Id Trinity | TRINITY_DN51955_c1_g1_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_397081 |
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ATGCCCCACAGATGCCTTCCAATACAAGGAAAAGTACATTCAAGCAAAGTATGTAGAGAAATCACTAATCATCAGGGAAGAGGATACACCCGGGAATCCT TCACTTCCCACAAGAATCTGGCAAGCAGTTCAAGCTATAAATGTACGAGAAGTGTATCGCCTTATTGTTACATCAAATTCAAATCTGATAAACACGATAT ATGATGACGTGGTTAAAGATTTGAACTTAGGACCTATGAACGAAGGGCATCAGCATGATCCTGAAGCCTGTCTGAGAATTGAAGAGACTAATGAGACTAA TAGGTGTTTCCGTGGATGGTCATTATTACATCTGGCATGTCATTCTGACAGTGCACTAATGATCGAGTTGTTGCTCCAATTTGGTGCTGATATAAACATG TGTGACTATCATGGAAGGACTCCCTTGCACCATTGCATTTCTAGTGGGAAGAACCCATTGGCAAAGTTTCTATTGAGAAGGGGTGCTAAACCATCAGTGA AAGATGCTGGTGGACTCAGTGTACTTGAAAGAGCAATGGAGATAGGAGCAATAAATGATGAAGAGCTATTTATCAAGCTTGCTGAATGCCAGTAAAAATT GAACTGGTATATGTATTTTGTTAAGAGTGCTGATGATAAGTTGTTGTTTGTGATTTTTATCTAGGATAGGAAGTTCATTGATTTTAGCATGCATGCCCAT TCCACCAAAAAGGAACTTCATTGTGATTTTAGCATACATTGTTGCAATTGGTTAATATGCCAATGGCCATGCTGCAAAACGTTATGGGTTTGCTATTATT GCTTCATTTTCATTGGATTTTAATTTTCTTGCATACTATTACTCCTTCTCCCCAACAATATTTTCAATAAGGTGTGTGGCTGCTTCCGAAACAAGTGTTG CTCTTAGGATTTAGTAAGGTTTTATACCATTAGACCAACACTTTGTTTATACATGTAATATGTTTATTTTTGTTTTTTGTACAACCAAGACCCTTCATCT TATGGGTAAAGAATTAATCTCACATCGAGATGCATAGTATTAGTTGCTCATCCCAATACTTGTGTTACTTGATACAGATCATTAGACTTAAACTCCATAT ATAATTGGAATAGGGAATTTATTGATGGTACTTTCATGATTCAAGGACCCTGGTTCACAAACATCAATGTGCAACACATTACAAGTAAGAGTTTTAGTAA CTATGGTAAAGGGTCTGTTCCATGAAATGTTTGAAATTCTAGGAGATGGCATTTTCAATTCTGATTTCACAAAATGGAAGTTCCACAGGGACATCCTTCA TTCATTGTTTAAAAACAACAACTTTGAGAGATTCTATCAACAAATCATTCAGAAGAAGTTGGAGATTAGCATCCAAACGTGAAGACCAAACCAAAAACAA TAGTAACCAAGCTGATGAGTCAGCAAATCAGAGATACTTTTGTAACCAAACAAGAAAGAGTAAACTGTATCATGGAAACCATGATAAATGGATCTTAAAA ATTTATAACTTTCACCTATAGATTACTAACTTTTAACCATGGCGACACGATCCTCCATTGTTGTTGTGTGATGTTCTTCGTTTGTAGAGCAACTCTTCTA TCCATTTCCCCTTCCTTTTCTATGCTCTTCCTTTATTGATGGTAGATAGAGCAACCTTTCTGGGCAGAGATAGGGACTATATTTTCAAGTC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_188870; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_397081
Blastp | ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD4 from Arabidopsis with 56.34% of identity |
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Blastx | ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD4 from Arabidopsis with 56.66% of identity |
Eggnog | domain, ankyrin repeat and PH domain(COG5347) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G10870) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019450952.1) |
Pfam | PH domain (PF00169.28) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |