Ll_transcript_397081

Id TrinityTRINITY_DN51955_c1_g1_i1
Name TranscriptLl_transcript_397081
SequenceGTGAGTTTAACCGAACACAAAGCACAGAGCAACAACAACAATGGCATCGTCATTCGTCAAACTCGATGATTCTCCAATGTTCCAGAAGCAGTTATTTTCT CTTGAAGAAACGACTGACGAGTTAAAGGACCGGTGCCAGAAACTATTTAAAGGGTGTAAGAAGTTTATGACAGCTTTGGGGGAACAATATAATGGGGAAA TTTCCTTTGCTGATTCATTAGAAGCATTTGGCGGTGGCCAGGATGACCCTGTTAGTGTATCAATTGGAGGGCCGGTCATATCTAAGTTTATTACCACACT GCGTGAGCTAGCTAGTTTTAAAGAGCTTCTTCGTTCACAGGTGAGTCGTCAAACCAGATTGCTGCATTTTTTCTCAAGAGTTTCAATAGTGACTGTGACT GTGGCACTTGCTTACTCTAGTCTCTAAGTGTGTTTTACTCGAGGGCAGAGGTTTTTTTTCTGTTTATTCAACTAGCTCAAATCATTTGAAGTAATAATCT TTTTCAGTTTGCTAATATGTATATATATTTTTTTTCTCCCTTGCCATCAATTGAATCATATTAAGTTTGTCTGGCTGATAAGTTGATTTAATTTAATATG TACCCAGTTGCTGATGGCGTTCAAAGATTTTGTCGAGATTGTGTAACTCATCCATAAACTTATTATTCATGTAGCAGTAAAATAGCAATTATGTGGCTCA TTCTCTCTACGTTGCTTTGTAGTGCATCAGTTCATTCAGTTGTGTCATGACAAAAGCAGGCCTAAGTTGAAGAAACAAAAAAAAACCAAGAAGTCCACTA GTCCATTCTTTTAAAAATCTTGAAAAATCAATGGAACTTAAACAACAGTTTCTTGATCGAAAAAATCTGGAGCAGCATGCTAATAACGACTAAACCTATG GAGTTTCCAACTTAACCTTTTTACCCAAAGAGCAAAGGTTCTGGAGATTCCAACCTTGCAATAAAATTGAACTCTAGTTGGAAATTCTTTCCCTATATAA ACTAACTTGCATACTTAGTTATGGTTAACAATCTAGAAAGCCATGACCCTCATATTTTATTGATATGGATTTTTTGTTTCAACAATTACTTGACAGATTT CTTGTATAGGTAGAGCACATGTTGATTGACCGGCTGACAGAGTTTATGACTGTTGATTTGCAAGATGTGAAGGTTATTTTTTTACTTTTTTTTTCTGTAG GGTTAATATTCCCGTTGTAGAATTTAATTGTTGTATAATTTTAAAAAAAATATGTGCTGGATATGGTTGGTTAAATTTCTTCAACTCTCTATCCTGTTTT CCATCCATTCTTGCTTGTGTCAGGATTCTCGTCGACGTTTTGACAAAGCTGTGCATTCTTATGATCAGGTATTGAGAAAATAAGAATTACCTTTCCAGAG TTGATAATGATATTTTGACATAATTTGTATATATGCAATTAAAAAGGTCGGTCCAGTGGATGAAGCTCCCACCTAGTGGTGTCAAATTGATGTTTATAAT TCAATGTTTTAATTGTCCTTGTGATGTTATCTATTCTTTCAGTTAGTTCAGTGCTTGGTACACTGTCTAAATGATAATTCATTTCCTTTTCTGTTTCCTG AATATTCTTTATGTGATGTCTAATTTGGGTATTCATCCATTTATTTTACTTTTTTTTCTTCTTTTCCTTGTGGCCATTTAGTTATTCCTCAGCTTTTATT ACATGGATGCTTTTAGTTCTTCCTATGGTAAACTTGTCTTGCATAAGAGTTTTAGCTTCTAAGATACTTGATCATGGTTTATGCGGGCTTCTCATTTTTG CAAGTATTTCTTAAGTCCTATTTTGATTCATTTGTCTTTTGACCGAACTTACAGTTGTTAATGGTAAATTATACTTTGATGAAGGGTTTAGCTAACTTCA GTAAATTATACTTTGATATCTTTGGAGATTAAAACATTTTTAAGTTCATCAAACTGCTACTTTTGTATTAAGAGTTCTCTTGTAGGCATTGTGGTATTGC TTGATTAATTCCACAATGGCTTAAGTTGAGTGCCAAAAAAATCATCTATTTTGCATAAAGGCAGTTCCATTTTTCTCTTGAGTGGTTCTTCTTGAATGCA ATAATTTGCTCACGTCTTTGACTTCAACATCGATCATCTAATCATCTCATATCTATTTGGACTTATATGAATCAAATTGCTCACAGTTGCTATTAATTTG TTTTCTAACATTACTCTTGTAACCTCTTGTCTCCAGTCACGAGAAAAGTTTGCGTCTTTGAAGAAAACTACACCAGGAGACGTTGTCATTGAATTAGAAG AGGTTTGCTTAATCAATTTGTCAATGATTAGTAGTTTCTTGAATTTGATGCAAAGTTTACATTGATGAGATCAACATTCTTTTTTAATGTGAAAGTTTTA ATCTGAAAGGAGCTCCAAAGCCCATGATGAGTTTTGAAGTGTATGGCACATATATCATTCCCACATTGATTCTGAATCCAAATTTGTGACAATCACTATC CTAAAGGGATAAAATGCATCGTGTAATATTGAAAACGGAAAATGTAACTTTGTGGACAGTGTTATGGGCCCATTACGCATACCTGTATTTCCAGCAAGAG ATGTCTTATCTTTTTGAGCCTCTATGCAATGTATTTTATTACCTTGTTGATCTCCATTCATGGATGGCTCTACATATTTGTTCACAGGGCCATTTAATTC ATCTTGTTCTCTTCTATTATTACTGTTAAAAAACATTATTTTATGACTATTTGTGAATCAAAATTATTTAATCAATTATCTCACTATTATGATCCCTGAC AGGATCTACAAAATTCAAAGTCAGCATTTGAAAAAAGTCGTCTCAATCTAGTGAACTCTGTCATGAACATTGAAGTTAAAAAGAAGTATGAGTTCTTAGA GTCCTTTAGTGCAATAATGGACGCTCATCTGAGATATTTTAAGTTGGGTTATGACTTAATGAGGCAAATGGAGCCCTATATTCATGAGGTTCGACAAGTG CTTCTCTTTCATTTCATTCTCCTGCTATTTATTTGTTTTATGCTTTTAGGTTTTGATTCATATAGGTATTTGGGGCTTGTTTTGATACAAGTTGATATCT CTTGTATCATATCTCAGTGAGATGTAATTATGCATTGTGACAGGATAACATGAAACATTTTACTAAATTTATTTAATATTGATCAACATTGAGTAATCTC TTTAGTGCATGTTTGGTTTAGATTCCTTTTTTTGCTTATTTTGTAACTAGCTTAGTTTATAAAAAAACTTATACACCAAGAAAAAGATGCAAAAACTAAC ATGTTCAAAAAGATGGGCTTGTTTTATTTTTTCAGTTTATAATCTCACATTTTATAATCAAAATCTAAAACCAATCTATATTTGATTCTGGTGGCTTTCA ATGATTCGAGCATGGATTGCTCCTTGTAAACTTACACAGTTTTGTTTTGTGTTACCATCCTGCGCTTAGGTGCTAACATATGCTCATCAATCTAAAGAAA TGGCTAATATTGAGCAAGATAAGCTTGAAAAACGAATCCTGGAATACCGAACTCAGGCCGAGCTGGAAAATATACGAGCTTCTTGCAATACAGAACCCTT GCCAGGTGCTGATGGCACCCATGTTGTAGGCTTGAACTCGTACAGATGTTTTGAAGCAGGGTTGCAGTCTGCAACCAAAGGGGAGGTTCAAACAGTTAAA CAAGGCTATTTGTTGAAACGATCATCAAGCTCGCGCGGAGGTTGGAATCGGAGGTTCTTTGTACTTGATAATCGAGGGAGTTTATATTATTACAGAGTGA AGGGATGCAGCATGGGCTCTGGTGAGCAAAACATTGGCATGTTTGGTAGATTTCGTTCAAGGAACAACAGGGTAGCATCGCTAAATGAGGATATTTTGGA TTGCTGTGGAGTTGATCTCTGCACATCCACTATAAAGATGGATGAAGAGGATGCTGATCTACGACTTTGCTTCCGTATAATTTCTCCCTCAAAATCATAT ACACTGCAGGCCGAAAATGAAGCTGATAGGATGGACTGGGTAAACAAAATAACTCGAGCCATCACATTGCTTTTCAATTCTCAGTTTATTCAGCCTCATT ATGGTAGATTACATTTTGAAAATAAAAGCTCAGAAGGTGGTGCTTCCTTAGCTAGCCAAACAGAGGATAGTAATATATCTCTGATGGAAGTGGTTAGTGT CTCCAAGATTTTAAGGGGAATTCCTGGGAATGGTATATGTGCTGAATGCAGTGCTCCTGAACCAGAATGGGCATCTCTAAATCATGGCATATTACTGTGT ATTGAATGCTCTGGGGTGCATCGAAATATTGGAGTTCATGTCTCCAAGGTGAGATCATTAACATTAGACGTTAGAGTTTGGGAACCTACTGTTTTGGAGT TATTTGATAACTTGGGTAATGCTTATTGTAATTCTATCTGGGAGGGCTTGCTTGTAGTTGATGATGAAAGAGTAGCTGAGTCAAATGCGCCTATGAAACC ATGCCCCACAGATGCCTTCCAATACAAGGAAAAGTACATTCAAGCAAAGTATGTAGAGAAATCACTAATCATCAGGGAAGAGGATACACCCGGGAATCCT TCACTTCCCACAAGAATCTGGCAAGCAGTTCAAGCTATAAATGTACGAGAAGTGTATCGCCTTATTGTTACATCAAATTCAAATCTGATAAACACGATAT ATGATGACGTGGTTAAAGATTTGAACTTAGGACCTATGAACGAAGGGCATCAGCATGATCCTGAAGCCTGTCTGAGAATTGAAGAGACTAATGAGACTAA TAGGTGTTTCCGTGGATGGTCATTATTACATCTGGCATGTCATTCTGACAGTGCACTAATGATCGAGTTGTTGCTCCAATTTGGTGCTGATATAAACATG TGTGACTATCATGGAAGGACTCCCTTGCACCATTGCATTTCTAGTGGGAAGAACCCATTGGCAAAGTTTCTATTGAGAAGGGGTGCTAAACCATCAGTGA AAGATGCTGGTGGACTCAGTGTACTTGAAAGAGCAATGGAGATAGGAGCAATAAATGATGAAGAGCTATTTATCAAGCTTGCTGAATGCCAGTAAAAATT GAACTGGTATATGTATTTTGTTAAGAGTGCTGATGATAAGTTGTTGTTTGTGATTTTTATCTAGGATAGGAAGTTCATTGATTTTAGCATGCATGCCCAT TCCACCAAAAAGGAACTTCATTGTGATTTTAGCATACATTGTTGCAATTGGTTAATATGCCAATGGCCATGCTGCAAAACGTTATGGGTTTGCTATTATT GCTTCATTTTCATTGGATTTTAATTTTCTTGCATACTATTACTCCTTCTCCCCAACAATATTTTCAATAAGGTGTGTGGCTGCTTCCGAAACAAGTGTTG CTCTTAGGATTTAGTAAGGTTTTATACCATTAGACCAACACTTTGTTTATACATGTAATATGTTTATTTTTGTTTTTTGTACAACCAAGACCCTTCATCT TATGGGTAAAGAATTAATCTCACATCGAGATGCATAGTATTAGTTGCTCATCCCAATACTTGTGTTACTTGATACAGATCATTAGACTTAAACTCCATAT ATAATTGGAATAGGGAATTTATTGATGGTACTTTCATGATTCAAGGACCCTGGTTCACAAACATCAATGTGCAACACATTACAAGTAAGAGTTTTAGTAA CTATGGTAAAGGGTCTGTTCCATGAAATGTTTGAAATTCTAGGAGATGGCATTTTCAATTCTGATTTCACAAAATGGAAGTTCCACAGGGACATCCTTCA TTCATTGTTTAAAAACAACAACTTTGAGAGATTCTATCAACAAATCATTCAGAAGAAGTTGGAGATTAGCATCCAAACGTGAAGACCAAACCAAAAACAA TAGTAACCAAGCTGATGAGTCAGCAAATCAGAGATACTTTTGTAACCAAACAAGAAAGAGTAAACTGTATCATGGAAACCATGATAAATGGATCTTAAAA ATTTATAACTTTCACCTATAGATTACTAACTTTTAACCATGGCGACACGATCCTCCATTGTTGTTGTGTGATGTTCTTCGTTTGTAGAGCAACTCTTCTA TCCATTTCCCCTTCCTTTTCTATGCTCTTCCTTTATTGATGGTAGATAGAGCAACCTTTCTGGGCAGAGATAGGGACTATATTTTCAAGTC BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_188870; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_397081

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_397081

BlastpADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD4 from Arabidopsis with 56.34% of identity
BlastxADP-ribosylation factor GTPase-activating protein AGD4 from Arabidopsis with 56.66% of identity
Eggnogdomain, ankyrin repeat and PH domain(COG5347)
KeggLink to kegg annotations (AT1G10870)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019450952.1)
PfamPH domain (PF00169.28)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;