Ll_transcript_296174

• Id Trinity: TRINITY_DN51771_c0_g1_i26
• Name Transcript: Ll_transcript_296174
• Sequence: AGAAAATGAAGGGAAAGTGAAAGAAAAAGAATCTTCATATGGAGCAAGAGTAGCTTCCTTGTTGTTTTATCATATATATATATTCTGTATTCCCCTTTCT CGTTTCTCACTGGTTTGAGTCTGCTTTACTCTAACCAACTTCTCTACTCTCTACACTCAAACATACACTCCCCTGGTTTGTCCGTTTGCACTGAACGATA AAGTTGTTATTTAATAATCAAACTGTCGTGACTGAAATCCTAAAATAATATTTTAACTTTTAGGATAAGACCATTTACTCGAGAGTTTATTGATTAGTAA GTGAGAGTCTCGTGTACTTACGTGCTTTTTTGGGTCAGGTACCTCAGTTTTTTTACTTTATACTCCCCTTGTTTTCATTTCCATATTTCCCTCGTCAAAA GGTGCTTTCTTTTTCTTTCTCATCTGTCCTTTTACTATTAAACTGAACAACAATTATTGGAATAATTACTTTACTTTGTAGAAGGGAACCCTCTAGTTTC ACAACTCATTCAGAGTGTTAGGAAGAAACAGTGATGGCAGGAGGAGCTCCAGCACCAAAAGCTGATGAACCACAACCACATCCACCAAAAGATCAGTTAC CCAATGTTTATTACTGCATTACCAGTCCTCCACCATGGCGTGAGTGAACCTAACTTTCATTTTAAAAAAAAAGCACTTTTTTTTGTTATGATAACTTTCT TTGTTTCTATAAATTATTTCCTTCCTTTTAGTTTTATTTTCCAGATTGTTGCTTTAGCTTAACAAATTTTCCAGATTCTTAGTTTCATGGTTGTTCATTT TAATTAATGAGTTATTTTGTTTCTCCAAAGGATTTGCTCTATTTTATGCAAGTTAGCAACAGGGTTATTTTTACTTCTGTCTTGATTGGAACTAATTTGA GAAGTCCTATTTCCAATTGATTGAAATTCTTTTGAACAGGACCTTATTGTTTTTCCTTATCTGTTGTAATTCTACATTAATGTTGATGTTTCATAGTTAT TTTCAGATCTAAATTTTGATGCTTTACAAACAATAGTTATTAATAGATAATAATGAGATTCTTAAGGGGGAAAATTATTCATGCTATTAAACTTTGGAGC ACTTAATCATTTATAACAACACTGAGCACATGCAGAGAATTATGGCTAATTAAGGAATGCTGTTTATTTGGCTAAATTCCATGCATGTTTGTTTTTTATG TTTTGTTACCTCCAACGTGTTAAATTCCCTGCTGATTACTCGTGCGTTTTCGCCAAAGCTACTTAGAGTAACTTTTGCTGCAAAAATTAAAACATGGTTC TCAACCGGGAAAGTAGCCACGCCCTGAATGCCACATTCAGTTGTCATGCTAGGTAGTTTCAACTAAAACATTGAAGAATCTCCACTTCCTCCCACCTAAA AGTCCCTGGACTCTGCTTTGTTGATAAACAAGACAATGATATATGTTTTGCTTCTTGCTTGATTTGATTTTATGTGAAATTTGGGGAATTCTATTGCAGC TGAGGCCATACTTCTTGGTTTTCAACACTATCTTGTCATGCTTGGTACAACAGTGCTAATTCCAACGGCTCTTGTTCCCCAGATGGGAGGTGGCAATGAG GAGAAGGCGCAAGTTATCCAAACACTACTCTTCGTAGCTGGAATTAACACATTATTGCAATCACTATTTGGGACTCGATTGCCTGCAGTAATTGGAGGGT CTTATACCTTTGTTCCGACGACAATCTCAATTATTCTTGCTGGTCGATTCAGTGATGAGGCAGATCCAATTGAGAAATTCAAGAGGATAATGCGGGCAAT CCAGGGTTCACTTATTGTTGCTTCAACTCTTCAAATAGTACTAGGCTTTAGTGGCCTATGGCGTAATGTTGCAAGGTTCTTAAGTCCACTTTCAGCCGTC CCTTTGGTATCTCTTGTTGGTTTTGGGCTGTACGAGTTAGGCTTCCCAGGGGTTGCTAAATGCATTGAGATTGGGCTGCCAGAGCTTATATTGCTGATTT TTGTCTCACAGTATGTACCGGATGTGCTACATTCAGGAAAACATATCTTCGGTCGTTTTGCTGTTTTATTTACAATTGCAATTGTGTGGCTATATGCTTA TATACTCACTGTCGGAGGGGCCTATAAGAATGCTGCACCTAAAACGCAGGCAACTTGCCGGACTGATCGTGCTGGCTTAATAGAAGCTGCCCCATGGATA CGAGTTCCATATCCCTTTCAATGGGGACCACCTTCGTTTGACGCAGGTGAAGCCTTTGCCATGATGATGGCATCCTTTGTTGCTCTTGTAGAGTCCAGTG GAGCTTTTATTGCTGTTTATCGGTTTGCAAGTGCAACACCATTACCACCATCAATTCTCAGTCGGGGTATCGGTTGGCAGGGAGTTGGCATTTTGTTATC AGGATTGTTCGGAACTGTCAATGCGTCCTCTGTGTCTGTAGAAAATGCAGGTCTGTTGGCCTTGACCCGTGTTGGCAGTAGAAGAGTTGTGCAAATATCT GCCGGGTTTATGATTTTCTTTTCAATTCTCGGAAAATTTGGAGCCGTTTTCGCTTCCATCCCACTGCCCATTGTTGCTGCTCTCTACTGCTTGTTCTTTG CTTATGTTGGTGCCGGAGGTCTTAGTTTTCTTCAGTTCTGCAACCTTAACAGTTTTAGAACAAAGTTCATACTAGGCTTCTCTCTTTTCCTGGGTTTGTC TGTGCCACAGTACTTCAACGAGTACACAGCAATTAATGGTTTTGGACCGGTCCATACAGGCGCAAGATGGTTCAACGATATAGTCAACGTTCCGTTTCAA TCAAAACCATTTGTTGCGGGCGTCGTGGCATATTTCCTGGACAACACACTGCATAAGAAAGAAGCCAGAAAAGATAGAGGAAAACATTGGTGGGACAAGT ACAAGTCCTTCAAGGGAGATACAAGAAGTGAGGAGTTTTATTCACTACCTTTCAATCTAAACAAGTACTTCCCCTCTGTTTAATTGTGAAAAGGGGCTAA ATTACAATGCAGTTTTATAAGTCTTGTCCTAATATTTAGATTGAATCTTATTACACCCCATAGGTTGTAACTATATGAATACTCCACCTTGTTATGGAAT TTTGTGAAACTTCGTTTTTAACTGTTGTTTCTGTAAGGAGCATGTTAATCTATCTATCATATAAATGTTTATACCATCTTCATTCACTCTTCAAAAAAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_187495;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_296174

FPKM

• PAB: 1.3
• PNAB: 6.2
• PS1: 5.4
• PS2: 5.9
• PS3: 5.6
• PW1: 4.9
• PW2: 7.2
• PW3: 3.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_296174

• Blastp: Nucleobase-ascorbate transporter 6 from Arabidopsis with 84.47% of identity
• Blastx: Nucleobase-ascorbate transporter 6 from Arabidopsis with 84.85% of identity
• Eggnog: permease(COG2233)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G62890)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019463856.1)
• Pfam: Permease family (PF00860.19)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;