Ll_transcript_399499

• Id Trinity: TRINITY_DN51953_c0_g1_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_399499
• Sequence: CTTTAGTTCTCAAACAAAACGACCAAAACTTGATAACGTTCCCGCTTAACTTGTTGGAGACAAAGCCAAATGCACCCTTCACAGAGATTGGAGTGTACTT GGCTCACTCCATTCAAATTCAAAACTTGCCCTTCACCCATGAACTCTAACTATGCAACCTTCCCTTTTATCACTATTATCCCTTCATCTAACCCCAAAAC ATTGTCTTTCCCAAAATACCCTCTTTCGTTCTTCCAACCAAAGAAAACCCATTTCCCATTGAAAGTGAAGAGAACAAGCTTTGTAATTAGAGCTTCAAAT GATGGTAATTCTCAAACAGCATCAAATTGGTCTAAATGGATTCCTACTGGTTCTTTTGCTGCTGATCAAGTTTTCAGATTGATTGCTGGTGCTACTGCTA GTCCCATTGGCCAGTTTGTATCCTCACCCACCACGTTTCTTCACTCTATTGACCCTAGAGTTAAATTGGTATGGCTTTTAGCTCTGGTTGTTCTACCAGC GCGGTCACATATAATAATGCGATTTGGATTAGTAATATTCTTGACTTTGCTTTCAATTTGGGTTCTACAAAGAGATGTTTGGAAGGTAAGTAATTGTAGT TCTCAATCCTTGACTTATCTAGCTTGGGGAGTAGAGTTATATTCATGTGTATGTAGTTTGTTTACTTTGCTTTATTATATTTGGTTAGTTGATCGTACGG GCTGGTTGGAATTTATCATTCCTAAGCTGTTGTCAAATCTATCATTGAAGGTTTGCATTGTATTTAATCTGATATTCACTATTTGATTATATCTATTTAT CAACATGATAACAGCTTTTTCTTATCCTGTTTTTTCATGCTTCAGCACCTGGCATTTCTCATTCTTAATGCTTGTTTTCGTTAGAACTACCTTATAGCTT CTCCGAATAAGTTGATTTTTCCTTTTTATTGAGTCAAAGATACTTGGTGGTTGGTTATGTATTTATAGTTTTTTCCATCTTGATGTGATGTGTTAATTCG GGAAATTTCTTGCTAATTTCTATTTGTAGGATCAATTGGGAAGAGTTTATTTTCTATCAGGATTGTTATTCATAACTTTAGGGCTGGGTGCAGATGGTGT GCCCTCGGTTGTTCAGTTGAGAACTCCACCACCTGCGCTGACGGGGCTTCCTAATTTTCCGGTATCTTTATCAGGTTAGTCATATGTAATAGCAAAGTTA GGTACGTTAACCTTTACAAGGAAAGGCTTACCTGTTGCAAGCACCGCTGCATGTTTGACTTTCACAGTAAGATGATTTATGCATTTCTGCCTTTTCTTTT AGCATTGTTCTGGACATTTAGCAGAAACCAAGCCTTGAAAAATTTCTGAAACAACAGAAACTTTTGCCAATTCCGATTTCTGAAAATTTGATCTGTATTT CAAAGCGCAAGTCTCTGTCTAACAACTACAACCCCTGAACAGCTATCATCTGCATTGCGATGGTTTTTGCTCCCTATGAGATACATAGGCGTCTCTGTGT CAGAAGCTGTGCTTACCCTTTTACTGTCACTGAGATTTATCAGTCTAGTTTTCAACGAGGTGAGAAGGGTTTGGGGTTAACCTGCATACATATGTATGAT TCTGATATTATAACGTAGTTTCAATCTCACTTTATGGTTATATTAATAGCTTGATTTATGTGCCACTAAGCATTTTTTGGGTTGTAACTAAATGATAAAC TGCAGCTTTTACCTTTTCTTGGTTTTAACTAACTCAAGCACACGTGATTATGATGTGAGCAGTGTTCTAAATTACCAATTCTAACTGTGTCATGTTGCAA AAAATATGGCTTTGGATATTGCATTTAGGTTATACGCATGGTAATGGAAGAGGAAAAGAACCATTGCTGGCCTTATTCATTAATGGTAGATTGGTACTGT TCATCTAAGAACTAAAGGAAGGCAAATAGATCAAGTTTACGGATTTAATAGGATTATGAACAGTTCTGCAAATGATGTAATTTCCTGATTCTAACAGTTT TGAGGTAAATTCAAGCCTGAATGAGATAAAATTTTGTATGTTCAAGTTTTCAATTGTTACTGATGATCGGGTTAGATTTGACACAAGCAATAAATGAATT AATTATGCCGAAAATACCAGATATCGACATAATGTTGAGGACAGGTTAGGGTAGATATCAGCCTAAGGACTGTAACAGTAGACAGACATGGAAAGAGCTG CAGGGCTGCTAAGAGTCTTTCATTGCGTCCAAGTTGCACTGTGACATTATGATCTGATACTTCTAAAATGCACAAAGTCCGGAACATTGCTTTCGGGGTT GTCTCTCGTAGGGTTAATTGGAAAAATGACTTTTATGGAGACAATTGATGTTTTCTTTAACTACTTCAGGCGGATCTTCAGAAATATTTTTAGTCACGCA GAACAAATTTCTCAGTGACTGTTCCGGTGATGGTGGAAGCGCTTATGTAACTAAAGTTAAGATTCATAATTTGGGTACTGATTCTTGGAGAAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_188861;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_399499

FPKM

• PAB: 0.1
• PNAB: 0.3
• PS1: 0.1
• PS2: 0.3
• PS3: 0.1
• PW1: 0.2
• PW2: 0
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_399499

• Blastp: Protein ABCI12, chloroplastic from Arabidopsis with 48.98% of identity
• Blastx: Protein ABCI12, chloroplastic from Arabidopsis with 67.5% of identity
• Eggnog: Cobalt transport protein(COG0619)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G21580)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019439763.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;