Ll_transcript_296429

• Id Trinity: TRINITY_DN51705_c0_g1_i9
• Name Transcript: Ll_transcript_296429
• Sequence: ATTTGTTAAAGATAGAACTTTTCTAATGGGCCTTAAGCATTTTAGTAAGCCCAACGGCCCAAACTCATCATCATCGTTTTCTTCTAACATTTTCAATTTG TGCAGTGTTGAGTGAGATGAACATGGCAGAGGAAGAAGAAGAAGCATTAACGAAAGCTACAAGAGAAGTTGAAGATCTTTACCATATCAGAGATACTTAT TTTCCACCTGAACCCATTGACAGAATTTCTAAGCTGCAACATCATTCCGATCTCGCTCTTCAACTCCTCGATTCCGTTCCTCTAGAACAAAGGAAATCGC CTATGCAACGAGCAACATTTGAATATCTCAGAGGGAAGATATTGGATGTATTTCCTGATTATAGGAAAGAAGCCGAGGATCATCTATCAAAAGCTGTTAA GTTAAACCCATCTCTTGCAGATGCTTGGCTTTGTTTAGGTAACTGCATTTGGAAGAAAGGTGATTTATCAGCCACAAAGAATTGTCTAAGTCTTGCATTA AATAAGGTTAATGCCAACACTGGAGATCCATGATTTAAATTACATTACGGGTGCAGTAATTTTGTTCTGGTTGAGATTCTGCACAGTGAACTAGTGATGG ATATTGGTTGTTATGCAGGGTCCTAACAAAAAAATTCTTTGTCAATTATCAATGCTTAAAAGGAAAATGTCTCAAGGTAAGGGTTTTGCTTTTACTTTTC TATTTTTGAAGATCATCCTTTTTTAGTTGTCCTGATTTCTTTAGTCGTTGTCCCTTTTGGTGTTGATTTTAGCCATCCTTTTATTAATTGGTTAGACAAG TTGGTTTCAAGACTGGTTAATTCTTAATGTGTTCTTTATGGTGTAATATCTGGAGATACTTTACCTTAACCACTAGAGAAATGGGTTTAAGATCTTTCTT GATGTTTTGGATAGAGTATATCTCTTTTTCCCCTTTTAATAGCAGCAATAAATCCTGGTAGTTGTACGGTACTTCTTTATCAGTGGTCTCAGATTTGATT ATGCTACTTGGGCATCAAATTAAGATTGAATGAAAATGTAAAAGTAGAAAGAAATATGTGGTGTTATGATATGCACTTGCAGAGCAGTTACTTTGGTTTG TTTTGTAATGAAAAAATTGAAGGTAGAAACTTATGCTTAGAAACAAGAAGTTGGGAAGGAGAACGGAGTGATGTGGGGCAGATAAGAATGTAAGAAAATG TAGAAAGTGTAGAGAAAATGATTATGTGTAAGTTTTTATGTTTGCATAAATACATAACAATATAATTCCTTTAAGTTTATCTGACAAAATGTGAACAGAA TAAGCACTTTGTGGTATGTTTTTGGAGAAAACTGAAAATTTTAAACTACCTAATAGTAGAGCAGTGCTATTTTCCTTGCTATGTACACAGGTGCAGAGAA TCAGGTAGAACTTGTTGAGGAAAGCATTCAACATGCCAAGGAAGCAATCACTTTGGATGTCAAAGATGGGAACTCTTGGTGTACGTTTGTTAAATAAACT ATTACTTTGATATATCTGGCATATCCTCTTATTGATTAACCACTTGTAAATATATGTTCATCTGTAAACATGTCGGTTGCTGTAAATTAGCTAGTGATTA GGCTGTCAGTTAGCTACTGATCTTCTCCTAGACTGATTAATATTTCAATTAAATAAGGGACCGGTTTGCATCCTAAACACAATTTGCTTAAAATATTGAT TATCCCCTTGGTTGTTCCTTGATTAACTGTAATTACACCATAAAATAAGGGCTCGTTGTGCAAACTAGACATGCTCAATTTCTCTCATACTTTATGCTCA CCTTCCCACTAGACATTAATCTTTATAGTTATTATGACCTTGGTCAAAAAAACATCATAAATAATGCTGTTCATAGAATCTGAAAACACTTTTATTTATT TTCATGCTTGTCCTTGAAAGTTGTTTGTAACTGAGGTCTCTAATATGTGGGAAGGGGGTGTTAGATCTTGTCTGTTGTGAATATAAGTTGCAAGATCTGT ATGTTTTAAGTTTTAACATCATCTGATCTCCTTGACAGATAATCTTGGAAATGCATGCCTTACAAGTTTTTTTGTCAATGGCGCTTGGGATCATAGCAAA CTTTTAAATTCTTTGAAAGCATATCAAAATGCTGAGAAAGATGAAAGAATGAGTTCTAATCCAGATCTATATTTTAATAGTGCCACTGTTCACAAATATC TAGAGAACTACCAGAAGGCTCTTAGTGGTTTTGAGGCTGCTGCTTTAAAGGATCCGGGTCTCAATGCTGCAGAGGAGGTTCAGAAGATAGTCAATTTACT TGACAAGGTCGACAATTTGTTGAGGGGACATGTAAGAGTTAAGCGAATTGCATCTTTGGCATCATCATTGTCTGCTGTTAATTTGAATTTGTCATACAAA AGAGTTACCATAAACCTTCTATCAGAGGGTCCAAATAGAGCTGTAGCGGTTGAGGGGAAGGTGTTTTTCTTTATCAGGAGTGAGAGTATTGCTCCTCTAT ACTATTTGCTTTGTGATGCAAATCAAACTTGCTTTGTTCTCTCAGTTTATGGTGTACATAATGATGTG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_187021;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_296429

FPKM

• PAB: 0.4
• PNAB: 1.2
• PS1: 2.1
• PS2: 1.3
• PS3: 1.7
• PW1: 1.1
• PW2: 0.8
• PW3: 1.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_296429

• Blastp: Tetratricopeptide repeat protein 5 from Homo with 34.21% of identity
• Blastx: Tetratricopeptide repeat protein 5 from Homo with 34.21% of identity
• Eggnog: tetratricopeptide repeat domain 5(ENOG410XP1F)
• Kegg: Link to kegg annotations (91875)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019453516.1)
• Pfam: Tetratricopeptide repeat protein 5 OB fold domain (PF16669.4)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;