Id Trinity | TRINITY_DN51962_c1_g1_i8 |
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Name Transcript | Ll_transcript_399664 |
Sequence | GTTGATTAAGTCCTACTACTACCAAAAGAAAGAGTAATCAGAAATAAATACTCCTACGAGTTAGATATAAACAGAACAAGTTCAGCGATATTACTATTCT CTATCACTTTTGCATTTTCCTTTGAATCACACAACACGAAAATTATGGACAAAGCCATTAACAGACAAAAGGTTCTTCTTCAACATCTCAACCCTTCATC ATCCATCTACGCTAACGAATCATCATCCCTCTCTGCTTCAGCATGTCTGGCGGGGGATAGCGCTGCTTATCACAGGACATCTGCATTTGGAGATGATGTA GTGATTGTGGCAGCATATCGGACTCCTCTTTGCAAAGCGAAACGTGGTGGTTTCAAAGACACGCACGCTGATGATCTGCTAGCCCCAGTTTTGAAGGCTG TAATAGAGAAAACCAACTTGAACCCAAGTGAAGTTGGTGACATTATTGTGGGTACTGTATTGGCACCTGGATCTCAAAGAGCTACTGAATGTCGAATGGC TGCATTCTATGCTGGTTTTCCTGATACTGTGCCTATTAGGACAGTTAATAGGCAATGTTCTTCTGGGCTCCAGGCTGTTGCCGATGTAGCTGCAGCTATA AAGGCTGGATTCTATGACATTGGAATTGGTGCTGGTTTGGAATCAATGACAGCTACCCCAATGGGATGGGAAGGATCGGTCAATCCCAAGGCAAAACTGT TTGAACAAGCTCAGAATTGCCTTCTTCCAATGGGGATTACGTCTGAAAATGTTGCACAACGCTTTGGAGTGTCAAGACAGGAACAAGATCAGGCTGCTGT TGAGTCTCATAGGCGTGCTGCTGCAGCTACTGCTGCTGGTAGATTTAAAGATGAAATTGTCCCAGTTACCACTAAGATCGTGGACCCAAAAACTGGCGAG 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TATCTGGATATACCAAGAAAGATGTACGGTCTAATGAGGCTACTATGAAATATTTACTCATGGGTGGGGCAAGCTCTTCTATTCTGGTTTATGGTTTTTC TTGGCTATATGGTTCATCCGGGGGAGAGATCGAGCTTCAAGAAATAGTGAATGGTCTTATCAATACACAAATGTATAACTCCCCGGGAATTTCAATTGCG CTTATATTCATCACTATAGGAATTGGGTTCAAGCTTTCCCTAGCCCCTTTTCATCAATGGACTCCTGACGTATACGAAGGAGTGCGGTTCGTTCGATAAA TTCCTACCTCTCTATCTATTTCTGAGATGTTTGGATTTTTCAAAACTCC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_188924; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_399664
Blastp | 3-ketoacyl-CoA thiolase 2, peroxisomal from Arabidopsis with 85.96% of identity |
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Blastx | 3-ketoacyl-CoA thiolase 2, peroxisomal from Arabidopsis with 84.18% of identity |
Eggnog | acetyl-coa acetyltransferase(COG0183) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G33150) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019432803.1) |
Pfam | Thiolase, N-terminal domain (PF00108.22) |
Rfam | Intron_gpII (RF00029) |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |