT TTATATTTTATTTCTGTAATTTTCTTTACTAGATAGTTCACTCGTACTTGGTATCTTGCAGAAATGTTTTAATCATAACCAGCCACTGGATCATACTTTT GAAGGCTCTGCTTCTTCCCTGTACAACAATGCTTTTAATAACTCAGATATGACTCAGCTGGATTATCATCCATTCAGTTTAAATCAAAATTTGGATCACG ACATACTAGGTGATGGTTCTGGTTTGATTGGTCAGATTGATTTTAACCAGCACCTCAACCACAAGACAGAAATTAAGAACTCAGAGTCAACTGAATTTAT TTTTGATGAAGGCTTTGATTGTAGCCAATTTTTTGGAGAAAATTACACCACGAAGGGTAGAGGGGAAATTATTCTTAACATCCTTCCAAATATCTGTCCT CCACCTTCTGCTTTCTTAGCTCCAAAGTGTGCACTGTGGGATTGTTTCAGACCTGCTCAAGGGTTAACATGTTGCCAGGACTATTGTAGCAGTGGTCACA AACTTTTGGCGAACAGTGAGGGTCTTCCCGGCACGACTCCAATTTTGCGTCCTGGGGGCATTGATGTAAAAGATGGTCCTTTGTTTGCTGCTGTTCATGC TAAAGCACAGGGGAAGGATGTAGGCATCCCTGAATGTGAAGGTGCTGCTTCAACTAAATCCCCTTGGAATGCTCCAGAATTATTTGACATGACTTTTCTT GAGGGTGAAACTTTAAGGGAGTGGCTCTTCTTTGACAAGCCTAGAAGGGCATTTGAGAGTGGAAATAGAAAACAGAGATCGCTCCCAGATTATAACGGGC GTGGTTGGCATGAGTCAAGGAAACATGTGATGAAGGAACATGGGGGACAAAAGAGGTGTTATTACATGGATCCCCAGCCTCCTGGTTATCTTGAGTGGCA CTTATATGAGTACAAGGTCAACAGCCATGACGGTTGTGCATTATACAGACTAGAACTAAAGCTTGTGGATAAAAAGAGAAGTCCTAAAGGAAAAGTGAGT AGGGAATCTCTTACTGATTTACAGAACAAGATGGGAAAGCTAACTGCTGCAGTTATATCTTCAGATGATGCTCAAAATGTCAAGGGAAGAACAATGAGAA AGTATGAGAATGTTGGGCCTCCTGAAAATTAAGTACTGCATGGGGCGGTTTTGCCCAATGAGTAAATAATATGTACAAATTTGCCTATGGATTACAACAT AATGAAACGTTTAACATTCCCTGTACAAGGTGTTCAAGTTGTGTGGTGTAAGGAAGATTCGGTATACTTTCTGATGGATGAGATGGAGTTTTTCTTCAGT TTTATAGCACTCAAATTTTGTCAAATTCTTGAAATTTAATAGCATTCAGTTTATTGTACATGCATTAATTCTCTAATGGTGAGATTAGTTTGATTGCTTG TACCAATGCTGCAAATCCATGGGTAATGCAAGGTAGAGTTTCTGTACATATAATATTTGCATTTGCATTGCCTTGTGTTGAATGAGACATCACAGTTCAC AGGTCATAGTTTTATACTTTTTTATTTTAGTCCTGTGCATGCATGCTTCTTTCTGTGGTATTATTTGAAGCACAATATGTGGGAATCAATAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_186962;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_410390

FPKM

• PAB: 0.1
• PNAB: 0.3
• PS1: 0.2
• PS2: 0.2
• PS3: 0.4
• PW1: 0.3
• PW2: 0.1
• PW3: 0.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_410390

• Blastp: Transcription factor VOZ1 from Arabidopsis with 74.78% of identity
• Blastx: Transcription factor VOZ1 from Arabidopsis with 75.23% of identity
• Eggnog: one zinc finger protein(ENOG410YAZS)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G28520)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019413456.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;