Ll_transcript_429875

Id TrinityTRINITY_DN52126_c2_g1_i12
Name TranscriptLl_transcript_429875
SequenceATTTATAAAAAAGCTAAAATAAAAGACACTTGTGTGTTATAACTTATAGTTATTAACTTATTTTCTTTACATGCAGTGAATCCATGGCTACCTCTTCGGT CCTCACCCATTAATGAATATAGACAAAGATCTTGAATTTGCTTTGTTCTGAAAATGGGTTCAAAAATTAAGCTTCTGGGTATGTGCATATGGCTATTTTA CTTGCCAAGTTTCACCTTCATTGTTGTGAATACACAAGATAATGAAAGTGGAAGAAGTGCAACTTTGAAGGGTAGTGTTGTCATTAATGGAAGATCTGTG ATTGGAAATATTGATGATGATTTTGTTTGTGCAACCCTTGATTGGTGGCCACCTCAGAAATGTGACTATGGGAGATGCAGTTGGGGTCTTGCTTCTCTTC TCAATTTGGTATTGTTGTTATTTTTCTTTTTATCCAAATTGTTTTTGATTCTTTTAAGGTTTTTTTTAAGAATGTTTAACTGCTGCAAATTTTTCTATGA CAACGTAAGTATAAGTAGTTTTTATTGTTTGTTAACTAGAAGTGATGTTTTTTCTATTTTCCTAATGCTTGCTTTGGATCTATTGGTACAGCTGCAAAAT AATTACTGTATAAAATTTAATCTTTTAATTTTATTGTTTTCTTAAAAATATATGTCATTATCTACTCATTGGTGAGGATCTGAGGCCAAGTTGATAATTT TATCACCACATAATGGTGAGATAATTGCATACTTTTTTTTTGCCTTTGGTAGATTATGTTTAACAAAAGGATAATTGAAATTAACTTTTGCTGAAATTTC AGGTTTCAATCTTTCATTTTCCTGTGTTCTTTAATGAATTAGGTTGAGTATATAAGTGAGAAGTCACATATTTGATATAAAGGAAAGAATGAAAGAGTTT ATAATTGACAAAGTCTATGAGACCATTACCTTAAGGTTTTTGTTTCAAGATATGGTGTCTCATTATAACTCTTTACTCTTTCCAATGCCCCGATGGGACT CTCGGTCGTTGGAGGTTCCCCAGTTGTGAATGGGCCGAACAAGTGGTATTAGAGCCGAGATGGCTCGACTGGGACATGGTGAACTCAAGGTGAAGTAAGT GTGTTGTGTGTGGTACCCACACTTGAGGTGGGAGATTGTTAGTTATATTCAAGTGTGAAGTCTCACATTGGATATGAGAAATAATTGGAAGAGTTTATAA GTCAAAAAGACACATGAAACTATTGTCTTAAGGTTTTTGGTTCAAGATGTGGTGTCCCACCTCTGGCTGACTCTTCACTCTTCTCATGCTCGATAACAAT GGAACCAACTGGTAGTTGGAGGCTCTTTTGTCGCAGTCGGGTCCAACAGATTAATTAATTGTTTTAATAATATATTGTACAGTTTGTAAAGGGAAGAGAG AACTCAAATCTTATAAATATTATCTCATGCAGGACCTCAACAACAAGATTTTGTTGAATGCAGTGAAAGCCTTTTCACCTTTGAAACTTAGATTAGGTGG AAGTTTGCAAGACAAGGTCATATATGAGACAGAAAATGATCAACAACCATGTACTCCTTTTCATGCTGACACTTCTCAAATGTTTGGTTTCTCACAAGGG TGCCTCCCAATGAAAAGATGGGATGAGCTAAACAACTTTTTTGAAAAAGCAGGAGTTAAGATTGTCTTTGGATTAAATGCTCTTGTTGGAAGAACTGTAT CTGGCTCTGCAGTTGGACCTTGGAACTACACGAATGCAGAATCTTTTATTCGTTACACTGTCTCAAAGAACTATGCCATCGATGGATGGGAACTTGGCAA TGAATTGAGCGGGAGTGGAGTTGGAACTAGTATTTCAGCAGACCAATATGCTTCTGATCTAACCGCTTTACGAAACATAGTTTACAATGCATATGAAGAG ATTGATCTTAAGCCACTAATCATTGCACCTGGAGGTTTCTTCTCTGCGGATTGGTTCAAGGAGTTTATAAGCAAATCCGGCACATCTTTGGATGTGGCCT CCCACCACATTTATAACCTTGGACCAGGAGTTGATGAGCACCTTGTGGAAAAAATTCTTAATCCTTCCTATCTTGATGGAGTGGCAAGCACATTTAGAGA CCTAAAAAATGTACTTGAAAGTTCAGGAACCGCAGCAACCGCATGGGTTGGTGAGTCAGGAGGGGCTTACAATAGTGGCCATCATCTTGTATCAGATGCA TTTGTGTACAGTTTCTGGTTAGTGGTAACTCCCTCCGATGTATATGCCGTAGTTTCGAGGGTTCCTTAAAACTATTACTAATGTTACTATATCACAAACA GGTATTTGGATCAGCTTGGTATGTCAGCTGCATATGATACTAAAACTTATTGCAGACAGAGCTTGATAGGAGGAAACTATTGTTTACTTAATACCACTAA TTTCATGCCAAATCCGGATTATTATAGGTACCGAATATTGAATTTCATAGTTGCTTAGGTCATTCATTAGTTGGTAAAGTTGAAAAACAAATTTCCAAGC AAGACGTGCATTTTTCCGTCGGATAAATTTGTTGTTTCCGTCGGATAAAGTTGAATGAAATGCTTTATTAGACGCCATTTCAAATAGATCCACAATGTTT CACGGCGAGGATTATAAAATCTGTGGTAATGTGCTTTGTTTGCAGTGCTCTTCTTTGGCATAGACTCATGGGAAGACATGTACTATCAACTACCTTCTCT GGGACAAAGAAGATAAGAGCTTATGCACACTGTTCAAAGCAATCTGTGAGTAAAACTTGTGTCACTATGATTATGAAATGCATATTTATGTTGGAGATTA ATTTAAATGTAGTTTTAGGTTAATGTTTTTTATACTATAACCAATCATACATCATACTTTCGAAGTAGTCATCGTGTAAGCCAAATATCGTTTTTTTTCC GTTATTGAATGACAGTGTAAAAATCTTTTACATTGCCGAATGCATGCAGAAAGGAATCACAATACTATTGATCAACCTGGACAGCAGCACGACCGTTGAA GCCGATGTGACCTTGAGCAGCACCAAGAATTTCTTGCATAGAAAAATGTCTGATGATTCAAAGCTAGTGAAGCTACCTCTCCATTATGCAA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_190272; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_429875

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_429875
BlastpHeparanase-like protein 3 from Arabidopsis with 64.39% of identity
BlastxHeparanase-like protein 3 from Arabidopsis with 61.86% of identity
EggnogHeparanase(ENOG410YDJW)
KeggLink to kegg annotations (AT5G34940)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019417502.1)
PfamGlycosyl hydrolase family 79, N-terminal domain (PF03662.13)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;