Id Trinity | TRINITY_DN52072_c5_g2_i12 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_473637 |
Sequence | CTTCAAAGCCTCAAACTCAGAAATCAGAATCATCCACTTTCCCTCACACAATAAGACCATAGAAGGAGAGAATGGCTATACTTCTGAACCTTGAAGAATT AAGAAAGACAAGTTTGATTATTAATTTCACTGCAACTGAAGGAGACATCCAAAGGGATCGCATTGATCCAAGATTGTAGTCTTAAATCTCTCTTTGCCTT CACAGAATATTTTGGATCATGCTATCCCTTTGGATTCTTCCTTTGGTGGCTTCTACCACTTTTCACACAGAAACTGCATTCTCTAGCTAAAAAAGATCAC GGCATATATAGTTCCGCAAGTTGAACATGGTTGAATTCATATTTCAAATCTGAAGTACTCAAAGATATATCAGTTCTTCAGTCCCAGGTGCTTGGATCCT ACCAAGGTAAATTATTCTTGTTGAAAGTTGTATCTCGTTATTCTTTCACAACATTCAAGTTATGTTCCAGCTTCGCAAGGTGAAGTACATAAGGAAACCC TTTCGATGTTTAATTCTATTATGTAGCCTAGCTTGGAGTTTTTGTTTTGGTAGGATAGATTGTTCTACCATGAGTCCATGAGTTTTTTTTATCTCTTTAC TAAAATGTTGTTGAGTATATTATCCTTGAAGTTTGGGTCGTTGTGTTAAAAAACAAAAAACAGAAAGAAACTAGCAGCCTTTTGGTGAGAAAATAAGCTA GATTATTAAAGCTAAAGTGGTAGGTTGTATTTATGAATATGTGGTTGTTTTTCTCCTATAGCTTCTGCCTTCAACCAAAATTCATTCATATCTTTATTTC CACATTACTTTTTTTATGGATTTTCTTCACTCTGAAATTAATGTATTTATGAATATGTGTTTTTCTTAGCCGATGTCCTTTAGCTTGGGACAAGATCACC TATCCCAAACCATATCTCAATTGGTGTATCAAGTCAATCAAAATATTACATTTTGTTATTTTTTATTTATAATTTTTTTATGTTATGTGGCAAAATCTTA TTGGTTTGGGACACACCCATCGAATTCAGTACAAGTAATCCCCATCCCTACGACACACCCATTCCATAGAGATCTATATAAGTAGCAGATTCTACAGCTC CACCATACACCGACTTGAACGGAGCAGAACCGCTCCATCTCCGCCGCACGTGCACGCCGGAAAATTAAATTCCATAACTTCAGATTTTAAATAACTAAAA AATTACGCCGCGATGAGTAATTCTGAGTCGAGAGAAGATGAATCGAAAGAAGAGGATAAGGACAACGAAGCTAACAAACTCCTACAACATCAATCATCAT CATCATCGGATAATGAAGAAGAGGTTGCATATGAAAATGGAGATAAAATCACGATCGTAGATTTCGACTATGTAGACGGTGATGAAGATTCAAACGTAAC ACCTCCTTTCTCATGGAAGAAGCTATGGGTTTTTACGGGACCAGGGTTCTTAATGAGCATAGCGTTTCTGGATCCAGGGAATCTAGAAGGGGATCTCCAA GCTGGAGCGATTGCTGGTTACTCTCTGCTATGGTTGTTGATGTGGGCCACTGTTATGGGGCTTTTGATTCAGCTTCTATCAGCGAGAGTTGGCGTCGCCA CTGGTCGCCACCTTGCTGAGTTGTGTAGGGATGAGTACCCTAATTGGGCGAGGTATGTGCTTTGGTTTATGGCTGAGTTGGCCTTAATTGGTGCTGATAT TCAAGAGGTGATTGGGAGTGCAATCGCTATTCAGATTCTTAGCCATGGCGTGTTGCCGCTTTGGGCTGGAGTTTTGATTACTGCTTCTGATTGGTATTCC CTTTTTTCTCTATTTCGTTTAGTATTGTGAGTCTTGCATCGAGTAAAATAACATACTCAATGTGACACTTAAGCTACGAGGCTCTCTCATCTAATAAACT AGTCTTTTGGGTTGCACTCTCCTCGTGTGCTTAAGTCCTAACCATTGGTGCTTTCATTGAGAGTGTGTCACGGAAATGACTATCTATAGACTGAAATAAG GTATAGTAACGAATACTAATAGCTGAGTGAAACTGGCAAAAGAAAATGGGCTACTCTATCGGGTCACTGTCGATAGAGTGAAAGCCATTGTGGACGTCGA TAGAGGCTCTCCCATATAATATATTAGTTTTTTGGGTTGAGCTCTTCTCATATGCTTAAGTCCTAAAATATTGATATTATTTTATTGTAGTGATCTTGTG ATTGGTTTCAATTATACATTTATACAAAATTGAGGAAATGTTGTTTTTTTATTGTGGGAAGGAGTTTACCTAGTAGTTGAGCATGGATGATATTTTGGAA AAAATAGGACTGTGGTTCACCGGAAAAGCTGGGTTATCAGATATCACCAATATAGTGGCACTGAAATCTTAGTATAATCATGATTAGAATTACATTAGTG GAGAACTTTACTTACAATTTGAAGCTGTAGGATCAAGTGCTTATAAGTAGACTAAAAATTATCTGTTTGTGAAAGCAAGATGTTAGCGCTCTCCTACAGT CACGCAAATCCCACCTAGGCCTTGCCAAAGCAAGATGTTGGCGCTCAGTGACAAATGGAAGCAGCATTTTGGTTTGGCTTACATGATTCATAAGTAGTGT TAGAAATCGAGAAACAATTGACCATATCCATTTCTTGGTACATCAGAAGTACATACGGCTTATCTTTTTTATATGCCAACGTCAGGGGATTAAAGGAATC ATAATATAAGTGCTCATTATGGCATACTCAATCCTAAAAAATTATAATAATTATACAATTTTAACACTAACCATTACACAATTGTAACAATGAGAAGTGA GAACTCAAGCAGGCTAAGCGAAGGATTTCCTGCCCTCAAGTAATAGGGAAACTATAGGCTGTTACTACTTACTGGTCATGGGTGGATAACTGGAATTGAA TTCTGAGATTAAATTTCGTGTTGTTTGTTCATAGCTTTATGATGGAGCAGTTGGCTGATAATTGATTGTTTGTAGGTTATACACTTGCAGATGTACATAA TAGCAGTAGTTATATATGCATAACTAGCTTACATGGTTGGTTGGTTGCTAATTTGCTTTGTAGTTATTATAACTTTATAATGTTACCGATATTTTTGCTG TATCTAGATTCTCTCTACGCCCCACATTTAAGGGAAGTCATGCTAATAATTTAGTCATGTCAACGGACTTGCTCTTAAATTCATTCATATACAAATCTCA AGCTTTTCCACTAATTTTTTCTTTTTCTGACATGATATGTTAAGCTTCTTCTTATGGAATCTGTACTAGGATGAATGCTTCTACTTTGTTGTTAATTTTG GAACTTTATTATCTTTCAACACTGTGTTGTGGATTATGAACTCTTCAACTATGACAGCCACATGGCTTTAACTCACTATAACTTTGAACTTGTGAATCCC CGTATCAATGCCAGAAGTTTTGAAATCCAATGGTTCAAAAACAAATTTCATATGCTATTTTATTATGAAATTTATCAGAGTACCATGTATAAATCAACCT CTTTAAAACATTTACTGGTTTCATTTCTTTATTTCATTTTTTTAACTTTAGTTTATTGCTATGTTTTTAATTAATTGCATGGAGCCTTCCAACTGTTCTT GTTCAAATACATTTAACTATAGTTTATTGTCTCTGTTTTTGAACAGTTTTTTCTTTCTATTTCTTGAGAACTATGGAGTGAGGAAATTGGAAGCTGCTTT TGCAGTTCTCATTGCGACTATGGGTCTTTCTTTTGCTTGGATGTTTGCTGACACAAAACCTAATGGAAAAGAACTATTGATGGGTATTTTGCTGCCAAGA CTTAGCTCGAAAACAATTCGTCAAGCTGTGGGTGTTGTGGGTTGTGTCATAATGCCTCACAATGTATTCCTGCATTCTGCTTTAGTCCAGTCGAGAAAGA TTGATCCCCACAAGAAAGGCCGTGTGCAGGAGGCTATTAACTATTATTCAATTGAGTCATCGGCTGCACTTTTTGTCTCCTTCATGATTAACCTATTTGT CACAACAGTTTTTGCTAAGGGGTTTTATGGTACAAAGCAGGCAAAAAGCATAGGATTGGTGAATGCTGGGCAATATCTTGAGGAAAAGTATGGTGGAGGA CTTGTGCCCATTCTCTATATATGGGGGATTGGGTTATTAGCTGCGGGACAGAGTAGCACCATCACTGGCACATATGCTGGGCAATTCATAATGGGGGGTT TTCTCAACCTACGTTTAAAGAAATGGTTGAGAGCATTGATCACTCGAAGTTTTGCAATTGTGCCGACTATAATTGTAGCTATTGTTTTTAATACATCAGA ATCCTCATTGGACATTTTAAATGAATGGCTTAATGTGCTTCAGTCCATGCAAATTCCTTTTGCCTTGATTCCCCTCCTCACCATGGTCTCGAATGAGCAG ATCATGGGGACCTTTAGGATTGGACCTGTTCTTGAGAGGGTAGCATGGACTGTTGCTGCACTGATAATGGTAATTAATGGGTATCTGTTGTTCGATTTCG TCATTTCTGAGGTGAAGGGCCTGCTGTTTGGTTTTGTAGTCTGCTCCTGCACAGCTGCCTATGTTGCATTCATCATATATTTGGTTTCACGGAGCGGCGC TCTTCCTTCCTCTTGGGTTAATCGACTTCCTAAGGGATTCTCTCTTACTAAAAATTAACTCAAACAAATTCACACATTAGAATCTGGAAACAGAACTCTG CAAACTCCGCCAGCCATTTTTTACATGAGAAGTTTTGCTTCATAGACATGAAGAAAGTTTAACGAACATTCACCAACCTTGCAACCTGCATTAAAGGAAG CACAAGGTCAGATGGTGGAAAATATGTGTATTTAACTGGACTTCATTTTTGCAATAGTTACAGGTTACCTTCCATGTGTAAAAAATGGAAATAATTTCCT TTAGTGGAAGATGTGGAGAGAGCATTGTGAACTTGCAAGGATGAATTACTTTCCTGCATGCTTTATTCTTTTTCTAACAAGGTGTGAACTGTGAAGTGCT CCATTATTCTTTGATTAAACAGTTTGTATTTAACATGGTACTTTCATCAAGTGACCTGGAGTAGGTTTTGCCCGCTGAAGGTGGCTGTGTATTTGTGTAA GACAACAGAGATTAGTTGTAGGGTTTAAATCTGGACAAGGATCCGCTGTCCCAAATCCTGTAAATCTTATCCCAAAGTCTGTACCAAACCAACAACAACA TGCAACGTCAGTAAAAAAAGTTAAACATTCATATTTTTATTTATTTTTTCTTCATTCTAATTGACTTGGTACATGGTTGGGGACATGCTTTGGGACAATT GATCCTCATCC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_189835; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_473637
Blastp | Metal transporter Nramp2 from Arabidopsis with 82.7% of identity |
---|---|
Blastx | Metal transporter Nramp2 from Arabidopsis with 83.12% of identity |
Eggnog | H( )-stimulated, divalent metal cation uptake system (By similarity)(COG1914) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G47240) |
CantataDB | - |
Mirbase | tcc-MIR393a (MI0017505) |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019417585.1) |
Pfam | Natural resistance-associated macrophage protein (PF01566.17) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |