Id Trinity | TRINITY_DN51717_c0_g4_i3 |
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Name Transcript | Ll_transcript_297324 |
Sequence | GTCCATATATCTTTTCTCGATTACATTTCATTATTATGATGCGTAAATTGTGACCCTCACCCACATGCTCTTGTCTTGTTTATATAGGTAGACATATTCA TAATTGCGTTGTGGTCACGAAGGAGTCAGAATGGCGATGAGGCCCAAAAGCGTTACTACCTATTCTCCCCTCTCTCTCACGCTTCAACCTCTGCGCGTGT TAAGACACGGGGGCATGAGAGTCATCGTAAATGTTTGGGAATAAAGTTTTTTTTTATCGGCAATTTTTTAGAATGTAAATGTTAGTATTTTATTGTGGGT GACACACCACCTCAACCTCTTTCATTCTAATTATCAAATTACGTTATATCTCCTCGGTTGGGAATAAAGATTGAAGATGGTAGAATAAAACTTTGTTTTG AAGTGACTTCAGTTGAACTCTCTGAAATAAACAACCCCACCTGCCACCTCACTCTCTTTCGTGTCATTACATCCACTCAACTTCCCATACCCACTCTTTC ATCAAACCATTGACTAACATCAACGGTTCAAAACCTATCAACTCATCCAATCCAACGGTGTCAACGAGCTTTCAACACCTCGTGATTTCCCCACAACTTA TCCAACCTCTTTTCATATATTCTTATTTTCAAAAGAGATAAAAATAAATAGACTGACAGTATATTATTATTGATTTTTTCTATTATTGTTGACTTGAAAA AGCAATTTAAATGAATGATAGATGATAAAATGCATATGAATAAATGTTTACACTCTTTTAAAAAATATTTTGAGTGTTCCAGCTAGCAAAGTTTACAGAG TGAACAACACAAGGTAACAAAATAAATGCACCTTTAGATCTCTCTATCTCTCTATCTCTCTCTCTTCCATGGTACATTCTCCACTCTTCTTCTCTCTACT 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Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_187114; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_297324
Blastp | Protein IQ-DOMAIN 31 from Arabidopsis with 56.25% of identity |
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Blastx | Protein IQ-DOMAIN 31 from Arabidopsis with 54.89% of identity |
Eggnog | IQ-domain(ENOG410YAVA) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G74690) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019463745.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |