Id Trinity | TRINITY_DN51795_c0_g1_i6 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_297229 |
Sequence | ATAAAATGCAATGCTGATCCATTTCCGCGTACACTTGTGTATGTGTGCCCCCACCCCAAACCTCAAACCAAAGCAAAACGTGACATGTCTCATTCAGTTC ACTACTTCTAGGCCTTTCCACCTCAAATAAACCACCACTACTCACATTCTTTTTGTGCTTTTTATCTCACACAACAAGATCCCCTTTTTAATTTCTCTGC AAAAGCTGAAAAGGGTGGAGTGGAAATGGCTGATTGGGGTCCAGTAGTGATAGCAGTGGTGCTGTTCGTGCTCTTGAGTCCAGGGCTGTTGTTTCAGATA CCAGGGAAGGGAAGAGTTGTTGAGTTTGGGAATATGCAAACTAGTGGTGCTTCTATTTTGGTTCATGCTATCATTTACTTTGGCCTCATCACTATCTTTC TTATTGCCATTGGGGTTCATATCTATACCGGGTAACTTTGTATTTTGGTTCAGATTTAAATGGAAGGAAAATTATGTGGTGAATTATATGTCCGTTTTTG TTTCTGGATTCTGTTTCCTTTATGGAGATCAAAGATATACCCTTACTGGCCAATTGTTGTGTCATTAGACTGTTGCTTATGTATAATGGCAGCATTTATT ACCGAAACATTTACCTCTTACATCTGAAAGAGGGAAGGGATGATTTGTTCCGATCCTAAAATCTCCCAGTTTTGCAACCTGGATGTTGTGGAATGCTCAA TATCCTGTCTGGTTATGGAGTATGAGCCTCTCATATTATGAGGATGGTTACTGGTGGCTAGATGAATTAAGGTCCAGCCCTATTGCCGTTAAAGATAACC ACTTGTATTGTTTGGATGTGGCTAGGAAGGGAGAAAGGATGGAAAAAGTTGCTTGGAGTTGAAGTTTAAATTCCGTTTTAATATCGTTTCAGTTACATCA TGAATGTTGATAAAATGTTTTCATGTCATCTTTTTAGCCAAACCTCATTCAGGTTATTAATATCTGATAAGGATTACTGGTGGATCTCATGCAGGAATGA GAATAGGATAGGGTTATTATGGTCCAAGACAGCTCAAGAACCTTATCAACCTGATTGATCCAATGGTTAATTTTGGTTGGGGTCAGGTATGAGTTAGTTA AAGAACACAACATATTTGGTTGGTTGGGTTGTTGGTTTTGGCTTTTGAATATTGACGACTTATTTAAAGAACTAGATTTTTGCCCCCATGCACGGAATGC TAGTTTTTGTTTTTATAAATGCTTCATCATATCAGTAACAGTACTCACATCCTTAAATAAATTTAATTGAGAAAAAGGTGTACGCATTGTCAGCATATGA GTTTTATATATTCATTTTTAATCACCATTGACTATTCAAAAAAGTAATAAAAATGAATGATGAATAATATACTGAGTGTGTATATATATTTACATTGACA TTGCATAAATATTACATCGCATGCATTTCTTTAGGATGAAGAACTCAGCCATCAAGGTCAAGGAGTTTATTTCTTTTGAAGTATGAGTAGGAGTAGTAAC AAAGTTGTATTATAATGTACAATATATATGTATGTGATGAAAATTAAAAAGAACATAATATATATGTAGTGTCAAAATAAATAAACTACTCAAAAGGTGG CCTTGATGGCCTATGAGTTCTTCATCATAAAGAAATGCATGCATCTCTTTATGCTAAAGAAATATGCATCACATGACTAAACATAATACTTATCAACATA CTTGATATTCAAAGGGCCTATTTGCTTTTCTGTTTCCTGATGTATTAGCTTGCAATATCCATTGGGGTGTGCTTCCGGTATCACATAGGACCCTTCCCAC TTAGGTGCCGATATCCATACATGTTGGTTTCTCATTTTTGCATCTGTCACCTTATGATCATTTTATGATAACTTTTCAATTTGTCATTGGCTCTTTCTCT TGCTCCATCCATGATCTCTGCCTCCAACACTCTGTCTTTCTTCCCTTCCGAATGCATCCTGGCTGATGGACTCCAACTTCCAGAGGCAAGACAGCTTCCG CTCCATACACCAATGAGAATTGTGTCCTTCATTGTCCCTTGCTTAGTAGTCTTATATGCCCACAAGGCTAATGAAAAATAGTCATTCCAGTTTTCAGGTA CATCATTCATCATTATTGTCAAGATATTGATCATCATCTTGTTAGTTGATTCAAGTTGACTATTCGATTTGGGATAGTAAAATGTAGACTTATGATGCCT GATCTTGTACACATCATGCACTCTCTTGATAATGAAATGAGCATCATTATCAGACATGATTCTTCCTAGCAACCAAACCTGCAGATGATGTTTTCCTAGA TGCATCTCACAACTAATTCCTCATTAGTGTTTGTACACCTACAAGTTCCACCCACTTGGTGTATTGTTCACTTGTAGGTAGAATATACTTATTCTTTCGT GGTTGCAGGTTCGCAGAAGTAATCTATTGTTACCGGTTCGACCCCCAAACTTCTTCCTCCTTGATGCCTCCTGTATGAGTAGAGATCCTATCCAATACTG GAGAGTATACTAAAAATGAATAAACTCCATTCCCCCCTCCTATTTTAGTATCGGATGGTGCATTACTGCAAAAGATCCCAACCCCTCCCGCATACCCCCT TGTGTGTTTCATCAACACCTTATCTTGATCTCCCTTCTCCATTCATTGAAGAGTCACTCCTGTGAAACCTGTTTTAACAGTTCTCCTTTGTCAAAGAGGT GCTTATTTGCTTGTCTCAACACTTTTCCTCCCCGCTTGTTCAAGGGAAGTATCCCTGCTTCTAGATACTCCTCCAAAGGCCTTATCCAATCTTGATTCAC CAACGGTACCATCGCCGTTTCCCTAATCTTTTGGCGCGACATACACACTACAATGACAGCGTCTCCCTAATCTTTTGGCGCGACATACACACTACAATGA CAGCGTCGCAATGTGTCTTCTTGCTAAGCAAGTATACTCCCAGTTGCTGCACTCTTCTATATAAGCTTGAACCTTCTTGTCTACACATTTGTAATACTTT TTTTCCACCTTCAGGAACACATAACATTAGGACCCCCTTTGGATTCTTGCACAATTCAGCTTTATATTTGATGAAGTCTTTTGTGATCCTGATGTTGTAG CTAATATGAATTATGGTATGTATCTTACACTCAGCTATCACAGTATTGTATGGGAATGTTAATTATCTTTCTCCTTAGGCTTTGTCCAGTTGATTAATGG TTAATTACTGAGTTGAGTTTGGAGAGGAAGAGAAAGGGAAAGGAAAGACTTTAAAGTCATCTGTCAAATGTATCTTAGTTCTAAAGTATTTCTTTTTTTT TTCTCCACTCGAAAACTAAACTCGTAAACGAACTCTAAAAATTGTTATACATGGATTTTAAATTAGTGGAGCCAAGTCAGACTTAGATATGATAACTACT AAACAATGGTCCCACCCCTTGTAACACGAAACATAGTATTTGTTCTGGGATCATATATGTTGTTCTACACCATATACTATCAATTTTGATGAGTTGAAAA AAATTTATTTAAGTTAAAATTGTAATCATTTGTTCAGTTAATCTTCCGATATATAAGCTCTAGTTTAATCATATATTTTTTAAAGGGAGGGATCAAGTCA CTCTAAGAGTAACTCTTTTAGGCTTACTCCTCATCTTAACCATCAATTCTAGATACATCCAATGGTTTGAATTAATGAATAGATTTAAATTATTGGATTT CCAAGAAATTGATGGCTAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_187656; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_297229
Blastp | - |
---|---|
Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0002879) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_003525413.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |