Id Trinity | TRINITY_DN51705_c0_g1_i6 |
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Name Transcript | Ll_transcript_296426 |
Sequence | ATTTGTTAAAGATAGAACTTTTCTAATGGGCCTTAAGCATTTTAGTAAGCCCAACGGCCCAAACTCATCATCATCGTTTTCTTCTAACATTTTCAATTTG TGCAGTGTTGAGTGAGATGAACATGGCAGAGGAAGAAGAAGAAGCATTAACGAAAGCTACAAGAGAAGTTGAAGATCTTTACCATATCAGAGATACTTAT TTTCCACCTGAACCCATTGACAGAATTTCTAAGCTGCAACATCATTCCGATCTCGCTCTTCAACTCCTCGATTCCGTTCCTCTAGAACAAAGGAAATCGC CTATGCAACGAGCAACATTTGAATATCTCAGAGGGAAGATATTGGATGTATTTCCTGATTATAGGAAAGAAGCCGAGGATCATCTATCAAAAGCTGTTAA GTTAAACCCATCTCTTGCAGATGCTTGGCTTTGTTTAGGTAACTGCATTTGGAAGAAAGGTGATTTATCAGCCACAAAGAATTGTCTAAGTCTTGCATTA AATAAGGTTAATGCCAACACTGGAGATCCATGATTTAAATTACATTACGGGTGCAGTAATTTTGTTCTGGTTGAGATTCTGCACAGTGAACTAGTGATGG ATATTGGTTGTTATGCAGGGTCCTAACAAAAAAATTCTTTGTCAATTATCAATGCTTAAAAGGAAAATGTCTCAAGGTAAGGGTTTTGCTTTTACTTTTC TATTTTTGAAGATCATCCTTTTTTAGTTGTCCTGATTTCTTTAGTCGTTGTCCCTTTTGGTGTTGATTTTAGCCATCCTTTTATTAATTGGTTAGACAAG TTGGTTTCAAGACTGGTTAATTCTTAATGTGTTCTTTATGGTGTAATATCTGGAGATACTTTACCTTAACCACTAGAGAAATGGGTTTAAGATCTTTCTT GATGTTTTGGATAGAGTATATCTCTTTTTCCCCTTTTAATAGCAGCAATAAATCCTGGTAGTTGTACGGTACTTCTTTATCAGTGGTCTCAGATTTGATT ATGCTACTTGGGCATCAAATTAAGATTGAATGAAAATGTAAAAGTAGAAAGAAATATGTGGTGTTATGATATGCACTTGCAGAGCAGTTACTTTGGTTTG TTTTGTAATGAAAAAATTGAAGGTAGAAACTTATGCTTAGAAACAAGAAGTTGGGAAGGAGAACGGAGTGATGTGGGGCAGATAAGAATGTAAGAAAATG TAGAAAGTGTAGAGAAAATGATTATGTGTAAGTTTTTATGTTTGCATAAATACATAACAATATAATTCCTTTAAGTTTATCTGACAAAATGTGAACAGAA TAAGCACTTTGTGGTATGTTTTTGGAGAAAACTGAAAATTTTAAACTACCTAATAGTAGAGCAGTGCTATTTTCCTTGCTATGTACACAGGTGCAGAGAA TCAGGTAGAACTTGTTGAGGAAAGCATTCAACATGCCAAGGAAGCAATCACTTTGGATGTCAAAGATGGGAACTCTTGGTGTACGTTTGTTAAATAAACT ATTACTTTGATATATCTGGCATATCCTCTTATTGATTAACCACTTGTAAATATATGTTCATCTGTAAACATGTCGGTTGCTGTAAATTAGCTAGTGATTA GGCTGTCAGTTAGCTACTGATCTTCTCCTAGACTGATTAATATTTCAATTAAATAAGGGACCGGTTTGCATCCTAAACACAATTTGCTTAAAATATTGAT TATCCCCTTGGTTGTTCCTTGATTAACTGTAATTACACCATAAAATAAGGGCTCGTTGTGCAAACTAGACATGCTCAATTTCTCTCATACTTTATGCTCA CCTTCCCACTAGACATTAATCTTTATAGTTATTATGACCTTGGTCAAAAAAACATCATAAATAATGCTGTTCATAGAATCTGAAAACACTTTTATTTATT TTCATGCTTGTCCTTGAAAGTTGTTTGTAACTGAGGTCTCTAATATGTGGGAAGGGGGTGTTAGATCTTGTCTGTTGTGAATATAAGTTGCAAGATCTGT ATGTTTTAAGTTTTAACATCATCTGATCTCCTTGACAGATAATCTTGGAAATGCATGCCTTACAAGTTTTTTTGTCAATGGCGCTTGGGATCATAGCAAA CTTTTAAATTCTTTGAAAGCATATCAAAATGCTGTGAGTGTGAAGAAGAATGATATAGAATTTAGCATCAATAATGTGTTATTATCTTCTTATATTTTTA GTGAATTTTAGGCTTATCCCTTACATATGTGGAAAACCTAATGATGTTTGGCTAATATGTACCAGGAGAAAGATGAAAGAATGAGTTCTAATCCAGATCT ATATTTTAATAGTGCCACTGTTCACAAATATCTAGAGAACTACCAGAAGGCTCTTAGTGGTTTTGAGGCTGCTGCTTTAAAGGATCCGGGTCTCAATGCT GCAGAGGAGGTTCAGAAGATAGTCAATTTACTTGACAAGGTCGACAATTTGTTGAGGGTAATGAAATTTTCATATGGCTATGTAGTAACCTAAACCTAGT AATTAGTTGAAGCCTTTTTTTCACAAGAGGATTTTTAGTAGATTGATATCCTAGCATGGTGGATTCTTTTCATGATAGAAGCTGGTAACTGCAAGCAACA TTAAAGTCAATCCCCCACCCCCTTTACCCAGCAAAATAATAAAAAAGGGTTGTACTCAACATCTTATTTTGGAAGAGGCAGCTTGCTATATATGATTTAT AAATGTACAGGGACATGTAAGAGTTAAGCGAATTGCATCTTTGGCATCATCATTGTCTGCTGTTAATTTGAATTTGTCATACAAAAGAGTTACCATAAAC CTTCTATCAGAGGGTCCAAATAGAGCTGTAGCGGTTGAGGGGAAGGTGTTTTTCTTTATCAGGAGTGAGAGTATTGCTCCTCTATACTATTTGCTTTGTG ATGCAAATCAAACTTGCTTTGTTCTCTCAGTTTATGGTGTACATAATGATGTGATTAAAGAAGGAGATCAGCTAACGCTGCTTAACCCTTACTTTCGTGA TGTTGATTTGTCCTGGAAAGATAAGAATTACCAGTTCAAATCTACACGCCTGGATTTCTATGAGCAAGTACTTGTAAATGGAAAAGCTCTGACTCTTCAA CAAGCTGTTCGAACATCAATATATGCACAACATAAACCTTGAAAAGACCACTGCTAAATAGTTATATACCAGGTCTGCTTTTGCTTGTTTTTGATTCTTA GTGCATTGGCGGTTCTGTTGTCATTCAGTAAATAGGTTAGTTGATAAATGTATACAGTTGAATTTATTGCCCATGTCATGGGTCACAATCTGAAAATAGA AGAATATACTTGAGAGGAAACTTCTGCTTTTGTTAAATGTCTGTTTCAACATTTTCTTATTTTGTTTCAACAGCGTGCTTATGTAATGATCTTGTAACTT TTAAGTACCAAAAAGTGTTTTTTGCATTTTTTAAGTACGGACTCTATTTTTTATATTTCTAAAAGTTCTTTTTTTTTTGGGAAGTTGGAGAACGTTGGG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_187021; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_296426
Blastp | Tetratricopeptide repeat protein 5 from Homo with 40.43% of identity |
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Blastx | Tetratricopeptide repeat protein 5 from Homo with 39.23% of identity |
Eggnog | tetratricopeptide repeat domain 5(ENOG410XP1F) |
Kegg | Link to kegg annotations (91875) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019453516.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |