| Id Trinity | TRINITY_DN52032_c1_g1_i7 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_474287 |
| Sequence | CAAAAATACACAAAGGCTTTTCTCAATTGCTTTACCCGTCCTTCCCCCTATTCCTCTCTCGCGCTTCTGGTGAGTCGCACCACTCATCGATCTGCCTTCC CCTCTGCCACCTATCTCCTCCTCACTTCACTCCATTGCCACCGCTACTTTCTTTCTCTCTCTACAAATTCTCTACTCTCTCTCTACAACTTCTAAGCATT CATTTCCAAATCTCGAATCGCGCACCTCGTAGACACCACTGTTGTGTTCAATTTCATAGAAAACCGTTCAAGTTCGTGATCAATTGAAGAAAATTAGAAT CAGCATAGAATTCTCTATACAAGAACTCAGATCAAAATCGTAGTTGACTAGTAGTGTTATTTTGTGTGTGCAAAGATGATGGCTGAGGATCTCGGTGTGG AAGCGAAGGAAGCAGCGGTTCGTGAAGTCGCGAAGCTTTTACCACTTCCGGAGCTTCTTCAGGCAATCTCCTCCATCAAGGCTGATTACATTTCGCGCCA ACAGGCCAATGATGCACAGCTTAGTACAATGGTTGTAGAGCAGGTTGAGCAAGCACAGGCAGGACTGAAATCACTCTCCTTGTCTGAGAAGTCAGTACAC CAGCTCCGGGAAAACTTTGTCTCCATTGAGAAGTTATGTCTAGAGTGCCAAACATTAATTGACAACCACGACCAGATAAAGCTACTCAGCAATGCCAGAA ATAACTTGAACACAACCTTGAAGGATGTTGAAGGTATGATGTCAATCTCTGTCGAGGCAGCAGAGGCTCGGGATTCTTTGAGCGATGACAAAGAAATTGT CAACTCTTATGAGAGGTTAACTGCTCTTGATGGGAAACGGAGATTTGCATTAGCAGCTGCAGGATCTCACAAGGAAGAGGTTGGAAGACTAAGAGAATAT TTTGAAGACGTTGATCGAACTTGGGAGACCTTTGAGAAGACACTATGGGGCCATATTTCCAATTTCTACAAACTTTCTAAAGAAAGCCCACAGACTTTGG TTCGTGCTTTACGGGTTGTTGAAATGCAAGAAATCCTTGATGAACAAGTTGCAGAGGAAGCAGCTGATGCTGAAGGGGATGGTGCAATATCATCAGTCGC AAATCCTGCCATAAAATCTACAAGTTCAATGGCTTCTTCTAAAAATTTGACACAGCAAAAAATGAAAGTTCATGGGAAAGGCTTTAAGGATAAGTGCTAT GAGCAAATACGGAAGACTGTAGAAGGACGCTTTAACAAGCTTCTTACGGAGCTTATCTTTGAGGATCTGAAAGCAGCACTAGAGGAAGCTCGGGTGATTG GGGACGAACTTGGAGACATCTATGATTATGTAGCTCCCTGCTTTCCTCCAAGATACGAAATTTTCCAACTAATGGTAAATCTGTACACTGAAAGGTTTAT TCAGTTTCTGAGGTTGCTCAGCGACAGGGCAAATGAATTAACAAATATTGAGATATTAAAGGTTACTGGTTGGGTGGTTGAATACCAGGATAATCTGATT GGGCTTGGTGTTGACGACTCTCTAGCCCAAGTCTGCTCTGAGAGTGGTGCCATGGATCCCCTTATGAACTCTTATGTTGAAAGAATGCAAGCTACAACTA GGAAATGGTACTTGAATATTTTGGAGGCTGATAAAACACAGCCCCCAAAGAAAACAGAAGATGGGAAGTTGTATACCCCAGCTGCTGTTGATCTATTCAG GATACTTGGAGAGCAAGTACAAATTGTTCGGGATAATAGCACTGATATCATGTTATACCGAATCGCATTGGCAACCATTCAGGTCATGATTGATTTTCAA GCGGCTGAAAAGAAGAGACTCGGAGAACCTGCTTCTGAAATTGGTCTGGAACCTTTATGTGCTATGATTAACAACAATTTGCGCTGCTATGATCTTGCAA TGGAACTGAGTAATAGCACCATAGAAGCGCTTGCACAGAACTATGCTGAGCAGGTTAATTTTGAAGATCCTTGTAAGGGTTTTCTCGAGGTTGCTAAGAA AGCTGTGCATCAGACTGTTAGTGTAATATTTGAAGATCCTGGAGTCCAGGAGTTGCTGGTAAAGCTATACCATAAAGGTAAAGTAATTTCTCCATCACCT AGCTAGTGTCTCTGTAGGTTTATTCTAATGGTTCTTACAGGGGAGGGGGGTTCTGTCCTCTTTGCAGAGGGACTAAGGAGTTGTTTTTTTAGGTAGGAAG ATTGCTAATTTTTCCATTCTCTACTCTTCCATTAATCTCGTAATAAAATCTCTATCTTTTAAAACAGGAAATTAGTTGCCTTCAGCATTAAGATATGATT GACTACAACTTATTGATAATAAAGTTTTGGATAAATTTCAATTATCCTTTCTAGCACTTACTACATGCTTGGGTATTTAGATTCATCGTACAGTATCCAA TATTATATTGTACCACCACTGAAGTACATTGTTTTATCAATAATAAATCTACCATGTTTCATTTTATATTCCATCAAGTACGTGCTTTTAAACCTTATTT GATGTTTTAAAAAGTTGACTTTTTTCCTTGTATATATCAGAATGGAGTGAGGGGCAAGTTACTGAGTATTTGGTTGCAACATTTAGTGATTATTTTAGTG ATGTAAAAATGTGAGTAAGTTTTCTGATCTCAGTAATTTTGTTTTGTTAATTCCAATATGTCATATTACCTCTATCAGCTTTCTTTGTTGTCTCTTAAGA ACATGGTAATAATGAAAGCTTAATCTGTGAAGCTAGGGCCTTAATACAGGTCTCATAAACCATCAGACCACTTTGTTCTTCTGGTTGTCAAATCATATAT TTTTCAAGTAAATACTAGTCATTGAGATCTCTGATGCTTTAACGCACCTTTACTGCCACCCTGTACCTACAAACACATAACTTGATGAATGTTTGATCTC ATGTCTGTGTCTTGATGGCATCATTTATTTATCATATAAAAAAGAACACATTCCTGATGCAAATTTGGAAGTTATTAGGTGTACTTTTGATTATGGAATT ATTTTTACTGTTATTATTCACTTTTCTTATTTTGGAATGGGGAAATCAACTAAGAAACATGATTTTGACTTAATTACCAGAAATCTGTCCACTAAGTGGC AGAGCTTGGCTAGAATTTTTTGGGGGTGAACAGTAGGAGACTTGGTAAATAAAAAGAATTTTGGCAATGGAGGCAAAATGACATTTTTATGGGCATTCTA TATTTCTATATAGAGGGTCTATTTACCTTTTCCATGTATTGACTGGTTGATATTGATTGATGAGCTGCCTATGCGATAGTTAACTAATGCAAGTTGAGTC ATCAACTTTAATGGAAACCAAATGCATTCATCTAAATTAACCTGAATCTTATTGTAAAATTGTAATCACATCTCAGCAAATGATTTTTTCTTTGCACTTA GTGCTAACAGTACTAGCAGAAGTCCTGTATGCTAGCAGCATGTGCATCCTCTTTTTTTATAGGAAAATGTTAGTATGTTAGTATCTGTAGTGGGTGAGGC TCGAACCCTCAACCTCCTTATAACTCTATTCCTTAAACCCTCCACCCTAACCACCTGGCCACCTTATGACTCCTGCAACATGTGCATTCTCATCAATAGC TAAAGGTTCCAAACTATGTAGTCAATCCCAGATCCCATATGAACCCAAAAACAGGATACAGCCATACAGGGATGGCCGTGATAAGGATGTTTAGGAAAGC AAAATAAGTAATTTTTACGATACACATATAAATGTTAAAAAATAGAAAATTTCACAATCAAAGACAAGCTCAAAATCAATGATATAACTCAAATCTAATA AAAGTACTAAGTACCTCAAAATCCCAATATAAGTCAAATCAATTCAAGGATTTAAGCCTTTCTAAGGCTTAAAAGTAAGTACTAGGTACTAGATACTAGT CTATTTGAAGCATTCAAAGTAATATAGCAAACAAGGTTGATGGCTCACAAGGTGTACTAGTCTATTCTAAGTATCCAAAATAATATCGTGAAGAAGGTTG ATGGCTCACAGGATTGAAGGGGGAGTTAAGGTCCAGTTGTGTTCAAATGGGTTCATAGCTGCTCACCAAGTCCTTATGTTCGAATTAGGTTTAGGGGTTG TCTAAATGACCAAAATGTCCCAGAAAAGAGACATAATGTTTTAAAAATGAGGGCTAAATGGGGTTTTAACCCCCTTGTTCATTTCCCAGTGAGATTCCAC TGGGAAACTGGGATGAGATCCGGTGATTTGGAGTTGGGATAGCCGGGATACAGATTGGGAATGGAATAGAAAATTACATATCAATACCATGCCAAACTAG GATGGGATCCTGGGAACGAGTGGGATCCCACTGCGATCAACTACTTAGGTTCCACAGTAATGGTTTGAACTTGGGTTGCTACACAGGATGGTTAATGAAT AGGGTCAATGGCATCCCTATGTGTATTAATCTTTTGAACAATTATCATCTAACAGGTTTAATTTTTTTAATATTAGTGGAAGCTTGTGCATTCAGTTGCA GTAACATAAGAAATATTTTTCTGAGAGATGTCTGAGAACCTCAAGTTTGGCTTGTATGAATTTTATGAACTGGATTTTGTTTATCACGTTTGGGGGATCT TAGTTTTCATGTCTAGAATATGTATGGCTGGTGAGAGTTGATTTTCCTACTTTCTCTCTTCTTCTTACTCTTTTTTCTCTAGCTTTGAGATCATCATTTT GTATTATTCTGGTTTAGTTGTTTAGCTATAAGCTTTGGTTCCTGTGTGTTGTAAAAACTGTTTCTGATTATTTCATTAGAAGTGCAATTGCTCTTAAATA GAATACAAGATGTCTAGTAAAGGAAATTCCTGAACTATTGCACATAGTTAATTCCTATGTTTAAGGGTCAATGATTCCTCTACAATAATCACAAAATCAG ACAGTTAGCCTTCCTCATTTATAGCATGTAATTCTGTATATACAAGGAAATATTCTATTATGCCAATCCTCAAAGATTCTGACAGTGTGCATCATCTGAA GTTTGTTAATGAATTATTGTTGTGTATGGCTTCTTTGCATTTTTCTGAAGTTCAGTTGTTGAATAACTGGTTTGTTGTGGAAAACTTATAGTTATAACTT CTCCTATATCTAAGGTACATTGAAGAAAGATCCTTCAGGAGATTTGTTGAAGCCTGCCTGGAGGAAACAGTGATTGTTTATGTTGATCACCTCCTAACAC AGAAAAACTATATTAAAGAAGAAACAATTGAACGGATGCGGCTAGATGAGGAGGTCATCATGGACTTTTTCAGGGAATATATCAGTGTTTCTAAAGTTGA AAACAGAGTGAGTATACTCAGCGACTTGAGGGAACTTGCTTCAGCAGAGAGCCTGGATACCTTCACGCTCATCTATACTAATATACTTGAACATCAGCCT GACTGCCCGCCTGAAGTTGTCGAGAAACTTGTTGGACTACGAGAAGGCATTCCTCGAAAGGATGCTAAGGAGGTGGTACAAGAATGCAAAGAGATATATG AAAATACACTTGTTGATGGAAAACCTCCAAAGACAGGATTTGTTTTTGCAAGGGTGAAGTGCTTAACAGCAGCTAAGGGGGGCCTTTGGCGTAAACTTAC TTAAAACTCAAATTCCATTCACTTATTTTCATTCTTTCTTTATTCCTTTTAATTATTTGTGTCCAAATCCCATATGTTATGGTGTCAATAAAGAAATTTT GTAATATACAACTAGTTACTCTATAATATTTTGAAATTTTATTTCCGTTCTCAGTTTCACTATGCACAGTATGTGGTTGACATTTGCAAAACTTCTCTAT TCAGAAAATGCTTTTGTTTGCTTAACCTTGCAAATCACGTAGGTGTGTATCTTGGAATGTTTTTTTGTTCAGTTTTTTATATATAACAGTATCATTCAC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_189516; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_474287
| Blastp | Exocyst complex component SEC6 from Arabidopsis with 87.89% of identity |
|---|---|
| Blastx | Exocyst complex component SEC6 from Arabidopsis with 87.89% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT1G71820) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019461452.1) |
| Pfam | Exocyst complex component Sec6 (PF06046.12) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |