Ll_transcript_473624

Id TrinityTRINITY_DN52072_c5_g2_i7
Name TranscriptLl_transcript_473624
SequenceCTTCAAAGCCTCAAACTCAGAAATCAGAATCATCCACTTTCCCTCACACAATAAGACCATAGAAGGAGAGAATGGCTATACTTCTGAACCTTGAAGAATT AAGAAAGACAAGTTTGATTATTAATTTCACTGCAACTGAAGGAGACATCCAAAGGGATCGCATTGATCCAAGATTGTAGTCTTAAATCTCTCTTTGCCTT CACAGAATATTTTGGATCATGCTATCCCTTTGGATTCTTCCTTTGGTGGCTTCTACCACTTTTCACACAGAAACTGCATTCTCTAGCTAAAAAAGATCAC GGCATATATAGTTCCGATACAGTATAATCCAACCAGAAATTAATTTATGATTATATACAGCAAGTTGAACATGGTTGAATTCATATTTCAAATCTGAAGT ACTCAAAGATATATCAGTTCTTCAGTCCCAGGTGCTTGGATCCTACCAAGGTAAATTATTCTTGTTGAAAGTTGTATCTCGTTATTCTTTCACAACATTC AAGTTATGTTCCAGCTTCGCAAGGTGAAGTACATAAGGAAACCCTTTCGATGTTTAATTCTATTATGTAGCCTAGCTTGGAGTTTTTGTTTTGGTAGGAT AGATTGTTCTACCATGAGTCCATGAGTTTTTTTTATCTCTTTACTAAAATGTTGTTGAGTATATTATCCTTGAAGTTTGGGTCGTTGTGTTAAAAAACAA AAAACAGAAAGAAACTAGCAGCCTTTTGGTGAGAAAATAAGCTAGATTATTAAAGCTAAAGTGGTAGGTTGTATTTATGAATATGTGGTTGTTTTTCTCC TATAGCTTCTGCCTTCAACCAAAATTCATTCATATCTTTATTTCCACATTACTTTTTTTATGGATTTTCTTCACTCTGAAATTAATGTATTTATGAATAT GTGTTTTTCTTAGCCGATGTCCTTTAGCTTGGGACAAGATCACCTATCCCAAACCATATCTCAATTGGTGTATCAAGTCAATCAAAATATTACATTTTGT TATTTTTTATTTATAATTTTTTTATGTTATGTGGCAAAATCTTATTGGTTTGGGACACACCCATCGAATTCAGTACAAGTAATCCCCATCCCTACGACAC ACCCATTCCATAGAGATCTATATAAGTAGCAGATTCTACAGCTCCACCATACACCGACTTGAACGGAGCAGAACCGCTCCATCTCCGCCGCACGTGCACG CCGGAAAATTAAATTCCATAACTTCAGATTTTAAATAACTAAAAAATTACGCCGCGATGAGTAATTCTGAGTCGAGAGAAGATGAATCGAAAGAAGAGGA TAAGGACAACGAAGCTAACAAACTCCTACAACATCAATCATCATCATCATCGGATAATGAAGAAGAGGTTGCATATGAAAATGGAGATAAAATCACGATC GTAGATTTCGACTATGTAGACGGTGATGAAGATTCAAACGTAACACCTCCTTTCTCATGGAAGAAGCTATGGGTTTTTACGGGACCAGGGTTCTTAATGA GCATAGCGTTTCTGGATCCAGGGAATCTAGAAGGGGATCTCCAAGCTGGAGCGATTGCTGGTTACTCTCTGCTATGGTTGTTGATGTGGGCCACTGTTAT GGGGCTTTTGATTCAGCTTCTATCAGCGAGAGTTGGCGTCGCCACTGGTCGCCACCTTGCTGAGTTGTGTAGGGATGAGTACCCTAATTGGGCGAGGTAT GTGCTTTGGTTTATGGCTGAGTTGGCCTTAATTGGTGCTGATATTCAAGAGGTGATTGGGAGTGCAATCGCTATTCAGATTCTTAGCCATGGCGTGTTGC CGCTTTGGGCTGGAGTTTTGATTACTGCTTCTGATTGGTATTCCCTTTTTTCTCTATTTCGTTTAGTATTGTGAGTCTTGCATCGAGTAAAATAACATAC TCAATGTGACACTTAAGCTACGAGGCTCTCTCATCTAATAAACTAGTCTTTTGGGTTGCACTCTCCTCGTGTGCTTAAGTCCTAACCATTGGTGCTTTCA TTGAGAGTGTGTCACGGAAATGACTATCTATAGACTGAAATAAGGTATAGTAACGAATACTAATAGCTGAGTGAAACTGGCAAAAGAAAATGGGCTACTC TATCGGGTCACTGTCGATAGAGTGAAAGCCATTGTGGACGTCGATAGAGGCTCTCCCATATAATATATTAGTTTTTTGGGTTGAGCTCTTCTCATATGCT TAAGTCCTAAAATATTGATATTATTTTATTGTAGTGATCTTGTGATTGGTTTCAATTATACATTTATACAAAATTGAGGAAATGTTGTTTTTTTATTGTG GGAAGGAGTTTACCTAGTAGTTGAGCATGGATGATATTTTGGAAAAAATAGGACTGTGGTTCACCGGAAAAGCTGGGTTATCAGATATCACCAATATAGT GGCACTGAAATCTTAGTATAATCATGATTAGAATTACATTAGTGGAGAACTTTACTTACAATTTGAAGCTGTAGGATCAAGTGCTTATAAGTAGACTAAA AATTATCTGTTTGTGAAAGCAAGATGTTAGCGCTCTCCTACAGTCACGCAAATCCCACCTAGGCCTTGCCAAAGCAAGATGTTGGCGCTCAGTGACAAAT GGAAGCAGCATTTTGGTTTGGCTTACATGATTCATAAGTAGTGTTAGAAATCGAGAAACAATTGACCATATCCATTTCTTGGTACATCAGAAGTACATAC GGCTTATCTTTTTTATATGCCAACGTCAGGGGATTAAAGGAATCATAATATAAGTGCTCATTATGGCATACTCAATCCTAAAAAATTATAATAATTATAC AATTTTAACACTAACCATTACACAATTGTAACAATGAGAAGTGAGAACTCAAGCAGGCTAAGCGAAGGATTTCCTGCCCTCAAGTAATAGGGAAACTATA GGCTGTTACTACTTACTGGTCATGGGTGGATAACTGGAATTGAATTCTGAGATTAAATTTCGTGTTGTTTGTTCATAGCTTTATGATGGAGCAGTTGGCT GATAATTGATTGTTTGTAGGTTATACACTTGCAGATGTACATAATAGCAGTAGTTATATATGCATAACTAGCTTACATGGTTGGTTGGTTGCTAATTTGC TTTGTAGTTATTATAACTTTATAATGTTACCGATATTTTTGCTGTATCTAGATTCTCTCTACGCCCCACATTTAAGGGAAGTCATGCTAATAATTTAGTC ATGTCAACGGACTTGCTCTTAAATTCATTCATATACAAATCTCAAGCTTTTCCACTAATTTTTTCTTTTTCTGACATGATATGTTAAGCTTCTTCTTATG GAATCTGTACTAGGATGAATGCTTCTACTTTGTTGTTAATTTTGGAACTTTATTATCTTTCAACACTGTGTTGTGGATTATGAACTCTTCAACTATGACA GCCACATGGCTTTAACTCACTATAACTTTGAACTTGTGAATCCCCGTATCAATGCCAGAAGTTTTGAAATCCAATGGTTCAAAAACAAATTTCATATGCT ATTTTATTATGAAATTTATCAGAGTACCATGTATAAATCAACCTCTTTAAAACATTTACTGGTTTCATTTCTTTATTTCATTTTTTTAACTTTAGTTTAT TGCTATGTTTTTAATTAATTGCATGGAGCCTTCCAACTGTTCTTGTTCAAATACATTTAACTATAGTTTATTGTCTCTGTTTTTGAACAGTTTTTTCTTT CTATTTCTTGAGAACTATGGAGTGAGGAAATTGGAAGCTGCTTTTGCAGTTCTCATTGCGACTATGGGTCTTTCTTTTGCTTGGATGTTTGCTGACACAA AACCTAATGGAAAAGAACTATTGATGGGTATTTTGCTGCCAAGACTTAGCTCGAAAACAATTCGTCAAGCTGTGGGTGTTGTGGGTTGTGTCATAATGCC TCACAATGTATTCCTGCATTCTGCTTTAGTCCAGTCGAGAAAGATTGATCCCCACAAGAAAGGCCGTGTGCAGGAGGCTATTAACTATTATTCAATTGAG TCATCGGCTGCACTTTTTGTCTCCTTCATGATTAACCTATTTGTCACAACAGTTTTTGCTAAGGGGTTTTATGGTACAAAGCAGGCAAAAAGCATAGGAT TGGTGAATGCTGGGCAATATCTTGAGGAAAAGTATGGTGGAGGACTTGTGCCCATTCTCTATATATGGGGGATTGGGTTATTAGCTGCGGGACAGAGTAG CACCATCACTGGCACATATGCTGGGCAATTCATAATGGGGGGTTTTCTCAACCTACGTTTAAAGAAATGGTTGAGAGCATTGATCACTCGAAGTTTTGCA ATTGTGCCGACTATAATTGTAGCTATTGTTTTTAATACATCAGAATCCTCATTGGACATTTTAAATGAATGGCTTAATGTGCTTCAGTCCATGCAAATTC CTTTTGCCTTGATTCCCCTCCTCACCATGGTCTCGAATGAGCAGATCATGGGGACCTTTAGGATTGGACCTGTTCTTGAGAGGGTAGCATGGACTGTTGC TGCACTGATAATGGTAATTAATGGGTATCTGTTGTTCGATTTCGTCATTTCTGAGGTGAAGGGCCTGCTGTTTGGTTTTGTAGTCTGCTCCTGCACAGCT GCCTATGTTGCATTCATCATATATTTGGTTTCACGGAGCGGCGCTCTTCCTTCCTCTTGGGTTAATCGACTTCCTAAGGGATTCTCTCTTACTAAAAATT AACTCAAACAAATTCACACATTAGAATCTGGAAACAGAACTCTGCAAACTCCGCCAGCCATTTTTTACATGAGAAGTTTTGCTTCATAGACATGAAGAAA GTTTAACGAACATTCACCAACCTTGCAACCTGCATTAAAGGAAGCACAAGGTCAGATGGTGGAAAATATGTGTATTTAACTGGACTTCATTTTTGCAATA GTTACAGGTTACCTTCCATGTGTAAAAAATGGAAATAATTTCCTTTAGTGGAAGATGTGGAGAGAGCATTGTGAACTTGCAAGGATGAATTACTTTCCTG CATGCTTTATTCTTTTTCTAACAAGGTGTGAACTGTGAAGTGCTCCATTATTCTTTGATTAAACAGTTTGTATTTAACATGGTACTTTCATCAAGTGACC TGGAGTAGGTTTTGCCCGCTGAAGGTGGCTGTGTATTTGTGTAAGACAACAGAGATTAGTTGTAGGGTTTAAATCTGGACAAGGATCCGCTGTCCCAAAT CCTGTAAATCTTATCCCAAAGTCTGTACCAAACCAACAACAACATGCAACGTCAGTAAAAAAAGTTAAACATTCATATTTTTATTTATTTTTTCTTCATT CTAATTGACTTGGTACATGGTTGGGGACATGCTTTGGGACAATTGATCCTCATCC BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_189835; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_473624

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_473624
BlastpMetal transporter Nramp2 from Arabidopsis with 82.7% of identity
BlastxMetal transporter Nramp2 from Arabidopsis with 83.12% of identity
EggnogH( )-stimulated, divalent metal cation uptake system (By similarity)(COG1914)
KeggLink to kegg annotations (AT1G47240)
CantataDB-
Mirbasetcc-MIR393a (MI0017505)
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019417585.1)
PfamNatural resistance-associated macrophage protein (PF01566.17)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;