Ll_transcript_296160

Id TrinityTRINITY_DN51771_c0_g1_i12
Name TranscriptLl_transcript_296160
SequenceAGAAAATGAAGGGAAAGTGAAAGAAAAAGAATCTTCATATGGAGCAAGAGTAGCTTCCTTGTTGTTTTATCATATATATATATTCTGTATTCCCCTTTCT CGTTTCTCACTGGTTTGAGTCTGCTTTACTCTAACCAACTTCTCTACTCTCTACACTCAAACATACACTCCCCTGGTTTGTCCGTTTGCACTGAACGATA AAGTTGTTATTTAATAATCAAACTGTCGTGACTGAAATCCTAAAATAATATTTTAACTTTTAGGATAAGACCATTTACTCGAGAGTTTATTGATTAGTAA GTGAGAGTCTCGTGTACTTACGTGCTTTTTTGGGTCAGGTACCTCAGTTTTTTTACTTTATACTCCCCTTGTTTTCATTTCCATATTTCCCTCGTCAAAA GGTGCTTTCTTTTTCTTTCTCATCTGTCCTTTTACTATTAAACTGAACAACAATTATTGGAATAATTACTTTACTTTGTAGAAGGGAACCCTCTAGTTTC ACAACTCATTCAGAGTGTTAGGAAGAAACAGTGATGGCAGGAGGAGCTCCAGCACCAAAAGCTGATGAACCACAACCACATCCACCAAAAGATCAGTTAC CCAATGTTTATTACTGCATTACCAGTCCTCCACCATGGCGTGAGTGAACCTAACTTTCATTTTAAAAAAAAAGCACTTTTTTTTGTTATGATAACTTTCT TTGTTTCTATAAATTATTTCCTTCCTTTTAGTTTTATTTTCCAGATTGTTGCTTTAGCTTAACAAATTTTCCAGATTCTTAGTTTCATGGTTGTTCATTT TAATTAATGAGTTATTTTGTTTCTCCAAAGGATTTGCTCTATTTTATGCAAGTTAGCAACAGGGTTATTTTTACTTCTGTCTTGATTGGAACTAATTTGA GAAGTCCTATTTCCAATTGATTGAAATTCTTTTGAACAGGACCTTATTGTTTTTCCTTATCTGTTGTAATTCTACATTAATGTTGATGTTTCATAGTTAT TTTCAGATCTAAATTTTGATGCTTTACAAACAATAGTTATTAATAGATAATAATGAGATTCTTAAGGGGGAAAATTATTCATGCTATTAAACTTTGGAGC ACTTAATCATTTATAACAACACTGAGCACATGCAGAGAATTATGGCTAATTAAGGAATGCTGTTTATTTGGCTAAATTCCATGCATGTTTGTTTTTTATG TTTTGTTACCTCCAACGTGTTAAATTCCCTGCTGATTACTCGTGCGTTTTCGCCAAAGCTACTTAGAGTAACTTTTGCTGCAAAAATTAAAACATGGTTC TCAACCGGGAAAGTAGCCACGCCCTGAATGCCACATTCAGTTGTCATGCTAGGTAGTTTCAACTAAAACATTGAAGAATCTCCACTTCCTCCCACCTAAA AGTCCCTGGACTCTGCTTTGTTGATAAACAAGACAATGATATATGTTTTGCTTCTTGCTTGATTTGATTTTATGTGAAATTTGGGGAATTCTATTGCAGC TGAGGCCATACTTCTTGGTTTTCAACACTATCTTGTCATGCTTGGTACAACAGTGCTAATTCCAACGGCTCTTGTTCCCCAGATGGGAGGTGGCAATGAG GAGAAGGCGCAAGTTATCCAAACACTACTCTTCGTAGCTGGAATTAACACATTATTGCAATCACTATTTGGGACTCGATTGCCTGCAGTAATTGGAGGGT CTTATACCTTTGTTCCGACGACAATCTCAATTATTCTTGCTGGTCGATTCAGTGATGAGGCAGATCCAATTGAGAAATTCAAGAGGATAATGCGGGCAAT ACAGGGTGCCCTTATTGTTGCTTCAACTCTTCAAATAGTACTAGGCTTTAGTGGCCTCTGGCGCAATGTTGCAAGGTTTCTAAGCCCACTTTCAGCAGTT CCTTTGGTATCTCTTGTTGGTTTCGGGCTGTATGAATTAGGTTTTCCAGGGGTTGCTAAATGCGTAGAGATTGGACTACCAGAGCTTATATTGGTAGTAT TTGTTTCACAGTATGTGCCCCATGTGCTACATTCGGGAAAACATATCTTCGACCGTTTTGCTGTTATCTTCACCGTTGCAATTGTATGGATATATGCTCA TCTACTCACAGTTGGAGGGGCTTATAACAACGCTGCACCTAAAACAAAAGTGTCCTGCCGCACTGATCGTGCTGGACTTATAGATGCTGCTCCTTGGATT AGAGTTCCATATCCCTTTCAATGGGGAGCACCTTCATTTGATGCAGGTGAAGCCTTTGCAATGATGATGGCAGCTTTTGTTGCTCTTGTGGAGGTAACTT TTTCTTCAGATCTTCCTTTTTTCCTTTTAAGTTGGAACAATTATTCTATTACATTCTATAACTGGGGATGGTATGTGTTTAATGTGCATTATAGTTTCAC CAAGTACATGAAGACATTGTTGGGATTATCCGGCATGTATACTTGTGTATAAGCTTAGAATTAGTTTATAAGGTTGCTAATTTGAATATATTATGCTTCA AAGTTAAGTTATTTACTTATGTTTTTATTTATTACAAACAGTCCAGTGGAGCTTTTATTGCTGTTTATCGGTTTGCAAGTGCAACACCATTACCACCGTC TATTCTTAGTCGAGGTGTTGGTTGGCAGGGAGTTGGTATTCTGTTATCGGGGTTGTTTGGAACTGTCAATGCATCCTCCGTATCTGTAGAAAACGCTGGC CTTTTGGCTTTGACTCGAGTTGGCAGTCGAAGAGTTGTGCAAATATCTGCTGGGTTTATGATTTTCTTTTCAATTCTTGGTAAATTCGGAGCAGTTTTCG CATCCATTCCACCTCCCATTATTGCCGCTTTGTACTGCTTGTTCTTTGCTTATGTTGGGGCTGGAGGTCTTAGTTTTCTTCAGTTCTGCAACCTCAACAG TTTTCGAACAAAGTTTGTACTAGGCTTCTCCATCTTCCTGGGCTTGTCTGTGGCTCAGTACTTCAATGAGTACCAAGCAATCAACGGATTTGGCCCCGTC CACACCGGAGCAAGATGGTTTAATGATATAATCAATGTGCCATTCCAATCAAAAGCATTTGTTGCTGGAATTGTTGCATATTTCTTGGACAACACACTAC ATAAGAAAGAAGGTGCTATTAGAAAAGACAGAGGCAAACACTGGTGGGATAAGTACAAGTCCTTCAAGGGTGACACAAGAAGTGAAGAGTTCTATTCATT GCCTTTCAATCTAAACAAATATTTTCCAGCAGTGTAGTTTTGCAAAGGACCATAACCATATAAGGTGGCTTCATCAAATATTGATTCACCATAGTGACTG AAAGGTCTTGATTATAGGCTACAGCTATATATGAATCTAGTTTCCTTGGCTAGAAGAATATTTTACAACATTATTTTATTGCTTTTGTTTCTGTGAATGT TGAACTGCAAAGAGGATTCATGGTAGTAATGAGCATGTTTTATTTAGCAAGCAATTTATTTATAATTATATTAGTTCGCTTTATTTACTTCACACCTTGC ACTTTTTAACTGTTATTGGAGATATCATCAAATCAAATGGTATGGATGTAATGCATATTAATGAGAG BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_187495; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_296160

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_296160

BlastpNucleobase-ascorbate transporter 6 from Arabidopsis with 84.25% of identity
BlastxNucleobase-ascorbate transporter 6 from Arabidopsis with 83.97% of identity
Eggnogpermease(COG2233)
KeggLink to kegg annotations (AT5G62890)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019456774.1)
PfamPermease family (PF00860.19)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;