Id Trinity | TRINITY_DN52081_c2_g3_i20 |
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Name Transcript | Ll_transcript_474681 |
Sequence | AACATGTCAAGTTAATCAAAAAAATTAAAAATTCATATTTTTATTTATTTTTTCTTCGTTCTTATTGATTTGGTGTATGGTTAGGGACATGCTTTGGGAC AAGTTATCCTCGTCACGTTAGATGACTATAAAAGTACACTATTAATAACACTGACACACACTCTTCAGTTATTGGAAATGAGAAACACAAAGACTTTAGC ATCAGAGTCTCTCTCCACTTTTCTCTTGTTTTGTTTCTATGGCACACTAATCAATGCTAAATACATAAACTATGATACTGGTTCTAACATAGTTGAAGCA AAATTGAACATTCACCTAGTACCTCATTCTCATGATGATGTTGGTTGGTTGAAGACTATTGATCAATACTATGTTGGATCAAACAATAGTATTCAGGGGG CATGTGTTGAAAATGTGTTGGATTCATTGGTTGTTGCTCTTCATAAAGATCCAAACAGAAAGTTTGTGTTTGCTGAGATGGCATTTTTCCATAGATGGTG GGTAGAACAAAGTCCAGAAACACAAAAAGAAGTTAGAAAGCTTGTGGATGCTGGGCAACTAGAATTCATAAATGGTGGATGGTGTATGCATGATGAAGCC ACAACTCACTACATAGACATGATTGACCAAACCACTTTGGGTCATGGCTTCATCAAGGATCAGTTTAACAAAACCCCTCTTGCTGGATGGCAAATTGACC CCTTTGGACACTCTGCTGTACAAGCTTATCTACTTGGTGCCGAGCTTGGTTTTGAATCAGTTCACTTTGCGCGGATTGATTATCAGGATAGAGCTAAGCG CAAAGGTGATAAGTCTCTCGAAGTTGTGTGGCGCGGGTCAAGAACATTTGGTTCTTCAGCTCAGATTTTTGCCAATGCATTTCCGGTTCATTATAGTGCT CCGAGCGGTTTTAATTTTGAAGTCAATAGTAATGATCCTCCATTACAGGACAATCCTCTTCTTTTCGATTACAATGTTAAACAGCGTGTCGAGGACTTTA TCAATGCCGCTACTACCCAAGCAAATGTGACAAGGACGAACCATATAATGTTTACGATGGGCGACGATTTCCAATACCAATATGCAGAAACTTGGTTCAA GCAAATGGATAAATTAATTCACTATGTTAATAAGGATGGTAGAGTGAATGCCTTGTATTCTACTCCATCTATTTACACCAATGCAAAGAATGCTGCAAAT GTATCATGGCCACTGAAAACCGACGATTACTTTCCGTATGCGGACGGACCATTTTCGTATTGGACCGGATTTTTCACTAGTCGCCCTGCGCTTAAAGGAT ATGTTAGGTTGCTAAGTGGATACTATTTGGCAGCGCGTCAACTTGAATTTTTCGCTGGAAAGAGTTCAACTATATCTCATACTCTTGAACTAGGCGATGC TCTAGGAATTGCGCAGCACCACGATGCTGTCTCTGGCACTGCCAAACAGCATACAACAGACGACTACGCCAAACGACTCGCTATTGGAGCCTCTAAGGCT AAAGCAGTAGTTAGTTCTTCTTTGGCTTGTCTTTCTAGTAAGCAATCCAGTAATCAATGTTCAGCACCTGCATCAGCATTTGCTCAGTGCCAATTACTGA ACATAAGTTACTGTCCTCCAACAGAAGAAAATATTCCAGAAACCAAAAGTTTGGTAGTAGTGGTTTATAACCCACTAGGATGGAACCGTACTGATATTGT CAGAATACCAGTTAATGATGTGAATCTTGTTGTCAAAGATTCTTCTGGAAATAACATTGAAGCACAATATGTTGATATTGATGAAGTTACAACAAATTTA AGAAAATTGTATGTGAAGGCCTACTTGGGTTTGTCACCAAAACAAGCCCCCAAATATTGGCTTCTGTTTCAGGTCTCAGTACCTCCACTTGGATGGAGTA CTTTCTTCATATCTCAACCAATTGGAAATGGAAAAGGTAGAAATGGATCTATCTCGCTCGGCAGGGCTCGGAAAAGTGACAACATTGACATAGGACCAGG GAATCTAAAGTTGTCATTTTCTTCAACCTCGGGACAACTCAAACGGATGTATAATTCCAGAACTGGAGTTGATATACCAATTCAGCAAAGCTATCTGTGG TATGGTTCTAGTGAGGGTGATATTTCTGATTCTCAGGCTTCTGGTGCGTATATCTTTCGGCCAAATGAATCCCCTCCGACCGTTGTTCCAAGATCAGTTC CTTACGAGGTAATCCGTGGACCGCTAGTTGATGAGATTCGTCAGAAGTTTAGCTCTTGGATTTACCAGGTGACTAGGCTGTACAAAGACAAAGATCATGC TGAAATTGAGTTCACTATCGGTCCAATTCCTATTGATGATGGAGTTGGAAAAGAGGTGATCACACGATTGGCGACGAATATGGTTACAAACAAGGAGTTT TATACTGATTCTAATGGAAGAGATTTTCTGAAACGGGTTCGAGATCATAGGGAAGATTGGCCGCTGCATGTTACTCAACCGGTAGCAGGAAACTATTATC CACTTAATCTTGGAATTTATACAAAGGATAAGAATTCTGAACTCTCAGTTTTAGTTGATCGTGCCACTGGCGGAGCCAGCATCAAAGATGGTGAGCTAGA ACTTATGCTTCACAGGCGTATTCTCAATGATGATGGTAGAGGAGTCGGGGAAGAACTCGACGAGCAAGTTTGCTTGAACAGCTTTACATGTGAAGGACTA ACAGTAAGAGGAAATTATTATATAAGCATTGACAAGATTGGAGAAGGCTCGCGCTGGCGCCGTAAAACCGGTCAGGAAATTTACTCACCGATATTGTTGG CTTTTTCGCACGAGAACTTGGAGAATTGGAAGTCCTCTCATTTGACCAAGGGAACTCTTATGGATCCAAATTACAACTTGCCTCCTAATGTTGCTCTTAT AACTCTTCAGGTAGAATAAGTGAAGCACAAAAAAATGTGATAGGATTTGTACTATGTCTTTCTCTTATCCATTTTTGTCTAACTTAATTGTTTTGTAGGA GTTAGATAATGGAATTGTGCTTCTCCGTTTGGCACATCTCTATGAGGTAAATATATAATCCTATCATTATCCACTTTGAGATGAATCAATCCAAAGAAAT ACAACTAAAACTCAAAAGGATAGAGTGTACCAAGTACCATTTCCGACCCGAAGGGTAGGGCATACAGGGCGATTGTTCGGCCGATGAAAAAGCGGGAGTT CAGTTTTATTTGATGTTATACTAATTTTGTTATGCCGATGATGAGTGTTTTAAATTGCGGATGTGATTATGGCCGAGGTTGCAGTTATTGCGATTGTGAT TATTGCAATCATTATGATGCGGATTATGGTCGTGACGTTGTGAACTCTTTTAGGTTTAAAAAACGTTTTCGAGTTTGATGTAGTCCATGCAGCCCAAATA TGATATGATGTGGTTGCGTTGCACTCTGATACGGACACATTATTGTGATTCAATATCACATCACAATTGCGGGGTGATGTAGTAACAGAAGCAAACACAA CTGCATTTTGTGGCTGCATCAGATAATGCGGTTCGCAATTTGATAGACCGACACTTGTCGTTGTTGCTACTTTAATGATTGAAAGTAAACACACTAGAAA ATGTCAAGAATTGCAAATACATTCACATCTTTCTTTCATGTTTTCAATGTGGTTAGACAAATGAAGATGCTGAGTATTCAACTTTAGCCAAAGTTGAACT AAAAAAGCTGTTTGCCACAAAAACTGTAAGCTTTTTCTCACCTCTCCTCTCCACATACTGGCTTGTCTTCATTCTTCACATAGCTACATATTTTAACATA ATTTGGATTAAATTAAGAGTGTAATATATGTGCAAAGATTTATATACAGTCAGAACATTGTCCATCATTCACTGGTATTATTTTTTGAAGAGTCAATGAG GATTGAAAATGATTCGTGGAAGATAGATTGACGGTGTATAAAACTTTTACATTGTGCATACGTCTTTTTTTCTTAGATTAACGTGAGAAACTGATGTGCA ATGTTTTAAATTGTGGTTGCGATCACGATTATGGTTACTATAATTGCAGTCATGCGGATTGCAGCTATTGCGGTGTGAAATATTTTGTGAAATGGTCTAA TGCAAACTGATGCAGTCTAATGCAATTGCATCATTGTGTATAAAAATGCGGACCGCATCACGCGATGTAGCCGCATTATTGCGGTGCATCACATCGCAAT TGCGGTGTGATACCGAATCACATTAACGTGACCACGACAGAACACATCGATGTCAAAAATATATTTTAATCACAAAGTAATCCACACCGCAGCGGTCGCA ATCCGCATCGCAACGGCCGCAATCGCAGTAACCACAACAGTTACCGCAACCGCAATTTAAAACACTGGTGGTCACTATTTTGTTCTTTCATGCAGATAAA TGAGTTGAAAGAAGTGAATTTATCAGCTAACCAACACAAATCAGAAATCAAAAAAATGGTATGGAAGGTTGAAGGGGACAAAGGGCAAGAATCTGAAGTA GTTAGGGGTGGCCCAGTTACTAGTCCTGATTATGTTGTTGAGCTTGGTCCTATGGAAATACGCACATTCCACTTAAAATTTCTCAAATGATTGCAGTCTT TTATTTATGCTAATCCCTTTTGGATAATAATGTAAACGGATACTGTGAAAGTCGAGCCGGACTTCAAACTGGAAGAGGTTTCGTATTAGGTTCAAGCGGT TAAACCGTCTGGTCTGACCGGATGATTTAATACATAATTAATAGTTTTTATCTATAAATATATAATTATATAAATGTAAAATTTTATATAATAATTATAT TGAATTATTATCTTTTAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_189895; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_474681
Blastp | Alpha-mannosidase from Canavalia with 75% of identity |
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Blastx | Alpha-mannosidase from Canavalia with 75% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_003548841.1) |
Pfam | Glycosyl hydrolases family 38 N-terminal domain (PF01074.21) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |