Ll_transcript_398145

• Id Trinity: TRINITY_DN51978_c0_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_398145
• Sequence: ATTATCCATCAACTCCACCATGGTGACGTTGGTAACACCTCCACCACCCTTCTTATCCATAACCACACAGAGCAAGAAGAACAACAAGAACAAGAACAAG AAGAAGCGAACTTTGAGGAATTTCATTCACTTCTCCCTTAAGAGAGGATTTGGTAACACTGCTCATAAACTAAACAACCTTCTATGGCTTCGCAATCTCG AAGACCCTCTTGCTTCTCCCTTTTCTCTACCTTCCTTCCCTCAACCATGCTACCCAGGACTAACTGGAGTAGATTTGCTCATATCTGATCTTAAGGCATT GGAAGCATATGCTAGCTACTTCTATTATTTCTCTAAGATTTGGTCTATGCCACTTCCTCAAGTTTATGATCCTCAACATGTTGCTCACTATTTCAGTGCC AGACCCCATCTTGTGGCCCTTCGTATTCTAGAGGTATTTTCCTCCTTCACTTCTGCCATGATCAATATTCGAACTTCGGAGTTTAGGAAGTTTCTAGGAC TAAATCCAGAAGAGGACGTGGATGATAAAACATCACAATATAATTTTGGGATGGTGTTAAAGGAAACAATGCTTAATCTTGGTCCCACTTTTATAAAAGT TGGTCAGTCCCTTTCCACAAGGCCAGATATTATTGGCATTGAGATGTCTAAGGCACTGTCTGGACTGAATGATCAAATCCCTCCTTTTCCCAGAGCTGTT GCTATGAAGATTATAGAGGAAGAGTTAGGTTCTCCTTTGGAGTCATTCTTCAGTTACATTTCCGAGGATCCTATAGCTGCTGCGTCATTTGGTCAGGTTT ACTTTGCCCGTACTATAGATGGTATTGACGTTGCTGTAAAAGTTCAGCGTCCTAATTTGCGTCATGTGGTGGTGCGGGACATCTACATCCTCCGTCTTGG GTTGGGGTTGCTGCACAATATTGCAAACAGAAAGAGTGATCCTCGTGTATATGCTGATGAGCTTGGGAAAGGTTTTGTTGGTGAATTGGATTATACTTTA GAGGCTGCAAATGCTTCAAAGTTTCAGGAAGTTCACTCCCCCTTTTCTTTCATTCGTGTGCCTAAAATATATCCACAGTTAAGTCGAAAGAGAGTTCTGA CCATGGAATGGATGGTTGGTGAAAGTCCAACAGATTTGCTTTCTTTATCTACTGGAAACTCTATCGGAAATGTCTCTGAATATTCAGAAAAGCAGAAAGT AGATGCAAAAAAGCGTCTTCTTGATCTGGTCAACAAAGGTGTTGAAGCAACACTGGTGCAACTTCTTGAAACAGGCTTATTACATGCTGATCCACATGCG GGTAACTTGCGTTACATCTCCTCAGGACAAATAGGGTTTCTAGATTTTGGTTTGCTTTGTCAAATGGAAAAAAAGCATCAATTTGCTATGCTGGCTTCAA TAGTCCATATAGTAAATGGTGACTGGGCATCCCTTGTCCGTGCTCTGATTGATATGGATGTTGTGAGGCCAGGGACAAATATCCGACTTGTTACCCAGGA GCTGGAACATGCCTTGGGAGAAGTAGAATTTAAAGAAGGAATTCCTGATGTCAAGTTCAGCAGGGTGAGAGTCATCTTTTGACAAGCAGTAATTTAGTAT ACGTATTTCAGGTGACGGTGCAAACCATTGTGTATTAGTGTTAAGGGATGGCAATGATAGCATTTCTGACTAATTTTTGGACTAATGATAACTGAAATAT AAATATAGAATGTACTAGTCACTATCTGAAAATAACAACAATTGAGTAAACACCGTTTCTAAAACTGAAATCACCTCAACCAAAGTTCAAAGTGTGTGAA ATATCCAAAACCAACCACATTGGAATTGGATATGTCTATAGCTAGACTGAGTATGGATATTCACATAATCAATCATCTCCTTGGATGAATATTGGTAGTT ATATAGAAGGCTGTCTTCACCTACAACTTTTTTCAACAGAAATGGTATCAAAGAAATTCAAATTATGTATATATATTCTGTGTCAGGTGTACTAAGGTTA AAAGTAATGGAAGTTAACCATAATCAAACTGGTGATGCTTTTTTGGGCATTGAAACTGATATGTTCAAACAGTATTTCTATTTTGCAGTTCTCTCTCAAT AAATATGTCTTTTATGATAGATAATCAGATTAACTAATTGTTTTGTCTATTTTATTGAGATTCCTACTTCTACCTATTGTGTAAACACAAACAAGTTCCA TTTGAATGCATGCATATTATGAAGGGTGCTTTTGCAGTATTGTTTGATGAGCTTTTAAAAACTCCGGTCTTTCTTGTTTCGGATGAGTGGAACAATATTA ACTACATTTTGTAAAGTCGTGGTTTTATAGATAGAAAAAAAGTCATGTTTGTATGGTGTCAAATGCATTATCCATATACCACTTTGCTGAATCAACATTT TCAAATGTAACCTGCTGGTTTAGTTTAAGCCTGATCGGCATTTTCTACTCCGTTAGAACTTGTTCCAACTCTCATCCCACTTTTAAAGGAAAGGAAAAAT TAGGAGATGAGACATTTTGACCTCATTATTTTCTTTCCCTTCCCCTTCCCTCTAGTCCTCTCGAACCAAACACATGGAATTTCTGAATTTATTAATTATT TATTCTGGAAGCTTTCTTCTCCAGTTACTGAAATTTTCAATAAATTTTCTCCAAGGTTCTGGGAAAGATTTGGTCGGTAGCACTCAAGCACCATTTCCGT ATGCCACCATATTATACACTTGTCTTACGATCCCTAGCTTCCTTTGAAGGCTTGGCTATAGCTGCAGATAAAAACTTCAAGACTTTTGAAGCTGCATACC CTTATGTTGTTCGGAAACTTCTCACAGAAAACTCAGCTGCAACAAAGAATATATTGCATTCGGTACCACAAGCCCTTTAACAATAAGCTCTGTGCAAACA GTCCACAAAAATGTAACATGATATCATGTTTTTGCACTTGTTTGCTGATTTTAAGTCTAGAAATAGATCCTAAGGCCCTTATCGTAAGAAATTTTTAAGT GATTTAATTATACTTTTTGGTGTGTCTCATCGAACGATTCATATTAGTTTTGCATTCTCATCGACGTGAGCTATCACACATGATACTGATGGATTTCTAT CGTATCCATTAGCAATGTTTCTACTCAATCTAGATTTGTCTAAATATAGTATCAATGTTTCATTCTCCTTAAACTTAAATTGTGAAGTATCAATTAGTAT TCCTCCTCTCTCTCTCTCTCTTTTAAAACTTTATTCTCTCTTTTTAGGCGCTTCTAAACAGAAAGAAGGAGTTCCAGTGGCAAAGGCTTTCCCTATTCTT GAGGATAGGGGCAACTAGGTATGTGAAAATGGCATCTTAGGAAGTGTCTTATCCAGGTAGTCCTTTTTTAGGTCTGAACCCTCGATGTTCAAAAGTCACA TTGAATTTCAATTAATCCGAGTCAAGATAGGAGGACCCAACACCTATTTATTTCATTCACAAGACTTGAACTCGATATATCTTTTAAGGGGAACCAAACT CGTACTACTCGGCATAATAGTTGCTCATGTCCATGTTCTTTTCTATCTTCTATATTTTGAATGACTTTTTTTTTAATTCTAATTACATTTTTTTAGAAAA AGTTTAGTCCTTTTTTGATGAAGTGTCTGTTATTATATCATGAAAACTCCAAATCCTTTTCTAAAAATAGTCACCTAGGTAGGATCTGCAAACCTAGTGC CTAATACTGTAAATTTCACTTTTGTCACACACAAGCTGAACAAGAAACATTCGTCAGTGATTTGCTTTGGCATGGACTTCCTCATTTGGGCATTAGGATT GCCTCTTTGAGTTATCTATTATTACTTGATGAGTTGCTATCATTTAACTGCTGTAAGTATAACCTCTCATGCTTCTGATGCTTTGTCAGGAAAAACTTGC AACTAGTAGCATCAAATACTTCCCCGGATCATTTACCAAATAAGGGTACTGACATGTTTGATGTTGCATACTTAGTCTTGAGGCTTTTACCATCCAAGGA TGGTGCTGCTCTTAGAAGACTTCTCATGACTGCTGATGGAGCTTCATTAATCAAAGCAATGGTCTCAAAGGAGGGGAAGTTTTATCGCGAACAGCTTTGC AAGATCATAGCTGACACTCTGTACCAATGGATGATTAAAGCTAGTCAGAATTCGAGGGTGATATTAGCCGATGGACGTGGTGATAGAGAATCAGATCAAT CCTCTAGGTCATCCTTGCCTGCATATGATTATAATTCTATCTTTAGAGATCGGCGACTTAGGGTGATATTCTCTCATGTTCTCAAATCTGCAAGTAGAGA TAAAATATTGATGCTGCGGTTATGCTGGGCTTCTCTTCTTCTAATTATTAAAGCTTCAAGTTTGGCTTGCCACCAGGCTATTGTGTCTCTGTCTGAAGCT TACATGGGCCAAATATTTGATGCTCCTAAGAGATATGCAGTCACTACATAACATTTACTTAGAAAGTTAGAACATATTAGTTTTCTCAAGTACAAGAGTG CATTAAGAGTGCATTCTTATCCAACAATTTCCAAAGAAAACAAGAACAAAGGTCTATCTATTTACATGGATAGCAAGAGTGAACCCATTTATTCCTTGCA AACAAAGCACTTGTGGTCTTAAGTTCAGTGTTTTGGTTTCAGGTGGGTGAAATATAGTTATAGAATTGTCATGTGTTTTAATTCACAGTTTCTGTACATG GGGAAATGTTGTACACTATAGTTTCATGTAAAGTGATAAAGTTACTTTTTGCAGAGTATAGATGCCATTGATTACTGATCTATGCATCAGTCCCAAGCAG ATATTTACATGCACTTACTTGACTTTTTTAACAAAGTGATCAGTTTTAGGATGATGATGAAATCTTTTATAGAAATACTGAATGTTTCAGAAGATCAATA AGTGAAAAGATAAATGATGTTCCCTTGGTTTGGTGTTCCTTCATCAATTAAGTGGAACTGAAATGAGTATTTTTCCATTTCATCCCTTCCAAAATTCTCA AAAACGATGATGTCTTAGTTGACATTCTATCATTTAGTTATATATATTTGTAATCGATTCTCTTTATGTATATAATATAGATAAAGTGACATTGCAACAT ACATTACTCTTGTAGTTTTGTTCTTCTTCACACTTTCCACTCTCTTTCTATTCTCTAAAACTGAATTCCTTCATGAGCACGCCGCCGCTTTCACGGGTAC TTCTATCTCTCATTCTCTCATCTTAGGATTCAGATTTTATTACTATGAGTTGAGTTGATTTGTCTGAGTTTTCAATAATTTGAATGGCATTTGCAGGGCA TGAAAATGTTGGAATTGAGTGGAATGACTCATCTCTGCAAGGGTCTTGTAGTGGTGCTGGTTACTGCTTACATTCTCATTCACCTTTTCCCTTCAGCTCT CACCTACCTTGCTCTAGTTCCTGCCATTTATATGCCACTTTCTGGATTTCATGGAGTTATAT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_189065;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_398145

FPKM

• PAB: 2.8
• PNAB: 0.4
• PS1: 0.3
• PS2: 0
• PS3: 0.7
• PW1: 0.6
• PW2: 1.1
• PW3: 2.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_398145

• Blastp: Uncharacterized protein sll0005 from Synechocystis with 35.75% of identity
• Blastx: Uncharacterized protein sll0005 from Synechocystis with 35.75% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (sll0005)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019427497.1)
• Pfam: ABC1 family (PF03109.15)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;