Id Trinity | TRINITY_DN52111_c1_g2_i4 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_430429 |
Sequence | TGATGGCAAAGCCAGTGGGGTAGATCTAGTTGGAGGGTACTATGATGCAGGGGACAATGTTAAATTTGGGTTACCCATGGCATTTACGGTTACAATGATG TCATGGAGCATCATAGAATATGGGAAACAAATGGCTTCAAGTGGTGAACTTAGTAATGCTATTGCAGCAGTTAAATGGGGTACTGACTATTTCATCAAAG CTCATCCTCAACCTGATGTTCTCTATGGAGAGGTGGGAGATGGTAACACTGACCATTACTGTTGGCAAAGGCCAGAGGATATGACCACTGACCGTCATGC TTATAAGATCGATACGAGTAATCCCGGGTCGGATCTCGCCGGAGAAACCGCCGCCGCTATGGCAGCTGCCTCCATTGTTTTCCGTCATTCTAACCCTTCC TATTCTGCTGAGCTCCTCCGCCATGCCTACCAGGTAATTTTGACATCGCTCTTACCGTCTTTTTCTATGGTTTTTTAATTTATTATTACTCCACAGGTTA CAATTTTTTTCCGTAGTTTTAAGTTTCTGGCGTTTTAGAATTCCAATAAATAATTATACATTATTTTTCAATTACATTCTTATTATTTTTAGATTTTTAT ATCATGTGGTTTTTTATACTACAGATATGAAATTAAACACAAGGTTTAAAAGACATAGAAGGGTGGTTGACCTAATTAAATTTCTTAAACAAACGACGGT TCAGTTATGTGATAATGCAATGTGAAAAAGGTTAAAAATTAAAACAGTGAAGCGCGTGGTCCTCACCTCGCTGATTGTGATTTAATCGTGAGCGGCTCGG GAAGTAAAACAGTTGGAGGGAGTAAATGAAACGACACTACAACTCATTTGCAGTAATATTTTGATTGGATATACAAATGTAAACCCCTTGAGAACAATAA ATAAACACAACTTTCTAAAGCAAATTGATAATTTTGCTGCAGATAAAATAAGTGATAGTTTAGATGAGAGTATGATTAACAAAGATTAGTAATATTTTTC CATATCACAACTTTGATTGTAGTGAGATGGTGTTGCTAAAGCTTGCTCACCTCAAAAACGAACCCGACACAGGAGATAATGTCTCAATAATTTTGGGACC CATGAAAATACACTTTCTAATTTCCTAGGCTAACTTTTTTGTTCTTTTACTTTATGCTCCTTTGTGAGTTAAAACAAAGGAAATTGAAAGAATTTGAGAG TAATTTTAAAAATGTATCTCATGATTTTCAAATATTTTTTTTTTCTTTCATAAAGATCTGGTGAATGTGTTGTGAGTTGATTTTGGAGCAGAAAAAAAGA AGCTTAGTAACCATAAAATAAAGTTGTTATATAATTGTAAACTTTTTTTTTCAACATAAAACTCTTTGTTTCCCTTTTCTAATAATAGCTAAACAAGTGT GAAACTGAAAATATTGTTTTTATCCTTTCATATTATTTTTCTCACTAGTAACTAGTATAATAGTATGATAAAGATTGTGGTCCAAGGATAAATTTGGTTT GTTCTTTTAAATGTGAAGACGGACCAAAAAGTAAAGCTACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATGGGTTGTGAAGTGTCAGTTTTGCCCTTTATCACTAAC AGATCCTTTTTGACCGTACAAATAGATCTTTATGAGGTACCAGCTCCTAACCGTCCCCTTGAAGGGATTCACAAAGGCCAAAAACAAATTTCGTTATTTG CCAAAATGGATTTGTATTGGACTAGTAGAATATGAGAGGATTTAGTTTTTAAAAAAGTTTAATTTGAAAAACAATAAAATCTGGACGACTGCAATTTTGT TTTGCCGTTAAACCATGTCATGTGGCTATGCTGTCGGTGCTATCCCTCACTGTTTTTTCCTTTTCTGGCCCAAGAAAGTACACTCTTCGTTGGTGTGGTT GGCTTCTGGCTCGCAATTTAATGTCTAAATTTTAATAATTACTAAATTATTAACTAAAAAACTATACCATACATTATTGGAATATATTTAATAATTGATT ATATAAATTATTTAATATTTATAACAGAGAGATTCCATAAATGTTAATTTAAGAAGCTTCAAGTTACTTCCTAGTTGCTTTAGACCTGCTTTTCCGCTAT CATAGATACCTCTTACTTTACTTTTTGACTTGCCTCCTGATTCTATTCTCGTTTCTGTCACTATTCCTATTAGGTGAAGAACATGTTGCATTTAATTGAT CATTTATTATTGTTGGACATTATGGGTCATCCTTGTTCTGAGTCTGAGACTGATTCCTCCCATATGGGGCAACGTAGTTGCATCTAATAAATGAGCGGAT CAGAAGGATCTCAACCATTCAAATTAGATTTTGGATGCAGAGGTGGTCATACAGGCCAAATAAATGAGCATACCAAATGGGTTCATTCAATAAATGCTTT ATGGTCTAATATAATATTAGAAAAATGGTTATCGTATGTAAAAGTTTTGTACACCGTCAACATATCTGAACATTGACTCTAGGATAATACTAATATACAT ATATGTTGGTCGTGTAAAAACTTTATATTGTTAATAAAAAGATATTTAAGTCATCCTATTAAACTAATATGGTGAATGAAATTAATGGTAGTCCATTCTA TTTTTCACCTGGACCTGCTCATCTGATTTTCAATTGTTTTTATCAAATTTCAGTTATTTGATTTTGCGGATAAATACAGAGGCAAATATGACAGCAGCAT CACTGTTGCCCAGAAGTATTATAAATCCATTAGTGGCTACAATGATGAGTTGCTATGGGCTGCTGCATGGTTATATCAAGCATCTAACAATCAGTATTAC CTAGATTACCTTGGTGCAAATGGTGACTCCATGGGTGGAACTGGTTGGGGCATGACTGAATTTGGTTGGGATGTTAAGTATGCTGGGGTTCAAACCTTAG TAGCCAAGTTCCTTATGCAAGGGAAGGCTGGTCATCATGCAGCAGTGTTTGAGAAATATCAGCAGAAGGCTGAGTATTTTATGTGTTCCTGTCTTGGTAA GGCTTCTAACAATGTCCGGAAGACTCCCGGTGGCCTCATATTCCGCCAGAGATGGAACAATATGCAGTTTGTCACAAGTGCTTCTTTCTTGGCCACTGTT TACTCTGACTATCTTTCCTCCTCTGGCAATAGCCTGAGATGTAATTCAGGCATTGTCCCTCCAGCTGAGCTTCTCTCCCTTGCAAAGTCTCAGGTAATTC GATCGAGTAATCGTATTCTCTGTCGTGTACCTCTTTTATAACCGTTGATATCTCGATGGTTATAAAACTGGTGTAAAAAGGTGTAAGCTGAAAAGTGATG TTAGGCATCATTTTCCAGTTTCTATTCTTGTATTAAATTGAACAATGTAGTCTTAATCAATTAATAAAATGACCAATACTATTCATGTTAAATATTCAGG TTGATTACATTCTTGGTGACAACCCAAGAGCCACAAGTTACATGGTGGGATATGGAAACAACTTCCCGCAAAGAGTTCACCATAGAGGTTCATCCATTGT GTCTATTAAGGTTAACCCTTCATTTGTCAGCTGCCGTGGAGGTTATGCTACTTGGTTCAGCAGCAAAGGCAGCGACCCCAATCTACTTACAGGTGCTACT GTTGGTGGACCTGATGCATATGACAACTTCGTCGATGAAAGAGATAATTATGAGCAAACAGAGCCAGCAACCTACAACAATGCTCCTCTTATTGGTATTC TAGCACGCCTAAATGCCGGTCATGGCGGCTACAATCAGCTCCTTCCAGTTGTTGTTCCAGCTCCTAAGCCTGTTTTCACCAAGACTCAACCATCCCCAAA ACCAAAGATATCTCCATCTCCAGCTTCATGGTCAGGTCCAATTTCCGTCGAACAAAAATCGACCAACTCATGGGTTTACAAAGGAAGAACTTATTACAGA TACTCAACTGTTGTGACTAACAAATCTAGCAAGCTGATCAAGTCTCTTAGTCTTTCAATATCAAAGCTTTACGGTCCAATTTGGGGTCTCACAAAGTCGG GTGATTCATACACTTTCCCATCATGGGTAAGCTCATTACCAGCAGGAAAAAGCCTTGAATTTGTCTACATCCATTCTGCTTCTCCAGCGGACGTGTCGGT TGCGAACTACTTGTTGGCCTGAGAATGATCTAATTTGGTTTGAAGTGATATGCAAATGGTATCTTCTGTGTTGTTTAAGAATTGTGCAGTGAGGGGAGGT TCCCTTTTTCGTTATCCTTATTTATTTTGGTGTCAAAACTTATATTCTCTTGTGTATTTTGCATTTCATTAGGTTAGATAAAACAATAGGTAGAATATAT AAGATGCAAGAACCAGAGCAGAAAGGAGTGAAGAGACAATAAAACTGAGTGCTCATCCTCTTTCTTCTCTGTTTCACAACTTATATACAGTGAGTGAGTG ATACAAGACAGACAACAGCAAAAGAGTGAGTTTACAAAAGTGGGAAAAAAAAATGAACTTCTCAATATTTTAGAGAAGAGTCATTACTTGTATTTTAAAA TAGCTTTGGATGTCTTTTCATGTGTCTTGATGTTTTTAAAGCTTTCAAGCATTTTGTACTTGTTAAGGTAACAGTTTGTGAAATACTATTATGTCTTTGT GCTATGCATTTGCAAATGGTGAGTCAGGTTTATATAACGGTTATAATAAAAGAGGTGGTACCTGGTCGAAAGAAATTGAAAGCAGATTAAATACAGTTTT AGCCAGATTTCTATTATAAATAAAGTCATGTAAATGAGATCTCAGTTTTCGTTCTTCATTTTTATCTCGATTCACGTATAAGATTACAAAATGATATGAG TTTAGGGAGAGAATCAAAGAGAGGTTTCGTTTGAAATTTCAATAAATGAATGTGTTAGGCTGATTGTAATAAAAATAACAAATAACAGAATCAGTTAAAG GAAAGTAAGAGAATTATACTGAAAAGGGAATTCATTCATTGCTCTTTCTTACTAGTGTTCAATCGGCTTAAAATAGAAGAAGATTATAAAATATCCAGGA TAGGCTAAATCTCTACTGTACAAGTGGTAGGATCCCCTCATTAACATACTGTCTTTTAACAATAAATTTACTCGAAATTATAGTCATTGTGCCAAGCTGG TTTAGATATAATTCTTTTGGGCTTAGTAGTCTTATTTTGGGCTCTATCATTGCCAACCCAACATGAACAACCTTGTCCGCAAAGTTGGAATTTGAATCTG ATGACTTGGGTAGCCCTGATCCAACAATTAAAGTGAGAGAGAGAAAATTGACAGCTGGTGAAATCCCCTAGTTTGGAAAAGAATCCAAAGAAATTAAAGG TTCAGATGTATTGTGGATGTTTGGGTGGGAGAATGGATGTTTGAAGGAGTGAATGGGAGACAAATGTATCCCATCACTAGGCTGTTGGTCAACAGCCTGT ATCACAGTCTGGCACGAAACCTTAGCAGAGCCATTGGATGGAGAAAAAGGACCGTTGGGTGGAAGATCTTGACCCTTGGATGGAGAGAGAAAAAATGGGA CAACTTTTTGTACCTTTTGCATGTACCTATGCTAGAGAAGCCGTGTGAGCTTTTTGAAAAGGAAAATTATTATTATGACTTAGCTCCCTCATTAAAGATG AACCATTGGATGTAAATGGTGGAAGATTGAACCCATCCAATGGTGTATGCGGTTTCCCAGTTGTAAGTGTAGGAGTAGCCTTAGTAAAAGCACCATTAAG TGTAGTTGGAAAAAGAGAATGTCTTTTATTTTCTCCACTCCCACGTTTCTCTGCTTCACTTAAACTTTTCTCTTTCTCAACATAACCCATGCTGCCTCTA GTCACAATTTTGTCATCATTTGCAAGTGGTTTTTGGATTGCTTCATCTTGGTCAAGATATCCATCTCTCTGTCTCGGTGGTAAAGGAACATATTGTGCGA TTGGATCTCCATGGAACCGTCACAGAAGAGAAACATGAAAGACGGGGTGTACCCGTGTAGACGGTGGCAAGTCTAATTCATACGCTACCGACCCAATGCG ACGAACGACTCTGTAAGGACCAAAATAGCGAGGGGTGAGTTTGTGAGAAGCCCTATGCACCATCGTGTTTTTCCGATAAGGTTGGAGCTTTAAAAGCACC CAATCGTCCACCTCCAAGAATCTCTGTCAAATAAGGAACATGCCCGTTCTGTGGTAATAAATCCGTGAGGGTTGGAGGTGCACGTCCATAGAGAACCTCA AATGGAGATAAACCTGTAGAAGAGTGTTTGTTGGTATTATACCAGAACTCGGCCAACGGAAGGTGACGAAACCACTTCTGTGATTGAGAACCCGCGAAGC ATCTCAGGTAAGTTTGTAAGCACCAATTAACCACCTCGGTTTGACCGTCAATTTGCGGGTGAGAGGCAGTGCTGATGCAAAGTGACGCCCCTTGAAGGCG GAAAACTCCTTCTAGAAGGAACTGAGAAAGAGTTTGTCGCGGTCAGACACTATTGAACGGGGGACCCCATGTAGCCTGGCAATCTCCGTGAGAAATCGAT TGGCTGAAACTTCCACACTGAATTTTATGGGCAAGCCAATGAAATGTGCATACTTTGACAAGCGATCAACCACAACCCATATTACAGTATGACCATGAGA CATTGATACCGGGCCAATTGCATGAAGCGGCCAAGCGAGCCATTGTAGGCTTAAGACCCATGGAATTCTTTTGTCTATTGGAGAGCCATGGAATTATGTG ATGAGAGAGTTGCGAAACTGCTTGAGATCAGGTATGAATATCCTCTGCTCATAGAACAACAGTCCATTAGAAAAGTGGAATTTTTGTTTCATGCTTGTAT CTGATTCTGATTTTTGTATGAGTGCCTTGCCGGCAGAGGTGATGTAGAAAGCCTGCAACTTCTCCAGAATGGCTGGAATAGGTGATGTCAGTGAAGTAGA TATGGGTTTCATGTGAATGCAAGCGAGACAATGCATCAACTACTCTATTAGAGTGTATATCTCACGGACATAGGCTTAGGCATGCTGCATTCAGGTAGAC ATTTTTCTACTGAAAAAAGCAAGCGGGTGACCTTCTTGAGACAACGTCGCGCCAATTGCAACAGAAGAAGCGTTTGTCTCAACATAAAAGCTCTCAGTGA AATCGGGCAGTCGAAGCACTGGTGTTTTAGTGATTTCTTGTTGTAATTTTGTAAAGGCCAGCTGAGCCTCCGATGTCCATGTAAAACTATGTTGTTTTAG TAGATCGGTGAGCGAAGTGGCGAGTGTGGAATAATGCTTCACAAACTTACGACAAAAACCAGTAAGGCCCAAAAAACCATGTAGTGCAGTGAATGAGCGA GGTGGCAGCCAATCCATCATTGCTTTTATCTTATCAGGATCGGGCCTTACACCAGATGATGAAATTATATGCCCCAAATAACCAACAGAATCAACCCCAA AAGTACATTTAGATAGTTTCGCATAAATCTGATTAGAATGTAATAGGGCCAAACTGCATTAGATGATCATGTAAATTGGAGCTATAAACAAGTATATCAT CAAAGAACACTAGGACGAACCGTCTTAAGTGGGGCCTGAGCAAATCATTCATGGCAGCTTGAAAACGAATGAGGGTGTGTAGGGTTTGGGTTTGCAGTCT GTTCGGGTTTGGGAAAGGAAGGGAGTGTGGTTGGTGTGCCAAAACGTGAGGTTTTGGGTTGTCCATGGTTGGATTTCCTTACCCTCTCTTCCACCAATTT TCCTAATCCAAGAGCCTCAGAGATTGAATTTGGTCTAAAATAGCCAATTCCCGTCGTATTTCCGGTAATAACCAGGGATGAAACAATTTAAGATCATCTC TTGAGATAATCCCCAACTGCGGTTATTAATATTTCGAACCACTTTTGGTAATCTGCAACAGAACCCACTTTCTTTAATCTGAATAATTCCGCTTGAGGAT TAGTGTAGGAAGATGGACCAAAACGTGTCTCCAAATCTTTAGTAAAAGTAGGCCAATCAGATAATTGACAGTTCTGAAACATCTACTTAAACCAATTGAG GGCCCCACCTTGCATATAGAATGCTATCATTGGTAGGTGTTGGTCAAGGGGTACCATATAGAGCTGAAAAAACTGTTGAACTTGAAAAATCCAATCAAAA GGTTCTGATCCATTAAATGACATGAGATGGAGCTTCGGCGGTTGGGGTTGGGACGGTGGGGAATTTGGAAGGTTTGGTTGGGAGGGGGGTGGAAGAGTGT GGTAAGGAGCGAAAAGTGGGTGAAGAGGGTGTTGTGGGGTCTGGTGTGGTGGAAAAGAATGAGTGTGGTGACTTGTTGAGTGTGAGATTTGAGAAGAAGC ATGAAAGGGTGAGATCTGAGAGGGATCAGGATGGGAAGAATAGAGGAAGGGGCAAGTTTTTTAGTGATGTTATGGAGGACAATGGTGATGGCAGCATGTC TAGCATCCTGATGTTCTTGTTTTTCCTTGAGTTTGTCCATAAGAAGATGAGAGATGGTATCATCAGGTTCCTTTTGAGTGATTTTGGGAGGCATTGAAGG AGAAATGTCAGCAGCAAATGTTAGGCTGATTGTAATAAAAATAACAAATAACAGAATCAGTTAAAGGAAAGTAAGAGAATTATACTGAAAAGGGAATTCA TTCATTTCTCTTTCTTACTAGAGCCCAATCAACTTAAAATAGAAGAAGATCACAAAATATATTGGATAGGCTAAATCTCTACCGCACACGTGGTAGGATC CCCTCATATTAACAAACTGTCTTTTAATAATAAATTTATTGGTAATTATAGTCATTGTGCCAAGTTGGTTTAGATATAATTCTTTTGGGCTTAGTAGTCT TATTTTGGGCTCTATCAGAATGATAGTGGAAGTTTGGATGATTCTCAAAAGAAAGAAAGGATAGCGAAAGAGTTTCAAATCATAAAGAGTGATCAAAAGC TCAAATATAACCTATTTCCTTAAACTAATCATATGCTAGATTGGTTAGTTTGTAAGGGAAGTAAAAAAGAGAGTGCGAAAATCATGGTTTTGGAAATGGC TGTTAGGAACTTGATGCCTCTATCAGTTATGTCAAACTAGTGGGCACATTTTGTGTCACGAGAAAAAAAGGTGGAAACAAGCTGACCAATCTTGTTAGCA TTTATTGTTAGGTACAAGCTACCTAAAGAAGTTAAAGAAAAAAAGGAAGAGATAAAACATTTGTTATCCAGATTTGACCAATTGTATAGGAATATCGAAC GACTACTATTATGTATTAGATATTAAAGTTGTGTCTTGGCTTAATCATTAGAGTTTACTAACACATAGCCATCTATTTCAATCATTTTACATCACCCTAA ACCAATAGTTTGTATTGTTTTTTCTACTGAAAAGTGTTAATCCATGACCGTGGACCGGTACACGATCTGGTCTTGTTTTGCTACCTACCAATATTTGTCT CGCCCTTATGGTTGTGTATGGTCGTATGTGTGGCAAATGAATGAATTTGGATGAATTTAAATTTTAATCATAATAGATGGAAACTGGAAAGTCATTCACC AGTCCATATAAATTCATTAGATCATATTTTAAATTATCCAAATCCATTGATATCCAAACTTATTGGATGAATTTCAATCCATCTAATTCACCTATGAATC AATTTAAATGGATTGGATGATTGAAT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_190145; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_430429
Blastp | Endoglucanase 6 from Arabidopsis with 72.61% of identity |
---|---|
Blastx | Endoglucanase 6 from Arabidopsis with 83.61% of identity |
Eggnog | hydrolase family(ENOG410XPC9) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G64390) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000588) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019446516.1) |
Pfam | Glycosyl hydrolase family 9 (PF00759.18) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |