Id Trinity | TRINITY_DN51714_c3_g2_i1 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_295027 |
Sequence | TGAATTATGTACCCAAACCCCATTCAAAACTAGTCATCACCTTTCTCTCCTCATCAACTCACTCCGCCCTACTCCGCCGCCACAACCACCGCTAACCGTC ATGTCAGCCAAGTGGCGCGCCCTTCAGCACCGCCACCGTTACACCTACAACGCCCTCGTTTTCCCTCCTTCATTCCTCAACTCCCTCCCTCAAAACGACA CCGTTTCTCTCTTCCATTCCACTTTCCTTCACTTCACAACCCTCACCTCCACTTACTCTCAACTACGCCACGCCAAAACCCTAGCCTCTTCCTTCTCACA ACTCCTAACCGAACCTCGCTCCGAACCTGAAATCAGAGAAGCTTCTAGAATCTACTTAGAACTTCTCTTTCTGGAAAATTCCACGCCGCTTCACCGAACT CTTATATCTCCTCTCACTAAGACTCAGTCATGGAAATATGTTATAGGAGAAACGTTTCGGAGTCTCTGTGAGGAGTACGGTGGTGGTGGTGGTGGTGAGG GGAAGAAGACGAGGTTTGCGGTGTCGCGAGCGGTGTTGTCGGTTTTAGGGTTGCCGAAGTTAGGGTACTTGGTTGATGTGGTGGAGAATTGTGCTGTGGT GGTTGCTTGGGATGTTGTTGTGGGTTTGAGTGATGTGGTTTCGGAGACGGATCGATTTGTGAGGCCTTCGCCGATTGTTATGGAACAATGCCAGGAGGCG TTGTCGTGTTTGTATTACTTGCTGCAGAAGTTTCCTGACAAGTTTAAGGGTTTGAGTGGTTTTGAGGAGAATGGTTGCGGTTTCGATGAGGGTGTTGTTG TTGTTGTTGGTGGTTATTTGAGTGTTATGGAGGGGATTGTGACTGTGATTTTGCGGATTTTGAGTTCCTCGGCGTTTTCGAGGGATTGCTTTGTGGCTGC TGGGGTGGCATTATGTGCTGCACTTCAAGTGTGTTTGAGTTCTAATGAGCTTGGCTCGGTTTTGATTGAAGGTATATTTAATTTAAAGGCATCAAATTCG GATGATGTTGATTCTGTTAATAGTGATTTTAGAAATGTTGTTGTGAAGATTCCTTGTAAGGATGATGTTTACTTAGGAATTTGTAATCTTTCTGTGTTGA GTAGGATTTGTCTCATACGAGGGATTCTTACAGCGGTTCCTAGACAATTGCTTAATACTCATTTTATTGCTGTGAATGGTGGTGAGGTTGGAAATGATGG TAGGGGAACTATTAGGACTATATTGTATGATGGAATTTTGCCCGAGTTGAGCAAGTACTGCGAGAATCCTACTGATAGCCATTTCAATTTTCATGCGTTG ACTGTGATGCAAATATGTTTGCAACAAATAAAAACATCGATATTGTCGAAACTTACTGATCTGTCGGGAGACTATGATCCTATTCCTGAGGAAATGGGGA TGCGGATACTAAGGATTATCTGGAATAATTTGGAAGATCCTTTGAATCAAACGGTGAAGCAAGTCCATCTTATTTTTGATCTGTTTTTGGACATTCAATC ATCACTTCGCTGGTCAGGGAATGGTGACAAAATAAACAATTTTTTGCTGAAGATTGGATCAGATCTTCTTGCCATGGGATCACGATGTAAGGGAAGATAT GTTCCTTTAGCATTGTTAACCAAGAGGTTGGGTGCGAAGAAAATGTTAAATATGAGCCCGAACCTGCTATTTGAGACAATACAGGCATATGTTGATGACG ATGTCTGTTGTGCTGTTACATCATTTCTCAAGTGTTTCCTTGAGTATTTGCGTGATGAGTATTGGTTGACTGATGGCATTGAAGGTGGCTACGCTCTGTA TAGAAGGCAGTGCCTTCCACCAGTTCTGTATGGGTTAGCATCTGGATTCTCAAAACTTCGTTCGAATTTAAATACTTACGCTTTGCCAGTTTTACTGGAA GTAGACGTGGATAGTATATTTCATATGCTTTCTTTCATCTCAGTTGGTCCAAACACGGATGAAAACGGAGTGGAATATCCAGAGATTGATTGTGCAAACA TGGAATTGAATCTTGAACAAAGAATTGCAATCCTAGTTTCACTGCTCAAGGTATCTCGGTCACTTGCTTTGGTTGAAGGGGACATCAATTGGTGTCAACA TTCTGCAGCGGGTGAAGAAGAGCCTCAGCTGGGAACAGAAAGCCGTGCCCTTGTTTGCATAAAGGGAATAAATGTTGAGATCTTTGTTCAGTGGCTAGTA AATGCATTGACTCATGTGGATGAGTCACTACGTCTTGATGCTGCTGAGTCTCTTTTCTTAAACCCCAAGACTGCAAGTCTACCTTCTCATTTAGAGCTAA CTTTAATGAAGGAAGCCGTGCCTTTGAATATGAGGTGTTGCTCCACAGCTTTTCAGATGAAGTGGAGCAGCTTGTTTCGAAAATTCTTTGCTAGGGTTCG AACAGCCCTGGAGAGACAATTCAAGCAAGGTAGCTGGAACCCTCTTGAGCATATTAAAGGTAACAGAGTTTATTCTTCAAACGGGAATAATGAAATGACA ACCAAAAGAGCAGATGATCTTTTTCACTTTATGAGGTGGCTGAGTTGCTTCTTATTTTTCTCATGCTATCCTTCTGCTCCTTACAAGAGAAAAATAATGG CAATGGATCTCATCTTGATTATGATAAATGTCTGGTCTATTAAACCATCAATTAGTGAGAAGTCTGATAGTTCTTTGTCAGGAGATCATCTCTATCCTTA CAGCAAAGGAATGACTTCATCCGATTCAACTCTTCTGTTAGTTGGTTCAATTGTTGATAGTTGGGATAGGTTGAGAGAGAGTTCGTTTCGCATATTACTT CATTTTCCGACTCCACTACCTGGAATTTCTGGTGATGACATGCTGAAGAAGGTAATTGCATGGGCTATGAAATTAGTTTGCAGTCCACGTGTAAGGGAAA GTGATGCCGGAGCTCTGACTTTGCGGCTAATATTTAGGAAGTACGTCCTGGAGCAAGGTTGGTTGATTGAAGATCCATTTAATGTTGTCAATTTAAGCTC AAAGCCTGAATTGGTAAATGAGGCTAATCAGTCAAGTAATCTTAGGATTCCTGTCATACTGTATATGAAATCAATGATCGATTGGTTGGATGTTGCTGTG AGACATGGGGAAGAAGATCTTTCTAAAGCATGCAGGAACAGCTTTGTCCATGGTGTATTACTTGCTTTGCGTTATGCTTTTGAGGAATTAGACTGGGATT CTGATGTCCCATTGTCTAGTATCTCAGAGATGAGGTATTTGTTGGAAATACTTTTGGAGCTTGTAATGAGGATAACTTCATTGGCACTATGGGTAGTTTC TGCAAATGCTTTGCATCTGCCTGAAGACATGGATGATATGGATGATGACGACAATCTTTTGTCAGAGATACCGGATCATGAGCATGAGCACATGTATTCA TCTGAACATGAGAACAGTAATTCAAAGCCTTCCCATGATGTCAAAGCATCGGAACAGATTGTCATGGTTGGTTGCTGGCTGGCTATGAAAGAGGTGAGCC TTCTTTTAGGGACTATTATAAGAAAGGTACCATTGCCAAGTAATGCTTGTTCAGATTTATCCAAGTTAGAGGGGTCTTCTGTTGAAACTGCAGACTTCTC GTCTAATTCTGTACTTGATTTGGAACAACTTGAAACAATTGGTAATCACTTTTTAGAAGTCCTCTTGAAGATGAAGCATAATGGTGCAATTGATAAGACG AGGGCTGGGTTCACAGCTCTTTGCAATCGTTTACTATGCTCAAATGACCCCAGGTATGGATTTTGGTACTCTATTTTATTTCTATTAAATGCTTTATTGA TTTCGCATCTAAAGAAATTTTGTTATTTTTCTATTAAACACTTTTTTACCCACACATGTGGTGGAATATCTTCAGCCATCTTAGTTTGATACTATAACAT GCCATCTCTGTGGCCTATACCACTTCTGCCATTACTGTTGCTATCACTGCTGTCACTGTTGCCTCCACCGCCATGGCACCACCACTGTTGCCACTCGACC ACCACCCAACTCCCACCCTACTATCTTCATGGAAACAGCCACCAGTCCACTACTGTCTGCAACCACAACCAATATTCAATTCATTATTTCATTATGGTTC CAATTTTAAAAATTTGGTTAGAATTATATATTTAAAAAACCTTTATCTTACATAAAAGAAAGAATTAAAATTTATATTTTAGAAAGTAAACTCAATTGCA ATGTCATTTCGTAATTCCTTTTACAAAACAAAATTAAAACTTTAAAATTCTAATCTAATAGTAGTCTTAACATAAATGGAATTTGGATATAATTTTAAAG ATAGATTCCAGTTTTTTCATCCAAAGAGAGGCTGATTGTTTTCACATATATGAAGATTCCTCATTAGCCTGATATCAAATGAACAACAATCAGGTGACTA TCTGAACTCTAGCTTACATTAAAGAAATATTGTAAGAATCCTCAGTTATCATTGCTATGCTTGATCTCTCAAGGCTTAAATTCAGTTAATAATTTATAAA ATATCTTTCACCCCGTTAGTTTCACCACATACTCGATTGGTTAACTATTTGTGTGATCTCTTGTTCTTAGTGGTTCATTTTATGTCCTTGTCCTTTCAAG TAGGTGGCCTTTTGTGATTCTTTAGTTTTTTCTGATAAATATTGATGCAATTGTGTTTTTAGATTACTGTTTTCTTGGCTTAATGTAGCATCATAGATAA AACACTGACGAACATGTATAATCATAATTGTATAATATAAATGAGGTGTAAAATTATAAGCTGGGCCTTTAATATCACTAAATCATCATATCATAAATAG TATGTTTTCAACACCTGATTTGTACCTTCCTTTTCAGGCTTTGTAGATTGACAGAGACCTGGATGGAACAACTTATGCAAAGAACTGTGGCCAAAGGACA AACAGTGGATGATTTGCTGAGAAGAAGTGCTGGAATTCCTGCTGCATTTATTGCATTGTTTCTCTCAGAACCAGAAGGAACACCCAAAAAACTCCTCCCG CGGGCACTAAGGTGGCTTATAGATGTAGGTAATGGGTCTGTGCTGAATCAAATTGAAACTGATAGCTTGAATGGTGACCAGTGCAAGTTAAATGGTTCAA GGAAAGGAAATAATTCTGCACAGGAAGCTGAAAGTAATGCGAGTCAGATGTCGTCAAAGATCAGAGATGAGGGTGTTATTCCTACTGTACATGCATTTAA TGCTCTAAGAGCCGCATTCAATGACTCTAACTTGGCCACCGATACATCTGGTTTCTCGGCTGAGGCTTTGGTTTTGGCTGTTCGCTCTTTCTCTTCGCCA TACTGGGAGATCAGAAATAGTGCATGTCTGGCTTATACTGCCTTAGTACGTCGCATGGTTGGATTCCTCAATGTTCATAAGCGAGAATCTGCACGGCGTG CACTAACTGGGCTCGAGTTTTTTCACAGGTATCCACCACTGCACTCATTTCTGTTCAATGAACTAGAAGTTGCTACTAAATTTTTGGGTCCTGCATCTTC AGGGGATTTAGAATCCATCCAGGGAAATAATCTACATCCAAGCTTGTATCCTATTCTGATTCTTTTGTCCAGGCTCAAGCCTTCATCAATATCTGGTGAG GCAGGAGATGAGCTGGACCCTTTCCTTTTCATGCCATGGATTAGGAGGTGCTCAACGCAAAGTAATTTACGAGTCCGTGTTCTTGCATCGAGAGCTTTAA CAAGTCTGGTATCAAATGAGAAATTGTCATCAGTCCTTCTCAATATTGCGTCTGAGTTGCCTTGCATAGAAAACCTAGTCAATTCATCTGCTTTACCAAA TGGTTTGGGTACGACTCGTAATTCCCACAGTATTTCTTTCAACTTAATCCATGGAATTCTCTTGCAGTTGAGTTCTCTGCTTGATATAAATTGTAGAAAT CTTGCCGAGAACTCAAAAAAAGATAATATAATTGGTGAATTAATCCAGACACTTTCACCTCGGTCATGGATTGCAAGGCCTACTCGTTGCCCTTGCCCTA TCATCAACAATGCATTCTTAGTGGTTCTGGATCAAATGCTCAATATTGCAAGAACATGTCAAGTAACCAATCATTTTTATCCCATTCGTAATCTGCTTTT GGAGTTGTCAGCGGAGTGCTTAGATTTAGAATCTTATGGCGCTTCATATTATGACCCAACCATTGCTGAACTCCGTAAACAAGCAGCCGTTTCCTATTTT GGTTGCTTGTTCCAAGCATCTGAGGATGAGGAAGAGGTATTCCATTTGCCACTGAAGCATTCACCCTCCAGTTCAAAATCATTGCCTAAACATGAAATGG AGAATGCTTCTGCTGGTGTTTTGGATGGGTTGATTTGCTGCTTGTCAGACTCATCATATGAGGTTCGACTTGCAACACTTAAGTGGCTACTGAAGTTCCT GAAAGCAGCTGAATCTGATGGTAAGGTCTATGATCCCAGTAATGACATCAGGACTGTTCAGCTCTGGGCCAAAACTAACCTTCATGGAACCTTGGTGAAG ATTTTGGCATCAGAGAAAAACCACAGATGTAGATATTACATTGTGAGGATACTTGTAGCTTGGAATATGCTGCAGTTTGAAAATGCTAGCCATGACAATT GCAACGGAACCAGTTATGTTGGTGTAATGGACTTCGACTGTGTTTTGCAATTTTGGAATGAATTAGTTTCTTTGTATAAGCAAACAATGCATGCAAAGAC TCGAGAAACCCTTGTTTGCTGTTTGGGAGTATGTGCTAAGAGAATCACACTGTTGCTTGTGAGCTCTATTCTGTCTAATGAAGGAACTGAGAAGTATGCT GTATGCAGTGAAATTAGCCAGGATGAAATGCTTGGTAGGTTGTTCGACTGCATTGTATTTTTTTGTAACATGATTAAACAATGTAGTTCACCATCTGAAC CGGCAAGTATTCGCAAGGCAGCTGCTGAATCCTTGATAGCTTCTGGTTTGCTCGAGCAGGCTGGGGCCCTTGGCTCAATTGTCATCAGTAACCACATTCC CTCTGGCCCTTCATCCTCTTGTTTTGTTAAAAGTGAAGCTGTTAATTTGTTTGCTCATCAAGTACTAGATGCATGGTTCACATGCATCAAGCTTCTGGAA GATGAAGATGACTCGGTTAGATTAAGGCTTTCCTCCGATGTTCAGAAGTGTTTTACTTCAGAAAGAACTAGAAGCAGCTCATCTCAAGTAGATAGAGTGA TAAGATTCTGTTTTGACCATCTATCTTCTATTTTTGGTCACTGGATTGATTACTTCAATTACCTCTGTCAATGGGTATTACATGCTGGAAGCTACGTAGC ATCATCGGAATCAGATCTTGTGAGACGAGTTTTTGACAAGGAGATTGACAATTATTACGAAGAGAAGCTGTTAATCAGCCAGATTTGTTGCTCCAATTTG GAAAAGCTACCGATTTTGAAATCATGGGCTGGGAAAGAAGAATTCAAGACTTATATACATGGCTGGAGAATGAGATTTTTCCATCAATTGTTGTCATATG CTGAAGACCATATTGGGCAACAAGAAGGGAATGATTGGATAGGAGGCATGGGTAACCATAAAGATGCATTTTTACCCTTATATGCAAATTTGCTTGGTTT CTATGCCCTCTCAAACTGCTTTTTCCTTGTGTCGGGCAATGACGCCGCCGAACATCTTCAACCCGATGTAGTTCTGCTTGGAAGAACCATTGATCCATTT CTTACAAACCCTTTAATTTCTAACCTATATATGTTAGTCCTAAAATCACATGAGAAAACCACATATGATGTTGCTAATAGGTTATCTCTTGAGATTGGAG ATGACACATGGGATAGTTTTACTCCTTATTTTCTTATTTGCTAGCATTTTGTATACTAGTTGTAATTCACATGAAGCTATTTACAGGAAGGTGCAATGGA ATTTTGGAATAACAGAGTTGTTACTATAAGAAAGCAGCATTGTCTTTTATTGGAGAAACTCATTTTGTATTGTGGTTAATGTATTCAACTTATTTGTAGA CTTCTTATTGTGCCCCTCAATGTGTCTTTTTGAAGATTAATTTGATGATATGTTTAGTGAGAAAAAAATGTATGCACTGATAGTGTAAGAGTTTTATATA CTGTCATTGCATCATCTATCATTGACTCTTCGAAAAAGTAATATAAATGAATGGTAGATGATGTAATAACTGTGTATAAACATTTACAGTAACAATGCAT AAATATTTTTTGTTTGTTTGTGTTGGGGGCTTGAGGCAAAGTTTAGTTTCTTTGTCCAATGGGAAG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_187079; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_295027
Blastp | Thyroid adenoma-associated protein homolog from Canis with 19.3% of identity |
---|---|
Blastx | Thyroid adenoma-associated protein homolog from Gallus with 29.95% of identity |
Eggnog | thyroid adenoma associated(COG5543) |
Kegg | Link to kegg annotations (100126180) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019442647.1) |
Pfam | Putative death-receptor fusion protein (DUF2428) (PF10350.8) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |