Ll_transcript_474281

• Id Trinity: TRINITY_DN52032_c1_g4_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_474281
• Sequence: TTTTACTGATGTAAAAATGTGAGTAAATTTTCTGATCTCAGTAAATTTTTTTGTTAATTTCACATGTGCCATAGTACCTCTGTCAGCTTTCTTTGTTGTC TCTTGAGATCATGTCTGTGTAATGCCCTTCATGGAAAAATAACAGTTTCTTGCTGCAAAGTTGGAAATATGAGATTTATTTTCGATTATGAACTTCTTAC TGTTATTATGCCCTACTCTTATTTTGTAATGGGGAAATCAACTAAGAAAAGATGAATTTGGCTTAATTACCGGAAATCTTTCCATAAAGTGGCAGAGCTT GGCTGGAATTTTTTGGGGGTGAACAATTGGAAACTCTGGGTAAATTAAAAGGATTTTGGTAGTGATAGCAAAATGACATTTTTATGGGCATTCTATATTC TATATATGGGACCTGCTGCCCATGTAATTAATCCTATCTATTTACCTTATCCATGCTTTATTGCAGGTTGATATTGATTGATGAGCTGTGTATGCTGTAG TTAACTAATCCAAGTCGAGTTATTATCGTTAATGGAAACATATGCATTCTTCTAAGTTAACCTGAAACTTATTGTAAAAAATTAATGATATCTGACCATA TGATACTTTTGTTTGCACTTGATGATAACAGTACTAGATGTCCTGTAAGCTATCAGCATGTGCATCCTCCTTAATAGCAAAAGGTTCCAAATTAAGGATT TGGTCTGTATAGCAACATGGGTATTCCTATGTTTATTATTCTTTTTAACAATTATCACCTACCAGTAAAAAGGTGTTGGAGGCACAGTTGTTTAGTTATT TTCTTTTGTTGTTTTGAAGGTTTTTCACTCATGTTTTGTTTAATAAGATTAGATCGGGATTTGTTTGTACTAGTCTTTTGCCAAGTTTCTGGATATGATT TGTGTTGATTTGTGCTATGCAATTATCCATATGAATTGTGTTTTAAATTCTGGAGTCTGAATGTTAGTTTGTTAACTAAAATAGTAGTTGAAATGGACAA ACGATGCCTTAAGGAATACAGTTTGAAGTGCTGCATGATTTTTTATTAAATAAAGTAAGCTGTTGAACTGAATCGTTCATGGTCGGTGCAGTTCCTACAC AGAATTCAACATTAGGTGAACCGAACCATCCTTCTGTTTAGTTTCTAAATTGAACCAAAAATTGAACCGAATTGTTACACCCTTACTACCAGGTTCAATT TTTTTAAGATTAGTGGAAATAGGTGCATTCAGTTGCATAGTAACAGAAGAAACATTTTTTTGTGTGAGATATCCAAGAATACCTCAAGTGTGGCTTTTGC ATGAAATTTTTGTACTGTATTTTGTTTATCAGTTTCCATTTCTAGAATATGTATGGCTGGTAAGAGTTGACTTTTCCACTTTCTCTCTTCTAATTTATTC TTTTTCTCTATCTTTGATATCATCATTTTTTATTATTCCGATGTACTTGTTTTCATTCATTGCAGTTTAGCTATATGCCTCGCTATGTGTAATCATCTGA ACTTTGTTTATGGAGTTGTTGGTGCAAATGGCTTCTCTTGCATTGATGTGAAGTTTGATTGTCGAATATTTGGTTTGTTGTGGAAAACTAATTGTTATAA ATTCCTATATATTTAAGGTACATTGAAGAAAGATCTTTTAGGAGATTTGTTGAAGCCTGCCTGGAGGAAACAGTGATTGTTTATGTTGACCATCTCCTAA CACAGAAAAACTACATTAAGGAAGACACTATTGAACGGATGAGACTAGATGAGGAGGTCATCATGGACTTTTTTAGGGAATATATCAGTGTTTCTAAAGT TGAAAACAGAGTGAGTATACTTAGCGACCTGAGGGAACTTGCTTCAGCAGAGAGTCTGGATACCTTCACACTCATCTATACTAATATACTCGAACATCAA CCTGACTGCCCGCCTGAAGTGGTTGAGAAACTTG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_189519;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_474281

FPKM

• PAB: 0.1
• PNAB: 0.7
• PS1: 0.3
• PS2: 0.8
• PS3: 0.2
• PW1: 0.1
• PW2: 0.1
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_474281

• Blastp: -
• Blastx: Exocyst complex component SEC6 from Arabidopsis with 88% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G71820)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019461452.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;