Id Trinity | TRINITY_DN51819_c1_g1_i26 |
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Name Transcript | Ll_transcript_446952 |
Sequence | AAGGAACCTCATAATCAACCAAAACAGACCGATAAATCCAAATGGTTAACCATGCTAGAAATATTAGTAAGAGAATATTTCATGCACCCCTCCACTATAA ATTGGGGCTCATCGCATAAGGAAGTCCAACCTCAACTCAGACAACTCCATGAAGAGTTCGAGCCAGATTACAACCCAACCCATGCTTTGCTCAGCCGACG AAAAGACCTCGATCCCAATTATTGCTCGGCTCACCCTCCTACGCACCAATAAGAACGAATCAATAATTAAAAAAAAATAAAGAATGTTAAGATTTTTTTA ACTGACATGATATATTTTTATCGATATATCAAAAGTTTTCCATGTATATGCCAAATTTTCCTCTTATTCTTCCATTACGGTTCCTTTAATCATTATTCAT TTCCTCATCTAAACTTTCAGATTTGTTTTCCTTCCTCAATCGTTTTTGTGATTCCAATCAATAACAGTAATCTAAACAAAGCATATTGAAAATCGAAGGA TACAAAATCAATTCACTATTCCAAATTTCTGAATCAAAGTTTCCACCATGCGAGGTCACGATTGGATCAACACAAATCTCCCTGAAGAGTTAATCGTCGA GATCTTCCGCCGCCTAGATTCCAAATCCACTCGCGACGCTTGTTCCCTCGTCTGCCACCGCTGGCTCCGCCTTGACCGACTCACTAGATCCTCCCTCAAA ATCGGCGCCACCGGTTCCCCTGACCTTTTCCTCCGAATCCTATCCACTCGCTTTCCCAATGTCACCAATGTCCATATCGATCAGCGCCTCTCCGTTTCTC CACCTCCTCCTATTCAGGGGAGAAGAGGGTCAAGGGACAATTCTAAGGTTTCGTCTGAGGAGAGCGGTGGCAGCAGCAATGTTGTTTCTCTGTGTTTATC 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GGGAACAGAGGGATAATTGCTGTTGGCAAGCATTGTAAGTTGCTGACTGATCTTAACATCCGATTCTGTGATAGGGTGGGGGATCAGGCCCTTATTGCTA TAGCTGAGGGTTGTTCCCTTCATTATCTGAATGTCAGTGGTTGCCACAAAATTGGAGATGCTGGAGTGATAGCCATTGCAAGGGGGTGCCCTCAACTCTG TTACTTGGACGTGAGTGTACTGCAGAATTTGGGTGATATGGCGATGACTGAATTGGGAAAACACTGTCCACTGCTTAAAGAAATAGTGATCTCACACTGC CGTCAAATAACAGATGTTGGTCTAACTCATCTTATAAAAGGTTGCACCATGTTGGAGTCATGCCATATGGTTTACTGCTCTGGTATAACTTCAGCTGCAG TGACCACAATGGTCTCTAGCTGTCCCAACATCAAAAAAGTACTCATTGAGAAGTGGAAGGTTAGCCAGAGTACCGAGCGCCGAGCAGGCTCCGTCATTTC TTACTTTTCTGTGGATCTATAGACCTCCTTTGGTACACATTACGAATTTGATGTCTGTTTGGACGTAAAGCAATCGTAAGGTTCATGTTTTTACATCTGT TTTCAGTTATTAAGCTGAACTTCCATCCTTCAGAGGATACAGTTTTTTCTTGGACAAATTTTAATGTATGAAAGTTATCACCCTCTTCGGAGTATCGACA TTATAGCCGTGGAACCCATGGGCTTAGAAATAAGTGATATTTACAATAAGTTGATTTCTAGACAAATAAATAAATATTATGACTTTGATTTCTTGATTTT AATCTTATTGCTCTAAG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_187851; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_446952
Blastp | F-box/LRR-repeat protein 4 from Arabidopsis with 61.17% of identity |
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Blastx | F-box/LRR-repeat protein 4 from Arabidopsis with 58.31% of identity |
Eggnog | F-box and leucine-rich repeat protein(ENOG410XQ54) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT4G15475) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019425930.1) |
Pfam | F-box-like (PF12937.6) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |