Id Trinity | TRINITY_DN51714_c3_g2_i3 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_295030 |
Sequence | TGAATTATGTACCCAAACCCCATTCAAAACTAGTCATCACCTTTCTCTCCTCATCAACTCACTCCGCCCTACTCCGCCGCCACAACCACCGCTAACCGTC ATGTCAGCCAAGTGGCGCGCCCTTCAGCACCGCCACCGTTACACCTACAACGCCCTCGTTTTCCCTCCTTCATTCCTCAACTCCCTCCCTCAAAACGACA CCGTTTCTCTCTTCCATTCCACTTTCCTTCACTTCACAACCCTCACCTCCACTTACTCTCAACTACGCCACGCCAAAACCCTAGCCTCTTCCTTCTCACA ACTCCTAACCGAACCTCGCTCCGAACCTGAAATCAGAGAAGCTTCTAGAATCTACTTAGAACTTCTCTTTCTGGAAAATTCCACGCCGCTTCACCGAACT CTTATATCTCCTCTCACTAAGACTCAGTCATGGAAATATGTTATAGGAGAAACGTTTCGGAGTCTCTGTGAGGAGTACGGTGGTGGTGGTGGTGGTGAGG GGAAGAAGACGAGGTTTGCGGTGTCGCGAGCGGTGTTGTCGGTTTTAGGGTTGCCGAAGTTAGGGTACTTGGTTGATGTGGTGGAGAATTGTGCTGTGGT GGTTGCTTGGGATGTTGTTGTGGGTTTGAGTGATGTGGTTTCGGAGACGGATCGATTTGTGAGGCCTTCGCCGATTGTTATGGAACAATGCCAGGAGGCG TTGTCGTGTTTGTATTACTTGCTGCAGAAGTTTCCTGACAAGTTTAAGGGTTTGAGTGGTTTTGAGGAGAATGGTTGCGGTTTCGATGAGGGTGTTGTTG TTGTTGTTGGTGGTTATTTGAGTGTTATGGAGGGGATTGTGACTGTGATTTTGCGGATTTTGAGTTCCTCGGCGTTTTCGAGGGATTGCTTTGTGGCTGC TGGGGTGGCATTATGTGCTGCACTTCAAGTGTGTTTGAGTTCTAATGAGCTTGGCTCGGTTTTGATTGAAGGTATATTTAATTTAAAGGCATCAAATTCG GATGATGTTGATTCTGTTAATAGTGATTTTAGAAATGTTGTTGTGAAGATTCCTTGTAAGGATGATGTTTACTTAGGAATTTGTAATCTTTCTGTGTTGA GTAGGATTTGTCTCATACGAGGGATTCTTACAGCGGTTCCTAGACAATTGCTTAATACTCATTTTATTGCTGTGAATGGTGGTGAGGTTGGAAATGATGG TAGGGGAACTATTAGGACTATATTGTATGATGGAATTTTGCCCGAGTTGAGCAAGTACTGCGAGAATCCTACTGATAGCCATTTCAATTTTCATGCGTTG ACTGTGATGCAAATATGTTTGCAACAAATAAAAACATCGATATTGTCGAAACTTACTGATCTGTCGGGAGACTATGATCCTATTCCTGAGGAAATGGGGA TGCGGATACTAAGGATTATCTGGAATAATTTGGAAGATCCTTTGAATCAAACGGTGAAGCAAGTCCATCTTATTTTTGATCTGTTTTTGGACATTCAATC ATCACTTCGCTGGTCAGGGAATGGTGACAAAATAAACAATTTTTTGCTGAAGATTGGATCAGATCTTCTTGCCATGGGATCACGATGTAAGGGAAGATAT GTTCCTTTAGCATTGTTAACCAAGAGGTTGGGTGCGAAGAAAATGTTAAATATGAGCCCGAACCTGCTATTTGAGACAATACAGGCATATGTTGATGACG ATGTCTGTTGTGCTGTTACATCATTTCTCAAGTGTTTCCTTGAGTATTTGCGTGATGAGTATTGGTTGACTGATGGCATTGAAGGTGGCTACGCTCTGTA TAGAAGGCAGTGCCTTCCACCAGTTCTGTATGGGTTAGCATCTGGATTCTCAAAACTTCGTTCGAATTTAAATACTTACGCTTTGCCAGTTTTACTGGAA GTAGACGTGGATAGTATATTTCATATGCTTTCTTTCATCTCAGTTGGTCCAAACACGGATGAAAACGGAGTGGAATATCCAGAGATTGATTGTGCAAACA TGGAATTGAATCTTGAACAAAGAATTGCAATCCTAGTTTCACTGCTCAAGGTATCTCGGTCACTTGCTTTGGTTGAAGGGGACATCAATTGGTGTCAACA TTCTGCAGCGGGTGAAGAAGAGCCTCAGCTGGGAACAGAAAGCCGTGCCCTTGTTTGCATAAAGGGAATAAATGTTGAGATCTTTGTTCAGTGGCTAGTA AATGCATTGACTCATGTGGATGAGTCACTACGTCTTGATGCTGCTGAGTCTCTTTTCTTAAACCCCAAGACTGCAAGTCTACCTTCTCATTTAGAGCTAA CTTTAATGAAGGAAGCCGTGCCTTTGAATATGAGGTGTTGCTCCACAGCTTTTCAGATGAAGTGGAGCAGCTTGTTTCGAAAATTCTTTGCTAGGGTTCG AACAGCCCTGGAGAGACAATTCAAGCAAGGTAGCTGGAACCCTCTTGAGCATATTAAAGGTAACAGAGTTTATTCTTCAAACGGGAATAATGAAATGACA ACCAAAAGAGCAGATGATCTTTTTCACTTTATGAGGTGGCTGAGTTGCTTCTTATTTTTCTCATGCTATCCTTCTGCTCCTTACAAGAGAAAAATAATGG CAATGGATCTCATCTTGATTATGATAAATGTCTGGTCTATTAAACCATCAATTAGTGAGAAGTCTGATAGTTCTTTGTCAGGAGATCATCTCTATCCTTA CAGCAAAGGAATGACTTCATCCGATTCAACTCTTCTGTTAGTTGGTTCAATTGTTGATAGTTGGGATAGGTTGAGAGAGAGTTCGTTTCGCATATTACTT CATTTTCCGACTCCACTACCTGGAATTTCTGGTGATGACATGCTGAAGAAGGTAATTGCATGGGCTATGAAATTAGTTTGCAGTCCACGTGTAAGGGAAA GTGATGCCGGAGCTCTGACTTTGCGGCTAATATTTAGGAAGTACGTCCTGGAGCAAGGTTGGTTGATTGAAGATCCATTTAATGTTGTCAATTTAAGCTC AAAGCCTGAATTGGTAAATGAGGCTAATCAGTCAAGTAATCTTAGGATTCCTGTCATACTGTATATGAAATCAATGATCGATTGGTTGGATGTTGCTGTG AGACATGGGGAAGAAGATCTTTCTAAAGCATGCAGGAACAGCTTTGTCCATGGTGTATTACTTGCTTTGCGTTATGCTTTTGAGGAATTAGACTGGGATT CTGATGTCCCATTGTCTAGTATCTCAGAGATGAGGTATTTGTTGGAAATACTTTTGGAGCTTGTAATGAGGATAACTTCATTGGCACTATGGGTAGTTTC TGCAAATGCTTTGCATCTGCCTGAAGACATGGATGATATGGATGATGACGACAATCTTTTGTCAGAGATACCGGATCATGAGCATGAGCACATGTATTCA TCTGAACATGAGAACAGTAATTCAAAGCCTTCCCATGATGTCAAAGCATCGGAACAGATTGTCATGGTTGGTTGCTGGCTGGCTATGAAAGAGGTGAGCC TTCTTTTAGGGACTATTATAAGAAAGGTACCATTGCCAAGTAATGCTTGTTCAGATTTATCCAAGTTAGAGGGGTCTTCTGTTGAAACTGCAGACTTCTC GTCTAATTCTGTACTTGATTTGGAACAACTTGAAACAATTGGTAATCACTTTTTAGAAGTCCTCTTGAAGATGAAGCATAATGGTGCAATTGATAAGACG AGGGCTGGGTTCACAGCTCTTTGCAATCGTTTACTATGCTCAAATGACCCCAGGCTTTGTAGATTGACAGAGACCTGGATGGAACAACTTATGCAAAGAA CTGTGGCCAAAGGACAAACAGTGGATGATTTGCTGAGAAGAAGTGCTGGAATTCCTGCTGCATTTATTGCATTGTTTCTCTCAGAACCAGAAGGAACACC CAAAAAACTCCTCCCGCGGGCACTAAGGTGGCTTATAGATGTAGGTAATGGGTCTGTGCTGAATCAAATTGAAACTGATAGCTTGAATGGTGACCAGTGC AAGTTAAATGGTTCAAGGAAAGGAAATAATTCTGCACAGGAAGCTGAAAGTAATGCGAGTCAGATGTCGTCAAAGATCAGAGATGAGGGTGTTATTCCTA CTGTACATGCATTTAATGCTCTAAGAGCCGCATTCAATGACTCTAACTTGGCCACCGATACATCTGGTTTCTCGGCTGAGGCTTTGGTTTTGGCTGTTCG CTCTTTCTCTTCGCCATACTGGGAGATCAGAAATAGTGCATGTCTGGCTTATACTGCCTTAGTACGTCGCATGGTTGGATTCCTCAATGTTCATAAGCGA GAATCTGCACGGCGTGCACTAACTGGGCTCGAGTTTTTTCACAGGTATCCACCACTGCACTCATTTCTGTTCAATGAACTAGAAGTTGCTACTAAATTTT TGGGTCCTGCATCTTCAGGGGATTTAGAATCCATCCAGGGAAATAATCTACATCCAAGCTTGTATCCTATTCTGATTCTTTTGTCCAGGCTCAAGCCTTC ATCAATATCTGGTGAGGCAGGAGATGAGCTGGACCCTTTCCTTTTCATGCCATGGATTAGGAGGTGCTCAACGCAAAGTAATTTACGAGTCCGTGTTCTT GCATCGAGAGCTTTAACAAGTCTGGTATCAAATGAGAAATTGTCATCAGTCCTTCTCAATATTGCGTCTGAGTTGCCTTGCATAGAAAACCTAGTCAATT CATCTGCTTTACCAAATGGTTTGGGTACGACTCGTAATTCCCACAGTATTTCTTTCAACTTAATCCATGGAATTCTCTTGCAGTTGAGTTCTCTGCTTGA TATAAATTGTAGAAATCTTGCCGAGAACTCAAAAAAAGATAATATAATTGGTGAATTAATCCAGACACTTTCACCTCGGTCATGGATTGCAAGGCCTACT CGTTGCCCTTGCCCTATCATCAACAATGCATTCTTAGTGGTTCTGGATCAAATGCTCAATATTGCAAGAACATGTCAAGTAACCAATCATTTTTATCCCA TTCGTAATCTGCTTTTGGAGTTGTCAGCGGAGTGCTTAGATTTAGAATCTTATGGCGCTTCATATTATGACCCAACCATTGCTGAACTCCGTAAACAAGC AGCCGTTTCCTATTTTGGTTGCTTGTTCCAAGCATCTGAGGATGAGGAAGAGGTATTCCATTTGCCACTGAAGCATTCACCCTCCAGTTCAAAATCATTG CCTAAACATGAAATGGAGAATGCTTCTGCTGGTGTTTTGGATGGGTTGATTTGCTGCTTGTCAGACTCATCATATGAGGTTCGACTTGCAACACTTAAGT GGCTACTGAAGTTCCTGAAAGCAGCTGAATCTGATGGTAAGGTCTATGATCCCAGTAATGACATCAGGACTGTTCAGCTCTGGGCCAAAACTAACCTTCA TGGAACCTTGGTGAAGATTTTGGCATCAGAGAAAAACCACAGATGTAGATATTACATTGTGAGGATACTTGTAGCTTGGAATATGCTGCAGTTTGAAAAT GCTAGCCATGACAATTGCAACGGAACCAGTTATGTTGGTGTAATGGACTTCGACTGTGTTTTGCAATTTTGGAATGAATTAGTTTCTTTGTATAAGCAAA CAATGCATGCAAAGACTCGAGAAACCCTTGTTTGCTGTTTGGGAGTATGTGCTAAGAGAATCACACTGTTGCTTGTGAGCTCTATTCTGTCTAATGAAGG AACTGAGAAGTATGCTGTATGCAGTGAAATTAGCCAGGATGAAATGCTTGGTAGGTTGTTCGACTGCATTGTATTTTTTTGTAACATGATTAAACAATGT AGTTCACCATCTGAACCGGCAAGTATTCGCAAGGCAGCTGCTGAATCCTTGATAGCTTCTGGTTTGCTCGAGCAGGCTGGGGCCCTTGGCTCAATTGTCA TCAGTAACCACATTCCCTCTGGCCCTTCATCCTCTTGTTTTGTTAAAAGTGAAGCTGTTAATTTGTTTGCTCATCAAGTACTAGATGCATGGTTCACATG CATCAAGCTTCTGGAAGATGAAGATGACTCGGTTAGATTAAGGCTTTCCTCCGATGTTCAGAAGTGTTTTACTTCAGAAAGAACTAGAAGCAGCTCATCT CAAGTAGATAGAGTGATAAGATTCTGTTTTGACCATCTATCTTCTATTTTTGGTCACTGGATTGATTACTTCAATTACCTCTGTCAATGGGTATTACATG CTGGAAGCTACGTAGCATCATCGGAATCAGATCTTGTGAGACGAGTTTTTGACAAGGAGATTGACAATTATTACGAAGAGAAGCTGTTAATCAGCCAGAT TTGTTGCTCCAATTTGGAAAAGCTACCGATTTTGAAATCATGGGCTGGGAAAGAAGAATTCAAGACTTATATACATGGCTGGAGAATGAGATTTTTCCAT CAATTGTTGTCATATGCTGAAGACCATATTGGGCAACAAGAAGGGAATGATTGGATAGGAGGCATGGGTAACCATAAAGATGCATTTTTACCCTTATATG CAAATTTGCTTGGTTTCTATGCCCTCTCAAACTGCTTTTTCCTTGTGTCGGGCAATGACGCCGCCGAACATCTTCAACCCGATGTAGTTCTGCTTGGAAG AACCATTGATCCATTTCTTACAAACCCTTTAATTTCTAACCTATATATGTTAGTCCTAAAATCACATGAGAAAACCACATATGATGTTGCTAATAGGTTA TCTCTTGAGATTGGAGATGACACATGGGATAGTTTTACTCCTTATTTTCTTATTTGCTAGCATTTTGTATACTAGTTGTAATTCACATGAAGCTATTTAC AGGAAGGTGCAATGGAATTTTGGAATAACAGAGTTGTTACTATAAGAAAGCAGCATTGTCTTTTATTGGAGAAACTCATTTTGTATTGTGGTTAATGTAT TCAACTTATTTGTAGACTTCTTATTGTGCCCCTCAATGTGTCTTTTTGAAGATTAATTTGATGATATGTTTAGTGAGAAAAAAATGTATGCACTGATAGT GTAAGAGTTTTATATACTGTCATTGCATCATCTATCATTGACTCTTCGAAAAAGTAATATAAATGAATGGTAGATGATGTAATAACTGTGTATAAACATT TACAGTAACAATGCATAAATATTTTTTGTTTGTTTGTGTTGGGGGCTTGAGGCAAAGTTTAGTTTCTTTGTCCAATGGGAAG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_187079; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_295030
Blastp | Thyroid adenoma-associated protein homolog from Mus with 23.21% of identity |
---|---|
Blastx | Thyroid adenoma-associated protein homolog from Gallus with 29.3% of identity |
Eggnog | thyroid adenoma associated(COG5543) |
Kegg | Link to kegg annotations (240174) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019442647.1) |
Pfam | Putative death-receptor fusion protein (DUF2428) (PF10350.8) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |