Id Trinity | TRINITY_DN51944_c1_g2_i4 |
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Name Transcript | Ll_transcript_398763 |
Sequence | TCTACCGAGGCCCTAATCCTGGTACTCACCATCCGCTATTGTCTCCACTTTGTAAGATTTCTTCATGTAGATTGTAACATTCAATTTAATGTCATCCTAT TTCAGCATTTTTTTACTATTTTAGATTCCAATCATGTATAGAAATTGTTAACGCTAGAAACTTGAATGCTATTCCCTTTTATGTTTCTGAAACTTCCATT TATATTGCATTTGCTGCGTTTACTTGCAATTTTAATATGTTAGAGAATAAGATTTATCCGGATAAAAAACCATATTTGAGTAAGTATCCTCTCCGGTACC GGAGAAACCAAAACAAAGGAAAAAATAACACGGGATGACACTTTTATCATTTCATATACAATGAAATAACATTTTTGCCAGTACTGGATAGGCAAATACT ACCAAAACAAAGGAAAAAATGACATGGGATGACACTTTTATCTTTTTACATGCAATGAAATAACACTTTTATCTTTTTACATACAATGAAATAACACTTT TGTCACCGAAAACAAAAAGGAAAAACAAGTATTTGCCTCTCCAGTAGTGGATAGGATCCTTGTTCACTTTTGAAGAGTATGCTCCGTCTTTGATAGCTGT TCAAAACACATGTCAGAGGGGCATACTCTTAATGTACAATTCTCATATAGGACGAAGAAATGTTAAGATGATGCCTAAATGGAAATCATTAGATTTTCCT ATCCTTGAAGATATATCTCCAATTAAACTTTCCTTGTATAGGTAATTTGATGCAATTAACCCGAGTTAAAATTAAACCATAATTAGATTTGCAAACCTAA AAGGAAGGAAAAAATATATTCATTTCATCATTTAAACATTAAAAAATCCAAAAACTTTACAGGTTGTGTTCATTGAACCTACGTGGCAGTTCACATATAT 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Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_188778; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_398763
Blastp | DnaJ protein P58IPK homolog A from Oryza sativa with 35.43% of identity |
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Blastx | Curved DNA-binding protein from Pseudomonas with 42.42% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (4328607) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019415359.1) |
Pfam | DnaJ domain (PF00226.30) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |