Ll_transcript_473715

• Id Trinity: TRINITY_DN52053_c0_g1_i3
• Name Transcript: Ll_transcript_473715
• Sequence: TTAGAACATGGTTAAAACTAGTTTAAACTCCTTTTTGCTTTCTTCAGCTGTTTTCAATATCTTGTAGAGGTCTTTATATATTGTTTCTCATATTTCATAC TCACTCTATTCCTTCTTATAAGTCACCATCTATAAAGTTTTGGTGGTCATTTTAACAAGGCACTTTACAATTTCCGTAACATATTCATTTTATTCTCCTC TATTTGTCCTTGTTAAATGCTTTAACTATTTCTACTCTTTTGGTCATTGATTAACGAGAAAACCCAATTAGATAAATCACTAGTAATGAGATTAAATTAA CAGTTTGTTATTTTTAAGACTATTAACTATGGAGTACTCAAATATTAAATAAGGATAAAATTGTAATTTTGTTGTACTACAATATTACAATAGGACGTAT TTTTTTCCTCTTTTAGATAATTCTGGTTTTGATTACTCCTCTTTTGATATGCTAATATGCTAATTTCTTTTAAATTATAGTTGGCAAATGTTTAACTCAC TGTTCCCCCTAAGTTCTTAAAATTGTTGATATGCAGTCAAACCCAGTTCTTGAAGCATTTGGTAATGCAAAAACTGTTAGAAATAACAATTCCAGCCGTT TCGGAAAATTTGTTGAGATTCAATTTGATAAATATGGACGAATATCTGGTGCAGCCATTAGAACTTATCTGCTAGAGAAATCTCGAGTTTGCCAAATATC AGATCCCGAGCGTAACTATCACTGTTTTTACCTTCTTTGTGCTTCTCCCCCCGAGGAAAAGGAGAAATATAAGTTAGGAGATCCTAGAGCATTTCACTAC CTAAATCAATCCAGTTGCTATGAATTAGCTGGTGTTAATGCTGCTCAAGAATATCTTAGCACCAAGAGAGCCATGGATATTGTGGGAATCAGTCAGGAAG AGCAGGATGCAATTTTCAGAGTTGTAGCTGCTATTCTTCATATCGGAAACATTAAGTTTGCAAAATCAGAAGAAACAGATTCATCGGTTCTTGAAGATGA AGAGTCCAAGTTCCATCTCCAAACAACAGCAGAACTTCTAATGTGTGACCCTAATGCTTTGGAAGATGCACTTCGTAAGCGTGTGATGATTACCCCAGAA GAAATTATCATGAGAAGTCTCGATCCTGTTGGTGCTACAGTTAGTAGAGACGGTTTAGCAAAGACACTATATTCTCGTTTATTTGACTGGTTAGTCTATA AAATTAATGTCTCCATTGGGCAGGATCCTAGCTCAAAATTTCTCATTGGCGTTCTTGACATATACGGTTTTGAAAGTTTTGTTTCTAATAGTTTTGAGCA GTTTTGTATTAATTTCACAAATGAAAAGCTGCAGCAACACTTCAACCAGCATGTGTTTAAGATGGAGCAAGAACAATATACAAAAGAAGGGATTAACTGG AGCTACTTAGAATTTGTAGATAATCAAGATGTACTGGATCTTATTGAAAAGAAACCGGGTGGAATCATTGCTCTGCTTGATGAAGCTTGTATGTTTCCAA AATCAACTCATGAAACATTTTCGCAAAAGCTTTATCAGACGTTCAAAGATCACAAGCGCTTCGTCAAGCCAAAATTGGCACGCTCGGACTTCACAGTTGT TCATTATGCAGGGGAGGTCCAGTATCGGTCTGAGCTGTTTTTAGACAAAAATAAAGACTATGTTGTTCCTGAACATCAAGACATGCTAAGTGCTTCCAGA TGTTCATTTGTATCAGGCCTTTTCCTCCCACTTTCTGAGGAGACAGCCAAATCTGCCAAGTTTTCTTCTATTGGTTCTCGTTTTAAGCTACAATTACAAC AATTGATGGAAACTCTCAATCTGACAGAACCCCACTATATTAGGTGTGTGAAGCCAAATAATCTATTACAACCTGGAATATTTGAGAATGTGAATGTCAT CCAACAATTACGTTCTGGTGGTGTTCTTGAAGCAGTACGAATTAAATGTGCTGGATTTCCCACTCATAGGACTTTTCATGATTTTTTAACTCGAGTAGGA ATTCTTGCTCCGGAGGTCCTTCTAGGGAACTTCAATGAAAAAGATTCTTGTAAAATGATTTTGGAGAAGATTGGCCTATCAGGTTATCAGATAGGGGAAA CACAAATATTCCTAAGAGCTGGTCAGATGGCTGAGTTGGATGCACAGAGAGCACGCCTGCTTAACAATTCTGCAACAGTTATCCAGAAGCAGATTAAAAC TCATTTTAGTAGGAAAACTTATGTTGCATTGCGGAAATCCTCTATTTTTATGTAATCCATTTGTAGAGATCAGTCATTTCTATTTTATGTATTTTGTGAA GGATGATAGGCACATTATTAACTCTGTCTTGGTTACTTAGATGCTGAGTAACTCCGTGTTTTTTTTTAAGAATCATTGCAGGAAGATTCTGTTGATGAAT CAATAGCTTCAATGGGTCTTATGCTTGCAATTCACATTGATAACTTGGCCTTTTCATAAACCAGCATTATTGTGTTGTTTCATTTGTCTGTTCTTGAATT GCAAATTGTCAACCATATACTTAGCCTCTTTATGTTTCCTTTATATCACAATTGTGACAGCACATGAAGTAGCGCATCAATGGTTTGGAAATCTGGTAAC TATGGAATGGTGGACTCATTTATGGCTCAATGAAGGTTTTGCAACATGGGTAATTCATTCTCTTATCCTCATGGGTTTGAATTGTAACCAATTAACCTTG AACCATGATCTTTGTATCTGCTAACATGTTTCCAGATAAGTTATATGACCACTGATATCTTATTTCCGGAGTGGAATATTTGGACTCAGTTTCTTCAACA AGCTTCCGAAGGTTTACATATGGATGCACTTGAAAAATCACATCTGATCGAGGTTGTCAGGACACTCTTAGAATGTGGTGCTGATCCAGAATCCCTAGTC AAAAAAACCAGCAAGACCGAGTTCCTTCCTATACACATGGCATCTCGTCTTGGCTTACCA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_189670;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_473715

FPKM

• PAB: 0.3
• PNAB: 0.7
• PS1: 0.3
• PS2: 0.7
• PS3: 0.2
• PW1: 0.5
• PW2: 0.8
• PW3: 0.6

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_473715

• Blastp: Myosin-9 from Arabidopsis with 77.27% of identity
• Blastx: Myosin-9 from Arabidopsis with 76.86% of identity
• Eggnog: myosin heavy chain(COG5022)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G08730)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019453131.1)
• Pfam: Myosin head (motor domain) (PF00063.20)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;