Ll_transcript_295386

• Id Trinity: TRINITY_DN51735_c0_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_295386
• Sequence: ATGAGCACTGTGACGCGCACTTGCTGTACAGTGTACACTCATAAGGACCACCCTACATTCCGTAAAGCTATTTCAATGTTATGTATTACTTTGTGAGTAC TGACATTTTAAGTGTCCGTTTATACTTTGTGCAAATGTTTTGCTTATTTCACATTCACTTTTCCTTTTCTATTCACTTTCTGCACTTATTTGTCTAGTTT TCTGTTGCTTTTTCAGTTGATACTTTCAATTAGGATTGGTCCTAGCATTTTATAGGTCTGGTGCGATAAAAGCATTTAGGATCATAATTTAGGAAACAAT TGACTATATGAAATTTGCATATCTGAATCTGAGGCTCCAAAATAAATTGTTATGGTGAAATAAAAATAAGTAGTCATAATTCATAAAAAAGTAATTATGT AATACTTTTAAAATACAATTTGAACAAAAAAGTCTCATACAAATCGAATCGTAATGACATAGATGTAATTTCTTTTTGGACTCAATTACTGTTACTTGAC TTTAGTCTAAGATATTCTTTTCAACTTCTTAATAGACTGTCTCATACTTAGGTCACTATGTCAGACCCTTATTTTAATTTTACATTAACTATATGATTGT ATAATACATTGGTCACTATAGACATCAAACTGATCAGAGCATTGAACAAATTCATGTGTAATGTAACAATAATTAATAACAACCAAATTAGAAAAGAACA AAAGCAATAGCTGGCTTGTCCTATGAGAATTTTTTGCAAAAGTTGTGCAGAAAAGGTTATGTATGTGGGTACAAGAAATTCGGGCCCCTTTAATTATGAG CACTGTGACGCGCACTTGCTGTACAGTGTACACTCATAAGGACCACCCTACATTCCGTAAAGCTATTTCAATGTTATGTATTACTTATGTTGTAATTTCT CCTATTCAGGCTTTGGAAAAACTGAAGTCTCAGCTGGCATATGCGGATGCTGCGCTTGAGGCAAGAAAGAAACCAGCCGAAGATGCAGCAGGTCCTAAGA TTATTGGGGAAGGGCTTGTTATAGATGAATGGGTGAGTATGCATACAGCTTAATTGCATTTTTAAGATAAGTCTTTGTTGCAATATGTTTGTTCAATCAA ATGCGGCATATGTTTGTTCAATCAAATGCGGCATATGTTTGTTCAATCAAATGCGGCATGTTTGTTCAATCAAATGCGGCATATGTTTAATCTGTGATTA TGTTTTCAGAAAGAGAGGAGGGAGAGATACCTCGCAAAGCAGCAGGGTGAAGTGGTAGTAGACTCTGTATAGAGGTTGGTCTTTGATAAGAATGATTGAA TAGAAGTTAAGTTCCAGCCGAAGATGTCCTTTGAGAGACAGATTATAAAATCACAGCTTCTTTCTGTAGAGAAATTTAAGGTAAATGACTAGTGCAATTG GGTGAAACTATGATTGGAAAATGGGGACTAACTCCTCTGTGTAGATAGTAAATGTTATATTGTTTTTAGTTTTTTTTTTGGATTGATATTAAATAATTTA TTCGGAGGATTGATATGACTAAGGGTTTTCTATAATTTCATCTACAACCCAGATTGGCTGAGATTTAATGAATAAATAAGCACCTTTAATTTAATTAAAA TGGATGTATGGATTAGGAGTAGCTTGATCCTCAATTTTGAAGATTACTCCGATAATTATCCATTCATTAAAAAGTCATCTAATTGCTTGTAGTCTTCAAC TAGCTATGGCAATGAAAACCGAACATGTAGGTATCCACCTGAACCGAACCCAAATTTAGCGGGGAAAACCTGATGTGATTGAGTTTGGGTTTTACCCGAT AATTTTCAAATTTGGGTTTGGTAGAGCAAAGACCCTAACCCGAACCCACCCGAAGTCATATAATTCAATTTAAAATTGAAATTTCTATCAAGTGCACATT GTTTTTAATTTCTAATTTTACTTTACATGCTATTGGATCTTCAAACATAAAAGAAATGAAATAATACAAGAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_187238;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_295386

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0
• PS1: 0.3
• PS2: 0.2
• PS3: 0
• PW1: 0.3
• PW2: 0.2
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_295386

• Blastp: -
• Blastx: Vesicle-associated protein 4-2 from Arabidopsis with 80.49% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G21450)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019445625.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;