Id Trinity | TRINITY_DN52033_c0_g1_i25 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_473376 |
Sequence | GTAACTTCTGGTAGTTTCTTCAACAACGTAATCTTAGAAAAATCATCGCCTCCATATTCGTCGCGACGTTTGGTATCCTTCTTTGTGGGGCTAGTTCTGT GCAATTCCTTGGTCAAAGGCTTTGCGGCTGACCAAATAGCATGGCGGATCAGGGCTCCAATGAAAGCTCCAGTTCTGGCAATATTTCAGCCGAGTTTTCG GATTCAACTCTTCAGCTCAATATCAAGACCCTTGATTCCCGCATCTGTAGTTTTCAAGTGGACAGAAATGTGATCTATAATCTCCTTTCCTGCTGTTCTA ATGTTTTCAAGTCCTTTTTGTGATAGTATCTGTAAACTAGAGTATAACTAAAACTGTTCTTCCAAATTATTCCAGATGTCTGTTTCATCATTCAAAGAGA AAATTGCCAATGAAACAGGTGTTGCAACGAGCCGGCAACGGCTGATATTTAGAGGAAAAGTATTAAAGGATGAGCACCTTCTTCCTGAGTATCATCTCGA AAATGGAGATACATTGCATTTAGTTGAAAGGCAACCAAATCCATCACAGGTTTCCGGTATGAGTTCTGCTGAGCCAACTGTTACAAATGCTAACCAAGGG AATGATGCTGGCTCGGGGGTTCCTGGTAATCGTGTTGGGACGATTTCACACAGTGTTGTTCTCGGGACTATTAATATGGGGGAACAAGGTGACAGCATGG TTCCTGACCTTAATGGGGTTATTGGGGCGGTCTTGAATTCTATTGGCATTGGTGGCCAGAACAGAAGTAGTGTTTCTAATGCTACACAAACTTCAGCTTC ATCAGGGAGTGAAACTGAAGGTGTGCATGCTGGAAATTGGAACCTAGCAGGAAATCAAGCACAGTCTGGACAGACATTTAATGGTCAGGCATTCCAGTCT CTTCCTCAAGTTGTTCAGATTCCTGTCCCGGCGGGGGCCATACCTATTCCTTCGCTTAATGCACCAATCCCTCATTCATTGAACACACTGTCTGAGTTTA TAAATAGCATGGAACACACACTATCACAAGATGGTCATGGGCCAAATCTGTCTTCAACTAACGCCAGAGATCAACAAGTAGAATTGCCAACCAATGCACA AGGGTTGCCTACGCTTGAAGCATTAAGCACCATTGTGCGTCGCACAGAACAATTGCTTAGTGATCATGCTGTTGCTGCTTTATCTCATATTGCAGGACGC TTGGACCGAGACGGAACTTCTTCTGATTTAAGTATAAGGGGTCAAATTCAGTCAGAATCGGTGCAAACAGGAATTGCTATGCAGCATTTAGGTGCACTTC TTCTCGAGCTTGGCCGAACAATGTTGACACTGCGTATGGGGCAGTCTTATGCAGAGTCTGCCATTAATGCTGGACCAGCAGTTTATATTTCACCATCAGG ACCGAATCCTATAATGGTGCAGCCCTTTCCACTTCAGACAAGCCCCCTCTTTAGCGGTTCTGTTCCTTCTTCAACTCCTACAACTTCTGGCGCTGTCGGT GTTGGAAGTGTTCCTAGGAACGTAAACATTCATATACATGCTGGTACCTCTCTTGCACCAATTATTTCACCAATTGGTTCTAGGCCAAATAATGGGGATG GGATAGCAGGTGAACTCCATAGTGAGCCTGCCTCTGGTGTTGGAGTTGCTAGCAGCACACAAACTGGGTTTGGTCTTTCTACTTCACAGCCACCTTCTGA TTCAACTCCATTATCATCTGTTTTAGCTGGACTCAGTTCTGGCCTTAGAGATTTTGTTGGCAATATGCAAGGAGATCACACAGTTGTGTCAGGTCAAACA GAATCAACTAGTCGAGACTTGTCTGCTGGTTCTGATTCTAGACCTGCACAGGGAAACGAACAGCGAGATACCACTGAAATGAATAGCTTCAGGGATGCTA GTCTATCCTCAGTTGGTTGTACTTCTGAAAGTGGTATACAGAAGCCCCAAACAGAGACAATCCAAACCCATAGTAGTGACGAGAGAGATGTTTCCGTTGA TAAATTTGTTTTTGATCAAGGTTGTTCAAGTGGAGAAACGATAGCAAAATCAGAAAAAGTACAAGGTGCTCCATCTGTAAGTGAAGAACGAGGTGTAATG GAAAGTGCCAAAGCTGCTCCATTAGGATTGGGTATGAGTGGTCTGCAACGTAAGAAGCGAACTCAACCTCAACCTAGTGTAAGTAAAGGTGGTGGTGATG GATCATCTGGTTCTTCTTCCAATCAAAATAGAACAAATGGTCAACGTATATTGCAAACTCTTGCCAGTCATGGATCTACTGTGACTTTGAGAAATCCCAA TGGGGGATCCCAGCAGCCCTTGCCCTCTGGTGATAGCCAGAATGATATGACCAGTTTAATGTCTCAGGTTTTGCATAGCCCTGCTATTGGTGGTTTGTTG TCAGGTGTTTCACAGCAAACAGGAGTTGACTCACCTAATGGCTTGAGGAATATGTTGGAACAGTTCACACAGAACCCACAGATGATGAACACAGTCAATC AAATTGCTGAACAGGTTGGCAGCGAGGATATTGGGAATATGTTTTCTGGAATGGAAAGTGGGCAAGGAGGTGGTATCGACTTGTCAAGGATGTTTCAACA GATGATGCCAATTGTATCTCGAGTTCTTGGTGGGGGAACTCCTCCCTCACTATTCTCTACTGCAGAACCACAGCCCCAGGCACCCTACAGAGATGATCAT CAAAGTTTACAGGTTTGTATGCAAGTGTTAATAAAGGAAAGGCCTTGGTTGTATTACTGCACTTGTTTTCTAATTTCTGTGGGTTGTTAACAAAACTAGA TTATTGTTGGCTACTTGGGCAGCAATTTAGAGTGGACATGCTGAGAAAACTTGAGCGGTATTACCATGTTGTACTTTTGTGTTTGTGACATCATGCCGTT TATTTGGTTTCTTTGTATGATTTGTGTATGTAGCATTTGCCGATACTTGATAGAAGACTAATATACTTCTACAATTTAACTTAATTGCCTTGGGGAGTGG GAATTCTAAGCCCTGCTTGGAGCATGCTCATCCCTTCTAACACCCCCGCAAGTGATATTCGGCTGCAGGCACCATATCAAAATATATCTTTTGTCCTTAG CGATGAAGTCGGGAAATAAGGGGATTATGGCGATATCGTTTAGGAAGTGACCTTTTAAAGGAGAAAGGCTAAATTCCATCTTCTCGTTGTGATCTCATTT GCCCATATGTCATGAAAGCCCTCCTTCCTTACTCCAGCTGTCCTAAACATTAAATTCTGATCATTTTGTATTTGGTTTACTGTCAAAACTTATTCCTACT TGTTTTAGATATTTATTTCATAAAAATTACATGCATAATTGCTGCCCGTTGATAAGAATCTTGAGGTAGATATTTTGTTGAAAGCTGATAAAATGAAGCA TACCTACTTGATTTTGGGATGTTACCATTTGTGTTTATACACTATGTTGTTAGATGGAACTATCAAAATGGTCCTGGAATCTGGGCCAGTCTGTATAACC CATGTTCCGAGGAGGTTTAGGCCTATGAGTTTGAACTTGAAGGCCAATTTGACTTGGCCAGATGGCTTATTTAGCATGTGGACCAACCTGTTATTTATAT TTATTTATTTTCAGCTCTTTAGTTGAATTATTAGGTCAGTTAAACGGACCGGCAGCTGTTTAAACCACTATCCATTTAGGGATTGTATAGGGTCCTTCAT TGTTGTTAGCACTTTCTTGCTTGATCCACCCTGCGTTAGGTCAGACCAGGCTGGCCTATTTTGACCCTCCATGTTGCATGGCATGTATTTTTTCTCTATT CTGTTAGCAATTTCTTATTTTCATGTATAAGTAGGATATGATTATGCCTATTGCCCTAGGTTTGGTTCATTGTTACCTTACAAAATAGCCAAACGAAAAC TTCAGCCGCTCATCAACTATACCATAGGGGGAATGACATTTGAAGTCCTTAATGGATAAAGTGATGTGCTAAAAACCAAAGGGCTACTCAATTCCTTTGT GTATTTTACACCTCTGGTCGTATATTGATTTTTTGGAAAATGGATACAAGTGATGTTCATAATATTGTGAATTGTGAAGAACTTCTAAAAAATAGCTTTC ATTTCGTAAATGAATGTAGACCACCTTAGAATCATCCATTTTTTTCTCGTAAATTGAAATGCTGAAATAGTGTTTCTCTTTTGACCATTTCCTTATCCTC TTTATATTCCAGCTCGACCTTCAACCAGCAGTACAGAGGATTGAGCACATGAGTCCACCTACAGATGTTTTCCGGGCTGTAGCTGAAAATGCGGTTCATT TATCCGGCAATGGAAGTGCTTCTAATGATCTTCTGGATGAGTTATGCAACAATGAGAGCCTTGCCAGTGAATATGTGGAGATGTTAAGAAATGATGTAAA ACAACGGTTCAAGGGACATTCGGAGCTGGACAAGTCCTAATTCCAGCATGTGTGGATATGTATTTTCTGCTTCATTACTTCTATTTTATGTCAAAACTCT TGGCCTTTCTAAAAGACCTTCCAGGAAATGAATTTGGGGGTGTCTGCCCTAACTTATTAATGGGTCTGGTTTATTTTGACAGATATCCAGATCATTATGT GAAAATTTAGTATGCACCACATACCTGAGTTCCGCACAGTTGTTTCAAATGTAAAATTGAGGTGTTTAGAAGCCTCCAGTGTCATATATGTATTATCTTT TGGGCTCAATTTGACCATCGATGCTTTTATCAAATAGTTTTGTGCCTCACATGCTGCTTTATGTGAATTAGTTTTACCGTGGTAGTTGTCTAATAGTATG TTTGGATAGAATTTGAAGGAGATAACATATTTTATTGAGGTGGACTGAAATGAAATGCCAACATTTGTTTTGGTTATTTTTAGTTCTGGGTGAGGATGTT AGATTTCTGCCTTGGGGAAGTAATTTGTATAGCGTGGTGTGATGTGGTTTGGTGGTGTTCATGGAGGCAAGCAAGTGTTATTGGCAAAGCAGAGGGTGTT TTTGGCTTTTTGCTACTATATATAAGAATTCCTCTAGTGTATTGTGTCCTTGTGTTGAAATTTTCATTTCTCTTGACGGGTGAATTTTTGTTACTTGTTT CATTTTTAATACATCCâBLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_189523; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_473376
Blastp | Large proline-rich protein BAG6 from Mus with 35.54% of identity |
---|---|
Blastx | Large proline-rich protein BAG6 from Mus with 34.06% of identity |
Eggnog | tail-anchored membrane protein insertion into ER membrane(ENOG410XS9P) |
Kegg | Link to kegg annotations (224727) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019453371.1) |
Pfam | Ubiquitin-like domain (PF14560.5) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |