Ll_transcript_446652

• Id Trinity: TRINITY_DN51868_c0_g1_i16
• Name Transcript: Ll_transcript_446652
• Sequence: AATCACTTTTCAAAAACGATACAGTATATAAAAAACACAATCAACATATCTGATTATTACACGTTGTATTAATTATAAATAATAGCCACCAGCGCATCAC CACGTTAGATTTGATTCAGTGTAATAAAACGACAAACCCAGTAGTAAATAAAAATAAATATTTCAATTATTATCACAGAACAACAACAACTCTGTTTCTT TCTTTCTTCACCCTTCAATTTGAATATTGAAGGAGAAGAAAAAGAAAGAAGAATAAAGAAGCTTCCAATTTCATCATCAATGGTGACCAGAGACGTTTTT CTCTTCTCAGAAACTCAATCTTCGAATTGGTGGCATGATATCGACGTTTCTCCTCTCTGGCAGGATCTAATCTTCCACGTCCTCGCCGCCCTCTACGGCA TCGTCTCCGCCATCGCTCTTGTTCAACTTGTTAGAATACAATTGAGAGTACCGGAATATGGTTGGACCACTCAGAAGGTCTTTCACTTTCTCAATTTTTT GGTCAATGGAGTTCGGTGCTCAGTTTTCATTTTCCGCCGTGATGTCCAGCAGTTACAGCCTGAGATTGTTCAACATATCTTACTTGACTTGCCGAGTCTT GCTTTCTTTACCACTTATGCGCTTTTGGTACTTTTCTGGGCTGAGATTTATTACCAGGCACGTGCTGTATCTACCGATGGACTAAGGCCAAGTTTCTATA CAATTAATGCTGTGGTTTATATTGTCCAGGTGAAAATTCTTGACCAACCCCACTATTATAGTAATAACTTCAGTTAAATAAGGACACGGATCAGGAGTCA TGCTCATATCAGGAATCGTACTGTTATTTTTTAGCTCATGTTTGCACTTAATTGTACATTCACTACTATAGACTACTGCTTGTTTTTATCTGTCAATATA TTTCCTTTGGGTTTGATAGGTGCATTACAATCACAAATTATGTCTGAAGCATTTTCCCATTTCATTCATCCTGGTTAAATCTACGTGACCTCTCATCAGT CTCTCATCACTTTGTAAGATGGATGAGTGGTACTACACAATGCAACTTATGGTATGTTGTGTTAACATTGCCAACTCCCATCTTCCTGGAATTTTCCTTC CATTTGCTCTAACTTTCTCAGCACAACTCCGTTTAGTATCGAATCCACTTAAGTATAATCATCTAGCGTTATTATCACCCACACAAAAAAAGAAGGTAAA AGAGCATCGGCACTAGCTCTTGGATCAGTTGGATGTATCTAGTAAGTATGTGCAATACCAATGTAAAAGTGTATGGACTCAAATTCGACCCTTGGTGCAA GCCGATTGCCACAGGAAAATATTTTGCTACACTGTCATTAATTTGCACAATAGTTGTTGCTCCAACATACATGTCCTTTATAACTATAACATATGCGATA TTAGCTCCTTTCTTCTCTAGAACTCTAAGGAATTCTCATGGCACCGTATCATATAGTTTTTTAATATGAAAGTAGACCCTTTTCTAGGTCTTGGCTTAGT TCTATCATTTTCCTTCAAAGTCCAAAATAATTTTTCAGCCTCAACGATTGACATTCCTCTTATGCTACGTGGATAAAAAACACTCAATTGGGCTCCGTTG AAGTATGAAAATCATATTTTCTGCAAAATAATTTACTAACGTGATTGTGCTAAAAGACAATAATGACCTTATTTCGAAAAATTGGTATTAAAGTTAACCC AATTTCTGGTCAGGTTTGAAATCTCTACTAGTGCATTATTTTAGCATTGCTTTATTGTTTGTTTATATCATCTTGACCATAGAGAGTCCCCAAATCATGA GATTAATCATTAGTATTGGTAGAGGAATATCTTGGGTTTTTGCTGTATCCTGTGTATGGTTAAGAATATCTTGAGTTTTTACTTGAAGTGTAAATGTTAA GGTTGTAATAAGAAAATTTTGAATCATAATATTTGATCATCTGAGACTAAGTAAACTAGACTTACTACCTGCTATTTTTTATTAGGAACCCACCGACTTT CTTTTTATGTATAAAAAAGTTACCAATGTGGAAGGGATTGTAAGTAACTGAGGGCAGTTGTTAGGATCAATTACTGATACATTAGAGGTTCTAGCATTGC ATAGCAATAGTGGAAGCGGTAGCAAAAGCTTGGCTGAAATCATGATTTAAATAGCTGCTACTCTCATGTTGAATAGTCTTGAATTGTTGATTTAATTTCT TTTTATGTGCTTCAGATTGCATTGTGGTTGATATTATTGTGGAAACCTGTCAGTGTGCTGGCCATCATGTCGAAGGTGTTCTTCGCAGGAGTCTCTTTGT TTGCAGCCCTTGGCTTTCTTCTCTATGGTGGAAGACTATTCTTGATGCTGCAACGTTTTCCTGTTGAATCCAAAGGTCGTCGCAAGAAGCTGCAAGAGGT TGGCTATGTGACCACCATATGCTTTTCATGTTTCCTTGTCAGATGTGTTATGATGTGCTTTAATGCATTTGATAAAGCTGCAGACCTTGATGTTTTGGAC CATCCCATTCTAAACTTCATATATTACCTGTCGGTGGAAATATTGCCTTCTTCTTTGGTCCTTTTCATTTTGAGGAAGCTGCCTCCCAAGCGTGGTATCT CACAATATCACCCAATTCGCTGAAAAGCTTGAACACACGGAGAAATGACTAAAGCATCTTTCACCGTTCTTCATTTTAATGAATGTTTCTCACACCCCTA TTATAATTTCCAGGGTACAGAGAGAAGTCAGTCTTTTCTATGTTGAGTGACAATGCTAATATATTGGGATTCAAGGCTCTCCCTTTAGTTATGTTGATTT TGAAATGTGACATGTTGTGGATTATCAAACTTGCTGGACTGTGTTATATATGTGATATTTGCACTGTCTGTAAGAACATATATGGCTGTTTTTTGAGGTT GAGCAATTCAACACAATGAGCAACCATTTTGGGAGAATGGGACTCTGATATATTGTATTGTATAATAGTGTTTTACTGCTACGAGTTGGTAAAATGTATT ATTGTTCTTTAACTTCTTTTCATTTTTCAGTCAAGTTCCAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_188160;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_446652

FPKM

• PAB: 0.5
• PNAB: 0.5
• PS1: 0.2
• PS2: 0.6
• PS3: 1
• PW1: 0.2
• PW2: 0.6
• PW3: 1.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_446652

• Blastp: Tobamovirus multiplication protein 3 from Nicotiana with 94.07% of identity
• Blastx: Protein TOM THREE HOMOLOG 1 from Arabidopsis with 75.16% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (107769903)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019464318.1)
• Pfam: Protein of unknown function (DUF1084) (PF06454.10)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;