| Id Trinity | TRINITY_DN52032_c1_g4_i1 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_474279 |
| Sequence | TTTTACTGATGTAAAAATGTGAGTAAATTTTCTGATCTCAGTAAATTTTTTTGTTAATTTCACATGTGCCATAGTACCTCTGTCAGCTTTCTTTGTTGTC TCTTGAGATCATGTCTGTGTAATGCCCTTCATGGAAAAATAACAGTTTCTTGCTGCAAAGTTGGAAATATGAGATTTATTTTCGATTATGAACTTCTTAC TGTTATTATGCCCTACTCTTATTTTGTAATGGGGAAATCAACTAAGAAAAGATGAATTTGGCTTAATTACCGGAAATCTTTCCATAAAGTGGCAGAGCTT GGCTGGAATTTTTTGGGGGTGAACAATTGGAAACTCTGGGTAAATTAAAAGGATTTTGGTAGTGATAGCAAAATGACATTTTTATGGGCATTCTATATTC TATATATGGGACCTGCTGCCCATGTAATTAATCCTATCTATTTACCTTATCCATGCTTTATTGCAGGTTGATATTGATTGATGAGCTGTGTATGCTGTAG TTAACTAATCCAAGTCGAGTTATTATCGTTAATGGAAACATATGCATTCTTCTAAGTTAACCTGAAACTTATTGTAAAAAATTAATGATATCTGACCATA TGATACTTTTGTTTGCACTTGATGATAACAGTACTAGATGTCCTGTAAGCTATCAGCATGTGCATCCTCCTTAATAGCAAAAGGTTCCAAATTAAGGATT TGGTCTGTATAGCAACATGGGTATTCCTATGTTTATTATTCTTTTTAACAATTATCACCTACCAGTAAAAAGGTGTTGGAGGCACAGTTGTTTAGTTATT TTCTTTTGTTGTTTTGAAGGTTTTTCACTCATGTTTTGTTTAATAAGATTAGATCGGGATTTGTTTGTACTAGTCTTTTGCCAAGTTTCTGGATATGATT TGTGTTGATTTGTGCTATGCAATTATCCATATGAATTGTGTTTTAAATTCTGGAGTCTGAATGTTAGTTTGTTAACTAAAATAGTAGTTGAAATGGACAA ACGATGCCTTAAGGAATACAGTTTGAAGTGCTGCATGATTTTTTATTAAATAAAGTAAGCTGTTGAACTGAATCGTTCATGGTCGGTGCAGTTCCTACAC AGAATTCAACATTAGGTGAACCGAACCATCCTTCTGTTTAGTTTCTAAATTGAACCAAAAATTGAACCGAATTGTTACACCCTTACTACCAGGTTCAATT TTTTTAAGATTAGTGGAAATAGGTGCATTCAGTTGCATAGTAACAGAAGAAACATTTTTTTGTGTGAGATATCCAAGAATACCTCAAGTGTGGCTTTTGC ATGAAATTTTTGTACTGTATTTTGTTTATCAGTTTCCATTTCTAGAATATGTATGGCTGGTAAGAGTTGACTTTTCCACTTTCTCTCTTCTAATTTATTC TTTTTCTCTATCTTTGATATCATCATTTTTTATTATTCCGATGTACTTGTTTTCATTCATTGCAGTTTAGCTATATGCCTCGCTATGTGTAATCATCTGA ACTTTGTTTATGGAGTTGTTGGTGCAAATGGCTTCTCTTGCATTGATGTGAAGTTTGATTGTCGAATATTTGGTTTGTTGTGGAAAACTAATTGTTATAA ATTCCTATATATTTAAGGTACATTGAAGAAAGATCTTTTAGGAGATTTGTTGAAGCCTGCCTGGAGGAAACAGTGATTGTTTATGTTGACCATCTCCTAA CACAGGTTCTGATGTTAATAAAATAATTCTTGGTTCTTATTTATGGAATAAAGTTGTGAATATAGTCTTCTGTAACATTTTTTCATGACTTTATTGTATC ACTGATAATTTGAATTGCAGAAAAACTACATTAAGGAAGACACTATTGAACGGATGAGACTAGATGAGGAGGTCATCATGGACTTTTTTAGGGAATATAT CAGTGTTTCTAAAGTTGAAAACAGAGTGAGTATACTTAGCGACCTGAGGGAACTTGCTTCAGCAGAGAGTCTGGATACCTTCACACTCATCTATACTAAT ATACTCGAACATCAACCTGACTGCCCGCCTGAAGTGGTTGAGAAACTTG BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_189519; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_474279
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Exocyst complex component SEC6 from Arabidopsis with 85.71% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT1G71820) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019461452.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |