Id Trinity | TRINITY_DN51960_c0_g1_i13 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_399952 |
Sequence | AATGCAGTTTCCTTATTCTCTATAGAGAGAGAGAAACATAAACGATGATGGAGGAAACCGGCACCATCATGGCCGTGGCGCCGTTGGAACCCGCGACTGA GACCCCGAACCCTCAACTTCCGACCGTTGCTTCCAAAATCAGAGAAGAAGGCGAGCTGTCATCTTCCTCTGATGATGGCGAAGAAAATCCTGTTAGCTCT ACTGTGCAACCCACCCCTGCTATAGAGTCTACTGCAGTTCATTTGGTGCACAGAAGTACCCAAGGTGTTCAGGGTGGTTCTAATAATATACAGTTACAAA CGACCAGTCAATCAACTTCACAGGCGAGCTTCGCAAAGAGCAAGTTACCCCGAAAATCTTCTCCGTGCACGGATCACGTCGGCTCAGATGAAAATCTAGT GATAAGTTTCTCTGGTGATGACAGTGGTAGTGACCTTGAACCTAAAAGTAATGCTTCCAGGTTGGGTAGCAATATAAAGCGACATAGCTCATCCTTGGAA AAATCAAACAAGTTAGAGCAAAGTGCTAGAAATGCTCCCAAGGCAATGCCCAAGAAGTTGCCTTTGAGTCGCACATCTATCTCATCAATTTCCAAATTTG GTGGTTCTAATACTAAAGGTGCTGGATCCATGTCATTGGGACAAGGATCACAAGCTAGAAATTTCAATCTAATAAACAAAAAATTAGCGGACCGAGAGCG TGGGCGTGATCAAGGAATGATATCAAATGACAATAAACTTCAGGATTTACGGCATAAGATTGCACTTCGGGAAAGTGAACTAAAGTTGAAGGCAGCCCAA CAACTTAAGGAATCTGCTTCAATTCCGGATAGGGATCATAATGCCGTAAAATTGAAGAATGATGCAGCTAGGAAATATACTCCAGTTTCTTCAGAGGCTG CACAGTTGGAGCCAAAGGAACCAGATACGAAGCGGTTTAAACTCAGCACATCTCGTGGTACCCCTCAAGTTGTTGGTAGTCAACAAGAAGTTGCTGCTAA GAAATCTATATCAATATCAACAGATTCTACCTGGGACAACTGTCATCCTCAGGAGAGAAACAAGGTTGATCATAGCGAAAATGAGATTCCATTAGGTAGT AGAGAGTCAACTGTGATTAGACCACAAAGGCAACCGGAGAAACATGTTGATAATTCATTACAAAATATGCCTTGTAGTTCAACAGACGGTGATGTCAATT ATGGTAGGAATCAGACTGAGAAGAGTAGTAGGCTGCTTGAACCTTCCATTGCTTTGAACAAGAATGCAATGCCGGCAAATATGATTTCCAATAGTGTGCC AAAAAACTTCGTAAGCTATCATTTTATTTAGTGTACATGACATATGCTTTTACTTGGTCTTGGCGACTTCACTAAAAGCTTGCCTTCACTTTTTTCTGTT TAGTAACTAACTATAAGTTATAGTTTGCTATAAATGGCATCTGCTTTTACTTGGTGACTTCAATGAGAACTTTGTCTTTGCCTTTTCTGTTTAGTAGCTA GCCATAAGTTATAGTTTGATGATATACATGATTTTTATCAACAACAAAAAATACCATACATCACATTTGCTTTTACTTGGTGACTTCACTGAAAACTCTG CCTGTGTCTCTTCTGTCTTGTAACTGACAAATGGTAAATCTTTCATGATCTTTTCCAAGTTTATCATTTTGAAGTCCTCCACCTAAAATTGATTAGGAAT TACTGATTAGTGATTCTGTGCAATATACCATGGCCTGTAATAGAGTGGATCGACTCTCTTTCTCTTGCTTGATTTATTAGTGACATATGGACCTTTTTAA TTTGTAATCAGTATGCCCCTTTTCATTGTTGCTCTTAAGAGTTCAGGTATATAGATTAAAATTTCAAACTTTTGAGGACACCGCAGTAGTGTTTCTAGCA AAACTTTGAATTTCTTGATATCATGTTTCTGTTGTCTTTAACCTCATAGAATAATGTTGACTTGTGTTGCTTTATCCATCAAGTTCTTTCTTTAATTAAG TGCTAACTGTAAGTGATTGCAAATAGGCTTTAGGATATCTGTTTTCTCTCTGATGTTTTTGACTCTCTCCTTACTCCTTTTCTCATCTCTCATTTAGGAA GTATTAAGTAATGCAGTTCTTTCTAATCATGATGGTAATGCAAATGTCTTGGAACATAGAGGCATAGATTTACAGTCACTTTTTGGAATGGAAGAGTTGG TAGACAAGGAACTTGAGGAAGCACAAGAGCACAGGCACAAGTGCGAAATTGAAGAAAGAAATGCACTTAAAGTTTATCATAAATCTCAGAGGTCCTTGCT TGAGGCGAATGCTCGATGCACCAATCTTTATCATAAAAGGGAATTGTATGCCACTAAGTTACGATCTTTAATTTTAAGCAATTCCAGCCTCTCTTGGTCT TCAGGGCAGCACCAACATCTTGAGATGGGGCTGGATTACTTACCCAGACATGGATATGAGATACCCACATCAAGCTGTCAGAGGCAGGCCGAATATAATG ATACCAATAATCCGAGTTTTGATTCTAATAATCAAGGCATCAATAATGGGTGTCCCAATACATTCTATCACCGTATGAATGGAGCAAATTTAGGTTCTGA ACCTTGCATTGAACCAGATGCCAGTACATCAGAGCCATTGCCTCAAAAGGGTAATACTGCAGATGGAGGTTACTCTCCTTTGGGTGAATTAGATACATCC GGTAACGAAAATGGAGAAATGTCTCCAGATGGACATGTGTCCACTCATCTTGGTGTTGAAAACCATAGAAACAAAGACATGATGGTCAAACTAATGGACA TAGATACTACATCAAATGCGAAACTTTCTGCTGATAGTCCCCAGGATCCCTTGGTTCTTGAAGCAACATTGAGGTCTGAATTATTTGCAAGACTAGGGAC AAGAGCTATGATTAAAACTCCATGCAACAACACCGAGCCTGTTGTTGAACTAGGGGCTGAAAATGAGGTTGGCAGTGGGAAAAGTCAGGTGCATTACTGT GTTGTCCCACTCTCTACAGCAGAAGATAATGATCTTAAAGGCATTGAGAGGCATGAAAGGAGTATCTGTCTGTATTCCAATGAGACTCAAACACAGCATA ACATTGGTGAAAATTCTTTGAATTCCAATTACAGCGCTGCTTCTGGAGATCAAGGTGGTATTCCTCGTCAAAGTCACTACTCGACAAATACAATAAACAT CTCCTCTTCGATTTTTAGGAGCGCATTTAGTCATCTGAAAGAAATGTCACCATTCAATTCAAATCAATTCCTTAGTAAAAATATTTCCATCCGTGCTAAT GATGGTGAAAATGAAAATGCTACTTGCCTCGCTTCTGATGTCACAAAGTGGAACAATATGTTAGCAAACTCAATGCCTGTCACCGTTGGGAATTTACTCT CTGAAGAAAGCTCTTATAGCTGCAGTCCTGCAGTTGATCCATTTTGGCCACTTTGCATGTTTGAGCTCCGAGGAAAATGCAATAATGATGAGTGTCCTTG GCAGCATGTTAAGGATTATGGAGACGGAAACGTTTGTAAACGTCAGCGAACTGATTCTAATAATCCAGGAGTAAGTAGGTTAGTAGACGATGATGATACG CATGCATGTTGGAGAGGATCTAGTTTTATTTATCACTGGAGTTAGTCTTGGGGCGTAAAATAATGTCTTATATCTGGAGTAAAGAATGTCAGGTTTGGAT TAGGATTGTCAAGGTAGATTACAAATGCATCAACAAAATTCTAATGGTATGACAAAAGTTCCCAAGTGTCGCAGAGCTACAATTCTGCCAACTTATATTG TTGACTTAGATACTCTGAAAGGGGATCAATTTGGATATAAACCTGTTGTGGCACATCCAAATGCTCAGGGCTGGCAGAAGTGTTTCAGTATCACCTTAGC TACGTCAAATCTGCTTCAAAATGGTTTACCCACTGATGGTCCATTACTCGACGGTGGTGCTGAACGCATAGAGGTCCATAGAGCATGGAGCAAACATTTT TCATCTTTTCAGTGGAGAAGTGGAGCTTGGGTTTGTTATTTCTGACTATTGTTTTTTGTTTTCCTGGTTTATAACACTTCTATTTGTTTTCAAATATTAT CTCTTTAATTATGTTTTAGTCTAAATCTATTACTTCAATGCTGAAGTGAACATAAGATGATTTCATTTTAATTTTCGTAAGACTTATTTCCATGATTTTA TTTGGTTACTTCAGGTAATTTGTAAAAAAAAAAATTAGGATGGTCCTTGATGAATGCTGTGTCAACGGAATTTTATGATGCCTATAGTTGAACACTTGAA CCTACTGTGTAAAATGAGATAAAAATTTTATTTCAGCAATATATATTTTTCGTTTTCTCCTTGCAAATGCAGAAGTTTCTTTCTAGTGGGTTCTGTGTCG CTTGCAGACTGATACCTACTCCTTTCTTATCTATTTAGTGTTTTTATTGTGTGCCAATTCTATGCTTGTTTTAGGAGATTATAGTTTAAAAGGGAGAATT AGGAATTTTTAATGGGGGATCAAAATGGTTTTCCTTCGAGATGATAAATTCGTCCATTCAGTGTTATCAATTTGCAAATTCTTCTTCAATTAGATTAGCA TGACTCTCAAAGTCATGTGATGTAGCAATAACAAACCAAATACAACGAGTAGTGAGATCATAAGCTAAGCCTTGGCTATAATATTCCACTATTTAAGCTT AAGATTTGAAGTATAACCAAACAACAACTAATTCTATAGTCCCATTAGAAATGATTAACTTTCATTTGATCTATTTTCCTAACTTGGGATTCTAACAGTC TCCTTCACACATGCCCAAGCTATCCAAGACCCGATTCTATCATTTTTTCTACAATAGGAGTTACCCCAACTTTCTTCATAATTTATTCATTTGAAGTATT ACCATACTTCTATTTCGTGACATGTGGATATCATTGCATGCACATAATTAAGATGCCACTGGCTATGGTTGTGTAACTGTAATAACCAAGTTGTTTCAAC TTTCAAGTCATGATTTTAGTGCAGTTTCAACTAGTTAATTTTGAAGTGGAAAAGTATGTTACTTATTAGATTTTTTTCAGTTTTTAATGAGAACCTTTGT TTTTCTTATTGGCTGTAATTACAATTTGAAAATTTTTCCACTCCATCTCTTGATTAGTCTGTCTTTTTTCCCATTGATTAAGCTGCCTAATATGGTTTGA ATTTATGAATTCATTGACTTGATGAATGTATTTATCAATGCTAATTTCCCCATTATTTGTCACATACTTTAGAATCAAATTAAGCATATTGGTGATGGTG AACAAGCTGTTGAGATGGCTCTTCTTATTCTCAGCCAGGAAACTAATACATTGCAGGGTGTAAGAAAGGCTCTATCAGTACTGTCAAAAGCTCTGGAGAC TGATCCAACATCTGTGGTTCTGTGGGTTGTGTATCTGCTCATCTGTTATGCAAATTTGAAGCCAAATGAAAAGGATGACATGTTCTTTTTCGCGGTTAAG AACTGTAAAGTATCTTATGCACTGTGGCTCATGTACATCAACAGTCAGAAAAGGATTGATGATCGGTTGGCTTCTTATGATGCCGCCCTCTCGGTGCTCT GTCAGCATGTATCTTCTGCTCCCGAGGACAGAATGCATGAAAGTGCATGCATTTTAGACCTGTTTCTGCATATGTTGGCTTGCTTATGCATGTCGGGAAA TGTTGAGAAGGCCATTGAAATAAGTCGTGGAGTATTTGCTTCTACAACTAAATCTGATGAGCCTCATCCTCATCATCTTCCACTCTTAGATATACTCAAT TGCTTAACAATTTCCGACAAATGTGTGTTCTGGATTTGTTGTGTTTACTTAGTTATTTACAGGAAACTGCCTGATGCTGTTGTGCATAAGTTTGAATGTG AGAAGGACCTCCTTGATATTGAGTGGCCGTTTGTCAGTTTATCAGAAGTTGATAAGCAAATGGCTGTTAAACTTGTGGAAATAGCTGTTGAATCTGTTGA CTCTTATGTCTACAATGAATCAGTGAAAAGTGAAGTTGACCTCAGGTCTGCTCAACTGTTTGCTCTCAATCATATTAGATCCATGGTTGCACTTGACAAC ATAGATTGCTTAAGAAACTTGTTGGATAAATATGTTAAGTTGTACCCTTCCTGCTTAGAGTTGGTCCTGGTATCAGCTCGTGTAAAGAAACAGGAGATTG GTGTTGACAGTTTTATGGGGTTTGAGGAAGCCATTAATATGTGGCCAAAGGAAGTTCCTGGAATACAGTGCATCTGGAATCAGTACATTGAAAATGCCAT CCAAAATCAAAGAATTGATTTTGCAAAAGAAATTACAGCCCATTGGTTTCACACTGTCTGGCAAATGCAGGATATTCCGAATGTTAGAGTGGGTGCCACT GATGGTCATAATTCTTGTGGCTCATTGGGATTGAATTCAAAATCTGTTCCAGAAACATCAACTCCTGATCTTAGCCAGATTGATGCTGTCTTTGGATTTC TTAATCTGTCTCTCTATAATATTTTTCAGAATGATGAAACAGAAGCATGCATAGCAGTTGACAAGGCTAGGAATGCTGCTATGTTTGGAGGTTTAGAGCA GTACTTGACAAAACATATAATGTTTGTGCTTTGTGATGCATTGAGCTTAAAGGAGAGTGGTACTAATGGTGCCATCAAAAAGGTTTTGGAGGGATATGTG GATTGTTCCTCTCAGGCTTCTCTGGTCCCTAAGGTGTTAACAAGAAAATTTCTTCAAAACATAAAAAAGCCAAGAGTGCAGAATCTCATTAGTAAAATAT TAAGTCCAGTTTCATTTGATTGTTCTCTACTAAACATGATACTTCAATCATGGTATGGGTCATCTCTTTTACCCGAAACAGGTAGCGATCTAAAACATTT AGTAGATTTGGTTGAAGCCATTATGAAAGTGGTTCCTTACAACTTCCAATTAGCTATTAATGTCTGCAATCTATTAAGCAAGAGCTATGAGTATTCTGAC CTACACTCAGCTGGTCTATGGTTTTGGGCTTGTTCAACCCTGGTAAGTGCAATTTTGGATACCATCCCAATACCACCAGAATTTATCTGGGTGGAAGCTG GGGGATTTTTGCAAAATGCCATGGGAATTGAAGCCATCTCTGAAAGGTTTTATAAAAGGGCTCTATCAGTGTATCCATTCTCTATCATGTTGTGGAAATG CTTCTATAAGCTACATAAGACCATTGGAGATGCAAAAGATGTTATCGAAGCAGCGAAAGAAAGGGGTATAGATTTGGTAACTGATTCAGTTTCTGGTTGT TAGGATCAACATATTTGTTCATGGGTTTGCTTATATGACAAGTAGGCCTCACTCAGCATATTTGTTCATGGGTTGATAGAAGTTTTTCAGGAGTATGATT GCTGAACTTGTACAGGAAAGTAGATTGGAGAGGTGTGATTGCATTAGATATATAGGAAGTAGTGTTGGGGACAAGATTGGATTGGTGAATCATCCTTACT TTTGCCATGTCCAAATTTTCCTTTAAGCTGATGTGAGCTTAAATTTTTGTATGCATGCTCTCTCCTTCCCCCACACATATAAATGAAAAGGTAAAAGTGG CACCATATTATGATGGTGGTGTGATAATTTTGTTGGTTGTTACCTGAAACAGATGAAATGAAAGAAAATTCTTTTTGTTTGTGGGTATCTGCTATCTAGT GGTTCAGTTTGTGTCCTTTACTTGTATCGGCATTTTGCCACATGGGGTTGTAGTATGTAGTATGTACCAACTACCAAGGGTTGGATTGTTCATCCATTAA AGCGGTAAGGCGAGGCAACTGAATAGCACTCCTATAGAAGAAAT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_188905; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_399952
Blastp | - |
---|---|
Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0002903) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019419361.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |