Ll_transcript_473437

• Id Trinity: TRINITY_DN52017_c2_g1_i13
• Name Transcript: Ll_transcript_473437
• Sequence: CGACACTCAAAATAGATTAGTTATTTAGCCAATATTACCGCAGTATAAAAATAAATAAGCTATCTTCAATGTGAACCATCATCACTATCATTTGATTCAG TCATATAGTCCCAACTCAGTAGACGAAAGAAAACCCTAGCAACTTGAGATTCCTTGGGTCTCTCGATTTGCCCCAATTTCCCAAAAACCCTAATTTATCT CAATCTCCTCAGAATGAGCAGTATTCGTAGGTTGAGTGGCGAAGAATCGCAAGCACTCTACTCTCTCCTGAAAGCAGAACAACGCCCAATTCACGAGATC GTTTCCGAATTCAACTCCAACATCTCTCGCACTCGCCACTTCACTCTCTGTTCCTATCTCCTCATGCTTTTGCAGGACAACAAGATACTCAACACTACTC AGCGGTTAATTGCGTTTTCTTTGCTACTGGAGGCATATGCATCTCAGAAACCTGCTTCAAATCCATTCATAAGTTTTATCTTAAATGCTGCCTGTCATGA AGATTCAGAAAGAGTCGTGAGGGCATTTATTCTGCAGCTATTAGGTGTTGATGGATCCATCAGTGGCAAAGAGGTTATATTCTGTTTCATTCCTTAAAAA CACTAGTAAAATACATGGTTTAACCTATTAGAAGTGCTTACTGAGAAAATATATCAGAATTTATTTTTCTGTTCTACATATTTACAGTTGCAATTCATTT CTCACTATCTATCAGCTACATTTTCTTTGAACCTGTAATCTGGGAAGAGGAGGGTTGTAGATAATCTTATTAGGCATGTGCAAGATTTGAAATGGCAATG CTGCTACCTATTTATTTATAAGCAAATGATGTATTAACTAGAATGAGCAAGATAATACATATAATTGTAATACTGTTATTGCTACTTTGCAACAGCCACC CGTAGTCAAGTATGGACTATATACAGGAAGATTTAAAAGATATGCTTTGTTTTATGTAACTTGGATGTGTTTTGTTGGAGCATAGAAACTTTTAGCGGAT TGATATAGGAAATGAAATCGTTTTTTGGGGATTTACATGACTAGTTCATGTTATAAGAGATTGCTGGTTTCAGTGTTATCAAATGGTAGCCATGGTGGAG GGTGGTGGTTGTTCCAGGCAGAATGCCATTCCTCTTTTGGAAAAACCTGCTAAATGGCTAGGCTATTTGGTGTTCAGGAATCAGGACAGCCATGGCTGTA TGGAAGTGACAGTGTATGGCAGAAATAGCGGACATGGCACTCTTATCGTAATATTCATGCGATTCATATCTAGGAACGTCATAAAGTGAAGTGCCAGTGA TACAGAATAGGATTAGAATCGCAAATGACCCTGAAGCGCACAACCTGGTTCCTCTAAGAGACAATTAGGTTTTTTTCTGATTTTTTGAAGTTTTCCCAGG TATTGTGCTGGTCCACTGGCCCGGTTCTGAAAACTATAAAATTTGGCATTTCGTCACGTTTCTTAAGTGGGATAGGGATGTGAAGTGTCAAAAATACCTT TCACTTATTCTCTTTGTTGAATACTAAACTTTTTGAACCTATTATTATTTTAAGATTTGTTACTTTCTCTGCCATATTCCCTTCCCCAATATCAGTATCA TTGTTGCAGAATTGTAGTGCTATCGTATCTCAACTCCCTGGCTCACTTTTTTATTCACTCATCCCCTCCTCTCTTTCTTTTATTAAGCTTCAATTCTTCC ATTTTTTAAGTGGGTTTCAATGTGTCAAAGAAAAAGGAGGAGGCTGATATTACATGGAATCACTGTGAAAGTGTTCCACCCTACAGAGTCATGATAGAAT GTAATATTGTTGTAATGTAAATAGTTAAGTTTATTGGTTACTGATAAATATTTTACTTTAAAATGCTAATATCTATTATTTCTTTATTTGAGAATATATT TTATATTATTTTTAATTATTAGTCAGTATCTGGTGCTATTATTAATTTTTTCTTTATATATTGTATTTTTTAATTATTTTGTGTCAACCACCACAATGAT GTCCATTATTTTCCCACAATGCCACCGCAACGTCATGATGGTTGAACTTTGGCAAACATCATGGGCCGCCATCAACAACACGGGTGCACATCTGCTGTCC CACAATGAGTGCCACTCCGTGTGCCATGAGTTTGTGATTGGTTGAAACAATGTATTTAAGTTAAAATTTAATTATTAAATATTTTTCTGACCAGTTATAG CTTACGGCACATGGAGTGACATTCATTATGGGACAGAAGATGTGCCCCGACAACACTGGGTGGTTTTATTGTTCAAATATTTTCCTTTCAGTTTGTTTTG GGTTGTTTCATCACTTTCAGGGGCCAGCTTTGTTTGTTGAAGCTCTTACTCTCCTTCTATGTAGCCTTTTCATTTTCCCTCTATAAGAATACCTTCATAA AAGCTATACAACCTATACTTATTAATCTTTAACTTTCGTTTTAGATCGAAAAATTTGTAAATTGGATGTTCTTTGTTGTTCAAACATGCATCTAACGTGT TTTCAGTATGGGGATCTATAGTTGGTTTCTCTTTCAACATGCATCTAAATGTTTGTGTCATCTTTGTGTTGATAATTCATGGCATTATGTTTGCTGTTGC TGCATATTTGCTTCCTTACTTTCTCCTTGATGATATGTTTGTCTTTAGTTTTAAATTGTGGTGTTTTTCTATCACTGGAGGGTTGCAGTTTCTTAAACAG TCTGCTTCAGATTATGTGAAAGGATTCGACCAATCATTGCATGACTTCCCATCATTAGATCAGTTGCAGCAGCAGTTTCCTGATGATGTTCATCTTGAAC CGTATCATCACTTATTTAAAGATGGTTCTGTAAAAAATGTAGTCCCAGACCCTGATGTTCCCTCCAATTGTGATATAGATTCACCAGAGTTTGATTTGCA CCCCGGTTCAAAACCTAAAATTGGATCTGGTGATAAAGAGGAGGCAGTAGTTGGGTTGTTATCAAATTTTTCACTAGAAGGATTACGTCCTCACTGGATC AGGCCTATTCCACCAAGGCTCCCAATACTTGATGAGGAGCTTGTTTGGCTCAACCCCGATGACAATCATGAACTGATGTGGGACTACAGTATGTGCATTG ATACAAGCAGAGGAGCTGCAGTAAGGGACTTAATTGCAAATGCTCTGAAGGGAGCCCTTGCACCTGCTCAGCAAGAGGTGACTATTGTTTTTGTTGATAA AACTTCAATAAAGTGTAGAGAAGAAAAAAATAAAAAAATACTAGTAATATGTAGGATAAGAAATCATGTGCAAAAAAAGGGAAAATAAAACGGCAGCGAA GAGGCAAGATTGGTGGAGCAAAGATGCCCAATCCCTTGGCATATTTAAGGACAACCCTTTGAAAATATGCTTCACATCAAATTGAAGCTGAAATCCTAAT CTTTTCCCAAGTCATATGCTGAACCAATTAAGTGCCCTTAAAGTGAGTGTTAGAAGCAATATCCAAATGTAGCAAATAGTAGCATAGATTCTGCATTGCC ATAAAAAATAGCTTCTTTACTTCCACCGAAACCACTAAAGCTAGTCAACAAAAATAGGACCATTGAGCTAGTCCATACCCAGCATTCACTATCAAGGATG GACAGTTTATGCCGTAAGAGACAGCTGTAGAACAATTGCGAAACAGATGAGAATTTGATTCTGAACAAACATCAGACCTAATACACGTATCAAGAGAAAG ACCTTCTGATTAATTTGTAATAAATATTTCCCCTTTTAGTTATAGTAAAAACAAAAAGATGGGACTTTTGGGTAAAAGTTTAAAACACCTGAGGTAATCT TCTTTTTATAAGAGTACAGATATGTTTTGTTGTACGGATTCCTTGTTACAAATTGCATCACATTGCAGTATGTCAAGTGAGACCTAGTGCTTATTTTGTC AAATGTTTGATGAAGAATATGATGTTTGTAATTTTTTACACAGAAAGTCCTTGTGGAGCTGGCTAATGATCCAAAGCTTGTATATCACTGTGGACTGACA CCAAGAAAGTTGCCTGTACGTGTTGTGATCTTTTTGAGCCAGTTATGTCTGGATGTTTTGTTCTCATTTCTTTTTCCTATCAGGAACTAGTGGAAAACAA TCCCCTAATTGCAATCGACGTTCTTACTAAGTTGATAAATTCTCCTGAAATAGCAGAGTATGCCTTTTGCCTCTATGTAATCTTTCTTTCTTTAGTATAT AAGGACCCAATCACTATTATTTTCTTTATTTCTATTTGCTTATTTATGGAGACAGATACTTTACAGTACTTGTCAATATGGACATGAGTCTACACTCAAT GGAAGTTGTGAACAGGCTTACAACAGCAGTTGAACTTCCTTCAGAATTTATTCACATGTATATCACTAATTGTATATCATCCTGTGTGAACATCAAGGAT AAGTACATGCAGAACAGGCTTGTGAGACTTGTTTGTGTTTTTCTGCAAAGCCTTATTCGAAATAACATCATCAATGTCAAAGATCTGTTCATTGAAGTTC AAGCGTTTTGTATTGAGTTTTCGCGAATTAGAGAGGCAGCTGCATTGTTCAGGCTTCTCAAGTCATTGGAATGATTGTTGTTAAAGGCTGTTCATTTTTT TCTCACTTCCTCTCCC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_189393;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_473437

FPKM

• PAB: 0.1
• PNAB: 0.3
• PS1: 0.5
• PS2: 0.2
• PS3: 0.2
• PW1: 0.2
• PW2: 0.4
• PW3: 0.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_473437

• Blastp: CCR4-NOT transcription complex subunit 11 from Danio with 36.52% of identity
• Blastx: CCR4-NOT transcription complex subunit 11 from Homo with 87.63% of identity
• Eggnog: chromosome 2 open reading frame 29(ENOG410XPKT)
• Kegg: Link to kegg annotations (336124)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019432523.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;