Ll_transcript_297240

• Id Trinity: TRINITY_DN51795_c0_g1_i14
• Name Transcript: Ll_transcript_297240
• Sequence: TTACAACTCTATCAATTATCATGATCACCCAATCATTTGTGCTTACCTTATCAGTTATCACAATTAAACCATTAAACAATTCTGGAAACATGGGATTCGT CAATGACACGTCATTTCTTGTTCCTTTACTTCATAACAATAGAACCTTCCCTTACACATATAGAAACTCTGAAACCCCAAAACGATTCGACACTGAGTTG AATCGGAGCCACTAGCGAGAGATACGAAGAGCGAGTTGGTGACTCGGTTGAGAAAGATAGAGAAACATGTCTGGTATTGCTCGTGGACGCCTCACTGAGG AACGAAAATCATGGCGGAAGAACCATCCTCATGGTTTTGTTGCGAAGCCTGAGACTCTGCCTGATGGTACGGTGAATTTGATGGTCTGGCATTGCACAAT TCCTGGAAAAGCTGGGACTGATTGGGAAGGTGGCTACTTCCCACTTACACTGAACTTTAGTGAAGACTACCCTAGCAAGCCTCCGAAGTGTAAATTACCA CAAGGTTTTTTCCACCCTAATGTCTATCCATCGGGAACCGTTTGCTTGTCTATTCTTAATGAGGATAGCGGGTGGAGACCAGCCATAACAGTGAAGCAAA TTCTTGTTGGCATCCAAGATTTGCTTGACCAGCCAAATCCTGCTGATCCTGCCCAGACAGAAGGCTATCATCTATTCATCCAGGATGCAGTGGAGTATAA GAGAAGGGTCCGGCAGCAGGCAAAGCAATACCCAGCTATTCTCTAGTGCTTTATCTCATTCCGTGCTAAAACTTACTAATCTGTGATTGTTGACTGTCAT GATATGCAGACACCTTGGTTTTAAGTATTTTTGCTTATTCTCATATCTGGATGAAGTGCTAATATAAACAGTGAAAGTCAACTAATACATACTTGTTGGC GATGCATTTTCTGCTTGATATTTGCTGCTCTAGTTCTAATATGAATGAATTATTTACTGTGATGACTGGTGAATTATATGTCCGTTTTTGTTTCTGGATT CTGTTTCCTTTATGGAGATCAAAGATATACCCTTACTGGCCAATTGTTGTGTCATTAGACTGTTGCTTATGTATAATGGCAGCATTTATTACCGAAACAT TTACCTCTTACATCTGAAAGAGGGAAGGGATGATTTGTTCCGATCCTAAAATCTCCCAGTTTTGCAACCTGGATGTTGTGGAATGCTCAATATCCTGTCT GGTTATGGAGTATGAGCCTCTCATATTATGAGGATGGTTACTGGTGGCTAGATGAATTAAGGTCCAGCCCTATTGCCGTTAAAGATAACCACTTGTATTG TTTGGATGTGGCTAGGAAGGGAGAAAGGATGGAAAAAGTTGCTTGGAGTTGAAGTTTAAATTCCGTTTTAATATCGTTTCAGTTACATCATGAATGTTGA TAAAATGTTTTCATGTCATCTTTTTAGCCAAACCTCATTCAGGTTATTAATATCTGATAAGGATTACTGGTGGATCTCATGCAGGAATGAGAATAGGATA GGGTTATTATGGTCCAAGACAGCTCAAGAACCTTATCAACCTGATTGATCCAATGGTTAATTTTGGTTGGGGTCAGGTATGAGTTAGTTAAAGAACACAA CATATTTGGTTGGTTGGGTTGTTGGTTTTGGCTTTTGAATATTGACGACTTATTTAAAGAACTAGATTTTTGCCCCCATGCACGGAATGCTAGTTTTTGT TTTTATAAATGCTTCATCATATCAGTAACAGTACTCACATCCTTAAATAAATTTAATTGAGAAAAAGGTGTACGCATTGTCAGCATATGAGTTTTATATA TTCATTTTTAATCACCATTGACTATTCAAAAAAGTAATAAAAATGAATGATGAATAATATACTGAGTGTGTATATATATTTACATTGACATTGCATAAAT ATTACATCGCATGCATTTCTTTAGGATGAAGAACTCAGCCATCAAGGTCAAGGAGTTTATTTCTTTTGAAGTATGAGTAGGAGTAGTAACAAAGTTGTAT TATAATGTACAATATATATGTATGTGATGAAAATTAAAAAGAACATAATATATATGTAGTGTCAAAATAAATAAACTACTCAAAAGGTGGCCTTGATGGC CTATGAGTTCTTCATCATAAAGAAATGCATGCATCTCTTTATGCTAAAGAAATATGCATCACATGACTAAACATAATACTTATCAACATACTTGATATTC AAAGGGCCTATTTGCTTTTCTGTTTCCTGATGTATTAGCTTGCAATATCCATTGGGGTGTGCTTCCGGTATCACATAGGACCCTTCCCACTTAGGTGCCG ATATCCATACATGTTGGTTTCTCATTTTTGCATCTGTCACCTTATGATCATTTTATGATAACTTTTCAATTTGTCATTGGCTCTTTCTCTTGCTCCATCC ATGATCTCTGCCTCCAACACTCTGTCTTTCTTCCCTTCCGAATGCATCCTGGCTGATGGACTCCAACTTCCAGAGGCAAGACAGCTTCCGCTCCATACAC CAATGAGAATTGTGTCCTTCATTGTCCCTTGCTTAGTAGTCTTATATGCCCACAAGGCTAATGAAAAATAGTCATTCCAGTTTTCAGGTACATCATTCAT CATTATTGTCAAGATATTGATCATCATCTTGTTAGTTGATTCAAGTTGACTATTCGATTTGGGATAGTAAAATGTAGACTTATGATGCCTGATCTTGTAC ACATCATGCACTCTCTTGATAATGAAATGAGCATCATTATCAGACATGATTCTTCCTAGCAACCAAACCTGCAGATGATGTTTTCCTAGATGCATCTCAC AACTAATTCCTCATTAGTGTTTGTACACCTACAAGTTCCACCCACTTGGTGTATTGTTCACTTGTAGGTAGAATATACTTATTCTTTCGTGGTTGCAGGT TCGCAGAAGTAATCTATTGTTACCGGTTCGACCCCCAAACTTCTTCCTCCTTGATGCCTCCTGTATGAGTAGAGATCCTATCCAATACTGGAGAGTATAC TAAAAATGAATAAACTCCATTCCCCCCTCCTATTTTAGTATCGGATGGTGCATTACTGCAAAAGATCCCAACCCCTCCCGCATACCCCCTTGTGTGTTTC ATCAACACCTTATCTTGATCTCCCTTCTCCATTCATTGAAGAGTCACTCCTGTGAAACCTGTTTTAACAGTTCTCCTTTGTCAAAGAGGTGCTTATTTGC TTGTCTCAACACTTTTCCTCCCCGCTTGTTCAAGGGAAGTATCCCTGCTTCTAGATACTCCTCCAAAGGCCTTATCCAATCTTGATTCACCAACGGTACC ATCGCCGTTTCCCTAATCTTTTGGCGCGACATACACACTACAATGACAGCGTCTCCCTAATCTTTTGGCGCGACATACACACTACAATGACAGCGTCGCA ATGTGTCTTCTTGCTAAGCAAGTATACTCCCAGTTGCTGCACTCTTCTATATAAGCTTGAACCTTCTTGTCTACACATTTGTAATACTTTTTTTCCACCT TCAGGAACACATAACATTAGGACCCCCTTTGGATTCTTGCACAATTCAGCTTTATATTTGATGAAGTCTTTTGTGATCCTGATGTTGTAGCTAATATGAA TTATGGTATGTATCTTACACTCAGCTATCACAGTATTGTATGGGAATGTTAATTATCTTTCTCCTTAGGCTTTGTCCAGTTGATTAATGGTTAATTACTG AGTTGAGTTTGGAGAGGAAGAGAAAGGGAAAGGAAAGACTTTAAAGTCATCTGTCAAATGTATCTTAGTTCTAAAGTATTTCTTTTTTTTTTCTCCACTC GAAAACTAAACTCGTAAACGAACTCTAAAAATTGTTATACATGGATTTTAAATTAGTGGAGCCAAGTCAGACTTAGATATGATAACTACTAAACAATGGT CCCACCCCTTGTAACACGAAACATAGTATTTGTTCTGGGATCATATATGTTGTTCTACACCATATACTATCAATTTTGATGAGTTGAAAAAAATTTATTT AAGTTAAAATTGTAATCATTTGTTCAGTTAATCTTCCGATATATAAGCTCTAGTTTAATCATATATTTTTTAAAGGGAGGGATCAAGTCACTCTAAGAGT AACTCTTTTAGGCTTACTCCTCATCTTAACCATCAATTCTAGATACATCCAATGGTTTGAATTAATGAATAGATTTAAATTATTGGATTTCCAAGAAATT GATGGCTAAAATAAGGAGTAAATCTAAAAGAATTACTGTTGGGGTAACTTGATACTCACCCTTTTTTAAATTATATTATTTGAATTTATATTTTAATTAT TTTGGAGGGAAAATTATCATAACAAGTTTTATTTAACATGTAGAAAAGGAGTAGATCATAATAGGGTTTTTTATCAGCTAATATTATGAGTAAACATGGG CCCGAGATGGTGGGTTATGGTTGGAATTAAACCAGTAATACTAGTTATAGTACCTATTATTCAAAGAGAAATTGCAGTGACTATGATTTATTTGATAGTA TCATTGGAAATGGGGTTTTGACATGGAATAATGTGGAAGGTAATCTGGTCTTAGGTAGTTGTGGGTTGGTTTATTGGCATTGAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_187656;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_297240

FPKM

• PAB: 3.1
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.3
• PS2: 0.2
• PS3: 0.5
• PW1: 0.7
• PW2: 0.8
• PW3: 0.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_297240

• Blastp: SUMO-conjugating enzyme SCE1 from Arabidopsis with 88.61% of identity
• Blastx: SUMO-conjugating enzyme SCE1 from Arabidopsis with 88.61% of identity
• Eggnog: ubiquitin-conjugating enzyme(COG5078)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G57870)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019446820.1)
• Pfam: Ubiquitin-conjugating enzyme (PF00179.25)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;