Id Trinity | TRINITY_DN51799_c1_g1_i14 |
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Name Transcript | Ll_transcript_297272 |
Sequence | GAAAGAGTGAGAATTTTGGGTCTAACTTCAGCACTATTTCTCTGCACCATCTTCCAAAACTTTTTCCCTCTTTTTTCTGCTTCATTCATTTTCCGATTTT CTCTCTTAATTCTTCACATCAGAGATCAGATATGGACTCTCATTCCGAAAACTTGACTTCGCTCTTCCAAAAACCTCAACCGGAGGAGCTTCATCACCGC AAGCCTCGTCTCGGCCGCAAACCTAAGAAGCGCCGTCGTTTTCACCAGGCTACTGAAATCGGAGCGAGTTCAGGTAATTTTACTTCTGATGATAACAATT TGGTGGTTGAGGATAGTGAATTTAAGGGAATTTTGGAAGGGAATGGTTCCGTTGGCGTGAATTCGGGAGTGTGCGGTGAGTTAGGTTGTGGATTTGATAC GAGTTTAGGTTTGGGAAATGGGAAGTCGAATGGGAGCGAAGTAACTCGAGTAAGGATAATTGCGTCTGAGGAGGGTTTGGATCATAAGAGTGTGGAAGCT AATGGGAATGTGCTTGATTTGAATGCTAGGATTAATTTGAATTTGAATGAAGGGTTTAGTTCACCTTTTAATAATGTTGAGGACGATGGTAGTTTGAAGA GAAGGGATTCGGTTGATTTGAATTTGGATGTGGATAATGAGGAGGATGGTGGTGACCGGAGTGTGTGTTATTTGGGCCATTCGGGAGGGGTGATGTTGGC GGAGGATGGTACAATTGATTTGAATGTGGATGTAGGTGAGGAAAGGGGTGATGGTGTTGATGGAAATGGACGTTCCGAGTTGGATGCTTCGTTTGATAAG ATACAGCAGACTGATAATATGAATCAGAAATCCACGGAAGCTTTAGGTGCCGCCACTTGTTTGATTGAGGAAAAGGAAGGTGATGATGTCAACGGAGACG CATCGGCTATTGACTCTCTCCAGGTTACAAATGTAGTTTCTGCTAAGGATTGTGATTACATGGAGGTTCAACAAATTGATAACAGTCCTTCTGCATTCCA AGGAAGTAGCCAGAGGAAGAGAAGAAAGGTATCAAAAAATGTAAAATCCACGACAGAGACAATTTTAAGGAGGAGTTCTCGCCAGGCATCGGCTAGAAAA CAGGTTTCAGGCACCATAGCATTGCAGGAGATGTATGATCCTTTGTTGTCTGTGGTACCCAGTTCCTTAACAGAAGAAAAACCTGTAACCTCTGGTGATG AGAAATATGAGCAGTGCAATGTTCCTCCACCGAAGTTGCAATTACCCCCCTCTTCTCAAAATTTGAATTTAGATGATGTTCCTGTTCTTGAACTTTTTTC TATTTATGCTTTTTTAAGATCTTTTAGTACTTTTTTATTTTTGAGTCCATTCGAATTGGAGGATCTTGTTGCCGCAGTGAAGTCTGAAACCCCCAGTATG TTATTTGACAGCATTCATGTTTCTATTTTGCACACTTTGAGAAAGCATTTGGAATATCTTTCCAGCGAGGGTTGCCAATCTGCAGCCGATTGCCTGAGGA ATCTTAACTGGGATTTCTTGGACTTGGTCACATGGCCCATTTTCATGGCCGAGTACCTGCTGATTCATGCCTCAGGATTTAAAACTGCTTTTGATCTTAA CCACTTAATGTTCAGAACTGACTACTGTAAACAACCTGTAAATGTGAAGATTATGATACTGCAGTACCTTTGTGATGATATGATTGAAGTGGAAGCCTCA AGGTCGGAGCTTAACAGAAGATCTTTGACAAAAGAGGCTGATATGGGCTTTGATCAGAATATGTATTTTGACACTTGTAAGAAAAGAAGAGCTGTAACGG ATATTTCTGGTGGTTCTTGTTTGACTGAGATTGTGGATGATACAATTGACTGGAACAGTGATGAGTGCTGCCTCTGTAAGATGGATGGAAGTTTAATATG CTGTGATGGTTGCCCTGCTGCATTCCACCCAAGGTGTGTGGGAATTGCAAGTGGCAATCTGCCCGAAGGTGACTGGTATTGCCCTGAGTGTGCAATTGGG CCACACAGGGCTTGGACGAAATCACATAAGTCACTTCGAGGAGCAGACTTGTTGGGGATTGATCATCATGGCCGTCTTTATTTTAGCAGCTGTGGTTACC TGTTAGTGTCAGACTCATCTGGTACAGATTCCTTGTTCAGTTATTACCACAAAAATGATATACATGTTGTAGTTGAAGTTCTAAAGTCTATGGGTACTTT GTATGGAAGCATATTAATGGCTATTTATGAACATTGGGATATCCCTGCTAACTTGTGTGTGGGGACCAGTAACTTGGTAGTCTTTAATCAAAGTTCCTGC AAGAACGTGCATATGAGCGGAAAGTATTATGCTAGTTTAGACAATAATCTGGCTGATGATCAAAGAAAGTTGGATGAAAATTCAACTGCTGACTGTTCTA CTCATCCTGGCCAAGACTTTCCAAAAGCTGGGACCCGCTTAGATTCAATGACTACTATAGAAAGTCCTTGTGTTGCTTCAGAAGGGTCAGCTGATACCAC ACAAATGAGATCAGGGATTGAGAATGTTCAAATGCCTGGACTTTATGGTTCCACTAGATCCGATGAATCCTTGAATCAGTCTGGAAAACCAGAAAAACAT CATCCAGTTGGTGATTGTTCTTTGACATCTTCCAGCTTAGATGTAGGGCATAAAATAAACTTAAGTTCTGTGGGTGCTAGCTGTACCCCCGCCACTGACA ATAAGGATACTTCAGAAGTGCCTTTTGGAGCTAACTACGTAAACTACTATAGTTTTGCCCGAACAGCCGCATTGGTTGCACAAGAGTTGATGTGCAAGTC ACCTGAAAAGATTAATAAGAATTATGCAATGTCTGATGAGGACATAATTTCGGAACAAGGAAAGGCCATTATAAAGAAATCTTCAAACTTTTGTTGGCCA AGCATTCAAAACCTGAATGATGTTGCTGAAAAGGAAAAATGTGGGTGGTGCTTTTATTGCAAAGTTGCTAATGATGACAGGGATTGCTTGTTTAATGATG TGATGAAGTCTGTTCGGGGAGTGTCGAATAGTACTTTAGTTGGGCTTCAATCCAGGAAGATCCAGAATGGACATCTTACAGCTATCATATGTCAGATTGT TTCCCTTGAGGACCGATTACGTGGGCTTTTGTTAGGTCCATGGTTGGATCCTCATCAAACCAATCTTTGGCATAAGGAGCTTATGAAGACATCTGATTTT GTTCCTGTTAAACGATTATTGCTCCTTGTAAGAATATGCTTTCTCTCTGTCAATTATTTTCGTGAATGACAATTAGTGCAAATTAAGTAAAAATGTAAAA CCGTTTGTGTTATTTTAATTATCAACTTAAAGTTGCACATGAGTGTGTGATTGAACATCATGGTGTTGTTTGATTCACGTAGCCTACCACACCTGGTGGA AAAAGGCTTGGTTGTTGCTGTAATATTGCACATGTTTGTGATTGAAATTTTTAATTTAGACCGTGTCAAGGGGTTTTGTTCCCTTTCTTT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_187685; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_297272
Blastp | DDT domain-containing protein PTM from Arabidopsis with 38.54% of identity |
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Blastx | DDT domain-containing protein PTM from Arabidopsis with 37.87% of identity |
Eggnog | Membrane-associated zinc metalloprotease(COG0750) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G35210) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019454302.1) |
Pfam | DDT domain (PF02791.16) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |