Id Trinity | TRINITY_DN51915_c1_g1_i19 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_397341 |
Sequence | GTCTAATTTACTCTTTATATCAATAATCTAACATAAAGTGTATTATAGTAAGGAGAGGGATTGTAACTGTGGTCGTAAATAGCTCAAAAAACATAGCCTT ATTTCCTGAACAGATTAAAAACAAGGTTTTCATCGCAATCTATGATGATCATCACCATGACAAGGCTTGAAGCAATATGATGATAAATAACATTTCTCCT TTCTCTTCACTCACAACATTAATCATATTTTTCCAAAATGCATTCTGGGAACACTTCTCATCACTTAGACCCTGATGTTATTGAAATCCCAACCCCAATT ACTCACAACCCTGCTAAACAGAAAGAGGTATAATTGGTACTTGTAATTTTATCATTTTTTTTTATTTCTTTCACAAAATATGTGGTTTTGGTTTTTTTTT CTTCATGTTGTGTCGTTAATCATATGCAACGTGTTGAACTTCTGTTTTTTTATATGGGTTTTCGGAAATGATCGTTTTTTGGCTGATCCATTTTTGTTTT CGATTGACCCGTTTTTCAAGTGGTGTTTTTTGATATTGTTGTCCCATTCATTTCGTGGTAGTTGCTGAGGTTTGTTGTTTTACATCATGCTATGTGTTTT CTTAGTGTGTTGTTGGTGTAGACGGATTTAATTTTGTTGTATTTAGTGAGGCTAGAGCCGATAAAAAAAATAGTGAGGCTAGAATGTTTTGATTCAAACA TTGTAAAATGAGTGTTTATTCTTTGGAAACTGACCAGCAAGGAAACAAGGACACTTTATAGAAGTCATTGTCTTGGTTTTGCGTCCAATATGTCCCACAT ATATCTTGGTGTCATGTCGCGTATCTTGGTTACGTGCCCGACACATATCTGTATTAGACACTTGGAACCATATTTTATTAAATTTTACACTTTTTTTTGT TGTATCCTGTGTATGTGTCGTATCGTATTTGTACTTCCTTGCTGGCCAGCTCTGGCTGTGGTGTGTTTTGTTATATATTTTTATCATTTTCACATTTATT TCTGGTCTTGGTTGTTGGTTACACTGTTTCTACCATAAGTGATTGAAGTTTAGGAAATTTTTATACCTTGGCTGATATTTCAGTTCAGATTGGAACTGGA TACCACTGAAGGGATGACCATGTTTTTGTCAAGTAATGCTACACATCGAGAAAATATTCATTACTTTTGACAGAACTCAGCTAAGCTAAATTTGTTTATT GGATGGAATAAGTAGAGAAGGGATACTCACCCATGTCACTCACGGATATCATTATCATTGGATTGTGTCTGCATCATATGCTATTGTTAAATTTAATTTG CCCCTGTATCTTTTTCCTCTAAGATTCTTTGACCTACCTACGAGTCTTTGTTTTCATTTTTTAGGTCATTTTTCATGATGTCGTCGATATTAACAGCGAT GACGACTCTGTGGATTTAGTGTTAAATGGTGAAAAGGTTGGTATAAGTAACAAGGGGAAGAAAATTGAAGGACATGTTTAATGAGACATTTCATCCGCAT GTTATGGAAAAATCTGAACCAGGTAGCGGGGTTGAGTCTTCCGATGATTATACTTCAGCAGCGCATAATTTAAACAGTGTTGATGACCATGGTTCTGACC AATCATGTGATGAAGACGACTATAGTGATCTTTTTTCGGATGATTATATGGACGTAGATGATTATGCTTCATTACAGGCTCATTTTGATAATGTGGATAT ACCTCCTGGAATTGAGGCACCCATTCCTTGGTTGGCAGAGTATGATTTAGGTTCAAAGAAAACTGGAGGTAGCTCCTTGTATCCTTCGGGTCATATTCAG TCCGATCCTAAAAATTCTTGTTTAACAAACTTAGCACAGTCTCCATGGTCATTAGAACCTACTTACCCTGTTTCCCAAGGACCTTCAGTGGGTAGTTCTA GTTTACCAATCAAAATGGACTCTATTGACCATCCCTCCGAAATAGAGTTATCTTCTGCTCAGTTATTTTCTCAAACTGTCCCAAGTAGGAAGAAATTAGA TGCCTATCAATGCAGGAGGCGTAAGTTTAAGTTTTCATTAGGAGAGTCTTCTAAATGTCATTTGCATTTGGGACCTTCTGAAGGTAAAAAGAAGCATAGT GTTTTGGATGCTTTAAATAGCCATGAGCTTATACACAATTCAGAGACTATGAAGCTATATGGAGGTGTAACTCCATATTGGGGACAATCTGCAAGTGCAA AGAAGGCAGGTGGAAGTAGTGGTTCACATAATTCAAATTTCGTTGGACCTGAAATTGGGTCATTGTATCCTCGAGCAATTGAAGTAACAAATCCTTGGTG GTTGAAGAGCCCCCCTTATGTTAAGTCATTTACTAATTCTAATTTTTTCTATCATGATAATACATGGGTTCACAATGGATCTACTACTGATAATACTGTT GTGACAATCTCTGATGAGGCCAGAGATGAAATTTTGAGGAAATTCACAAATTTTAAACAGTTTGACACTGCTGAAGACACTTCAGACCATTACTTTGTTC ATGTTGATTCTTCCGTGAAGCAGCATCCTAAGAATTGGGCTAAAAGAATCCAGGAAGAGTGGAAGTCATTGGAGAAGGATTTGCCTGACTCAATATTTGT CCGAGTTTATGAATCGAGGATAGATCTTTTGCGGGCTGTGATTATTGGAGCTGAGGGAACTCCTTATCATGATGGTCTTTTCTTTTTTGATGTTTTCTTC CCTAGTGGCTATCCTAATGTACCCCCACTTGTCCAGTACAACTCTGGTGGCCTTCGGCTCAACCCAAATTTATATAATTGTGGCAAAGTATGCCTTAGTC TACTCAATACCTGGTCTGGCAGTAAGAATGAGAAGTGGCTTCCAGGTGTTTCAACAATTTTACAGGTTCTAGTCTCTATACAAGGTCTAATCTTGAATGC AAAGCCTTACTTTAATGAGCCTGGATTTGCACGTTCGAATGGTTCAGCAAGTGGTGAAATGAAGTCCCTGCGGTATAATGAGGATATATTTATCCTATCA TTGAGAACAATGGTGTATATGATTAGGAATCCTCCAAAGGTTGGATTCTAGAACCCCCATATCTTGGTTCTTTTTTTTAATATCTCAAACATGTTATATT GTTTTAAGAAGTGTGCAAAGCATGTTCATTCTTACCACCTCAAGGAAATGATGCATAGGCCTGTGCCAGTTCTTTTTGGCAAGCAATGGAGACAAATGAG AGAAGTAATAAGCTATATCTAATTTAGGAAGAAAGTTTGTCATTTTAGAACAATAGTTATCAAATATATAGGCAAATAGTTTCGAGGATTTCTATTCAGT TATTTCTGAAGTACTAGTAGGGATGTAAGATATATTCACTTTCATTAGCCTAGAATTGACATCTTGCCATTGATAATTGTCTACATTTAGCTGCATTAAT CAAGATACTTTACAAATTAGTTAAACATATTGACTCATCTTTGCAAAACATTTACTGACATGGTTTATTGCTTTCTCATCAAGTCTAAAGTGGTTTTTTT TTAATAAAGTGTCTCTATGCTTGCTATATTTAGCCTTTCCAAGGTCTTGGTTCTTTTATGTGTTGTGGATATTGAACCACTATTTACTATTTCAAATCAT CAATAGTGAAGCATCCTTTGTTTGATAAACTCCTATGCTCATCAACTTAGACACACTTCCTACTACTGGAATGTATCAGCGCATAGTGAAAATCCATACT ACATGCATTCCATTAGTTTTATTATTGCACATGGTCTTTCGTCTTTGGGAAGACTTGGAACATCAATGGTTAAATGCATATTCGTCAACAAATGTACATA TCTAACAACAGCATACTCATAATCACTTAATCTTTGCCTTAAAACTACATGGAATTTGTTTCTTATCAATCTTCTATCGGTTGGCGTGTTCCCACTCCAG GTTATTGGATCTTTTAAACACCGATCCTCCTTGCAGAAAAGGGTTAAAGGGCTTGCTATAACTTAGATTTCGTCAAAGTACACTTGTTTATCGCTTGATG ACATTACTTCTTTCGTTTTACTTGTGATTTTCACACTTTCACCTTCTATCCCTGTAATTATGTTATAAAATATTTTCACCACAGTATGAATGAAGTGTTA GTTTAGTGTGTTTTAGGCATTTGAATGAAGGACAAGACAAGTGCTAGAATGTGCAAGTAGCTTACAATTTTGTTATGTAATTATTGCTTAAAAAACTCGT AACTGCCTTCTATTTAAAAAATTGACTGTTCAGGTAATTTTTTGGTTTCAGAATTTTGAGGAATTTGTTGCTGGCCACTTCTGCAGCCGCGCACATGATA TTCTGATAGCATGTAAAGCATATATGGATGGAGCTCAAGTTGGCTGTTTGGTCAAAGGCGAGGTTCAGGATGTTGATCCGGTCGACAGGAGCTGCTCGAA GTTGTTCAAGAATTCTTTAGCTGGGTGTGTGAATATGCTTGTCAGAGAGTTTACGAGAACCGGAGCTAAGGATTGTGACAAATTCTTGTCTCCTTTAACA ACAGCCGAGAACAAGCCACCGGGTCAATTGCCTGAGGCTCCTGCTACATTTTCTTTATGAACCCAATTTTGAGACTTGATACAAAAGGCTCATAACAATT AATTTATTACCGTTACAAGTAGGTTTATGTTTTATATTACATAGTTGAACTCTTATTATAGACTACCTTATTTTCGGGAACAATGCCTGCACATAATTCT GGATAAAATATGTAGTTGCAGATGAATACATAATGCATTGTTAGGTTGAAATGAGATCCATAATGAAATTATCATGGTTGACATGATCATGATTTGTCTG TTAGACTTTTAGAAAACCTTTGTGAGCTTTTAATGGTTCATGAGAACCCCG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_188546; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_397341
Blastp | Probable ubiquitin-conjugating enzyme E2 25 from Arabidopsis with 68.78% of identity |
---|---|
Blastx | Probable ubiquitin-conjugating enzyme E2 25 from Arabidopsis with 68.78% of identity |
Eggnog | ubiquitin-conjugating enzyme(ENOG410XP8C) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G15355) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019413877.1) |
Pfam | Ubiquitin-conjugating enzyme (PF00179.25) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |