Id Trinity | TRINITY_DN52081_c2_g3_i4 |
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Name Transcript | Ll_transcript_474656 |
Sequence | AACATGTCAAGTTAATCAAAAAAATTAAAAATTCATATTTTTATTTATTTTTTCTTCGTTCTTATTGATTTGGTGTATGGTTAGGGACATGCTTTGGGAC AAGTTATCCTCGTCACGTTAGATGACTATAAAAGTACACTATTAATAACACTGACACACACTCTTCAGTTATTGGAAATGAGAAACACAAAGACTTTAGC ATCAGAGTCTCTCTCCACTTTTCTCTTGTTTTGTTTCTATGGCACACTAATCAATGCTAAATACATAAACTATGATACTGGTTCTAACATAGTTGAAGCA AAATTGAACATTCACCTAGTACCTCATTCTCATGATGATGTTGGTTGGTTGAAGACTATTGATCAATACTATGTTGGATCAAACAATAGTATTCAGGGGG CATGTGTTGAAAATGTGTTGGATTCATTGGTTGTTGCTCTTCATAAAGATCCAAACAGAAAGTTTGTGTTTGCTGAGATGGCATTTTTCCATAGATGGTG GGTAGAACAAAGTCCAGAAACACAAAAAGAAGTTAGAAAGCTTGTGGATGCTGGGCAACTAGAATTCATAAATGGTGGATGGTGTATGCATGATGAAGCC ACAACTCACTACATAGACATGATTGACCAAACCACTTTGGGTCATGGCTTCATCAAGGATCAGTTTAACAAAACCCCTCTTGCTGGATGGCAAATTGACC CCTTTGGACACTCTGCTGTACAAGCTTATCTACTTGGTGCCGAGCTTGGTTTTGAATCAGTTCACTTTGCGCGGATTGATTATCAGGATAGAGCTAAGCG CAAAGGTGATAAGTCTCTCGAAGTTGTGTGGCGCGGGTCAAGAACATTTGGTTCTTCAGCTCAGATTTTTGCCAATGCATTTCCGGTTCATTATAGTGCT CCGAGCGGTTTTAATTTTGAAGTCAATAGTAATGATCCTCCATTACAGGACAATCCTCTTCTTTTCGATTACAATGTTAAACAGCGTGTCGAGGACTTTA TCAATGCCGCTACTACCCAAGCAAATGTGACAAGGACGAACCATATAATGTTTACGATGGGCGACGATTTCCAATACCAATATGCAGAAACTTGGTTCAA GCAAATGGATAAATTAATTCACTATGTTAATAAGGATGGTAGAGTGAATGCCTTGTATTCTACTCCATCTATTTACACCAATGCAAAGAATGCTGCAAAT GTATCATGGCCACTGAAAACCGACGATTACTTTCCGTAACGATCAGATATTCTTATGCTACCAAAGTACCTTATGATGTATTAAGTATTAACCACTTGTG CTGCATACTATTTCTTTTAGGTATGCGGACGGACCATTTTCGTATTGGACCGGATTTTTCACTAGTCGCCCTGCGCTTAAAGGATATGTTAGGTTGCTAA GTGGATACTATTTGGCAGCGCGTCAACTTGAATTTTTCGCTGGAAAGAGTTCAACTATATCTCATACTCTTGAACTAGGCGATGCTCTAGGAATTGCGCA GCACCACGATGCTGTCTCTGGCACTGCCAAACAGCATACAACAGACGACTACGCCAAACGACTCGCTATTGGAGCCTCTAAGGCTAAAGCAGTAGTTAGT TCTTCTTTGGCTTGTCTTTCTAGTAAGCAATCCAGTAATCAATGTTCAGCACCTGCATCAGCATTTGCTCAGTGCCAATTACTGAACATAAGTTACTGTC CTCCAACAGAAGAAAATATTCCAGAAACCAAAAGTTTGGTAGTAGTGGTTTATAACCCACTAGGATGGAACCGTACTGATATTGTCAGAATACCAGTTAA TGATGTGAATCTTGTTGTCAAAGATTCTTCTGGAAATAACATTGAAGCACAATATGTTGATATTGATGAAGTTACAACAAATTTAAGAAAATTGTATGTG AAGGCCTACTTGGGTTTGTCACCAAAACAAGCCCCCAAATATTGGCTTCTGTTTCAGGTCTCAGTACCTCCACTTGGATGGAGTACTTTCTTCATATCTC AACCAATTGGAAATGGAAAAGGTAGAAATGGATCTATCTCGCTCGGCAGGGCTCGGAAAAGTGACAACATTGACATAGGACCAGGGAATCTAAAGTTGTC ATTTTCTTCAACCTCGGGACAACTCAAACGGATGTATAATTCCAGAACTGGAGTTGATATACCAATTCAGCAAAGCTATCTGTGGTATGGTTCTAGTGAG GGTGATATTTCTGATTCTCAGGCTTCTGGTGCGTATATCTTTCGGCCAAATGAATCCCCTCCGACCGTTGTTCCAAGATCAGTTCCTTACGAGGTAATCC GTGGACCGCTAGTTGATGAGATTCGTCAGAAGTTTAGCTCTTGGATTTACCAGGTGACTAGGCTGTACAAAGACAAAGATCATGCTGAAATTGAGTTCAC TATCGGTCCAATTCCTATTGATGATGGAGTTGGAAAAGAGGTGATCACACGATTGGCGACGAATATGGTTACAAACAAGGAGTTTTATACTGATTCTAAT GGAAGAGATTTTCTGAAACGGGTTCGAGATCATAGGGAAGATTGGCCGCTGCATGTTACTCAACCGGTAGCAGGAAACTATTATCCACTTAATCTTGGAA TTTATACAAAGGATAAGAATTCTGAACTCTCAGTTTTAGTTGATCGTGCCACTGGCGGAGCCAGCATCAAAGATGGTGAGCTAGAACTTATGCTTCACAG GCGTATTCTCAATGATGATGGTAGAGGAGTCGGGGAAGAACTCGACGAGCAAGTTTGCTTGAACAGCTTTACATGTGAAGGACTAACAGTAAGAGGAAAT TATTATATAAGCATTGACAAGATTGGAGAAGGCTCGCGCTGGCGCCGTAAAACCGGTCAGGAAATTTACTCACCGATATTGTTGGCTTTTTCGCACGAGA ACTTGGAGAATTGGAAGTCCTCTCATTTGACCAAGGGAACTCTTATGGATCCAAATTACAACTTGCCTCCTAATGTTGCTCTTATAACTCTTCAGGAGTT AGATAATGGAATTGTGCTTCTCCGTTTGGCACATCTCTATGAGGTAAATATATAATCCTATCATTATCCACTTTGAGATGAATCAATCCAAAGAAATACA ACTAAAACTCAAAAGGATAGAGTGTACCAAGTACCATTTCCGACCCGAAGGGTAGGGCATACAGGGCGATTGTTCGGCCGATGAAAAAGCGGGAGTTCAG TTTTATTTGATGTTATACTAATTTTGTTATGCCGATGATGAGTGTTTTAAATTGCGGATGTGATTATGGCCGAGGTTGCAGTTATTGCGATTGTGATTAT TGCAATCATTATGATGCGGATTATGGTCGTGACGTTGTGAACTCTTTTAGGTTTAAAAAACGTTTTCGAGTTTGATGTAGTCCATGCAGCCCAAATATGA TATGATGTGGTTGCGTTGCACTCTGATACGGACACATTATTGTGATTCAATATCACATCACAATTGCGGGGTGATGTAGTAACAGAAGCAAACACAACTG CATTTTGTGGCTGCATCAGATAATGCGGTTCGCAATTTGATAGACCGACACTTGTCGTTGTTGCTACTTTAATGATTGAAAGTAAACACACTAGAAAATG TCAAGAATTGCAAATACATTCACATCTTTCTTTCATGTTTTCAATGTGGTTAGACAAATGAAGATGCTGAGTATTCAACTTTAGCCAAAGTTGAACTAAA AAAGCTGTTTGCCACAAAAACTGTAAGCTTTTTCTCACCTCTCCTCTCCACATACTGGCTTGTCTTCATTCTTCACATAGCTACATATTTTAACATAATT TGGATTAAATTAAGAGTGTAATATATGTGCAAAGATTTATATACAGTCAGAACATTGTCCATCATTCACTGGTATTATTTTTTGAAGAGTCAATGAGGAT TGAAAATGATTCGTGGAAGATAGATTGACGGTGTATAAAACTTTTACATTGTGCATACGTCTTTTTTTCTTAGATTAACGTGAGAAACTGATGTGCAATG TTTTAAATTGTGGTTGCGATCACGATTATGGTTACTATAATTGCAGTCATGCGGATTGCAGCTATTGCGGTGTGAAATATTTTGTGAAATGGTCTAATGC AAACTGATGCAGTCTAATGCAATTGCATCATTGTGTATAAAAATGCGGACCGCATCACGCGATGTAGCCGCATTATTGCGGTGCATCACATCGCAATTGC GGTGTGATACCGAATCACATTAACGTGACCACGACAGAACACATCGATGTCAAAAATATATTTTAATCACAAAGTAATCCACACCGCAGCGGTCGCAATC CGCATCGCAACGGCCGCAATCGCAGTAACCACAACAGTTACCGCAACCGCAATTTAAAACACTGGTGGTCACTATTTTGTTCTTTCATGCAGATAAATGA GTTGAAAGAAGTGAATTTATCAGCTAACCAACACAAATCAGAAATCAAAAAAATGGTATGGAAGGTTGAAGGGGACAAAGGGCAAGAATCTGAAGTAGTT AGGGGTGGCCCAGTTACTAGTCCTGATTATGTTGTTGAGCTTGGTCCTATGGAAATACGCACATTCCACTTAAAATTTCTCAAATGATTGCAGTCTTTTA TTTATGCTAATCCCTTTTGGATAATAATGTAAACGGATACTGTGAAAGTCGAGCCGGACTTCAAACTGGAAGAGGTTTCGTATTAGGTTCAAGCGGTTAA ACCGTCTGGTCTGACCGGATGATTTAATACATAATTAATAGTTTTTATCTATAAATATATAATTATATAAATGTAAAATTTTATATAATAATTATATTGA ATTATTATCTTTTAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_189895; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_474656
Blastp | Alpha-mannosidase from Canavalia with 78.09% of identity |
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Blastx | Alpha-mannosidase from Canavalia with 73.53% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_003520192.1) |
Pfam | Glycosyl hydrolases family 38 N-terminal domain (PF01074.21) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |