Ll_transcript_446646

• Id Trinity: TRINITY_DN51868_c0_g1_i12
• Name Transcript: Ll_transcript_446646
• Sequence: CCAAACTTGTGTAGATTTGTTTAAATGTTTGTGTTATATAATTAAACAACAAACTCTTTCACCAGACATTTCATTTTTCATTGATTCTCCTCCGCTCCGC TCCGCTCTACTCTGCTTTCTCTCTCTCTCTATTCTCTGTCTAATCCCAAAATATTTCTATCTCACCTTCCCCTTCCAACAAAACCAAACCCAATAATAAA CCCATTAAAATATAACAAACAAAAAACTTAATCAATAATTAGATTAGAAATTAGATATCTCTCATTCTTTCAATTTATTTCACTTGAAGAATTAAGTTTC CGATTCCTTCCATGGTGGCCAGAGGCGTGCCGGCCAAGACGGCAGCGGCGTTGGCCGCCGTTCTTTTCTCAGAAACTCAATCCTCCAACTGGTGGCGTGA TATCAACGACTCTCCCTTCTGGCAGGATCGCATCTTCCTCCTCCTCGCCGCGCTCTACGGCATCGTCTCCGCCGTCGCTCTCGTTCAACTTTTTCGAATT CAATTGAGAGTACCGGAATATGGTTGGACCACGCAGAAGGTCTTTCACTTTCTTAATTTTTTGGTCAATGGAGTTAGATGCTCAGTTTTCATTTTCCGTC GCGATGTGCAGAAATTACAGCCTGAGATTGTTCAACATATCTTACTTGACATGCCAAGTCTTGCTTTCTTTACGACTTATGCACTTTTGGTGCTCTTCTG GGCTGAGATTTATTATCAGGCACGTGCTGTATCCACTGATGGACTAAGACCGAGTTTCTATACAATCAATGCCGTGGTTTATATTGTTCAGGTGAAAATC ATATTTCCAGTAAAATAATATAGTAACATGACTGCGAGAGAAAGAATGACAACCTTATTTTAAAAAAATGGGTATAAGTTATGTACTGATCCATTGTTCT GGTCAGATTTGAAAGGTCCACAGATGCATTAATTTAGCATTGTTTTATTTTGTTTCCATCATCTTGATCATAGAAAGTCCCCAAATCACGAGATTAATCA TTAATATTGGTGGGTTAGTATGTTGGTTTGTTGTATTGGTGTATCCTAAGGTTAAGAGAATGTGTGAGATTTTACCAAATGCCATTGTCTGGAGGGAGTG TTTCTTTTTAATGACGTTTTTAGTGTAAAGGTTAAGATCATAATAAGAAAATTTGAGTCATGTTTGATTTTGGGGAGCGCATGAGTTAGACCTACTACCC GCTATTTTTATGCGGCTAAAAGCCATTGGATTTCTTTTTATGTATAAAAAACCACCGTGGAAGATATTTTAAGTAACCGAGGAAAATTGTTAGGATCAAG TACTGATGCATTAGAGGTTCTAGCATTACATGGGAATAGTGGATGCAGTATCAAAAGCTTGCTGGAAATCAGCTAATTAAACTTTCTAAACAGACATAGA TGGGTTGAATTTTTGTCTCTTGCAGCTGAAGGATTTAAACTTAATGATAGATCCCTTTTGCTGCATATGTGGCCTTGTGGGATTAAAAAGGGAAACCCGA TGCATGAGACTCCCACCTAATGGGTCTGTGGATTTAACATGATCAATAAAAAATACATTTTTAATGTGTTTCCGTCTTTCATTTCATTATTGACCTCAAA ATGATGTTCAGCTATTGACCTTTAATATTCAAAATGATGTTTAGCTATTCTTTTGTTGTATAATCTCTATGTCTACTCAATTTTTTAAATAGATGCTAGT TCATATTCACTAGTTTTGAATGTATTGATGATTTTGTGCTAGATTGTACTGTGGTTGATATTATGGTGGAAACCTGTCAGTGTGCTGGTCATCGTGTCTA AGATGTTCTTTGCAGGGGTCTCTTTGTTTGCAGCCCTTGCCTTTCTTCTCTATGGCGGAAGGTAATTATGTTTCAACTTCATATGATGTAATTTGGAATG AAATTAATTCATCCAGGGTGTAGATAACACTCACTAAGCAGGTACCACACAAAACAAGGGAGTAAACAACACATCTCTATGGAATGCTTAAGAAACTGAA AAAAAGATCAACTAGCATGCCACATTATTTTGTGAAAATAATTGGGCTGAAGTTTTCTCTCAATCTTTATCATGTGAATACTTCTTTGTTATCCTGATGA GCCTATCCAATTTTTGTCTTTTCTGTGTTTTTCGACAGACTATTCTTGATGCTGCAACGCTTTCCTGTTGAATCCAAAGGTCGACGCAAGAAGCTGCAAG AGGTTGGCTATGTGACCACCATATGCTTTTCATGTTTCTTTGTCAGATGTGTTATGATGTGCTTTAATGCATTTGATAAAGCTGCCGACCTTGATGTCTT GAACCATTCCGTTCTAAACTTCATATATTACTTGTTGGTGGAAATATTGCCTTCTTCTTTGGTCCTTTTCATTTTGAGGAAGCTACCACCGAAGCGAGGT ATCACACAATATCACCAAATTCACTGAAAATAATGAACTTGCAGAAAAATGACTCGGGTGCTATTCGCGGTTCTCCATTTTCATGGATGTTTCTCATACT TCCGGAGGACATAGACAAGTCAGTCTTTTCGAAGTTGTGTGACAAAGCTAATATATCACGGGATTTAAAGTTCTCCCTTTAGTTTTGTAGGTTTTAAGAT GTGGCATTTTATGAATTATCAAGCTTGCTGAGCTGTGTTATATGTGTGATATTTGCAGTGTTTGTTGGAAAAAATATGGTTGCTTCTCAAGCTTGACCAT TTTGACACAATGATCAAACATTTTGGGAGAACTGACACTGATATATTGTATTGTATGATAAGGTTTTACTGCTGCAAGTTGGTGAGAAATGTGCTTTCAT TTTCTCTTGGCTAAGGGCTTATAACTTCTTCTGCAGATTATATTCCATGCTTCTTTTTAGGGATGACAATGAAAACCGAACCCGTGGGTACCAGCCCGAA CCCCACCCGAATTTAAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_188160;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_446646

FPKM

• PAB: 8
• PNAB: 4.5
• PS1: 4.7
• PS2: 3.5
• PS3: 4.9
• PW1: 3.3
• PW2: 3.4
• PW3: 4

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_446646

• Blastp: Protein TOM THREE HOMOLOG 1 from Arabidopsis with 71.17% of identity
• Blastx: Tobamovirus multiplication protein 3 from Arabidopsis with 78.08% of identity
• Eggnog: tobamovirus multiplication(ENOG41110A4)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G14530)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019459951.1)
• Pfam: Protein of unknown function (DUF1084) (PF06454.10)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;