Ll_transcript_473622

• Id Trinity: TRINITY_DN52072_c5_g2_i6
• Name Transcript: Ll_transcript_473622
• Sequence: CTTCAAAGCCTCAAACTCAGAAATCAGAATCATCCACTTTCCCTCACACAATAAGACCATAGAAGGAGAGAATGGCTATACTTCTGAACCTTGAAGAATT AAGAAAGACAAGTTTGATTATTAATTTCACTGCAACTGAAGGAGACATCCAAAGGGATCGCATTGATCCAAGATTGTAGTCTTAAATCTCTCTTTGCCTT CACAGAATATTTTGGATCATGCTATCCCTTTGGATTCTTCCTTTGGTGGCTTCTACCACTTTTCACACAGAAACTGCATTCTCTAGCTAAAAAAGATCAC GGCATATATAGTTCCGCAAGTTGAACATGGTTGAATTCATATTTCAAATCTGAAGTACTCAAAGATATATCAGTTCTTCAGTCCCAGGTGCTTGGATCCT ACCAAGGTAAATTATTCTTGTTGAAAGTTGTATCTCGTTATTCTTTCACAACATTCAAGTTATGTTCCAGCTTCGCAAGGTGAAGTACATAAGGAAACCC TTTCGATGTTTAATTCTATTATGTAGCCTAGCTTGGAGTTTTTGTTTTGGTAGGATAGATTGTTCTACCATGAGTCCATGAGTTTTTTTTATCTCTTTAC TAAAATGTTGTTGAGTATATTATCCTTGAAGTTTGGGTCGTTGTGTTAAAAAACAAAAAACAGAAAGAAACTAGCAGCCTTTTGGTGAGAAAATAAGCTA GATTATTAAAGCTAAAGTGGTAGGTTGTATTTATGAATATGTGGTTGTTTTTCTCCTATAGCTTCTGCCTTCAACCAAAATTCATTCATATCTTTATTTC CACATTACTTTTTTTATGGATTTTCTTCACTCTGAAATTAATGTATTTATGAATATGTGTTTTTCTTAGCCGATGTCCTTTAGCTTGGGACAAGATCACC TATCCCAAACCATATCTCAATTGGTGTATCAAGTCAATCAAAATATTACATTTTGTTATTTTTTATTTATAATTTTTTTATGTTATGTGGCAAAATCTTA TTGGTTTGGGACACACCCATCGAATTCAGTACAAGTAATCCCCATCCCTACGACACACCCATTCCATAGAGATCTATATAAGTAGCAGATTCTACAGCTC CACCATACACCGACTTGAACGGAGCAGAACCGCTCCATCTCCGCCGCACGTGCACGCCGGAAAATTAAATTCCATAACTTCAGATTTTAAATAACTAAAA AATTACGCCGCGATGAGTAATTCTGAGTCGAGAGAAGATGAATCGAAAGAAGAGGATAAGGACAACGAAGCTAACAAACTCCTACAACATCAATCATCAT CATCATCGGATAATGAAGAAGAGGTTGCATATGAAAATGGAGATAAAATCACGATCGTAGATTTCGACTATGTAGACGGTGATGAAGATTCAAACGTAAC ACCTCCTTTCTCATGGAAGAAGCTATGGGTTTTTACGGGACCAGGGTTCTTAATGAGCATAGCGTTTCTGGATCCAGGGAATCTAGAAGGGGATCTCCAA GCTGGAGCGATTGCTGGTTACTCTCTGCTATGGTTGTTGATGTGGGCCACTGTTATGGGGCTTTTGATTCAGCTTCTATCAGCGAGAGTTGGCGTCGCCA CTGGTCGCCACCTTGCTGAGTTGTGTAGGGATGAGTACCCTAATTGGGCGAGGTATGTGCTTTGGTTTATGGCTGAGTTGGCCTTAATTGGTGCTGATAT TCAAGAGGTGATTGGGAGTGCAATCGCTATTCAGATTCTTAGCCATGGCGTGTTGCCGCTTTGGGCTGGAGTTTTGATTACTGCTTCTGATTGTTTTTTC TTTCTATTTCTTGAGAACTATGGAGTGAGGAAATTGGAAGCTGCTTTTGCAGTTCTCATTGCGACTATGGGTCTTTCTTTTGCTTGGATGTTTGCTGACA CAAAACCTAATGGAAAAGAACTATTGATGGGTATTTTGCTGCCAAGACTTAGCTCGAAAACAATTCGTCAAGCTGTGGGTGTTGTGGGTTGTGTCATAAT GCCTCACAATGTATTCCTGCATTCTGCTTTAGTCCAGTCGAGAAAGATTGATCCCCACAAGAAAGGCCGTGTGCAGGAGGCTATTAACTATTATTCAATT GAGTCATCGGCTGCACTTTTTGTCTCCTTCATGATTAACCTATTTGTCACAACAGTTTTTGCTAAGGGGTTTTATGGTACAAAGCAGGCAAAAAGCATAG GATTGGTGAATGCTGGGCAATATCTTGAGGAAAAGTATGGTGGAGGACTTGTGCCCATTCTCTATATATGGGGGATTGGGTTATTAGCTGCGGGACAGAG TAGCACCATCACTGGCACATATGCTGGGCAATTCATAATGGGGGGTTTTCTCAACCTACGTTTAAAGAAATGGTTGAGAGCATTGATCACTCGAAGTTTT GCAATTGTGCCGACTATAATTGTAGCTATTGTTTTTAATACATCAGAATCCTCATTGGACATTTTAAATGAATGGCTTAATGTGCTTCAGTCCATGCAAA TTCCTTTTGCCTTGATTCCCCTCCTCACCATGGTCTCGAATGAGCAGATCATGGGGACCTTTAGGATTGGACCTGTTCTTGAGGTGAGTTAATCATCTCA CTGTTCTCTCATTTCATCATTTTTTAATCATAAGATCTCTGAAGTAACTTCCTGCATGGTTTGAATTATGTTTTTCATCATATTATATTATTTGATGACA AAGAAATGGGTGGTTTAGAAAAATGAGATTGAAGTTTTCTTATGTTTAGCTTGTCTCTGCAGCTATCGAACTTTTTCTATTGTTAATTTACTTGTCCGTC TAAATTGATGTGTGGGTGTAATCTGTTAAACAAATGTCATGTTTCTTAAGATAATAACTATTGGCTATTCAATCAAGAATCTATGCATGTTTGCTCGGTA AAAGTAGGAATAGAAATGTAGTAATATAGATGCATGCAGATGAAAGTCATTAAAAGTGCTAATTCTCTGGCACAGATTGTTTTTCAGATCATTAATGTTC ACTGCAGTAGGTGAAGATGCATAAATTTCAACTTATACTGTTGCTTGATCGAGTTCATTAAGTCCTAAACTTCAAGGAGTTGTCTCATAACACTTGAGGA AAATGTTTGTTCACTTGTTGCATGTCAATTTCTGTTTAGATACCAAAATCATGCATAGATTTTTTCCTGCCTTCATTCACTCACTTCTAAATTGTATAAA TTACATTGTACTGGATCTAGGGCGACGAAGAAGTTAATTATATAAACATAATGTGGTAATATAAGGTCCACAAAATGATCTCCAGTTATTAAAGTTATCT GTTTTCTTTGTTACTAATTTTTTGTTCTATTTTTGCAGAGGGTAGCATGGACTGTTGCT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_189835;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_473622

FPKM

• PAB: 0.9
• PNAB: 0.8
• PS1: 0.7
• PS2: 1.5
• PS3: 1.8
• PW1: 0.6
• PW2: 0.8
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_473622

• Blastp: Metal transporter Nramp2 from Arabidopsis with 81.46% of identity
• Blastx: Metal transporter Nramp2 from Arabidopsis with 84.74% of identity
• Eggnog: H( )-stimulated, divalent metal cation uptake system (By similarity)(COG1914)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G47240)
• CantataDB: -
• Mirbase: tcc-MIR393a (MI0017505)
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019417585.1)
• Pfam: Natural resistance-associated macrophage protein (PF01566.17)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;