Id Trinity | TRINITY_DN52032_c1_g1_i5 |
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Name Transcript | Ll_transcript_474284 |
Sequence | GCTGTTTTAATAACATTGTTATTAAGCATAAAAACACAACTATTCCTCTCGCGCTTCCGGCGAGTGCGCTCCACTCTTCAACCTCCGTTCCCGTCTGCCA CCTACTCGCTCCACTGCCACATTCACTCACTTTCTCTCTCTAGAACTTTTCTCCTTCTCTCTCTAGAAAATTCTCTTCCTCTCTCTCAAATCGCGCACCG CAATCTCGTGTTCAAGTTTCTCAAAACTCGATCAAACTCAATCGATTAAATCATCACATAATCTCTGACACAAGAATCCAAAATCAAAATCTCAGTCGTA GTTTTTGGTGTGCAAAGATGATGGCTGAGGATCTCGGTGTGGAAGCGAAGGAGGCAGCGGTTCGTGAAGTCGCGAAACTGTTGCCACTTCCAGAGCTTCT TCAGTCAATCTCATCAATCAAAGCCGATTACATTTCGCGCCAACAGGCTAATGATGCACAGCTTAGTACAATGGTTGTAGAGCAGGTTGAGCAAGCACAG GCAGGACTGAAATCACTCTCCTTGTCTGAAAAGTCAGTAAACCAGCTTCGGGAAAACTTTCTCTCCATTGAGAAGTTATGTCAGGAGTGCCAGACATTAA TTGACAACCATGACCAGATAAAGCTACTTAGCAATGCCAGAAATAACTTGAACACAACCTTGAAGGATGTTGAAGGAATGATGTCCATCTCTGTCGAGGC AGCAGAGGCTCGAGATTCTTTAAGTGATGACAAAGAAATTGTTAACACTTATGAGAGATTAACCGCTCTTGATGGGAAACGGAGGTTTGCATTAGCAGCT GCAGCATCTCACAAGGAAGAGGTTGGAAGACTAAGAGAATATTTTGAAGATGTTGATCGAACCTGGGAGACCTTTGAGAAGACACTATGGGGCCACATTG 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TATATGAAAATACACTTGTTGATGGAAAACCTCCAAAGACAGGATTTGTTTTTGCAAGGGTGAAGTGCTTAACAGCAGCTAAGGGGGGCCTTTGGCGTAA ACTTACTTAAAACTCAAATTCCATTCACTTATTTTCATTCTTTCTTTATTCCTTTTAATTATTTGTGTCCAAATCCCATATGTTATGGTGTCAATAAAGA AATTTTGTAATATACAACTAGTTACTCTATAATATTTTGAAATTTTATTTCCGTTCTCAGTTTCACTATGCACAGTATGTGGTTGACATTTGCAAAACTT CTCTATTCAGAAAATGCTTTTGTTTGCTTAACCTTGCAAATCACGTAGGTGTGTATCTTGGAATGTTTTTTTGTTCAGTTTTTTATATATAACAGTATCA TTCAC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_189516; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_474284
Blastp | Exocyst complex component SEC6 from Arabidopsis with 86.49% of identity |
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Blastx | Exocyst complex component SEC6 from Arabidopsis with 86.49% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G71820) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019413792.1) |
Pfam | Exocyst complex component Sec6 (PF06046.12) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |