Ll_transcript_430452

• Id Trinity: TRINITY_DN52111_c1_g2_i15
• Name Transcript: Ll_transcript_430452
• Sequence: TGATGGCAAAGCCAGTGGGGTAGATCTAGTTGGAGGGTACTATGATGCAGGGGACAATGTTAAATTTGGGTTACCCATGGCATTTACGGTTACAATGATG TCATGGAGCATCATAGAATATGGGAAACAAATGGCTTCAAGTGGTGAACTTAGTAATGCTATTGCAGCAGTTAAATGGGGTACTGACTATTTCATCAAAG CTCATCCTCAACCTGATGTTCTCTATGGAGAGGTGGGAGATGGTAACACTGACCATTACTGTTGGCAAAGGCCAGAGGATATGACCACTGACCGTCATGC TTATAAGATCGATACGAGTAATCCCGGGTCGGATCTCGCCGGAGAAACCGCCGCCGCTATGGCAGCTGCCTCCATTGTTTTCCGTCATTCTAACCCTTCC TATTCTGCTGAGCTCCTCCGCCATGCCTACCAGGTAATTTTGACATCGCTCTTACCGTCTTTTTCTATGGTTTTTTAATTTATTATTACTCCACAGGTTA CAATTTTTTTCCGTAGTTTTAAGTTTCTGGCGTTTTAGAATTCCAATAAATAATTATACATTATTTTTCAATTACATTCTTATTATTTTTAGATTTTTAT ATCATGTGGTTTTTTATACTACAGATATGAAATTAAACACAAGGTTTAAAAGACATAGAAGGGTGGTTGACCTAATTAAATTTCTTAAACAAACGACGGT TCAGTTATGTGATAATGCAATGTGAAAAAGGTTAAAAATTAAAACAGTGAAGCGCGTGGTCCTCACCTCGCTGATTGTGATTTAATCGTGAGCGGCTCGG GAAGTAAAACAGTTGGAGGGAGTAAATGAAACGACACTACAACTCATTTGCAGTAATATTTTGATTGGATATACAAATGTAAACCCCTTGAGAACAATAA ATAAACACAACTTTCTAAAGCAAATTGATAATTTTGCTGCAGATAAAATAAGTGATAGTTTAGATGAGAGTATGATTAACAAAGATTAGTAATATTTTTC CATATCACAACTTTGATTGTAGTGAGATGGTGTTGCTAAAGCTTGCTCACCTCAAAAACGAACCCGACACAGGAGATAATGTCTCAATAATTTTGGGACC CATGAAAATACACTTTCTAATTTCCTAGGCTAACTTTTTTGTTCTTTTACTTTATGCTCCTTTGTGAGTTAAAACAAAGGAAATTGAAAGAATTTGAGAG TAATTTTAAAAATGTATCTCATGATTTTCAAATATTTTTTTTTTCTTTCATAAAGATCTGGTGAATGTGTTGTGAGTTGATTTTGGAGCAGAAAAAAAGA AGCTTAGTAACCATAAAATAAAGTTGTTATATAATTGTAAACTTTTTTTTTCAACATAAAACTCTTTGTTTCCCTTTTCTAATAATAGCTAAACAAGTGT GAAACTGAAAATATTGTTTTTATCCTTTCATATTATTTTTCTCACTAGTAACTAGTATAATAGTATGATAAAGATTGTGGTCCAAGGATAAATTTGGTTT GTTCTTTTAAATGTGAAGACGGACCAAAAAGTAAAGCTACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATGGGTTGTGAAGTGTCAGTTTTGCCCTTTATCACTAAC AGATCCTTTTTGACCGTACAAATAGATCTTTATGAGGTACCAGCTCCTAACCGTCCCCTTGAAGGGATTCACAAAGGCCAAAAACAAATTTCGTTATTTG CCAAAATGGATTTGTATTGGACTAGTAGAATATGAGAGGATTTAGTTTTTAAAAAAGTTTAATTTGAAAAACAATAAAATCTGGACGACTGCAATTTTGT TTTGCCGTTAAACCATGTCATGTGGCTATGCTGTCGGTGCTATCCCTCACTGTTTTTTCCTTTTCTGGCCCAAGAAAGTACACTCTTCGTTGGTGTGGTT GGCTTCTGGCTCGCAATTTAATGTCTAAATTTTAATAATTACTAAATTATTAACTAAAAAACTATACCATACATTATTGGAATATATTTAATAATTGATT ATATAAATTATTTAATATTTATAACAGAGAGATTCCATAAATGTTAATTTAAGAAGCTTCAAGTTACTTCCTAGTTGCTTTAGACCTGCTTTTCCGCTAT CATAGATACCTCTTACTTTACTTTTTGACTTGCCTCCTGATTCTATTCTCGTTTCTGTCACTATTCCTATTAGGTGAAGAACATGTTGCATTTAATTGAT CATTTATTATTGTTGGACATTATGGGTCATCCTTGTTCTGAGTCTGAGACTGATTCCTCCCATATGGGGCAACGTAGTTGCATCTAATAAATGAGCGGAT CAGAAGGATCTCAACCATTCAAATTAGATTTTGGATGCAGAGGTGGTCATACAGGCCAAATAAATGAGCATACCAAATGGGTTCATTCAATAAATGCTTT ATGGTCTAATATAATATTAGAAAAATGGTTATCGTATGTAAAAGTTTTGTACACCGTCAACATATCTGAACATTGACTCTAGGATAATACTAATATACAT ATATGTTGGTCGTGTAAAAACTTTATATTGTTAATAAAAAGATATTTAAGTCATCCTATTAAACTAATATGGTGAATGAAATTAATGGTAGTCCATTCTA TTTTTCACCTGGACCTGCTCATCTGATTTTCAATTGTTTTTATCAAATTTCAGTTATTTGATTTTGCGGATAAATACAGAGGCAAATATGACAGCAGCAT CACTGTTGCCCAGAAGTATTATAAATCCATTAGTGGCTACAATGATGAGTTGCTATGGGCTGCTGCATGGTTATATCAAGCATCTAACAATCAGTATTAC CTAGATTACCTTGGTGCAAATGGTGACTCCATGGGTGGAACTGGTTGGGGCATGACTGAATTTGGTTGGGATGTTAAGTATGCTGGGGTTCAAACCTTAG TAGCCAAGTTCCTTATGCAAGGGAAGGCTGGTCATCATGCAGCAGTGTTTGAGAAATATCAGCAGAAGGCTGAGTATTTTATGTGTTCCTGTCTTGGTAA GGCTTCTAACAATGTCCGGAAGACTCCCGGTGGCCTCATATTCCGCCAGAGATGGAACAATATGCAGTTTGTCACAAGTGCTTCTTTCTTGGCCACTGTT TACTCTGACTATCTTTCCTCCTCTGGCAATAGCCTGAGATGTAATTCAGGCATTGTCCCTCCAGCTGAGCTTCTCTCCCTTGCAAAGTCTCAGGTTGATT ACATTCTTGGTGACAACCCAAGAGCCACAAGTTACATGGTGGGATATGGAAACAACTTCCCGCAAAGAGTTCACCATAGAGGTTCATCCATTGTGTCTAT TAAGGTTAACCCTTCATTTGTCAGCTGCCGTGGAGGTTATGCTACTTGGTTCAGCAGCAAAGGCAGCGACCCCAATCTACTTACAGGTGCTACTGTTGGT GGACCTGATGCATATGACAACTTCGTCGATGAAAGAGATAATTATGAGCAAACAGAGCCAGCAACCTACAACAATGCTCCTCTTATTGGTATTCTAGCAC GCCTAAATGCCGGTCATGGCGGCTACAATCAGCTCCTTCCAGGTATTGTCATCATTGTCCTCGCTTTTGGCCCCTCTCATAAATAGTAGCGATGTCAAAT ATCTTCTAGCCAATATCTGGTTATCACTAACCATGTTTAATTTATTCCTTGCAGTTGTTGTTCCAGCTCCTAAGCCTGTTTTCACCAAGACTCAACCATC CCCAAAACCAAAGATATCTCCATCTCCAGGTACTCTTTGAGTCTTTGGCTTAATTTAATTACCTGAGAAATACTTCAACTTCAACCTAATGTGAAATGTT GAGCTGAGATTAAAATCTAACATTGGAATTTGTTTTCTCAGCTTCATGGTCAGGTCCAATTTCCGTCGAACAAAAATCGACCAACTCATGGGTTTACAAA GGAAGAACTTATTACAGATACTC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_190145;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_430452

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.7
• PS1: 0.2
• PS2: 0.5
• PS3: 0.5
• PW1: 0.4
• PW2: 0.2
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_430452

• Blastp: Endoglucanase 6 from Arabidopsis with 82.43% of identity
• Blastx: Endoglucanase 6 from Arabidopsis with 82.95% of identity
• Eggnog: hydrolase family(ENOG410XPC9)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G64390)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0000588)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019446516.1)
• Pfam: Glycosyl hydrolase family 9 (PF00759.18)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;