Ll_transcript_473462

• Id Trinity: TRINITY_DN52077_c2_g1_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_473462
• Sequence: GTATTTATTTATTTTGTTGGTATACTCTAGGACCAGATTTTAATGAGTGAAAATTTGAATTATTATAAAGATTTATTAACCATTTAAGGAAGAATATAAA TATATGATATAGTTTGTGTTCCTAAATTCTGACACGAAAGGTTATTGCAGAAACCAAATCCTTGCTCTCACCTTCTCCTCCTAGATCGATTCAGGGTATT GTATTTTCATCTGGAGACCGGTGTTGGTGAATCGCGAGAAATTGACGATGTTGGCATTTTAAGCTGATTTATAAACTTTGCCCTCTTGTTCCATTGGATT TTGAACCATGTTTAAGATGGGCAAAGGGCTGCAATAATTAAAGTCAGATGAGAATCCAGGTGACTGGTGTTTGCAGAGAGGCTGAAGTTATCAATCATGG CTTTGAGATTTATAGCGATTTCGGCAATTTCTACGGTGCTAAGCTTTGTGGGTCTGCAGTTTTGCACAGACTTCTCATTATATACAGTTAAATCAGATGG AGTTATTGGCTGGAATTTAGTGCACTCGGACAATGCCAACCAATACACCGTCACCGAGTTACCTTTGGGTTTGTACACTACCATAGGGCTACTGGCAAAT TGCACAACCAATGTATTTATCTTTCTCAATCTTTGTCTTACGGTGAGTTTGCTGTATGGAACATGAGTTACTAATATTAAGCATTCATGGATAATGATGC TATATGGTGTTTATCTGTGGTGGACCGGTGGTTCATATGTTCTGTAGTTATGGTGGATGATGTGTACAGTAACAGATCAGAATATACAAATATAATAGAA CTGTCCTCTAATCATTATTTTCACAGTTTCTCCTGTTTCACTACAAACAAGGATTGTGGGTAAGATAAGTAGATTTCAAGTAAAATGAACAGGTGCTTGA GTGCTATTTCCCTTGGTTATTTTTGGGCATGGGTGGAGATTCAATATAAGAATAAGATAACTAAGTTCATGAATTTTGTGATGGTCGATGATTATGACTT CTTTTGCTGCTTCAGAACATACTTTTTTATTGGACAGGGGTACAATAATGCTTTGCACGCTGTTCAATAAATGACACTCTTCCTACATAATTTAGATTGT GTTTTTTCCTATACCAGTTAATATTGTTCTTACTGTTTATGCACCTCATTATCATTTGCAGGCTATGTTCTTCACTGAGTTGTATTCTTCTGAGACACGT AAAATGATTGAGCGTCTCATTTATTATGTCGTTTACAAGGTTATTCTTCTGTTTCTGTAGCCTTTTAAAGTAATTATCTGATTTTTATTCTATATTATTG AATCTAGTTTTCTAGTATTATATGATTGGGAGCTACTACATTGATTAGACATTCCTTTTCTCACCTCTCCTTTTCTTCTTTTGATCAATTTTTTATTTGA TATGTTGGTTTGGCATTTGGAAATTGCTCCTAGGATTTGTGTTTAACAACTTGGAGTTGCTAAGCTAGTTCACATGGTAAATGCTTGTGTCTCAGTAGCA CTTGGCACTTCATTATTAAACCCTTATATGATAGTTGTAAGCCATGTTAATATAAGCTCTTACATTATACTGTAGCTCTCTACAGTATGTGATGCTACGA TCAGCATGTATAACTTCTCTAGTCCACTCTCTATATATGTAAAAGGAGCCAGTCAAATCTATTAGGTTAGGTGTGTACTGGCTCGATTTAGCGAAAACAT TTGTGAGCTGCTAGTTTTTTAATGTATGCATGTATATATATTGTGTAAACTTTGAAAACTTTAAATATAATTTGGGAACTGTTGGAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_189875;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_473462

FPKM

• PAB: 0.1
• PNAB: 0.1
• PS1: 0.1
• PS2: 0.4
• PS3: 0.2
• PW1: 0
• PW2: 0.2
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_473462

• Blastp: -
• Blastx: E3 ubiquitin protein ligase RIN2 from Arabidopsis with 42.05% of identity
• Eggnog: zinc ion binding(COG5243)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G25230)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019427183.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;